Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.19 0.19 1.0 0.28 0.27 0.22 0.15 0.16 0.43 0.16 0.29 0.14 0.18 0.23 0.14 0.31 0.38 0.17 0.18 0.09 0.15 0.19 0.22
0.0 0.03 1.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.31 0.06 0.07 0.06 0.11 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0
0.02 0.19 1.0 0.01 0.0 0.01 0.11 0.15 0.01 0.02 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.03 0.0 0.0
0.0 0.21 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.14 0.11 1.0 0.01 0.0 0.0 0.28 0.05 0.05 0.1 0.06 0.04 0.05 0.01 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.05 0.01 0.01
0.51 0.31 0.89 0.16 0.17 0.18 0.39 0.31 0.45 0.13 1.0 0.08 0.34 0.76 0.79 0.18 0.13 0.08 0.09 0.17 0.48 0.21 0.18
0.37 0.22 1.0 0.08 0.06 0.07 0.55 0.14 0.56 0.46 0.13 0.06 0.26 0.14 0.16 0.09 0.05 0.05 0.05 0.18 0.19 0.06 0.06
0.63 0.24 1.0 0.24 0.16 0.41 0.45 0.17 0.26 0.56 0.39 0.28 0.54 0.42 0.3 0.16 0.1 0.08 0.09 0.38 0.23 0.25 0.27
0.11 0.09 1.0 0.08 0.04 0.06 0.09 0.05 0.27 0.1 0.08 0.05 0.09 0.23 0.16 0.07 0.09 0.02 0.02 0.07 0.12 0.05 0.05
0.08 0.23 1.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.0 0.16 0.08 0.02 0.03 0.09 0.04 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.09 0.01 0.01
0.1 0.15 1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.22 0.12 0.03 0.05 0.15 0.08 0.16 0.01 0.01 0.01 0.0 0.13 0.05 0.0 0.0
0.48 0.28 1.0 0.17 0.11 0.27 0.63 0.14 0.3 0.51 0.3 0.21 0.48 0.46 0.27 0.12 0.09 0.06 0.06 0.34 0.29 0.21 0.09
0.02 0.07 1.0 0.04 0.05 0.03 0.06 0.0 0.09 0.13 0.05 0.06 0.11 0.05 0.07 0.03 0.03 0.03 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0
0.19 0.3 1.0 0.02 0.02 0.02 0.4 0.07 0.17 0.14 0.09 0.03 0.1 0.1 0.06 0.03 0.04 0.01 0.01 0.14 0.09 0.03 0.03
0.71 0.35 1.0 0.12 0.02 0.08 0.68 0.0 0.19 0.26 0.12 0.08 0.45 0.87 0.8 0.11 0.08 0.04 0.04 0.74 0.72 0.2 0.06
0.22 0.03 1.0 0.02 0.01 0.01 0.16 0.07 0.8 0.18 0.11 0.05 0.11 0.14 0.06 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.05 0.01 0.0
0.37 0.67 0.98 0.09 0.09 0.14 0.22 0.26 0.85 0.44 0.38 0.49 1.0 0.12 0.16 0.05 0.03 0.09 0.06 0.75 0.42 0.03 0.12
0.33 0.33 0.85 0.06 0.04 0.07 0.2 0.15 1.0 0.27 0.16 0.16 0.27 0.1 0.12 0.02 0.03 0.03 0.02 0.27 0.32 0.03 0.05
0.24 0.3 0.93 0.09 0.05 0.09 0.15 0.11 1.0 0.69 0.2 0.14 0.23 0.24 0.17 0.04 0.06 0.04 0.04 0.41 0.21 0.08 0.07
0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.03 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
0.74 0.29 0.56 0.37 0.28 0.26 0.5 0.28 0.38 0.85 0.48 0.55 0.92 0.74 1.0 0.34 0.32 0.22 0.22 0.56 0.86 0.63 0.68
