Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
1.0 1.0 0.14 0.02 0.05 0.06 0.06 0.31 0.17 0.16 0.17 0.1 0.02 0.22 0.29 0.05 0.13 0.04 0.05 0.12 0.07 0.1 0.2 0.06 0.23 0.03 0.33 0.01
0.34 1.0 0.19 0.05 0.19 0.34 0.11 0.17 0.1 0.24 0.21 0.14 0.2 0.09 0.08 0.15 0.06 0.24 0.13 0.16 0.04 0.07 0.15 0.06 0.03 0.03 0.17 0.11
0.29 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.1 0.03 0.06 0.01 0.01 0.16 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.12 0.04
0.77 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.33 0.25 0.04 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.05 0.05 0.21 0.02 0.18 0.0
0.7 1.0 0.09 0.04 0.07 0.06 0.08 0.13 0.17 0.15 0.2 0.06 0.06 0.16 0.17 0.05 0.05 0.06 0.05 0.08 0.07 0.06 0.16 0.07 0.31 0.39 0.17 0.04
0.31 1.0 0.16 0.13 0.21 0.3 0.15 0.21 0.31 0.17 0.32 0.22 0.3 0.34 0.36 0.15 0.09 0.13 0.08 0.15 0.11 0.2 0.24 0.13 0.27 0.14 0.26 0.16
0.01 1.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.08 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.0 0.05 0.04
0.2 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.07 0.29 0.03 0.0
0.03 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.05 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01
0.16 1.0 0.18 0.02 0.02 0.01 0.1 0.06 0.04 0.07 0.03 0.0 0.06 0.11 0.13 0.02 0.03 0.06 0.02 0.04 0.1 0.04 0.05 0.08 0.43 0.09 0.09 0.13
0.43 1.0 0.03 0.01 0.07 0.15 0.04 0.55 0.49 0.21 0.37 0.05 0.01 0.18 0.12 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.18 0.0
0.27 1.0 0.02 0.07 0.03 0.02 0.01 0.08 0.0 0.12 0.01 0.02 0.0 0.05 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.16 0.04 0.02 0.05 0.08 0.16 0.04 0.06
0.15 1.0 0.04 0.01 0.02 0.03 0.03 0.05 0.07 0.04 0.07 0.03 0.03 0.04 0.04 0.01 0.01 0.07 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.03 0.02 0.07 0.04 0.01
0.3 1.0 0.11 0.03 0.09 0.08 0.15 0.26 0.04 0.48 0.03 0.03 0.04 0.19 0.17 0.02 0.03 0.02 0.1 0.05 0.02 0.02 0.78 0.02 0.07 0.24 0.31 0.06
0.15 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.02 0.03 0.0
1.0 0.65 0.65 0.22 0.21 0.24 0.45 0.27 0.37 0.29 0.39 0.17 0.39 0.25 0.26 0.34 0.27 0.09 0.17 0.34 0.43 0.32 0.3 0.33 0.4 0.18 0.26 0.18
0.04 1.0 0.04 0.01 0.05 0.04 0.08 0.04 0.04 0.04 0.05 0.03 0.04 0.09 0.07 0.02 0.03 0.16 0.06 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.2 0.06 0.15 0.01
0.42 1.0 0.13 0.09 0.05 0.09 0.13 0.09 0.08 0.07 0.07 0.04 0.11 0.11 0.1 0.08 0.06 0.03 0.06 0.08 0.1 0.07 0.08 0.07 0.12 0.08 0.14 0.08
0.42 0.8 0.14 0.13 0.37 1.0 0.17 0.53 0.3 0.15 0.35 0.14 0.09 0.36 0.42 0.21 0.17 0.07 0.14 0.22 0.28 0.28 0.16 0.2 0.47 0.59 0.4 0.11
