Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.07 1.0 0.1 0.01 0.02 0.02 0.15 0.05 0.09 0.06 0.07 0.02 0.17 0.68 0.67 0.03 0.13 0.13 0.25 0.06 0.05 0.01 0.23 0.04 0.48 0.15 0.11 0.0
0.23 0.7 0.45 0.56 0.67 0.81 0.51 0.56 0.56 0.79 0.55 0.78 0.68 0.64 0.56 0.25 0.3 0.54 0.23 0.3 0.21 0.33 0.33 0.24 1.0 0.45 0.47 0.67
0.08 0.55 0.24 0.38 0.72 0.67 0.66 0.25 0.42 0.73 0.39 0.87 0.55 0.71 0.63 0.36 0.3 0.56 0.28 0.35 0.34 0.29 0.27 0.29 1.0 0.74 0.71 0.6
0.12 0.8 0.15 0.16 0.17 0.07 0.26 0.18 0.42 0.17 0.37 0.24 0.19 1.0 0.67 0.36 0.32 0.72 0.47 0.25 0.28 0.28 0.24 0.28 0.27 0.25 0.35 0.12
0.12 0.54 0.21 0.29 0.26 0.49 0.25 0.37 0.23 0.25 0.23 0.22 0.2 0.92 0.72 0.4 0.36 0.19 0.17 0.34 0.41 0.37 0.2 0.33 1.0 0.8 0.67 0.52
0.12 0.52 0.43 0.37 0.65 0.57 0.47 0.25 0.35 0.42 0.34 0.65 0.5 0.75 0.62 0.28 0.38 0.33 0.13 0.34 0.27 0.37 0.33 0.3 1.0 0.51 0.63 0.57
0.18 0.54 0.27 0.1 0.16 0.11 0.24 0.17 0.29 0.15 0.3 0.21 0.3 0.37 0.38 0.14 0.27 0.08 0.07 0.1 0.08 0.13 0.13 0.14 1.0 0.56 0.39 0.09
0.36 0.89 0.37 0.25 0.42 0.56 0.33 0.36 0.4 0.4 0.47 0.4 0.31 0.56 0.51 0.38 0.32 0.16 0.22 0.33 0.36 0.31 0.22 0.33 1.0 0.7 0.54 0.2
0.01 1.0 0.02 0.07 0.04 0.05 0.04 0.06 0.13 0.08 0.13 0.05 0.07 0.44 0.71 0.03 0.04 0.08 0.01 0.03 0.02 0.04 0.08 0.03 0.37 0.33 0.15 0.08
0.23 1.0 0.42 0.47 0.74 0.89 0.47 0.35 0.43 0.56 0.39 0.78 0.44 0.57 0.48 0.26 0.33 0.29 0.11 0.31 0.3 0.3 0.39 0.23 0.43 0.78 0.54 0.76
0.22 0.77 0.43 0.36 0.49 0.5 0.46 0.3 0.44 0.41 0.39 0.51 0.27 0.9 0.71 0.28 0.29 0.53 0.52 0.39 0.27 0.35 0.4 0.3 0.82 0.49 1.0 0.39
0.15 0.93 0.47 0.47 0.77 0.86 0.75 0.34 0.37 0.35 0.37 0.65 0.65 0.94 0.81 0.29 0.39 0.32 0.17 0.33 0.28 0.31 0.24 0.26 0.49 0.74 1.0 0.86
0.21 0.63 0.5 0.57 0.45 0.36 0.7 0.23 0.42 0.31 0.36 0.51 0.73 0.8 0.81 0.55 0.46 0.35 0.4 0.53 0.52 0.5 0.62 0.45 1.0 0.7 0.82 0.69
0.11 0.68 0.38 0.4 0.43 0.62 0.5 0.32 0.39 0.29 0.5 0.42 0.35 1.0 0.85 0.32 0.38 0.23 0.38 0.39 0.33 0.4 0.6 0.33 0.41 0.69 0.92 0.47
0.29 0.38 0.19 0.3 0.37 0.3 0.24 0.15 0.28 0.35 0.18 0.48 0.19 0.63 0.55 0.15 0.15 0.29 0.13 0.16 0.18 0.16 0.26 0.12 0.87 1.0 0.46 0.53
0.47 0.6 0.14 0.14 0.29 0.26 0.12 0.19 0.33 0.24 0.37 0.34 0.15 1.0 0.78 0.07 0.06 0.2 0.04 0.12 0.06 0.14 0.17 0.09 0.43 0.67 0.91 0.18
0.09 0.43 0.41 0.37 0.77 0.56 0.36 0.32 0.49 0.6 0.47 1.0 0.41 0.93 0.82 0.33 0.48 0.7 0.65 0.39 0.27 0.41 0.35 0.38 0.59 0.83 0.62 0.68
0.17 1.0 0.25 0.25 0.25 0.25 0.26 0.15 0.29 0.17 0.25 0.29 0.15 0.72 0.8 0.19 0.21 0.42 0.34 0.27 0.17 0.26 0.53 0.26 0.39 0.66 0.49 0.21
