Heatmap: Cluster_121 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.43 1.0 0.32 0.23 0.39 0.37 0.49 0.31 0.48 0.37 0.44 0.43 0.45 0.75 0.56 0.23 0.23 0.27 0.16 0.28 0.17 0.22 0.44 0.2 0.41 0.51 0.62 0.22
0.65 0.66 0.05 0.17 0.07 0.08 0.07 0.04 0.05 0.08 0.04 0.07 0.2 1.0 0.75 0.42 0.33 0.21 0.47 0.55 0.56 0.61 0.15 0.5 0.46 0.63 0.68 0.21
0.02 1.0 0.02 0.02 0.03 0.07 0.03 0.13 0.11 0.05 0.1 0.0 0.03 0.5 0.5 0.12 0.1 0.07 0.06 0.06 0.06 0.07 0.13 0.12 0.71 0.07 0.14 0.0
0.23 1.0 0.18 0.14 0.23 0.39 0.25 0.17 0.23 0.15 0.22 0.2 0.18 0.57 0.48 0.17 0.14 0.2 0.27 0.23 0.24 0.2 0.26 0.21 0.52 0.68 0.54 0.22
0.4 1.0 0.49 0.39 0.47 0.55 0.5 0.33 0.35 0.37 0.37 0.46 0.48 0.66 0.55 0.39 0.37 0.2 0.42 0.41 0.42 0.37 0.29 0.34 0.79 0.86 0.67 0.32
0.54 0.68 0.28 0.17 0.33 0.3 0.23 0.26 0.18 0.19 0.17 0.18 0.24 0.38 0.38 0.2 0.2 0.12 0.16 0.21 0.22 0.18 0.18 0.18 1.0 0.66 0.59 0.16
0.19 1.0 0.22 0.25 0.29 0.29 0.24 0.31 0.37 0.25 0.46 0.37 0.23 0.59 0.7 0.31 0.25 0.37 0.34 0.31 0.27 0.31 0.55 0.35 0.52 0.53 0.29 0.33
0.1 0.88 0.4 0.1 0.29 0.25 0.38 0.26 0.3 0.24 0.25 0.25 0.28 0.33 0.29 0.32 0.18 0.28 0.32 0.6 0.3 0.32 0.2 0.32 0.66 1.0 0.43 0.13
0.77 1.0 0.32 0.3 0.14 0.14 0.28 0.29 0.27 0.37 0.22 0.08 0.27 0.66 0.69 0.27 0.16 0.12 0.34 0.29 0.31 0.23 0.22 0.25 0.96 0.42 0.54 0.23
0.31 0.94 0.27 0.37 0.31 0.38 0.32 0.17 0.23 0.23 0.22 0.33 0.26 0.47 0.48 0.29 0.19 0.17 0.22 0.31 0.34 0.26 0.4 0.26 1.0 1.0 0.33 0.32
0.01 1.0 0.65 0.01 0.44 0.19 0.52 0.25 0.32 0.4 0.32 0.57 0.57 0.59 0.63 0.01 0.02 0.21 0.01 0.02 0.01 0.03 0.21 0.03 0.33 0.2 0.32 0.02
0.28 0.63 0.04 0.05 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 0.4 0.35 0.04 0.02 0.07 0.05 0.06 0.04 0.05 0.01 0.04 1.0 0.38 0.39 0.05
0.27 1.0 0.32 0.32 0.19 0.3 0.4 0.33 0.27 0.35 0.3 0.17 0.29 0.46 0.37 0.29 0.27 0.54 0.32 0.34 0.38 0.35 0.33 0.38 0.52 0.22 0.31 0.29
0.48 0.66 0.42 0.31 0.81 0.59 0.58 0.51 0.74 0.72 0.85 0.98 0.66 1.0 1.0 0.58 0.46 0.47 0.32 0.55 0.44 0.56 0.53 0.57 0.32 0.6 0.65 0.36
0.46 0.57 0.43 0.33 0.35 0.48 0.37 0.37 0.43 0.31 0.49 0.34 0.29 0.37 0.37 0.33 0.35 0.36 0.5 0.4 0.41 0.33 0.34 0.37 1.0 0.35 0.35 0.37
0.11 0.99 0.27 0.34 0.68 0.72 0.15 0.4 0.23 0.21 0.32 0.75 0.2 0.49 0.46 0.22 0.28 0.21 0.24 0.3 0.27 0.37 0.19 0.38 1.0 0.84 0.43 0.47
0.39 1.0 0.09 0.01 0.03 0.02 0.07 0.02 0.04 0.02 0.04 0.03 0.04 0.52 0.44 0.03 0.02 0.03 0.03 0.05 0.04 0.05 0.03 0.05 0.47 0.35 0.39 0.01