0.63 1.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.4 0.0 0.02 0.0
1.0 0.57 0.33 0.06 0.21 0.14 0.2 0.35 0.44 0.22 0.45 0.1 0.09 0.16 0.17 0.25 0.1 0.14 0.18 0.28 0.29 0.24 0.25 0.24 0.36 0.06 0.28 0.04
0.12 1.0 0.18 0.1 0.1 0.09 0.1 0.09 0.12 0.09 0.14 0.1 0.08 0.09 0.08 0.12 0.1 0.05 0.11 0.1 0.11 0.11 0.05 0.11 0.16 0.08 0.07 0.07
0.42 1.0 0.09 0.1 0.13 0.12 0.09 0.08 0.1 0.1 0.09 0.12 0.08 0.1 0.1 0.09 0.09 0.07 0.05 0.11 0.08 0.1 0.06 0.08 0.15 0.16 0.09 0.11
0.81 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.01 0.06
0.57 1.0 0.06 0.06 0.04 0.03 0.08 0.03 0.07 0.03 0.06 0.06 0.06 0.04 0.05 0.04 0.05 0.03 0.06 0.06 0.05 0.06 0.04 0.06 0.09 0.06 0.05 0.07
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.01 0.01 0.0
0.21 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.01 0.0
0.03 1.0 0.03 0.06 0.02 0.03 0.04 0.14 0.05 0.04 0.04 0.01 0.02 0.05 0.05 0.04 0.03 0.02 0.09 0.04 0.04 0.04 0.02 0.04 0.07 0.01 0.04 0.01
0.08 1.0 0.05 0.01 0.05 0.02 0.02 0.06 0.16 0.05 0.18 0.06 0.05 0.12 0.16 0.05 0.05 0.05 0.05 0.07 0.08 0.07 0.05 0.05 0.08 0.09 0.14 0.02
0.89 1.0 0.28 0.12 0.22 0.16 0.13 0.44 0.38 0.37 0.31 0.17 0.12 0.22 0.28 0.17 0.15 0.14 0.12 0.25 0.2 0.23 0.45 0.21 0.38 0.19 0.39 0.1
0.51 1.0 0.08 0.05 0.21 0.2 0.09 0.25 0.18 0.17 0.16 0.15 0.09 0.13 0.22 0.05 0.05 0.05 0.03 0.07 0.06 0.07 0.28 0.06 0.17 0.46 0.13 0.05
0.14 1.0 0.09 0.11 0.17 0.22 0.12 0.26 0.11 0.17 0.09 0.13 0.1 0.07 0.14 0.11 0.14 0.05 0.1 0.08 0.05 0.07 0.18 0.05 0.16 0.03 0.09 0.09
1.0 0.99 0.18 0.14 0.27 0.15 0.14 0.34 0.06 0.22 0.03 0.07 0.14 0.09 0.11 0.14 0.07 0.05 0.05 0.06 0.07 0.07 0.06 0.05 0.12 0.04 0.32 0.04
0.07 1.0 0.03 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.08 0.07 0.04 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.18 0.05 0.19 0.01
0.24 1.0 0.13 0.07 0.07 0.05 0.09 0.04 0.04 0.05 0.05 0.06 0.1 0.13 0.09 0.08 0.11 0.06 0.05 0.1 0.08 0.1 0.09 0.06 0.05 0.03 0.07 0.05
0.25 1.0 0.02 0.04 0.03 0.12 0.02 0.06 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.35 0.26 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 0.1 0.02 0.48 0.02
0.01 1.0 0.08 0.03 0.03 0.03 0.06 0.03 0.04 0.04 0.03 0.03 0.07 0.1 0.08 0.05 0.05 0.18 0.05 0.07 0.05 0.05 0.03 0.05 0.05 0.04 0.08 0.04
0.47 1.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03 0.03 0.07 0.02 0.05 0.04 0.05 0.09 0.1 0.01 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.08 0.01 0.14 0.08 0.06 0.02