0.15 0.71 0.29 0.37 0.36 0.3 0.31 0.25 0.34 0.53 0.21 0.37 0.33 0.66 0.62 0.17 0.25 0.21 0.1 0.2 0.16 0.19 0.32 0.14 0.47 1.0 0.86 0.68
0.18 1.0 0.14 0.03 0.05 0.02 0.06 0.05 0.12 0.06 0.15 0.04 0.03 0.71 0.56 0.03 0.02 0.04 0.06 0.06 0.06 0.06 0.09 0.06 0.48 0.09 0.83 0.03
0.0 1.0 0.17 0.05 0.0 0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.68 0.0
0.22 0.41 0.28 0.51 0.33 0.27 0.38 0.15 0.22 0.37 0.16 0.31 0.34 0.64 0.54 0.16 0.2 0.12 0.11 0.19 0.18 0.15 0.15 0.14 1.0 0.83 0.6 0.63
0.17 0.25 0.53 0.47 0.47 0.6 0.63 0.27 0.27 0.44 0.25 0.43 0.38 0.53 0.48 0.28 0.37 0.24 0.23 0.34 0.3 0.34 0.27 0.28 1.0 0.92 0.56 0.48
0.32 0.92 0.44 0.52 0.48 0.48 0.55 0.43 0.51 0.47 0.5 0.51 0.47 1.0 0.9 0.47 0.44 0.48 0.26 0.55 0.51 0.55 0.61 0.48 0.83 0.9 0.7 0.74
0.04 0.71 0.3 0.4 0.95 0.94 0.35 0.38 0.3 0.34 0.27 0.73 0.47 0.61 0.53 0.29 0.32 0.24 0.11 0.25 0.24 0.24 0.16 0.2 1.0 0.24 0.51 0.75
0.04 1.0 0.08 0.0 0.04 0.04 0.1 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 0.01 0.28 0.32 0.02 0.01 0.06 0.01 0.03 0.01 0.01 0.08 0.03 0.39 0.23 0.46 0.0
0.35 1.0 0.35 0.5 0.59 0.81 0.38 0.27 0.37 0.31 0.32 0.66 0.4 0.54 0.53 0.22 0.46 0.24 0.38 0.27 0.18 0.32 0.29 0.22 0.52 0.85 0.46 0.66
0.2 0.58 0.65 0.37 0.47 0.48 0.86 0.5 0.55 0.55 0.62 0.63 0.49 0.66 0.67 0.29 0.32 0.47 0.33 0.44 0.57 0.44 0.63 0.42 1.0 0.45 0.52 0.6
0.29 0.66 0.55 0.43 0.54 0.57 0.53 0.31 0.39 0.41 0.34 0.69 0.63 0.82 0.86 0.29 0.29 0.5 0.44 0.45 0.32 0.42 0.42 0.32 0.92 0.71 1.0 0.62
0.02 0.54 0.53 0.08 0.17 0.22 0.26 0.57 0.25 0.55 0.08 0.17 0.11 1.0 0.63 0.08 0.11 0.1 0.15 0.11 0.21 0.14 0.41 0.14 0.52 0.71 0.78 0.19
0.05 0.59 0.07 0.21 0.15 0.14 0.18 0.26 0.28 0.24 0.24 0.18 0.2 0.77 0.75 0.16 0.13 0.17 0.07 0.12 0.11 0.12 0.34 0.1 1.0 0.4 0.43 0.42
0.05 1.0 0.11 0.07 0.12 0.06 0.08 0.07 0.09 0.08 0.09 0.11 0.07 0.41 0.47 0.09 0.07 0.14 0.1 0.1 0.08 0.1 0.04 0.1 0.55 0.53 0.18 0.04
0.09 0.64 0.61 0.41 0.36 0.51 0.58 0.4 0.42 0.59 0.46 0.34 0.37 1.0 0.93 0.41 0.37 0.71 0.53 0.51 0.48 0.47 0.46 0.42 0.79 0.73 0.75 0.75
0.12 0.51 0.17 0.22 0.33 0.24 0.14 0.15 0.23 0.27 0.16 0.37 0.22 0.62 0.55 0.07 0.07 0.21 0.18 0.09 0.08 0.09 0.19 0.07 1.0 0.51 0.43 0.29
0.42 0.94 0.03 0.01 0.02 0.02 0.08 0.04 0.05 0.02 0.13 0.02 0.02 1.0 0.88 0.04 0.04 0.02 0.04 0.04 0.02 0.04 0.03 0.05 0.86 0.31 0.68 0.04
0.21 0.28 0.2 0.12 0.32 1.0 0.18 0.68 0.09 0.09 0.1 0.13 0.08 0.42 0.41 0.11 0.13 0.08 0.05 0.14 0.11 0.12 0.12 0.11 0.46 0.29 0.33 0.12
