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Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
YPD,37C,RB1 KO
YPD,37C,WT
YPD,WT
YPG,WT
WT
37C,PUS7 KO
2n,Pre-SPO
2n,YPD
Butyric acid
Acetic acid
Lactic acid
Propionic acid
HCl
Ctrl
ZFS1 KO
cyr1 KO
cyr1/CYR1 KO
+Tomatidine
TRY4 KO
ZFU2 KO
ZCF8 KO
YPD
Spider
FBS
Lees
RPMI
CUP9 KO
RIM101 KO
RIM101 OE
YPD,30C,AOX2 KO
+SHAM,WT
+Pyocyanin,WT
CPH2 KO
HMS1 KO
MTLa/a,YPD-K,WT
MTLa/a,YP-K,WT
YPD,+Caffeine,WT
YPD,+Myriocin,WT
YPD,RTG3 KO
YPD,+Caffeine,RTG3 KO
YPD,+Myriocin,RTG3 KO
Log,YPD,RCA1 KO
Log,YPD,RCA1 REV
HSF1-TAP/HSF1 -Dox
HSF1-TAP/HSF1 +Dox
tetO-HSF1/tetO-HSF1 -Dox
tetO-HSF1/tetO-HSF1 +Dox
MBF1 KO
YNB-CSM,WT
YNB-CMS,MBF1 KO
YNB-CSM,GCN4 KO
YNB-His,WT
YNB-His,MBF1 KO
YNB-His,GCN4 KO
Infection;Mouse Kidney,WT
Infection;Mouse Kidney,MBF1 KO
OPC Infection:Mouse Tongue Epi Sheet,WT
KAR3 KO
KIP1 KO
YPD,MIG2 KO
YPD,MIG1/MIG2 KO
YPG,MIG1/MIG2 KO
EFG1 KO
+Miconazole
RPMI1640,6h,WT
RPMI1640,6h,CYS4 KO
RPMI1640,+EAOA,6h,CAF2
EBSS+2%H.Serum,EPT1 KO
EBSS+2%H.Serum,EPT1 OE
EBSS+2%H.Serum,PSD1/PSD2 KO
EBSS+2%H.Serum,WT
TET-TEM1 On
TET-TEM1 Off
Serum
SET1 KO
SIR2 KO
-Dox,WT
+Oxi.Stress,+Cat.Stress
+Cat.Stress
+Oxi.Stress
+Nitro.Stress
+Oxi.Stress,+Cat.Stress,+Nitro.Stress
+Oxi.Stress,+Nitro.Stress
+Cat.Stress,+Nitro.Stress
+H2O2
+H2O2,+NaCl
+NaCl
HSP90/HSP90,Ctrl
HSP90/HSP90,+Dox,Ctrl
HSP90/HSP90,+Dox,Heat Shock
tetO-HSP90/hsp90,Ctrl
tetO-HSP90/hsp90,+Dox,Ctrl
tetO-HSP90/hsp90,+Dox,Heat Shock
+Dox,WT
+Dox,STE11 KO
-Dox,STE11 KO
4n,Pre-SPO
4n,YPD
-1.37 -1.76 0.99 -1.25 -0.85 -0.65 0.43 -0.77 0.2 -0.4 0.09 0.35 -0.77 -1.02 0.13 0.5 -0.04 -0.82 -1.17 -1.22 -1.26 -0.23 -0.74 -0.28 -0.38 -0.64 -2.33 -0.93 -0.89 0.82 0.03 1.08 0.57 0.44 -1.87 -2.04 1.41 1.24 1.81 1.56 2.09 -1.17 -0.82 -1.37 -1.49 -1.85 -0.49 -0.12 -0.34 -0.47 -0.74 -0.36 -0.33 -1.17 0.01 0.52 -0.2 -0.47 -1.14 -1.22 -0.95 -1.3 -1.14 0.32 0.34 -0.51 -0.89 -1.35 -0.86 -1.28 -1.1 0.7 0.69 -1.35 -0.15 -1.0 0.8 -2.0 -0.43 -1.55 -0.69 -1.87 -1.93 -1.6 0.09 -0.37 -0.19 -0.64 -0.03 1.26 -0.59 1.32 1.24 1.31 1.79 1.29 0.67 -0.51
-4.18 -4.5 -0.16 0.59 -0.54 -0.67 -0.96 -1.99 -1.1 -2.26 -2.4 -1.17 -2.62 -2.44 0.96 0.88 0.82 -4.54 0.06 0.25 -0.13 -0.31 -0.58 -0.5 -0.71 -0.27 -3.65 0.48 0.4 -2.36 -2.65 -3.02 0.8 -0.16 -2.1 -1.13 2.94 1.95 1.84 3.14 2.05 0.8 0.83 - - - -1.43 -3.44 -4.0 -4.71 -2.77 -4.26 -4.03 -1.46 2.23 1.89 0.8 -2.08 -2.55 -0.34 -0.35 0.07 0.68 -2.21 2.99 1.82 0.37 - - - - -1.15 0.49 0.21 1.12 -2.4 -5.71 -4.07 -2.2 -2.05 -2.98 -2.54 -2.39 -2.16 -1.95 -2.42 -2.03 -2.96 -3.57 0.08 -2.79 -1.78 0.6 -4.11 -4.0 -2.21 -0.11 -1.01
