Heatmap: Cluster_15 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.28 0.0 0.09 0.09 0.0 0.17 0.0 0.05 0.67 0.33 0.0 1.0 0.22 0.0 0.22 0.07 0.54 0.71 0.0 0.11 0.0
0.07 0.3 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.22 0.15 0.12 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.56 0.08 0.22 0.0
0.31 0.61 0.85 0.56 0.77 0.95 0.88 0.64 0.61 0.46 0.65 0.61 1.0 0.52 0.63 0.95 0.67 0.56 0.58 0.87 0.98 0.81 0.63 0.84 0.93 0.92 0.46 0.65
0.45 1.0 0.39 0.21 0.64 0.13 0.36 0.14 0.12 0.2 0.11 0.5 0.68 0.18 0.2 0.24 0.14 0.27 0.11 0.25 0.26 0.2 0.16 0.24 0.34 0.08 0.25 0.06
0.12 0.39 0.59 0.28 0.55 0.23 0.37 0.58 0.48 0.37 0.46 0.23 0.43 0.15 0.19 0.87 0.42 0.43 0.38 0.78 1.0 0.62 0.35 0.73 0.17 0.19 0.36 0.28
0.1 0.1 0.55 0.35 0.74 0.33 0.48 0.53 0.28 0.39 0.21 0.36 1.0 0.07 0.09 0.74 0.29 0.37 0.25 0.48 0.48 0.42 0.38 0.39 0.05 0.08 0.17 0.32
0.3 0.29 0.45 0.15 0.48 1.0 0.62 0.2 0.12 0.15 0.13 0.28 0.45 0.24 0.2 0.49 0.71 0.25 0.42 0.34 0.27 0.37 0.23 0.32 0.62 0.12 0.37 0.12
0.47 0.8 0.44 0.57 1.0 0.77 0.42 0.77 0.55 0.67 0.55 0.54 0.48 0.55 0.58 0.63 0.31 0.62 0.32 0.64 0.66 0.51 0.51 0.45 0.44 0.68 0.68 0.46
0.97 0.63 0.45 0.13 0.47 0.23 0.48 0.68 0.61 0.33 0.92 0.23 0.48 0.09 0.03 1.0 0.42 0.38 0.45 0.69 0.89 0.68 0.27 0.66 0.03 0.04 0.04 0.16
0.17 0.44 0.27 0.14 0.37 0.25 0.13 0.61 0.42 0.17 0.91 0.26 0.2 0.07 0.06 1.0 0.67 0.82 0.35 0.49 0.59 0.83 0.52 0.46 0.13 0.05 0.18 0.03
0.36 1.0 0.23 0.28 0.21 0.23 0.17 0.3 0.13 0.18 0.14 0.12 0.28 0.17 0.18 0.24 0.16 0.29 0.11 0.22 0.23 0.15 0.17 0.15 0.25 0.2 0.25 0.16
0.26 1.0 0.73 0.62 0.76 0.71 0.84 0.58 0.82 0.46 0.68 0.63 0.53 0.35 0.44 0.96 0.92 0.33 0.39 0.96 0.67 0.88 0.56 0.87 0.16 0.35 0.46 0.55
0.67 1.0 0.42 0.43 0.59 0.4 0.32 0.49 0.45 0.38 0.41 0.56 0.31 0.17 0.18 0.84 0.72 0.37 0.37 0.65 0.6 0.64 0.28 0.64 0.34 0.29 0.39 0.23
0.2 0.72 0.36 0.33 0.68 0.46 0.4 0.39 0.37 0.34 0.35 0.51 0.37 0.46 0.44 0.47 0.38 0.31 1.0 0.42 0.37 0.41 0.24 0.35 0.72 0.5 0.52 0.38
0.3 0.66 0.4 0.46 0.66 0.77 0.58 0.65 0.82 0.49 1.0 0.68 0.44 0.48 0.53 0.98 0.94 0.5 0.42 0.7 0.67 0.79 0.61 0.74 0.36 0.63 0.49 0.49
0.29 0.94 0.58 0.58 0.3 0.25 0.28 1.0 0.4 0.99 0.63 0.3 0.44 0.52 0.52 0.62 0.67 0.49 0.44 0.67 0.62 0.71 0.56 0.59 0.77 0.14 0.47 0.6
