1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.18 0.73 0.53 0.68 0.78 0.83 0.47 0.53 0.5 0.47 0.52 0.61 0.55 0.7 0.63 0.43 0.44 0.62 0.36 0.48 0.41 0.52 0.57 0.42 0.28 0.64 1.0 0.84
0.09 0.69 0.31 0.21 0.35 0.19 0.15 0.45 0.24 0.25 0.23 0.22 0.26 0.49 0.5 0.2 0.12 0.72 0.25 0.23 0.26 0.2 0.3 0.2 0.92 1.0 0.65 0.14
0.04 0.45 0.34 0.48 0.15 0.08 0.38 0.35 0.5 0.58 0.59 0.14 0.29 0.4 0.45 0.25 0.17 0.19 0.12 0.3 0.25 0.25 0.19 0.19 0.7 1.0 0.35 0.27
0.02 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2 1.0 0.07 0.01
0.11 0.31 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05 0.05 0.07 0.06 0.01 0.01 0.06 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.21 1.0 0.03 0.04
0.21 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.11 0.06 0.0
0.01 0.48 0.0 0.02 0.05 0.03 0.06 0.03 0.02 0.04 0.01 0.06 0.04 0.05 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.12 1.0 0.03 0.01
0.29 0.46 0.05 0.15 0.13 0.46 0.14 0.11 0.06 0.08 0.06 0.14 0.08 0.22 0.26 0.06 0.11 0.23 0.12 0.07 0.05 0.07 0.15 0.07 0.56 1.0 0.13 0.27
0.18 0.65 0.56 0.72 0.81 1.0 0.43 0.67 0.46 0.51 0.51 0.6 0.4 0.83 0.76 0.4 0.42 0.66 0.53 0.47 0.39 0.48 0.31 0.45 0.49 0.9 0.88 0.49
0.18 0.56 1.0 0.8 0.79 0.71 0.77 0.83 0.81 0.5 0.87 0.66 0.65 0.75 0.68 0.52 0.48 0.36 0.52 0.78 0.64 0.69 0.63 0.66 0.35 0.59 0.76 0.5
0.1 0.9 0.22 0.14 0.4 0.39 0.1 0.2 0.11 0.13 0.17 0.41 0.14 0.56 0.46 0.18 0.22 0.16 0.37 0.17 0.18 0.2 0.12 0.22 1.0 0.96 0.46 0.16
0.17 0.73 0.21 0.29 0.28 0.5 0.29 0.23 0.28 0.33 0.22 0.21 0.33 0.39 0.37 0.26 0.24 0.31 0.15 0.3 0.39 0.25 0.3 0.22 0.47 1.0 0.38 0.36
0.25 0.28 0.55 0.44 0.51 0.27 0.31 0.51 0.33 0.29 0.28 0.16 0.23 0.63 0.49 0.38 0.26 0.21 0.25 0.58 0.43 0.45 0.3 0.26 0.54 0.29 1.0 0.33
0.28 0.7 0.18 0.13 0.15 0.2 0.19 0.13 0.16 0.1 0.18 0.16 0.16 0.23 0.24 0.11 0.16 0.11 0.09 0.15 0.1 0.16 0.2 0.14 0.61 1.0 0.19 0.2
0.23 0.64 0.51 0.35 0.69 0.63 0.44 0.57 0.35 0.46 0.38 0.44 0.51 0.47 0.43 0.51 0.34 0.61 0.31 0.45 0.52 0.44 0.3 0.35 1.0 0.65 0.45 0.5
0.11 0.24 0.21 0.48 0.48 1.0 0.31 0.37 0.21 0.33 0.2 0.26 0.31 0.61 0.52 0.28 0.24 0.29 0.18 0.29 0.27 0.22 0.2 0.19 0.25 0.39 0.61 0.49
0.11 0.68 0.13 0.23 0.17 0.15 0.21 0.15 0.2 0.19 0.2 0.2 0.21 0.42 0.41 0.18 0.19 0.15 0.33 0.21 0.17 0.21 0.27 0.18 0.36 1.0 0.36 0.36