-0.57 -0.84 0.63 -1.13 -0.55 -0.13 0.14 -0.01 0.99 0.44 0.68 0.9 -0.33 -0.69 1.03 0.58 -0.19 0.2 -0.66 -0.45 -0.57 0.64 -0.11 -0.95 -1.29 -1.34 -2.59 -0.5 -0.69 0.84 0.09 0.71 -0.84 -1.22 -1.59 -1.48 1.35 1.61 1.37 1.55 2.01 -1.77 -2.32 -0.43 -0.55 -1.24 0.04 0.0 0.27 0.18 0.63 -0.21 -0.12 -0.05 -1.67 -1.18 -1.12 -0.07 -0.71 -1.25 -1.32 -0.9 -1.31 -0.98 0.4 -1.37 -0.95 -1.76 -1.78 -1.64 -1.58 0.45 0.39 -0.5 -0.6 -1.26 0.78 -1.77 -0.76 -1.17 -0.09 -1.41 -1.83 -0.74 0.22 -0.39 -0.12 -0.21 0.37 1.18 -0.5 0.91 1.87 -0.02 0.44 0.5 0.21 -0.08
- - 1.92 4.24 0.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 4.5 4.16 3.43 - 0.61 -0.61 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.25 -0.49 -0.64 -1.43 1.54 -1.27 0.14 -1.6 -0.21 -0.43 -0.02 -0.05 -0.64 -0.18 - 2.08 2.17 0.76 -1.03 -0.78 -0.78 -0.06 2.3 1.01 1.8 1.13 -1.31 0.04 0.28 -0.11 0.17 -0.1 -1.49 -0.87 - -2.51 -0.02 0.02 -0.39 -0.95 0.47 -0.84 -0.35 -1.08 -1.49 0.2 -2.35 - 0.24 0.53 0.51 0.77 0.83 1.04 - - - 1.39 0.91 -1.11 -1.23 -2.16 -2.26 -1.53 0.35 2.06 1.17 0.51 0.36 1.36 0.86 -0.51 -0.47 2.19 -2.32 0.72 -2.58 -2.77 -4.86 -2.09 -2.52 -2.68 -2.45 -4.9 -2.59 -2.17 -1.2 -1.55 -1.95 -1.15 -2.5 -1.96 -2.16 -3.78 -3.1 -0.15 0.07 -0.79
0.02 -0.36 -0.2 -0.19 -0.42 -0.88 -0.75 -0.43 0.77 0.67 0.67 0.76 0.95 -0.24 -0.75 -3.33 -1.15 -0.36 -0.27 -0.51 -0.55 -1.07 0.1 -0.36 -0.19 -0.36 -0.65 -0.29 -0.58 -0.08 0.48 0.15 0.92 0.41 -1.19 -0.55 -1.85 -1.56 -1.28 -1.53 -1.35 0.05 0.27 -1.1 -1.3 -0.84 0.42 0.53 -0.57 -0.18 0.57 -0.34 -0.0 1.41 -1.71 -1.02 0.44 -0.07 0.28 -0.65 -0.41 -0.5 0.17 1.13 -0.43 0.44 -0.23 -0.13 -0.24 0.56 -0.32 -1.32 -0.39 -0.88 -1.24 0.44 1.0 -0.98 0.03 -0.9 -0.86 -1.01 -0.87 -1.17 1.24 0.33 0.26 0.26 -0.06 1.44 -0.06 -0.3 -0.04 1.21 1.73 1.55 -0.7 -0.26
-0.81 -1.17 0.97 0.77 0.02 0.55 -0.09 -0.04 0.19 -0.09 0.03 0.32 -0.13 -0.5 0.54 0.82 -0.04 -0.86 -0.42 -0.28 -0.39 0.25 0.55 0.25 0.52 0.37 -2.41 0.99 0.32 0.8 0.42 0.39 0.21 0.09 -1.47 -0.99 0.84 1.01 1.16 0.33 1.13 -2.3 -3.32 -0.92 -1.58 -1.7 -0.76 -1.31 -0.4 -0.7 0.09 -0.57 -0.55 -0.74 -0.71 -0.68 -0.64 0.16 -0.26 0.79 0.54 0.57 0.57 -0.43 0.77 -0.95 -0.19 0.11 -0.41 -0.32 -0.22 0.53 0.1 0.62 -1.0 -0.23 -0.44 -1.41 -1.82 -0.29 -0.81 -1.06 -1.41 -0.73 -0.45 0.37 0.69 -0.57 -0.18 0.53 -0.47 -0.0 0.98 -1.01 -0.0 0.38 -0.0 -0.08
