Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.01 0.01 0.15 0.05 0.27 1.0 0.61 0.51 0.04 0.24 0.04 0.03 0.24 0.06 0.05 0.03 0.11 0.08 0.04 0.02 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 0.05 0.28 0.02
0.0 0.01 0.0 0.07 0.23 1.0 0.01 0.15 0.0 0.05 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.01 0.01 0.05 0.18 0.4 1.0 0.08 0.72 0.13 0.44 0.04 0.08 0.02 0.12 0.09 0.08 0.12 0.02 0.01 0.02 0.09 0.05 0.11 0.02 0.05 0.0 0.1 0.63
0.06 0.05 0.05 0.29 0.14 0.75 0.2 0.32 0.06 0.15 0.06 0.04 0.11 0.05 0.08 0.23 0.22 0.06 0.02 0.08 0.11 0.1 0.13 0.05 0.02 0.01 0.08 1.0
0.0 0.02 0.08 0.37 0.41 1.0 0.88 0.16 0.09 0.16 0.13 0.19 0.13 0.02 0.02 0.16 0.21 0.17 0.14 0.19 0.11 0.21 0.09 0.18 0.04 0.01 0.03 0.72
0.03 0.13 0.12 0.13 0.39 1.0 0.12 0.06 0.11 0.06 0.12 0.19 0.06 0.04 0.05 0.21 0.15 0.08 0.08 0.18 0.12 0.19 0.1 0.16 0.12 0.1 0.04 0.26
0.08 0.04 0.16 0.07 0.35 1.0 0.3 0.19 0.02 0.05 0.01 0.11 0.11 0.13 0.11 0.12 0.09 0.05 0.04 0.09 0.05 0.1 0.03 0.06 0.29 0.02 0.1 0.13
0.16 0.08 0.27 0.29 0.4 0.82 1.0 0.22 0.18 0.27 0.17 0.31 0.51 0.2 0.19 0.16 0.14 0.82 0.16 0.18 0.19 0.16 0.38 0.18 0.22 0.61 0.28 0.2
0.26 0.74 0.3 0.07 0.1 1.0 0.41 0.49 0.83 0.28 0.15 0.01 0.2 0.28 0.39 0.08 0.16 0.22 0.05 0.13 0.25 0.07 0.38 0.09 0.15 0.07 0.55 0.06
0.16 0.28 0.08 0.14 0.27 0.55 1.0 0.15 0.06 0.15 0.07 0.11 0.08 0.14 0.18 0.22 0.17 0.34 0.26 0.27 0.13 0.25 0.06 0.29 0.18 0.06 0.14 0.19
0.19 0.33 0.25 0.11 0.53 1.0 0.48 0.38 0.31 0.51 0.38 0.54 0.46 0.1 0.08 0.17 0.26 0.27 0.11 0.14 0.11 0.14 0.13 0.15 0.11 0.1 0.19 0.2
0.08 0.04 0.05 0.08 0.37 1.0 0.68 0.35 0.02 0.16 0.02 0.06 0.08 0.05 0.04 0.13 0.26 0.05 0.05 0.1 0.09 0.13 0.06 0.09 0.24 0.12 0.04 0.1
0.01 0.0 0.22 0.25 0.41 1.0 0.21 0.16 0.02 0.09 0.02 0.14 0.16 0.01 0.02 0.15 0.11 0.1 0.19 0.1 0.09 0.12 0.12 0.1 0.01 0.16 0.02 0.46
0.52 1.0 0.15 0.14 0.68 0.69 0.45 0.6 0.29 0.29 0.32 0.23 0.24 0.05 0.07 0.86 0.48 0.2 0.23 0.48 0.47 0.49 0.13 0.42 0.35 0.46 0.15 0.25
0.1 0.17 0.15 0.26 0.37 0.53 1.0 0.18 0.26 0.28 0.22 0.33 0.21 0.18 0.18 0.23 0.23 0.22 0.25 0.22 0.11 0.23 0.26 0.18 0.13 0.26 0.18 0.43