0.38 0.41 0.46 0.16 0.18 0.22 0.26 0.57 0.27 0.41 0.6 0.13 0.17 0.17 0.14 0.92 0.83 0.75 0.44 0.62 0.69 0.77 1.0 0.5 0.14 0.34 0.24 0.23
0.52 1.0 0.83 0.79 0.53 0.75 0.6 0.51 0.54 0.59 0.53 0.43 0.45 0.53 0.54 0.87 0.8 0.46 0.68 0.87 0.86 0.84 0.55 0.89 0.35 0.35 0.64 0.79
0.32 0.49 0.56 0.55 1.0 0.86 0.61 0.56 0.45 0.47 0.44 0.65 0.98 0.51 0.52 0.51 0.55 0.57 0.42 0.51 0.48 0.46 0.66 0.46 0.25 0.6 0.74 0.44
0.5 0.93 0.76 0.55 0.66 0.83 0.78 0.49 0.49 0.43 0.74 0.56 0.33 0.38 0.38 0.7 0.86 0.69 1.0 0.67 0.67 0.75 0.48 0.79 0.55 0.34 0.37 0.68
0.65 0.66 0.35 0.66 0.79 1.0 0.38 0.73 0.26 0.52 0.28 0.4 0.5 0.86 0.77 0.35 0.33 0.35 0.16 0.43 0.38 0.42 0.87 0.33 0.56 0.43 0.84 0.41
0.43 1.0 0.5 0.34 0.55 0.32 0.41 0.3 0.29 0.27 0.31 0.32 0.63 0.21 0.23 0.69 0.54 0.4 0.57 0.54 0.57 0.48 0.28 0.55 0.11 0.07 0.45 0.21
0.42 0.93 0.63 0.74 0.43 0.42 0.64 0.62 0.53 0.45 0.55 0.36 0.46 0.87 0.82 0.53 0.65 0.67 0.31 0.71 0.64 0.63 0.63 0.57 0.25 0.25 1.0 0.57
0.19 0.83 0.95 0.58 0.52 0.51 1.0 0.54 0.52 0.74 0.53 0.5 0.67 0.62 0.6 0.57 0.58 0.67 0.43 0.83 0.8 0.71 0.91 0.69 0.14 0.33 0.77 0.71
0.51 0.65 0.52 0.61 1.0 0.74 0.42 0.5 0.35 0.47 0.37 0.62 0.75 0.15 0.18 0.48 0.44 0.32 0.11 0.43 0.3 0.31 0.37 0.37 0.36 0.72 0.21 0.54
0.44 0.91 0.32 0.63 1.0 0.83 0.38 0.72 0.64 0.5 0.7 0.64 0.59 0.34 0.43 0.78 0.7 0.47 0.27 0.71 0.69 0.65 0.58 0.71 0.53 0.73 0.57 0.48
0.1 0.17 0.11 0.2 0.09 0.19 0.2 0.61 0.29 0.32 0.28 0.16 0.01 0.29 0.29 0.48 0.9 1.0 0.27 0.34 0.33 0.58 0.34 0.35 0.16 0.13 0.27 0.41
0.45 0.97 0.62 0.5 0.34 0.43 0.54 0.53 0.66 0.4 0.72 0.29 0.67 0.48 0.51 0.76 0.81 0.6 0.67 0.72 0.76 0.81 1.0 0.7 0.43 0.42 0.66 0.6
0.51 0.74 0.49 0.55 0.8 0.82 0.4 0.84 0.57 0.68 0.63 0.39 0.57 0.46 0.49 0.5 0.36 0.48 0.38 0.44 0.47 0.39 0.67 0.38 0.47 0.49 1.0 0.4
0.34 0.93 0.37 0.48 1.0 0.75 0.49 0.62 0.36 0.6 0.28 0.53 0.45 0.42 0.47 0.69 0.41 0.45 0.15 0.49 0.44 0.4 0.46 0.36 0.23 0.49 0.78 0.42
0.23 0.45 0.39 0.31 0.58 0.4 0.37 0.72 0.33 0.52 0.31 0.28 0.31 0.13 0.14 1.0 0.39 0.35 0.18 0.49 0.56 0.48 0.31 0.37 0.14 0.15 0.25 0.19
0.11 0.45 0.29 0.12 0.41 0.18 0.13 0.61 0.13 0.38 0.39 0.16 0.22 0.03 0.17 1.0 0.39 0.6 0.1 0.41 0.35 0.47 0.5 0.24 0.05 0.01 0.06 0.04
