Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.01 0.01 0.01 0.24 0.0 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.06 0.04 0.01 0.01 0.02 0.8 0.84 0.26 0.42 0.9 0.7 1.0 0.03 0.79 0.01 0.01 0.02 0.73
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.67 0.0 0.2 0.72 0.65 0.77 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.38
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.57 0.0 1.0 0.71 0.42 0.8 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.56
0.01 0.01 0.1 0.5 0.04 0.04 0.05 0.09 0.03 0.04 0.04 0.05 0.27 0.05 0.06 0.96 1.0 0.72 0.38 0.61 0.76 0.63 0.28 0.71 0.02 0.01 0.03 0.33
0.17 0.28 0.42 0.51 0.34 0.34 0.51 0.33 0.5 0.3 0.48 0.42 0.45 0.7 0.81 0.57 0.53 1.0 0.45 0.62 0.47 0.59 0.54 0.57 0.23 0.45 0.46 0.5
0.01 0.1 0.15 0.44 0.05 0.04 0.13 0.06 0.06 0.13 0.05 0.04 0.09 0.1 0.12 0.68 0.65 0.27 0.76 0.54 0.56 0.57 0.21 0.58 0.07 0.05 0.08 1.0
0.05 0.05 0.25 0.49 0.15 0.35 0.2 0.8 0.59 0.46 0.26 0.09 0.1 0.14 0.13 0.41 0.38 1.0 0.29 0.32 0.61 0.4 0.28 0.32 0.07 0.17 0.17 0.36
0.06 0.23 0.13 0.67 0.12 0.15 0.18 0.26 0.08 0.26 0.08 0.07 0.33 0.28 0.26 0.86 1.0 0.3 0.52 0.61 0.73 0.6 0.1 0.6 0.52 0.03 0.39 0.8
0.0 0.02 0.3 0.41 0.07 0.07 0.09 0.69 0.07 0.29 0.03 0.0 0.3 0.02 0.1 0.48 0.0 0.0 1.0 0.53 0.41 0.63 0.1 0.4 0.06 0.56 0.08 0.87
0.02 0.11 0.37 0.16 0.07 0.13 0.15 0.35 0.21 0.49 0.25 0.08 0.09 0.07 0.08 0.46 0.44 0.11 0.14 0.49 0.54 0.49 0.76 0.46 0.06 0.06 0.07 1.0
0.01 0.04 0.07 1.0 0.37 0.56 0.19 0.44 0.33 0.25 0.46 0.28 0.35 0.3 0.38 0.47 0.34 0.91 0.64 0.42 0.5 0.39 0.12 0.43 0.22 0.13 0.15 0.22
0.11 0.34 0.52 0.53 0.35 0.3 0.59 0.44 0.32 0.37 0.4 0.38 0.49 0.61 0.59 0.55 0.57 1.0 0.29 0.67 0.55 0.67 0.41 0.57 0.27 0.3 0.68 0.53
0.03 0.04 0.27 0.38 0.19 0.08 0.28 0.47 0.19 0.36 0.18 0.1 0.32 0.06 0.08 1.0 0.47 0.49 0.5 0.61 0.8 0.53 0.35 0.52 0.01 0.02 0.16 0.58
0.15 0.51 0.49 0.38 0.07 0.06 0.49 0.35 0.26 0.21 0.23 0.04 0.59 0.19 0.2 0.83 0.69 0.42 0.83 1.0 0.9 0.71 0.33 0.82 0.31 0.36 0.29 0.34
0.01 0.01 0.1 0.12 0.02 0.13 0.15 0.15 0.0 0.29 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.44 0.49 0.05 0.29 0.4 0.74 0.35 0.05 0.38 0.06 0.01 0.06 1.0
0.01 0.1 0.71 0.48 0.58 0.35 0.64 0.23 0.5 0.46 0.57 0.86 0.84 0.71 0.64 0.22 0.32 0.27 0.36 0.29 0.2 0.28 0.25 0.19 0.06 0.76 0.48 1.0
0.13 0.38 0.48 0.36 0.32 0.32 0.4 0.25 0.26 0.17 0.23 0.27 0.41 0.38 0.42 0.37 0.38 0.54 0.3 0.38 0.3 0.37 0.56 0.32 0.52 1.0 0.35 0.51
1.0 0.12 0.15 0.21 0.11 0.11 0.49 0.05 0.08 0.13 0.09 0.22 0.36 0.06 0.08 0.14 0.14 0.11 0.05 0.12 0.07 0.11 0.13 0.08 0.03 0.27 0.1 0.65
0.01 0.02 0.88 0.92 0.47 0.98 0.11 0.24 0.05 0.43 0.02 0.23 0.24 0.05 0.04 1.0 0.21 0.09 0.65 0.34 0.93 0.69 0.06 0.37 0.03 0.03 0.05 0.9
0.0 0.0 0.15 0.55 0.08 0.04 0.08 0.32 0.17 0.35 0.22 0.07 0.13 0.06 0.08 0.67 0.22 1.0 0.42 0.53 0.62 0.56 0.18 0.45 0.02 0.05 0.07 0.48
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.55 0.0 0.52 1.0 0.63 0.77 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.66
1.0 0.38 0.11 0.36 0.16 0.24 0.25 0.16 0.14 0.14 0.14 0.1 0.22 0.15 0.19 0.25 0.28 0.28 0.29 0.25 0.22 0.19 0.19 0.19 0.25 0.2 0.17 0.42