0.21 0.93 0.03 0.11 0.02 0.02 0.12 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.07 0.22 0.25 0.05 0.07 0.09 0.03 0.04 0.03 0.05 0.18 0.05 1.0 0.48 0.2 0.14
0.25 1.0 0.09 0.06 0.1 0.11 0.09 0.09 0.09 0.11 0.09 0.12 0.08 0.37 0.35 0.03 0.04 0.08 0.07 0.06 0.02 0.05 0.14 0.04 0.64 0.56 0.21 0.07
0.72 0.81 0.88 0.71 1.0 0.98 0.68 0.6 0.52 0.64 0.52 0.76 0.72 0.78 0.74 0.62 0.72 0.6 0.59 0.64 0.55 0.6 0.72 0.51 0.72 0.88 0.95 0.66
0.35 0.94 0.51 0.6 0.54 0.49 0.39 0.28 0.31 0.31 0.3 0.49 0.35 0.6 0.53 0.32 0.41 0.17 0.92 0.34 0.29 0.38 0.32 0.39 0.93 1.0 0.53 0.54
0.44 0.57 0.05 0.03 0.07 0.08 0.05 0.07 0.08 0.06 0.08 0.09 0.07 0.2 0.2 0.06 0.04 0.59 0.05 0.07 0.07 0.07 0.11 0.06 0.73 1.0 0.1 0.04
0.1 0.77 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.27 0.24 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.7 1.0 0.12 0.01
0.15 1.0 0.28 0.32 0.35 0.34 0.45 0.22 0.33 0.25 0.37 0.44 0.48 0.49 0.46 0.29 0.2 0.14 0.15 0.26 0.3 0.24 0.44 0.22 0.33 0.99 0.38 0.3
0.1 1.0 0.14 0.26 0.1 0.06 0.32 0.09 0.28 0.24 0.22 0.2 0.29 0.33 0.33 0.09 0.09 0.14 0.17 0.13 0.09 0.12 0.29 0.09 0.33 0.59 0.33 0.4
0.24 1.0 0.28 0.48 0.51 0.5 0.22 0.59 0.47 0.68 0.51 0.52 0.3 0.41 0.45 0.3 0.34 0.43 0.13 0.31 0.25 0.33 0.51 0.33 0.68 0.45 0.48 0.6
0.51 0.9 0.57 0.73 0.9 0.94 0.44 0.57 0.44 0.46 0.43 0.67 0.59 0.66 0.69 0.52 0.58 0.53 0.59 0.55 0.48 0.51 0.71 0.43 0.73 1.0 0.91 0.7
0.01 1.0 0.14 0.61 0.12 0.08 0.11 0.17 0.18 0.07 0.23 0.11 0.1 0.73 0.71 0.17 0.21 0.39 0.55 0.28 0.33 0.34 0.15 0.38 0.34 0.85 0.45 0.27
0.14 0.46 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.07 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 1.0 0.16 0.01 0.0
0.07 0.7 0.03 0.07 0.04 0.02 0.07 0.03 0.05 0.16 0.06 0.06 0.07 0.37 0.29 0.01 0.1 0.14 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.07 0.45 1.0 0.18 0.06
0.44 0.73 0.28 0.31 0.32 0.27 0.25 0.21 0.18 0.2 0.18 0.27 0.32 0.37 0.35 0.22 0.22 0.3 0.19 0.21 0.16 0.2 0.25 0.19 0.73 1.0 0.31 0.27
0.23 0.76 0.3 0.29 0.52 0.52 0.33 0.39 0.27 0.38 0.3 0.46 0.36 0.5 0.42 0.23 0.28 0.27 0.12 0.26 0.2 0.28 0.26 0.24 1.0 0.86 0.43 0.26
0.13 0.52 0.45 0.65 0.46 0.48 0.42 0.6 0.22 0.48 0.26 0.17 0.63 0.44 0.47 0.53 0.34 0.4 0.3 0.52 0.48 0.37 0.31 0.33 1.0 0.8 0.72 0.32
0.2 0.44 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.12 0.01 0.01 0.0 0.21 0.19 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 1.0 0.02 0.17 0.03