0.45 0.79 0.49 0.19 0.59 1.0 0.57 0.2 0.13 0.21 0.16 0.3 0.47 0.24 0.21 0.52 0.4 0.29 0.61 0.45 0.39 0.44 0.15 0.44 0.48 0.19 0.31 0.14
0.99 0.78 0.53 0.57 0.64 0.8 0.66 1.0 0.91 0.79 0.94 0.69 0.61 0.79 0.78 0.61 0.42 0.55 0.58 0.51 0.71 0.48 0.68 0.49 0.88 0.75 0.69 0.48
0.62 0.7 0.72 0.42 0.33 0.23 0.71 0.29 0.54 0.24 0.93 0.22 0.52 0.26 0.26 1.0 0.74 0.42 0.66 0.71 0.75 0.63 0.8 0.55 0.46 0.28 0.58 0.34
0.84 0.71 0.28 0.63 0.25 0.26 0.27 0.62 0.69 0.66 0.82 0.28 0.22 0.43 0.5 0.42 0.36 0.31 0.36 0.57 0.36 0.4 1.0 0.42 0.47 0.19 0.82 0.51
0.66 0.89 0.28 0.5 0.25 0.42 0.32 1.0 0.44 0.68 0.46 0.23 0.25 0.45 0.52 0.38 0.35 0.25 0.14 0.34 0.27 0.37 0.61 0.33 0.13 0.18 0.41 0.23
0.14 1.0 0.7 0.25 0.46 0.56 0.67 0.73 0.4 0.59 0.41 0.33 0.4 0.4 0.38 0.35 0.44 0.24 0.19 0.49 0.53 0.53 0.39 0.42 0.86 0.23 0.47 0.28
0.39 0.43 0.56 0.63 0.76 0.71 0.58 1.0 0.61 0.87 0.66 0.63 0.79 0.56 0.63 0.65 0.62 0.61 0.43 0.67 0.61 0.63 0.75 0.61 0.38 0.74 0.54 0.61
0.0 1.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.29 0.17 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.17 0.15 0.54 0.11 0.0 0.37 0.31 0.17 0.42 0.7 0.83 0.08 0.08 0.42 0.0
0.42 0.99 0.48 0.77 0.48 0.31 0.84 0.39 0.48 0.58 0.49 0.49 0.91 0.76 0.63 0.25 0.15 0.49 0.27 0.28 0.26 0.27 0.61 0.27 0.23 0.12 1.0 0.22
0.23 0.15 0.53 0.76 0.53 0.53 0.18 0.27 0.33 0.25 0.27 0.34 0.16 0.22 0.2 0.24 0.28 0.47 0.25 1.0 0.47 0.55 0.5 0.54 0.04 0.16 0.18 0.83
0.23 0.7 0.55 0.71 0.6 0.6 0.54 0.8 0.58 0.7 0.7 0.49 0.99 0.85 0.86 0.58 0.72 0.72 0.26 0.72 0.63 0.7 0.99 0.61 0.35 0.46 1.0 0.83
0.88 1.0 0.53 0.54 0.26 0.37 0.4 0.25 0.13 0.28 0.16 0.23 0.25 0.25 0.3 0.6 0.52 0.23 0.38 0.62 0.46 0.48 0.39 0.52 0.38 0.22 0.55 0.49
0.19 0.85 0.4 0.47 0.37 0.35 0.51 0.4 0.58 0.49 0.5 0.52 0.29 0.46 0.51 0.29 0.22 0.39 0.17 0.46 0.24 0.29 0.8 0.32 0.2 1.0 0.43 0.8
0.38 1.0 0.4 0.6 0.83 0.65 0.48 0.35 0.48 0.45 0.45 0.76 0.23 0.57 0.69 0.68 0.65 0.39 0.47 0.73 0.42 0.69 0.68 0.5 0.52 0.84 0.56 0.99
0.46 0.76 0.43 0.66 0.69 0.55 0.4 0.39 0.43 0.24 0.39 0.62 0.53 0.33 0.47 0.6 0.44 0.49 0.39 0.47 0.38 0.5 1.0 0.49 0.17 0.56 0.47 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)