0.37 0.62 0.37 0.28 0.33 0.39 0.36 0.23 0.3 0.32 0.35 0.35 0.34 0.58 0.55 0.29 0.27 0.27 0.53 0.3 0.28 0.34 0.34 0.31 1.0 0.25 0.43 0.36
0.52 0.56 0.37 0.23 0.36 0.35 0.32 0.15 0.13 0.16 0.13 0.32 0.41 0.35 0.3 0.22 0.19 0.13 0.21 0.22 0.2 0.21 0.09 0.19 1.0 0.37 0.23 0.18
0.14 1.0 0.11 0.14 0.18 0.36 0.36 0.3 0.29 0.29 0.27 0.23 0.33 0.88 0.57 0.15 0.1 0.26 0.05 0.1 0.06 0.11 0.13 0.1 0.32 0.53 0.35 0.12
0.66 0.93 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.73 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.55 0.35 0.81 0.01
0.15 1.0 0.23 0.04 0.16 0.13 0.09 0.08 0.23 0.18 0.21 0.2 0.22 0.88 0.72 0.07 0.05 0.23 0.04 0.09 0.05 0.08 0.15 0.07 0.33 0.22 0.51 0.15
0.84 1.0 0.17 0.21 0.2 0.16 0.23 0.19 0.23 0.16 0.24 0.18 0.13 0.95 0.78 0.3 0.22 0.14 0.19 0.34 0.27 0.32 0.17 0.31 0.78 0.53 0.76 0.21
0.38 1.0 0.1 0.03 0.07 0.12 0.08 0.07 0.05 0.09 0.03 0.03 0.05 0.55 0.52 0.03 0.06 0.03 0.06 0.07 0.06 0.06 0.04 0.04 0.68 0.23 0.43 0.04
0.01 0.9 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.48 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.99 0.34 0.0
0.25 0.75 0.58 0.34 0.59 0.75 0.56 0.3 0.36 0.41 0.33 0.57 0.44 1.0 0.8 0.32 0.34 0.78 0.42 0.39 0.37 0.37 0.45 0.29 0.78 0.89 0.92 0.4
0.83 1.0 0.22 0.34 0.18 0.13 0.14 0.18 0.28 0.12 0.33 0.18 0.29 0.49 0.46 0.11 0.08 0.11 0.23 0.18 0.12 0.18 0.13 0.16 0.81 0.31 0.35 0.09
0.02 0.77 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.45 0.0
0.16 1.0 0.19 0.06 0.09 0.04 0.13 0.15 0.3 0.18 0.37 0.13 0.11 0.47 0.37 0.08 0.12 0.08 0.06 0.11 0.06 0.12 0.11 0.1 0.68 0.3 0.34 0.05
0.14 1.0 0.49 0.25 0.25 0.21 0.45 0.22 0.3 0.29 0.31 0.24 0.27 0.49 0.47 0.26 0.27 0.23 0.36 0.4 0.26 0.36 0.26 0.31 0.34 0.65 0.42 0.33
0.18 1.0 0.29 0.3 0.51 0.37 0.3 0.18 0.46 0.27 0.39 0.6 0.35 0.77 0.88 0.34 0.45 0.41 0.56 0.37 0.26 0.41 0.62 0.39 0.23 1.0 0.45 0.41
0.21 0.61 0.09 0.06 0.03 0.11 0.14 0.4 0.2 0.34 0.12 0.03 0.17 0.54 0.46 0.12 0.12 0.12 0.26 0.12 0.07 0.09 0.11 0.09 1.0 0.09 0.3 0.14
0.91 1.0 0.07 0.03 0.02 0.02 0.08 0.04 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.29 0.29 0.05 0.02 0.02 0.08 0.13 0.05 0.04 0.07 0.06 0.43 0.26 0.24 0.03
0.15 0.79 1.0 0.17 0.07 0.04 0.89 0.31 0.45 0.29 0.5 0.15 0.65 0.63 0.64 0.25 0.23 0.12 0.3 0.26 0.39 0.28 0.43 0.35 0.42 0.77 0.82 0.18