0.17 0.2 0.48 0.64 0.81 0.96 0.31 0.49 0.33 0.36 0.31 0.55 0.52 1.0 0.82 0.34 0.36 0.3 0.44 0.41 0.35 0.41 0.39 0.3 0.49 0.65 0.81 0.5
0.14 0.63 0.3 0.23 0.42 0.42 0.33 0.22 0.26 0.25 0.27 0.38 0.35 0.5 0.42 0.18 0.2 0.71 0.29 0.25 0.18 0.22 0.21 0.2 1.0 0.63 0.42 0.24
0.35 0.65 0.19 0.24 0.52 0.49 0.25 0.24 0.19 0.18 0.17 0.37 0.3 0.29 0.27 0.29 0.26 0.32 0.27 0.25 0.24 0.23 0.21 0.23 0.66 1.0 0.32 0.18
0.05 1.0 0.38 0.09 0.14 0.15 0.14 0.41 0.17 0.38 0.13 0.19 0.09 0.28 0.39 0.17 0.12 0.15 0.31 0.18 0.2 0.22 0.27 0.22 0.64 0.86 0.15 0.11
0.14 1.0 0.23 0.21 0.25 0.22 0.2 0.28 0.26 0.25 0.32 0.26 0.16 0.41 0.38 0.2 0.2 0.23 0.17 0.23 0.29 0.23 0.33 0.19 0.44 0.63 0.28 0.11
0.26 0.92 0.45 0.71 0.39 0.35 0.45 0.46 0.25 0.48 0.27 0.27 0.48 0.6 0.56 0.58 0.37 0.4 0.23 0.54 0.42 0.42 0.52 0.33 0.78 1.0 0.79 0.52
0.01 0.88 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.03 0.04 0.02 0.04 0.01 0.17 0.26 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.21 0.02 0.34 1.0 0.09 0.01
0.27 1.0 0.45 0.29 0.56 0.65 0.52 0.32 0.45 0.42 0.45 0.55 0.44 0.43 0.4 0.37 0.25 0.22 0.13 0.37 0.34 0.38 0.35 0.3 0.73 1.0 0.35 0.45
0.12 0.27 0.09 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.19 0.18 0.0
0.14 1.0 0.16 0.15 0.11 0.06 0.06 0.05 0.11 0.12 0.11 0.11 0.08 0.07 0.07 0.04 0.03 0.71 0.04 0.08 0.05 0.09 0.05 0.08 0.64 0.76 0.05 0.08
0.08 0.26 0.69 0.75 0.86 0.91 0.69 0.54 0.48 0.63 0.44 0.51 0.63 1.0 0.78 0.7 0.46 0.58 0.72 0.67 0.66 0.6 0.47 0.57 0.42 0.48 0.87 0.68
0.02 1.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.05 0.05 0.01 0.0 0.14 0.19 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.43 0.23 0.05 0.07
0.16 0.88 0.14 0.13 0.17 0.21 0.1 0.14 0.17 0.17 0.14 0.24 0.06 0.55 0.46 0.07 0.06 0.13 0.04 0.13 0.06 0.11 0.16 0.1 0.75 1.0 0.35 0.16
0.06 0.82 0.08 0.27 0.1 0.08 0.17 0.21 0.36 0.19 0.37 0.1 0.07 0.26 0.32 0.18 0.18 0.13 0.2 0.14 0.15 0.17 0.16 0.17 0.45 1.0 0.19 0.44
0.17 0.79 0.33 0.35 0.48 0.43 0.43 0.41 0.39 0.42 0.39 0.45 0.36 0.66 0.68 0.32 0.27 0.47 0.17 0.32 0.27 0.33 0.5 0.32 0.82 1.0 0.66 0.39
0.1 0.93 0.03 0.15 0.05 0.19 0.27 0.15 0.01 0.12 0.01 0.03 0.35 0.03 0.06 0.04 0.08 0.09 0.06 0.06 0.04 0.03 0.04 0.02 1.0 0.58 0.16 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)