0.17 0.17 0.3 0.42 0.14 0.14 0.32 0.51 0.15 0.31 0.24 0.13 0.35 0.42 0.41 0.38 0.34 1.0 0.55 0.64 0.41 0.36 0.42 0.38 0.07 0.15 0.69 0.76
0.14 0.14 0.57 0.63 0.48 0.51 0.53 0.39 0.36 0.32 0.41 0.41 0.52 0.37 0.34 0.65 0.49 1.0 0.8 0.7 0.74 0.66 0.29 0.72 0.18 0.35 0.39 0.43
0.02 0.05 0.29 0.58 0.49 0.59 0.57 0.16 0.09 0.12 0.09 0.29 0.31 0.05 0.04 1.0 0.56 0.53 0.99 0.85 0.81 0.83 0.12 0.66 0.03 0.09 0.09 0.44
0.03 0.0 0.82 0.85 0.16 0.07 0.07 0.18 0.16 0.04 0.09 0.1 0.08 0.07 0.05 0.07 0.14 0.13 0.45 0.82 0.24 1.0 0.73 0.45 0.02 0.51 0.21 0.2
0.06 0.26 0.35 0.76 0.49 0.42 0.36 0.44 0.44 0.29 0.43 0.38 0.5 0.4 0.39 0.65 0.52 1.0 0.78 0.59 0.61 0.54 0.61 0.53 0.24 0.54 0.51 0.66
0.06 0.01 0.57 0.93 0.72 0.87 0.5 0.28 0.09 0.2 0.08 0.15 1.0 0.04 0.07 0.33 0.24 0.48 0.1 0.32 0.25 0.33 0.4 0.26 0.02 0.02 0.42 0.65
0.01 0.02 0.13 0.48 0.08 0.07 0.24 0.34 0.15 0.23 0.17 0.07 0.11 0.05 0.05 0.49 0.43 0.57 0.99 0.53 1.0 0.52 0.12 0.5 0.02 0.03 0.05 0.61
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.18 0.0 0.4 0.24 1.0 0.5 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.88
0.0 0.0 0.02 0.14 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.55 0.74 0.0 1.0 0.73 0.58 0.87 0.01 0.77 0.0 0.02 0.01 0.4
0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.76 0.0 0.3 0.94 0.89 1.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.64
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 0.0 0.48 0.83 0.83 0.92 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.87
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.63 0.0 0.32 0.69 0.56 0.68 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.79 0.0 1.0 0.99 0.51 0.74 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.88
0.11 0.06 0.44 0.29 0.1 0.12 0.42 0.22 0.25 0.58 0.24 0.12 0.25 0.32 0.27 0.83 0.75 0.93 0.42 1.0 0.77 0.93 0.2 0.87 0.12 0.14 0.46 0.61
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.77 0.0 0.79 1.0 0.86 0.82 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.46
0.07 0.07 0.2 0.64 0.18 0.1 0.33 0.11 0.25 0.16 0.29 0.14 0.36 0.13 0.14 0.71 0.52 1.0 0.73 0.63 0.66 0.63 0.27 0.64 0.08 0.14 0.13 0.44
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.82 0.0 1.0 0.86 0.75 0.83 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.63
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 1.0 0.0 0.25 0.68 0.53 0.74 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.51
0.1 0.57 0.2 0.42 0.17 0.14 0.37 0.23 0.24 0.16 0.26 0.2 0.32 0.35 0.37 1.0 0.95 0.27 0.51 0.9 0.95 0.92 0.58 0.81 0.33 0.51 0.43 0.36
0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.73 0.0 0.34 0.9 0.8 0.9 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.91 0.0 0.91 1.0 0.35 0.53 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.82
0.3 0.24 0.45 0.82 0.53 0.32 0.65 0.31 0.76 0.32 0.59 0.71 0.93 0.41 0.37 0.88 0.5 0.46 0.28 0.97 1.0 0.75 0.55 0.93 0.16 0.21 0.45 0.47
0.12 0.02 0.05 0.51 0.04 0.02 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.02 0.03 0.02 1.0 0.59 0.14 0.61 0.85 0.91 0.72 0.01 0.91 0.01 0.02 0.03 0.49