-1.46 0.15 0.17 -2.62 -0.43 -0.84 1.58 -0.7 0.26 0.1 1.17 0.34 1.21 -0.11 0.98 -2.45 0.19 -0.56 -0.19 -0.93 -0.88 0.1 0.52 2.59 1.52 0.56 -2.0 0.1 0.25 -0.08 -0.98 0.77 -1.78 -1.99 -0.47 -1.81 -0.65 -1.62 1.05 -0.51 -1.09 1.09 2.99 -0.13 -0.67 0.6 0.2 1.08 0.18 0.32 -0.35 1.63 1.69 -0.33 -1.62 -1.79 -0.43 0.81 0.97 -2.5 -1.62 -1.8 -1.42 -0.22 -2.79 -1.72 -2.55 -0.6 -0.65 -1.47 -0.92 -0.8 1.17 -1.47 -0.3 -0.74 -1.63 -3.65 -2.87 -3.7 -4.04 -3.03 -3.85 -3.56 -1.53 -3.99 -3.63 0.44 -0.84 -0.97 -0.92 -0.22 -2.17 -1.5 -1.13 -2.43 1.43 -0.39
-0.91 -0.43 1.05 -1.55 -0.5 -1.05 0.96 0.57 0.49 0.03 0.28 0.21 0.06 -0.5 -0.9 -1.98 0.38 -0.98 -0.13 -0.38 -0.42 0.26 0.53 0.98 0.36 -0.03 -0.55 -0.66 -0.4 0.94 0.96 1.38 -0.45 -0.75 0.42 -0.37 0.18 -0.3 0.14 0.42 -0.38 -0.23 1.19 -0.05 -0.38 0.67 0.54 0.01 -0.25 -0.34 0.01 0.29 0.19 0.58 0.75 1.99 0.07 0.07 -0.08 -1.68 -1.25 -1.51 -1.41 0.73 -1.56 -2.15 -2.42 -0.1 -0.31 -0.18 -0.09 -0.98 0.41 -0.63 -0.05 -0.9 0.17 -1.28 -0.18 -1.15 -0.77 -1.25 -1.37 -1.28 0.15 -0.86 -0.58 -0.14 -0.31 0.27 -0.32 -0.51 -0.78 0.06 0.35 0.12 0.99 0.22
-1.38 -1.77 -0.05 1.9 0.55 -0.57 0.51 0.03 -0.1 0.16 0.06 -0.2 -0.13 -0.45 -2.77 0.55 -0.43 -1.66 -0.63 -0.58 -0.57 0.4 0.37 0.19 0.38 0.62 -0.99 -0.8 -0.72 -4.18 -3.84 -3.24 -0.27 -0.03 -1.45 -0.98 -1.68 -1.21 -1.42 -1.84 -1.28 -3.39 -3.46 -0.9 -2.35 -2.53 -3.0 -7.22 -1.27 -1.07 -0.33 -1.35 -1.08 -0.62 - - - -0.97 -1.07 1.86 1.89 1.84 2.04 -1.61 2.24 2.42 2.24 -0.9 -1.78 0.03 -1.19 0.98 1.18 0.0 -4.29 -3.77 -0.81 -0.42 -0.85 -0.61 -0.44 -0.23 -0.75 -0.17 -0.5 -0.49 -0.22 0.15 0.43 1.14 0.22 0.82 1.11 -1.35 -1.11 -0.3 0.43 -0.1
-1.89 -1.76 -3.44 -1.05 2.7 - -9.39 -3.15 - - - - - -2.78 - 3.0 0.85 0.26 - - - 1.96 3.75 -1.91 -1.11 -2.31 - - - -4.59 -5.38 -4.88 - - -1.07 -0.57 - - - - - -1.93 -0.76 - - - - -3.74 0.76 0.76 0.22 0.03 -0.2 -1.61 -3.73 -2.03 - 1.43 -1.2 -1.31 -0.78 -1.6 -2.08 - 2.73 1.66 1.04 0.28 0.53 0.67 0.77 0.37 0.31 4.13 - -0.58 0.86 - - -8.69 - - -7.38 - -5.38 -11.36 -5.85 - - - - - - 1.25 0.97 0.95 -5.03 -2.14