0.08 1.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.15 0.01 0.1 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
0.09 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.05 0.01 0.0
0.15 1.0 0.28 0.06 0.18 0.09 0.2 0.12 0.13 0.11 0.13 0.17 0.15 0.42 0.4 0.08 0.06 0.12 0.06 0.15 0.04 0.11 0.27 0.1 0.14 0.19 0.39 0.09
0.48 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0
0.08 1.0 0.2 0.15 0.19 0.27 0.21 0.16 0.15 0.19 0.15 0.21 0.19 0.25 0.24 0.11 0.15 0.23 0.17 0.14 0.1 0.13 0.19 0.13 0.29 0.28 0.24 0.18
0.06 1.0 0.1 0.1 0.09 0.06 0.09 0.08 0.16 0.36 0.18 0.11 0.11 0.19 0.19 0.08 0.12 0.08 0.06 0.12 0.1 0.1 0.1 0.09 0.09 0.13 0.21 0.11
0.62 1.0 0.09 0.19 0.21 0.3 0.13 0.04 0.19 0.07 0.15 0.23 0.1 0.16 0.13 0.14 0.14 0.17 0.06 0.17 0.09 0.16 0.25 0.15 0.1 0.53 0.08 0.26
0.66 1.0 0.03 0.07 0.09 0.15 0.05 0.02 0.13 0.03 0.09 0.09 0.05 0.08 0.06 0.04 0.03 0.05 0.03 0.04 0.01 0.03 0.03 0.04 0.06 0.24 0.02 0.07
0.77 1.0 0.41 0.21 0.43 0.52 0.3 0.47 0.58 0.41 0.57 0.35 0.31 0.3 0.3 0.28 0.25 0.15 0.13 0.33 0.27 0.31 0.34 0.3 0.33 0.2 0.4 0.18
0.31 1.0 0.0 0.01 0.36 0.6 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.39 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.13 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.06 0.02
0.08 1.0 0.09 0.03 0.03 0.02 0.08 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.06 0.23 0.22 0.05 0.04 0.02 0.03 0.05 0.05 0.04 0.02 0.05 0.19 0.15 0.2 0.02
0.13 1.0 0.07 0.04 0.07 0.3 0.06 0.14 0.04 0.07 0.05 0.05 0.09 0.1 0.12 0.07 0.21 0.25 0.02 0.06 0.06 0.07 0.25 0.09 0.19 0.0 0.2 0.04
1.0 1.0 0.39 0.23 0.38 0.3 0.2 0.28 0.22 0.18 0.2 0.21 0.2 0.13 0.2 0.17 0.19 0.17 0.09 0.29 0.25 0.28 0.34 0.2 0.21 0.35 0.21 0.19
0.38 1.0 0.1 0.04 0.14 0.25 0.08 0.25 0.24 0.14 0.39 0.11 0.06 0.2 0.31 0.05 0.05 0.1 0.07 0.08 0.07 0.09 0.41 0.08 0.02 0.04 0.28 0.1
0.12 1.0 0.31 0.18 0.69 0.58 0.2 0.51 0.41 0.37 0.46 0.45 0.08 0.47 0.61 0.21 0.18 0.09 0.1 0.19 0.24 0.2 0.54 0.19 0.23 0.06 0.36 0.08
0.08 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.3 1.0 0.03 0.02 0.04 0.04 0.04 0.11 0.12 0.1 0.17 0.05 0.07 0.12 0.12 0.03 0.04 0.06 0.03 0.04 0.02 0.03 0.07 0.03 0.34 0.02 0.07 0.02
1.0 0.45 0.08 0.02 0.06 0.1 0.11 0.53 0.26 0.09 0.29 0.04 0.05 0.2 0.18 0.1 0.09 0.1 0.06 0.11 0.12 0.09 0.06 0.09 0.09 0.1 0.21 0.05
0.19 1.0 0.08 0.02 0.03 0.03 0.04 0.06 0.09 0.08 0.06 0.02 0.01 0.15 0.13 0.03 0.02 0.02 0.02 0.05 0.05 0.04 0.05 0.03 0.2 0.07 0.21 0.01
0.91 1.0 0.13 0.14 0.22 0.21 0.13 0.11 0.11 0.15 0.12 0.19 0.19 0.14 0.13 0.13 0.14 0.14 0.17 0.13 0.09 0.12 0.07 0.1 0.27 0.17 0.21 0.09