0.16 0.03 0.02 0.04 0.17 0.2 1.0 0.06 0.01 0.14 0.03 0.09 0.1 0.04 0.04 0.06 0.06 0.08 0.02 0.04 0.03 0.05 0.01 0.03 0.01 0.04 0.03 0.03
0.29 0.2 0.03 0.08 0.46 1.0 0.55 0.01 0.04 0.02 0.06 0.08 0.12 0.24 0.25 0.08 0.07 0.05 0.04 0.07 0.02 0.07 0.04 0.05 0.03 0.07 0.36 0.03
0.02 0.02 0.06 0.2 0.47 1.0 0.24 0.12 0.07 0.14 0.09 0.3 0.19 0.02 0.03 0.39 0.32 0.2 0.25 0.26 0.2 0.28 0.11 0.25 0.03 0.12 0.02 0.35
0.57 0.73 0.48 0.44 0.6 0.89 1.0 0.43 0.39 0.5 0.41 0.5 0.57 0.48 0.52 0.52 0.53 0.58 0.54 0.53 0.49 0.54 0.6 0.48 0.51 0.59 0.56 0.52
0.07 0.01 0.0 0.22 0.34 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.06 0.06 0.1
0.01 0.0 0.18 0.06 0.26 1.0 0.22 0.16 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.13 0.08 0.07 0.04 0.07 0.06 0.1 0.07 0.09 0.01 0.0 0.01 0.72
0.21 0.06 0.12 0.2 0.2 0.34 1.0 0.09 0.05 0.13 0.06 0.15 0.15 0.1 0.14 0.32 0.28 0.1 0.14 0.2 0.08 0.26 0.18 0.13 0.02 0.03 0.16 0.28
0.08 0.33 0.38 0.5 0.32 0.55 1.0 0.27 0.32 0.51 0.33 0.29 0.46 0.3 0.28 0.48 0.47 0.21 0.24 0.57 0.45 0.45 0.29 0.49 0.21 0.48 0.64 0.67
0.03 0.02 0.07 0.05 0.24 1.0 0.08 0.07 0.08 0.05 0.1 0.23 0.07 0.03 0.03 0.1 0.15 0.13 0.1 0.1 0.07 0.13 0.07 0.13 0.01 0.04 0.02 0.05
0.11 0.12 0.37 0.4 0.54 0.61 1.0 0.25 0.46 0.3 0.42 0.49 0.24 0.27 0.3 0.59 0.52 0.26 0.33 0.56 0.4 0.63 0.43 0.53 0.07 0.34 0.2 0.72
0.36 0.55 0.76 0.41 0.51 0.67 1.0 0.41 0.32 0.86 0.34 0.43 0.75 0.46 0.4 0.34 0.42 0.28 0.89 0.43 0.41 0.41 0.39 0.39 0.5 0.32 0.7 0.49
0.04 0.08 0.17 0.13 0.18 0.22 1.0 0.14 0.23 0.13 0.22 0.14 0.14 0.15 0.14 0.46 0.27 0.08 0.27 0.43 0.22 0.48 0.1 0.44 0.01 0.04 0.24 0.23
0.04 0.03 0.03 0.15 0.41 1.0 0.87 0.1 0.03 0.09 0.04 0.1 0.04 0.06 0.07 0.2 0.15 0.03 0.09 0.15 0.02 0.16 0.05 0.11 0.05 0.86 0.13 0.14
0.0 0.01 0.02 0.14 0.76 1.0 0.41 0.09 0.11 0.34 0.2 0.07 0.08 0.01 0.02 0.27 0.32 0.0 0.04 0.22 0.0 0.13 0.2 0.14 0.0 0.0 0.02 0.12
0.65 0.3 0.15 0.43 0.51 1.0 0.45 0.03 0.01 0.02 0.01 0.22 0.21 0.08 0.08 0.08 0.24 0.06 0.13 0.18 0.07 0.08 0.13 0.07 0.18 0.02 0.25 0.45
0.06 0.05 0.12 0.04 0.29 1.0 0.33 0.07 0.05 0.15 0.02 0.03 0.07 0.04 0.04 0.03 0.03 0.06 0.06 0.05 0.05 0.03 0.08 0.03 0.06 0.12 0.07 0.03