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.08 0.04 0.44 -1.71 -0.22 0.04 0.21 -0.1 0.09 -0.17 -0.32 -0.09 0.12 -0.01 -0.38 -0.79 -1.69 0.07 -0.18 -0.16 -0.24 -0.1 -0.13 0.07 0.17 0.14 -0.03 -0.23 -0.06 0.57 0.74 0.77 0.45 0.05 -0.41 -0.68 0.22 0.26 0.39 0.29 0.37 0.69 0.46 -0.22 -0.31 -0.15 -0.36 1.2 -0.21 -0.08 0.01 -0.15 -0.09 -0.51 0.53 0.37 1.08 0.19 -0.22 -1.47 -1.58 -1.52 -0.93 -0.87 -0.52 -2.49 -1.13 -0.67 -0.71 -0.47 -0.76 -0.21 0.19 -0.43 0.77 -0.47 0.51 -0.01 -0.71 -0.04 -0.17 -0.1 0.06 -0.04 0.29 0.06 0.19 -0.04 -0.09 0.17 0.03 -0.1 -0.26 0.54 0.9 0.89 0.26 -0.08
0.21 0.22 0.32 1.68 -0.1 -0.14 0.26 0.43 0.15 0.18 0.02 -0.28 0.8 0.07 -0.15 -1.61 -1.35 -0.01 0.25 0.46 0.24 0.54 0.15 0.06 0.06 0.27 -1.32 0.41 0.45 -1.2 -1.12 -0.66 -0.71 -0.04 -0.8 -0.72 0.01 0.1 -0.6 0.09 0.07 -1.73 -2.15 -1.89 -2.3 -1.97 -0.65 0.72 -0.13 0.08 0.9 0.39 0.48 1.19 -3.17 -1.82 -0.26 0.64 0.67 1.49 1.79 1.58 1.11 -0.54 -0.31 -0.59 -0.07 -2.63 -2.78 -1.4 -3.39 -1.01 0.77 -0.32 -3.7 -0.28 -1.72 -0.93 -0.69 -0.69 -1.2 -0.52 -1.24 -0.35 0.8 -0.15 0.26 0.73 0.16 0.69 0.56 0.33 -0.78 -2.23 -2.12 -2.0 0.54 0.51
-0.79 -1.04 1.98 4.0 0.48 - - - - - - - - - - - - -6.71 - - - -5.2 -2.32 -2.59 -2.7 -1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.14 -2.44 -2.49 -2.68 -2.84 -2.28 - -4.11 - -2.27 -3.13 4.22 4.17 4.13 3.7 - 1.16 -3.08 -0.29 -2.13 -1.83 0.11 -1.11 -1.52 -2.46 -3.57 - -1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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0.01 -0.44 0.39 0.97 0.89 -0.71 0.43 -0.19 -1.1 -0.73 -1.26 -1.21 -0.26 -0.24 2.35 -0.25 -1.1 0.01 -1.13 -0.95 -0.81 0.71 0.98 0.83 0.8 0.78 -1.56 -0.74 -0.8 -0.87 -0.97 -0.79 0.61 0.65 -1.82 -1.53 0.51 0.73 0.86 -0.07 0.64 - - -0.66 -1.56 -4.05 -1.65 -4.91 -0.13 -0.08 0.08 0.1 0.06 0.34 -5.51 -6.35 -4.83 0.53 0.31 1.3 1.24 0.94 -0.11 -0.92 -0.34 0.66 0.45 -0.63 -0.85 -1.18 0.01 0.28 1.34 1.21 -1.46 -0.24 -0.69 -0.72 -0.56 -0.47 -0.71 -0.38 -0.52 -0.75 -0.33 -0.4 -0.15 -0.07 -0.27 0.81 0.08 0.06 0.55 0.52 -0.44 -0.5 0.67 -0.04
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1.15 1.05 -1.26 -0.4 1.19 -0.1 -0.66 -0.34 -0.74 -0.26 -0.55 -0.96 0.1 -0.29 - -0.5 -1.48 -0.54 -0.57 -0.77 -0.7 0.92 0.55 0.73 0.75 0.89 -0.62 -0.49 0.34 -2.78 -2.75 -2.69 -2.83 -1.82 -6.57 -5.94 -1.39 -0.77 -0.97 -1.06 -1.35 0.94 0.61 -0.02 0.21 0.13 -0.11 -11.1 1.53 1.5 1.4 1.64 1.51 1.42 -12.4 - - 1.12 1.26 0.13 -0.1 -0.16 0.04 -0.55 0.97 1.99 2.11 -0.27 -0.69 -1.12 -0.36 0.24 0.37 0.61 -1.49 -0.84 -0.63 -0.75 -1.28 -0.55 -0.85 -0.56 -0.88 -0.31 -0.78 -0.54 -0.53 -0.1 -0.34 -2.35 -0.37 -0.86 -2.86 -0.44 -0.61 -0.96 -0.52 -0.3
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.