0.5 1.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.07 0.02 0.05
0.36 1.0 0.11 0.09 0.05 0.04 0.11 0.03 0.05 0.03 0.05 0.05 0.07 0.08 0.11 0.1 0.1 0.07 0.07 0.11 0.12 0.1 0.14 0.1 0.1 0.09 0.13 0.11
0.58 1.0 0.05 0.07 0.11 0.22 0.06 0.11 0.09 0.1 0.09 0.13 0.03 0.17 0.21 0.08 0.1 0.12 0.03 0.1 0.08 0.12 0.16 0.07 0.34 0.21 0.19 0.07
0.57 1.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.02 0.0
1.0 0.53 0.25 0.13 0.2 0.11 0.24 0.42 0.41 0.19 0.61 0.17 0.18 0.18 0.14 0.35 0.18 0.16 0.12 0.26 0.29 0.24 0.16 0.21 0.08 0.02 0.26 0.06
1.0 0.62 0.23 0.14 0.16 0.08 0.2 0.39 0.34 0.18 0.51 0.13 0.11 0.22 0.17 0.28 0.17 0.2 0.15 0.22 0.22 0.21 0.17 0.17 0.1 0.02 0.32 0.08
0.14 1.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.05 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.23 0.01 0.04 0.01
0.12 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.0 0.01 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.26 0.02 0.04 0.01
0.11 1.0 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.03 0.07 0.03 0.05 0.01 0.01 0.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.11 0.0 0.32 0.44 0.12 0.0
0.29 1.0 0.1 0.11 0.16 0.21 0.1 0.1 0.1 0.12 0.13 0.16 0.09 0.19 0.25 0.1 0.26 0.1 0.04 0.18 0.08 0.2 0.12 0.08 0.25 0.23 0.32 0.1
0.5 1.0 0.04 0.06 0.08 0.18 0.03 0.1 0.07 0.09 0.05 0.05 0.0 0.02 0.04 0.14 0.1 0.04 0.14 0.1 0.16 0.13 0.13 0.11 0.04 0.12 0.02 0.04
0.62 1.0 0.08 0.08 0.1 0.07 0.07 0.1 0.07 0.07 0.08 0.06 0.08 0.14 0.13 0.15 0.09 0.07 0.07 0.13 0.16 0.09 0.07 0.1 0.36 0.13 0.2 0.05
0.51 1.0 0.12 0.09 0.27 0.27 0.11 0.16 0.08 0.06 0.06 0.07 0.09 0.16 0.14 0.06 0.06 0.06 0.07 0.11 0.06 0.08 0.12 0.06 0.16 0.06 0.35 0.11
0.45 1.0 0.03 0.03 0.04 0.01 0.05 0.01 0.04 0.01 0.04 0.08 0.02 0.08 0.08 0.11 0.07 0.02 0.07 0.12 0.09 0.11 0.03 0.16 0.0 0.0 0.02 0.02
0.53 1.0 0.02 0.04 0.06 0.02 0.06 0.02 0.06 0.02 0.06 0.1 0.03 0.08 0.08 0.19 0.11 0.1 0.49 0.2 0.18 0.18 0.03 0.25 0.0 0.0 0.02 0.03
0.33 1.0 0.18 0.02 0.17 0.19 0.03 0.14 0.1 0.16 0.32 0.08 0.02 0.06 0.1 0.09 0.09 0.16 0.07 0.04 0.04 0.05 0.08 0.06 0.28 0.0 0.04 0.0
0.66 1.0 0.03 0.1 0.16 0.14 0.04 0.06 0.1 0.07 0.08 0.12 0.05 0.07 0.11 0.06 0.06 0.08 0.04 0.07 0.05 0.05 0.21 0.06 0.07 0.06 0.1 0.09
0.04 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.07 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.14 0.07 0.0
0.33 1.0 0.09 0.11 0.04 0.12 0.07 0.07 0.08 0.06 0.09 0.08 0.07 0.08 0.11 0.22 0.23 0.16 0.2 0.18 0.14 0.16 0.16 0.18 0.07 0.07 0.07 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)