0.01 0.0 0.09 0.04 0.49 1.0 0.44 0.18 0.15 0.38 0.1 0.27 0.31 0.01 0.01 0.04 0.03 0.15 0.04 0.07 0.03 0.03 0.09 0.04 0.0 0.01 0.03 0.07
0.08 0.01 0.01 0.01 0.59 1.0 0.09 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.02
0.63 0.5 0.54 0.11 0.46 0.87 0.49 0.46 0.32 1.0 0.21 0.48 0.52 0.18 0.16 0.24 0.23 0.93 0.41 0.32 0.3 0.25 0.43 0.3 0.45 0.03 0.34 0.17
0.02 0.03 0.03 0.05 0.05 0.02 1.0 0.02 0.01 0.21 0.02 0.03 0.14 0.03 0.02 0.07 0.08 0.06 0.06 0.09 0.09 0.05 0.03 0.06 0.01 0.1 0.02 0.06
0.03 0.05 0.1 0.26 0.31 1.0 0.24 0.19 0.05 0.29 0.08 0.17 0.11 0.05 0.05 0.25 0.18 0.09 0.08 0.1 0.13 0.12 0.09 0.1 0.07 0.03 0.05 0.49
0.0 0.0 0.09 0.19 0.59 0.34 0.95 0.08 0.27 1.0 0.33 0.82 0.36 0.01 0.01 0.04 0.03 0.67 0.06 0.03 0.02 0.01 0.03 0.04 0.0 0.01 0.01 0.2
0.01 0.0 0.06 0.08 0.35 1.0 0.35 0.14 0.04 0.19 0.03 0.13 0.1 0.17 0.1 0.06 0.04 0.11 0.04 0.09 0.06 0.07 0.02 0.06 0.01 0.01 0.28 0.04
0.0 0.0 0.01 0.05 0.25 1.0 0.3 0.1 0.01 0.04 0.01 0.06 0.05 0.03 0.03 0.23 0.24 0.03 0.11 0.15 0.11 0.23 0.1 0.13 0.0 0.0 0.04 0.23
0.19 0.13 0.11 0.29 0.43 1.0 0.18 0.35 0.1 0.3 0.1 0.21 0.19 0.1 0.11 0.19 0.24 0.21 0.06 0.15 0.16 0.18 0.1 0.15 0.53 0.39 0.09 0.72
0.14 0.08 0.11 0.3 0.53 1.0 0.14 0.37 0.13 0.23 0.13 0.24 0.22 0.11 0.13 0.22 0.13 0.21 0.17 0.19 0.17 0.19 0.11 0.16 0.22 0.17 0.16 0.39
0.43 0.91 0.49 0.23 0.21 0.27 0.44 1.0 0.55 1.0 0.45 0.19 0.18 0.58 0.44 0.25 0.2 0.21 0.3 0.33 0.32 0.39 0.42 0.27 0.38 0.22 0.71 0.2
0.19 0.34 0.21 0.02 0.34 1.0 0.17 0.04 0.08 0.12 0.1 0.12 0.03 0.08 0.17 0.21 0.21 0.04 0.39 0.15 0.2 0.16 0.2 0.16 0.05 0.02 0.07 0.06
0.02 0.05 0.09 0.06 0.42 1.0 0.18 0.1 0.1 0.11 0.11 0.06 0.14 0.07 0.06 0.16 0.09 0.08 0.06 0.13 0.09 0.1 0.03 0.11 0.05 0.09 0.05 0.12
0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.08 0.33 0.57 0.79 1.0 0.11 0.06 0.16 0.08 0.42 0.3 0.14 0.12 0.36 0.23 0.14 0.14 0.29 0.1 0.35 0.09 0.23 0.08 0.03 0.13 0.6
0.04 1.0 0.52 0.18 0.17 0.23 0.52 1.0 0.27 0.74 0.23 0.15 0.32 0.27 0.18 0.39 0.24 0.23 0.32 0.27 0.5 0.28 0.29 0.3 0.2 0.15 0.31 0.14
0.25 0.27 0.38 0.32 0.39 0.59 1.0 0.27 0.27 0.35 0.32 0.32 0.37 0.23 0.22 0.49 0.36 0.58 0.59 0.38 0.24 0.43 0.41 0.41 0.09 0.26 0.32 0.61