0.19 0.81 0.03 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.04 0.03 0.01 0.36 0.32 0.03 0.03 0.04 0.02 0.04 0.04 0.04 0.02 0.04 1.0 0.85 0.24 0.01
0.21 1.0 0.13 0.25 0.18 0.15 0.19 0.14 0.19 0.14 0.19 0.17 0.19 0.56 0.48 0.17 0.16 0.14 0.11 0.2 0.18 0.19 0.21 0.17 0.9 0.72 0.48 0.2
0.37 0.59 0.23 0.13 0.18 0.16 0.22 0.35 0.44 0.22 0.49 0.19 0.14 0.39 0.35 0.14 0.15 0.11 0.18 0.21 0.27 0.24 0.25 0.22 1.0 0.39 0.42 0.09
0.12 0.52 0.17 0.09 0.14 0.11 0.21 0.08 0.14 0.13 0.16 0.14 0.15 0.59 0.57 0.16 0.14 0.17 0.13 0.19 0.18 0.15 0.23 0.15 1.0 0.37 0.29 0.21
0.04 0.47 0.17 0.09 0.12 0.08 0.14 0.06 0.09 0.09 0.1 0.11 0.13 0.17 0.18 0.14 0.14 0.1 0.08 0.15 0.15 0.16 0.08 0.15 1.0 0.45 0.19 0.11
0.3 1.0 0.27 0.26 0.27 0.28 0.27 0.16 0.27 0.23 0.25 0.4 0.2 0.51 0.45 0.17 0.21 0.15 0.09 0.22 0.15 0.23 0.27 0.2 0.62 0.59 0.46 0.37
0.32 0.8 0.11 0.03 0.07 0.08 0.1 0.11 0.15 0.09 0.15 0.09 0.07 0.56 1.0 0.05 0.05 0.08 0.03 0.08 0.06 0.08 0.17 0.07 0.88 0.53 0.25 0.03
0.11 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.52 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.69 0.0
0.01 1.0 0.15 0.07 0.3 0.11 0.27 0.09 0.43 0.23 0.65 0.27 0.23 0.61 0.68 0.22 0.24 0.59 0.18 0.23 0.15 0.16 0.44 0.26 0.27 0.44 0.34 0.03
0.4 1.0 0.1 0.08 0.12 0.17 0.06 0.18 0.17 0.12 0.12 0.05 0.05 0.38 0.38 0.08 0.06 0.31 0.05 0.17 0.08 0.06 0.07 0.07 0.94 0.44 0.68 0.0
0.03 0.86 0.28 0.08 0.33 0.25 0.28 0.21 0.26 0.34 0.26 0.39 0.39 0.83 0.67 0.17 0.15 0.37 0.13 0.22 0.17 0.19 0.17 0.18 1.0 0.98 0.49 0.14
0.17 0.72 0.22 0.12 0.21 0.18 0.2 0.16 0.14 0.24 0.19 0.19 0.21 0.61 0.53 0.12 0.12 0.38 0.08 0.14 0.12 0.17 0.15 0.14 1.0 0.1 0.33 0.18
0.32 1.0 0.06 0.16 0.07 0.07 0.08 0.06 0.12 0.06 0.12 0.11 0.12 0.53 0.4 0.08 0.08 0.07 0.04 0.07 0.05 0.07 0.08 0.06 0.43 0.69 0.22 0.07
0.13 1.0 0.14 0.17 0.15 0.25 0.21 0.1 0.1 0.13 0.09 0.2 0.15 0.59 0.52 0.15 0.18 0.13 0.1 0.32 0.1 0.15 0.15 0.17 0.35 0.44 0.53 0.41
0.04 1.0 0.61 0.53 0.45 0.28 0.46 0.28 0.41 0.59 0.44 0.62 0.72 0.57 0.54 0.26 0.29 0.57 0.54 0.43 0.27 0.31 0.29 0.3 0.26 0.41 0.51 0.46
0.33 0.79 0.26 0.18 0.24 0.2 0.26 0.28 0.41 0.39 0.46 0.2 0.21 0.37 0.37 0.19 0.24 0.22 0.15 0.24 0.16 0.24 0.17 0.22 1.0 0.47 0.28 0.14
0.08 1.0 0.52 0.36 0.38 0.45 0.53 0.3 0.41 0.21 0.37 0.43 0.57 0.59 0.5 0.42 0.41 0.36 0.76 0.5 0.52 0.49 0.42 0.42 0.25 0.6 0.41 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)