0.02 0.02 0.17 0.55 0.19 0.15 0.27 0.11 0.16 0.29 0.19 0.19 0.28 0.1 0.09 0.95 0.52 0.77 0.45 1.0 0.78 0.86 0.07 0.89 0.05 0.04 0.12 0.47
0.06 0.19 0.42 0.26 0.12 0.22 0.59 0.2 0.16 0.07 0.18 0.13 0.4 0.11 0.12 0.51 0.54 0.43 0.61 0.59 0.62 0.55 0.29 0.39 0.18 0.14 0.15 1.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 1.0 0.1 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.52
0.02 0.08 0.65 0.36 0.53 0.56 0.58 0.39 0.37 0.65 0.41 0.5 0.49 0.04 0.04 0.76 0.64 0.77 0.39 0.8 0.88 0.73 0.38 0.72 0.02 0.59 0.06 1.0
0.02 0.16 0.64 0.35 0.19 0.35 0.64 0.34 0.19 0.35 0.18 0.14 0.39 0.15 0.16 0.51 0.47 1.0 0.35 0.57 0.79 0.6 0.69 0.55 0.1 0.22 0.15 0.46
0.0 0.0 0.16 0.11 0.0 0.0 0.29 0.01 0.0 0.16 0.0 0.0 0.19 0.01 0.01 0.33 0.63 0.29 0.17 0.31 0.31 0.26 0.03 0.38 0.0 0.0 0.01 1.0
0.07 0.08 0.32 0.65 0.5 0.5 0.39 1.0 0.49 0.93 0.58 0.34 0.45 0.08 0.1 0.37 0.32 0.33 0.2 0.43 0.26 0.38 0.19 0.39 0.04 0.07 0.11 0.73
0.59 0.15 0.31 0.43 0.39 0.42 0.58 0.2 0.26 0.47 0.36 0.31 0.88 0.23 0.24 0.59 0.49 0.45 0.55 0.65 0.51 0.53 0.3 0.55 0.18 0.78 0.27 1.0
0.06 0.13 0.24 0.74 0.06 0.06 0.21 0.16 0.14 0.29 0.14 0.04 0.14 0.08 0.07 0.33 0.27 0.19 0.25 0.44 0.33 0.32 0.09 0.35 0.15 0.06 0.15 1.0
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.72 0.0 0.78 0.98 0.99 0.86 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.02 0.31 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.62 0.44 0.0 0.9 0.69 1.0 0.67 0.0 0.53 0.01 0.03 0.01 0.7
0.0 0.01 0.09 0.76 0.05 0.07 0.08 0.15 0.17 0.1 0.16 0.05 0.15 0.02 0.05 0.78 0.59 1.0 0.89 0.67 0.72 0.64 0.49 0.77 0.03 0.02 0.04 0.99
0.08 0.1 0.91 1.0 0.34 0.27 0.51 0.2 0.31 0.17 0.27 0.38 0.4 0.16 0.17 0.71 0.97 0.28 0.72 0.78 0.53 0.93 0.32 0.94 0.12 0.14 0.19 0.94
0.03 0.02 1.0 0.83 0.31 0.2 0.51 0.08 0.07 0.11 0.06 0.17 0.57 0.02 0.03 0.47 0.29 0.4 0.9 0.53 0.34 0.55 0.32 0.51 0.01 0.02 0.07 0.83
0.01 0.06 0.14 0.29 0.12 0.1 0.12 0.14 0.1 0.13 0.11 0.06 0.13 0.12 0.12 0.45 0.31 0.65 1.0 0.43 0.55 0.39 0.14 0.41 0.03 0.14 0.14 0.3
0.15 0.46 0.15 0.22 0.43 0.24 0.45 0.11 0.18 0.13 0.6 0.41 0.24 0.46 0.36 0.91 1.0 0.89 0.39 0.65 0.72 0.44 0.05 0.51 0.0 0.59 0.29 0.19
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.78 0.0 0.29 0.82 0.64 1.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.38
0.01 0.16 0.18 0.38 0.13 0.05 0.16 0.07 0.19 0.05 0.23 0.15 0.08 0.19 0.2 0.89 0.79 0.35 0.45 0.87 0.87 0.92 0.17 1.0 0.04 0.12 0.19 0.43
0.0 0.13 0.09 0.33 0.06 0.03 0.08 0.04 0.11 0.04 0.15 0.09 0.05 0.16 0.16 0.98 0.78 0.47 0.52 1.0 0.81 0.89 0.12 0.96 0.03 0.09 0.14 0.84
0.04 0.07 0.35 0.23 0.25 0.12 0.48 0.19 0.09 0.15 0.14 0.12 0.42 0.05 0.07 0.88 0.57 0.16 1.0 0.59 0.91 0.61 0.26 0.63 0.03 0.09 0.14 0.31
0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.93 0.0 0.65 1.0 0.8 0.97 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.59
0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.37 0.0 0.34 0.96 0.31 0.58 0.06 0.29 0.0 0.0 0.0 0.49
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.96 0.96 0.43 0.26 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)