0.77 0.43 0.18 0.11 0.16 0.22 1.0 0.09 0.06 0.19 0.06 0.08 0.57 0.03 0.04 0.14 0.18 0.09 0.12 0.16 0.13 0.16 0.08 0.15 0.15 0.05 0.07 0.13
0.08 0.18 0.21 0.24 0.15 0.15 1.0 0.11 0.1 0.19 0.08 0.08 0.24 0.18 0.19 0.55 0.45 0.19 0.49 0.47 0.39 0.45 0.21 0.44 0.11 0.19 0.17 0.34
0.0 0.02 0.0 0.02 0.16 1.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.01 0.02 0.04 0.03 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.05 0.04 0.13 0.15 0.14 1.0 0.07 0.02 0.2 0.02 0.06 0.26 0.06 0.05 0.15 0.11 0.23 0.08 0.17 0.03 0.12 0.05 0.11 0.01 0.01 0.06 0.07
0.08 0.1 0.19 0.3 0.11 0.38 1.0 0.23 0.07 0.2 0.08 0.06 0.35 0.22 0.25 0.34 0.27 0.28 0.32 0.42 0.31 0.34 0.27 0.39 0.05 0.31 0.29 0.33
0.26 0.76 0.28 0.35 0.25 0.5 0.35 0.72 0.32 1.0 0.28 0.13 0.43 0.55 0.55 0.21 0.22 0.96 0.17 0.22 0.26 0.22 0.65 0.23 0.19 0.05 0.52 0.31
0.08 0.17 0.17 0.18 0.26 0.35 1.0 0.17 0.24 0.63 0.25 0.18 0.19 0.22 0.24 0.12 0.07 0.16 0.06 0.14 0.07 0.11 0.1 0.1 0.08 0.26 0.19 0.38
0.18 0.46 0.63 0.06 0.35 1.0 0.42 0.85 0.22 0.65 0.16 0.07 0.09 0.07 0.11 0.17 0.26 0.09 0.07 0.14 0.46 0.18 0.49 0.15 0.46 0.11 0.14 0.13
0.01 0.0 0.21 0.26 0.39 1.0 0.47 0.09 0.05 0.24 0.04 0.2 0.51 0.02 0.03 0.17 0.18 0.19 0.14 0.17 0.15 0.16 0.12 0.16 0.02 0.04 0.03 0.38
0.02 0.0 0.05 0.1 0.26 1.0 0.1 0.02 0.03 0.03 0.02 0.16 0.06 0.0 0.01 0.08 0.24 0.02 0.06 0.1 0.13 0.08 0.03 0.06 0.01 0.02 0.01 0.11
0.32 0.03 0.03 0.09 0.21 1.0 0.14 0.03 0.03 0.12 0.04 0.11 0.04 0.01 0.01 0.02 0.12 0.07 0.03 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.09 0.02 0.03 0.03
0.07 0.07 0.48 0.3 0.22 0.21 1.0 0.24 0.24 0.33 0.25 0.18 0.83 0.11 0.11 0.43 0.3 0.42 0.48 0.6 0.6 0.4 0.32 0.44 0.3 0.62 0.26 0.62
0.09 0.55 0.3 0.08 0.33 0.77 0.72 0.16 0.06 1.0 0.09 0.12 0.84 0.3 0.23 0.06 0.06 0.17 0.15 0.1 0.15 0.06 0.07 0.11 0.51 0.01 0.5 0.11
0.03 0.05 0.01 0.01 0.71 1.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.06 0.04 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.02
0.03 0.04 0.17 0.27 0.23 0.79 1.0 0.33 0.09 0.15 0.07 0.09 0.09 0.07 0.08 0.21 0.2 0.06 0.08 0.13 0.11 0.15 0.08 0.15 0.04 0.03 0.13 0.6
0.75 0.69 0.14 0.18 0.45 1.0 0.59 0.19 0.18 0.17 0.21 0.19 0.15 0.12 0.16 0.43 0.41 0.39 0.26 0.41 0.32 0.41 0.24 0.36 0.04 0.06 0.15 0.34