0.41 0.56 0.59 0.56 0.5 0.42 0.39 0.35 0.37 0.43 0.36 0.64 0.44 1.0 0.83 0.68 0.63 0.33 0.36 0.72 0.75 0.64 0.68 0.57 0.84 0.98 0.68 0.82
0.19 0.55 0.35 0.4 0.25 0.33 0.45 0.41 0.35 0.3 0.28 0.14 0.2 0.77 0.64 0.29 0.25 0.17 0.17 0.47 0.3 0.38 0.25 0.25 0.46 0.27 1.0 0.75
0.06 1.0 0.08 0.13 0.11 0.07 0.12 0.07 0.08 0.13 0.11 0.15 0.18 0.77 0.68 0.07 0.1 0.13 0.06 0.11 0.1 0.09 0.1 0.1 0.6 0.63 0.52 0.15
0.17 0.85 0.53 0.67 0.74 0.69 0.88 0.36 0.59 0.6 0.65 0.73 1.0 0.76 0.8 0.42 0.38 0.52 0.22 0.41 0.39 0.37 0.53 0.32 0.44 0.79 0.69 0.67
0.08 0.37 0.11 0.18 0.23 1.0 0.19 0.24 0.11 0.11 0.12 0.13 0.16 0.32 0.29 0.2 0.22 0.11 0.16 0.17 0.17 0.16 0.14 0.15 0.35 0.24 0.42 0.25
0.07 0.74 0.51 0.42 0.63 0.49 0.61 0.44 0.62 0.65 0.64 0.71 0.63 1.0 0.92 0.42 0.43 0.51 0.23 0.52 0.54 0.55 0.55 0.49 0.5 0.69 0.68 0.71
0.03 0.7 0.16 0.32 0.45 1.0 0.51 0.31 0.2 0.22 0.19 0.42 0.4 0.64 0.61 0.12 0.21 0.34 0.12 0.17 0.13 0.13 0.15 0.12 0.58 0.56 0.48 0.52
0.09 0.59 0.18 0.37 0.67 1.0 0.41 0.22 0.28 0.31 0.28 0.72 0.35 0.47 0.39 0.13 0.23 0.14 0.05 0.16 0.1 0.15 0.1 0.12 0.48 0.46 0.4 0.64
0.09 0.62 0.33 0.39 0.93 0.86 0.34 0.31 0.36 0.4 0.37 1.0 0.35 0.79 0.73 0.57 0.51 0.65 0.55 0.46 0.5 0.51 0.36 0.44 0.81 0.42 0.68 0.44
0.12 0.56 0.6 0.55 0.61 0.46 0.44 0.39 0.35 0.43 0.41 0.64 0.45 0.9 0.75 0.36 0.41 0.34 0.25 0.47 0.39 0.54 0.35 0.44 1.0 0.67 0.6 0.73
0.03 0.31 0.1 0.01 0.11 0.06 0.11 0.31 0.35 0.23 0.35 0.14 0.05 0.45 0.37 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.03 0.01 0.15 0.0 1.0 0.2 0.24 0.0
0.04 0.08 0.19 0.01 0.16 0.19 0.15 0.18 0.29 0.5 0.36 0.2 0.15 0.23 0.17 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.22 0.28 0.0
0.18 0.37 0.18 0.33 0.55 0.54 0.24 0.17 0.24 0.38 0.19 0.67 0.42 0.78 0.69 0.18 0.17 0.15 0.06 0.19 0.16 0.17 0.24 0.13 1.0 0.93 0.56 0.54
0.1 0.89 0.53 0.33 0.48 0.4 0.66 0.35 0.51 0.76 0.55 0.63 0.66 1.0 0.9 0.28 0.35 0.49 0.2 0.34 0.27 0.34 0.38 0.23 0.63 0.96 0.75 0.51
0.0 1.0 0.08 0.08 0.07 0.05 0.18 0.08 0.14 0.08 0.14 0.1 0.26 0.7 0.63 0.05 0.06 0.25 0.04 0.05 0.09 0.04 0.09 0.05 0.12 0.07 0.76 0.05
0.19 0.9 0.76 0.57 0.74 0.67 0.72 0.37 0.45 0.44 0.46 0.63 0.72 1.0 0.95 0.57 0.56 0.66 0.5 0.72 0.66 0.67 0.74 0.65 0.74 0.63 0.81 0.73
0.01 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 1.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.21 0.01 0.46 0.04
0.05 0.85 0.09 0.12 0.22 0.23 0.13 0.21 0.28 0.18 0.37 0.35 0.16 0.72 0.79 0.16 0.22 0.15 0.07 0.13 0.12 0.14 0.39 0.15 0.53 1.0 0.35 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)