0.22 0.03 0.11 0.21 0.49 1.0 0.17 0.33 0.07 0.14 0.07 0.28 0.13 0.05 0.1 0.23 0.28 0.19 0.12 0.21 0.13 0.23 0.43 0.25 0.03 0.29 0.09 0.35
0.02 0.01 0.08 0.1 0.36 1.0 0.36 0.03 0.02 0.11 0.02 0.12 0.19 0.19 0.29 0.07 0.13 0.06 0.03 0.08 0.08 0.09 0.25 0.07 0.0 0.03 0.14 0.05
0.05 0.02 0.07 0.08 0.37 1.0 0.17 0.09 0.04 0.19 0.04 0.11 0.07 0.04 0.03 0.05 0.16 0.03 0.02 0.06 0.03 0.06 0.08 0.05 0.01 0.11 0.03 0.1
0.15 0.75 0.59 0.44 0.48 0.86 1.0 0.36 0.3 0.45 0.3 0.42 0.88 0.53 0.52 0.78 0.62 0.39 0.5 0.66 0.82 0.61 0.45 0.59 0.65 0.51 0.49 0.67
0.02 0.01 0.14 0.17 0.5 1.0 0.44 0.36 0.11 0.33 0.16 0.08 0.17 0.04 0.05 0.12 0.16 0.15 0.18 0.11 0.17 0.11 0.19 0.13 0.03 0.01 0.04 0.21
0.0 0.33 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.39 0.0 0.21 0.19 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.24 0.0 0.32 0.23 0.0
0.32 0.23 0.14 0.22 0.31 1.0 0.34 0.22 0.12 0.16 0.11 0.19 0.16 0.24 0.22 0.11 0.13 0.07 0.06 0.13 0.12 0.12 0.1 0.11 0.4 0.14 0.35 0.26
0.06 0.1 0.12 0.18 0.21 0.28 1.0 0.11 0.06 0.28 0.07 0.07 0.4 0.08 0.08 0.31 0.23 0.13 0.16 0.24 0.23 0.25 0.07 0.21 0.04 0.14 0.11 0.34
0.04 0.55 0.12 0.2 0.44 0.95 0.3 0.23 0.31 1.0 0.21 0.29 0.14 0.19 0.25 0.13 0.18 0.14 0.11 0.11 0.17 0.17 0.15 0.16 0.22 0.05 0.21 0.68
0.14 0.62 0.47 0.23 0.36 1.0 0.49 0.9 0.45 0.84 0.32 0.22 0.26 0.28 0.25 0.17 0.22 0.48 0.41 0.19 0.26 0.23 0.72 0.18 0.09 0.04 0.35 0.41
0.31 1.0 0.15 0.34 0.38 0.79 0.55 0.37 0.13 0.54 0.37 0.72 0.5 0.24 0.51 0.48 0.31 0.32 0.0 0.0 0.26 0.0 0.67 0.0 0.23 0.83 0.76 0.4
0.25 0.39 0.48 0.07 0.54 1.0 0.93 0.35 0.51 0.48 0.54 0.39 0.44 0.13 0.12 0.33 0.26 0.38 0.13 0.26 0.16 0.36 0.38 0.28 0.01 0.03 0.18 0.08
0.66 0.49 0.51 0.06 0.55 0.93 1.0 0.39 0.41 0.39 0.44 0.39 0.56 0.09 0.09 0.32 0.19 0.4 0.13 0.38 0.12 0.25 0.35 0.16 0.03 0.04 0.17 0.03
0.14 0.33 0.16 0.22 0.53 1.0 0.34 0.46 0.21 0.61 0.25 0.35 0.3 0.14 0.14 0.08 0.19 0.05 0.05 0.09 0.07 0.09 0.14 0.07 0.13 0.06 0.28 0.22
0.24 0.63 0.2 0.46 0.61 1.0 0.44 0.41 0.17 0.53 0.22 0.34 0.48 0.3 0.28 0.18 0.27 0.23 0.22 0.17 0.18 0.17 0.23 0.15 0.26 0.11 0.61 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)