0.33 0.29 1.0 0.09 0.08 0.06 0.32 0.14 0.91 0.13 0.07 0.06 0.17 0.33 0.1 0.06 0.07 0.06 0.07 0.19 0.14 0.07 0.09
0.32 0.35 0.93 0.23 0.19 0.21 0.58 0.37 1.0 0.47 0.34 0.24 0.41 0.36 0.32 0.31 0.31 0.21 0.21 0.36 0.41 0.29 0.26
0.12 0.12 1.0 0.16 0.17 0.11 0.04 0.15 0.26 0.06 0.17 0.1 0.12 0.25 0.27 0.17 0.16 0.08 0.1 0.08 0.24 0.19 0.15
0.1 0.14 1.0 0.08 0.05 0.07 0.12 0.07 0.09 0.11 0.06 0.05 0.04 0.07 0.05 0.05 0.03 0.03 0.03 0.1 0.11 0.07 0.07
0.28 0.12 1.0 0.03 0.06 0.06 0.52 0.06 0.42 0.07 0.11 0.02 0.29 0.14 0.08 0.04 0.04 0.01 0.01 0.12 0.1 0.06 0.04
0.2 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.33 0.03 0.01 0.0 0.04 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.0 0.0
0.27 0.07 1.0 0.01 0.0 0.0 0.15 0.03 0.68 0.03 0.07 0.01 0.1 0.09 0.12 0.01 0.02 0.0 0.0 0.13 0.06 0.01 0.01
0.16 0.16 1.0 0.26 0.22 0.17 0.19 0.15 0.48 0.15 0.18 0.12 0.11 0.17 0.17 0.22 0.23 0.08 0.08 0.14 0.16 0.15 0.15
0.23 0.27 1.0 0.01 0.01 0.01 0.27 0.04 0.52 0.09 0.12 0.04 0.15 0.39 0.15 0.01 0.01 0.0 0.0 0.16 0.15 0.02 0.01
0.15 0.24 1.0 0.02 0.02 0.04 0.16 0.06 0.33 0.19 0.09 0.06 0.27 0.1 0.14 0.02 0.04 0.01 0.01 0.1 0.14 0.08 0.13
0.55 0.36 1.0 0.19 0.14 0.21 0.67 0.35 0.6 0.3 0.31 0.22 0.44 0.42 0.23 0.08 0.03 0.08 0.09 0.69 0.5 0.21 0.22
0.39 0.23 1.0 0.07 0.07 0.07 0.3 0.09 0.44 0.08 0.17 0.06 0.35 0.22 0.08 0.05 0.07 0.04 0.04 0.13 0.17 0.07 0.07
0.01 0.13 1.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.49 0.11 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0
0.52 0.26 0.45 0.03 0.03 0.08 1.0 0.25 0.58 0.31 0.33 0.21 0.8 0.67 0.53 0.02 0.03 0.08 0.07 0.21 0.38 0.06 0.04
0.05 0.16 1.0 0.04 0.01 0.04 0.01 0.02 0.08 0.09 0.05 0.04 0.3 0.18 0.14 0.04 0.07 0.01 0.0 0.12 0.13 0.0 0.04
0.07 0.29 1.0 0.21 0.17 0.1 0.37 0.08 0.18 0.15 0.22 0.12 0.12 0.07 0.18 0.1 0.07 0.06 0.04 0.33 0.12 0.2 0.23
0.1 0.16 0.79 0.07 0.07 0.07 0.17 0.04 1.0 0.12 0.39 0.05 0.32 0.07 0.08 0.09 0.07 0.02 0.02 0.04 0.08 0.12 0.12
0.11 0.08 1.0 0.04 0.12 0.05 0.18 0.12 0.67 0.26 0.07 0.07 0.44 0.1 0.08 0.08 0.13 0.04 0.03 0.04 0.05 0.07 0.12
0.25 0.41 1.0 0.2 0.14 0.14 0.0 0.0 0.05 0.02 0.29 0.04 0.2 0.49 0.13 0.16 0.12 0.0 0.0 0.12 0.35 0.09 0.33
0.88 0.66 0.86 0.24 0.3 0.37 0.54 0.49 0.27 1.0 0.65 0.55 0.7 0.83 0.43 0.22 0.28 0.26 0.22 0.68 0.64 0.86 0.57
0.33 0.5 1.0 0.01 0.02 0.01 0.61 0.12 0.51 0.4 0.24 0.07 0.13 0.1 0.03 0.03 0.06 0.02 0.01 0.14 0.19 0.0 0.02
0.47 0.33 1.0 0.21 0.2 0.25 0.5 0.41 0.35 0.44 0.28 0.28 0.43 0.55 0.61 0.33 0.33 0.2 0.18 0.58 0.49 0.16 0.17
0.16 0.08 1.0 0.11 0.06 0.11 0.24 0.09 0.25 0.2 0.11 0.11 0.21 0.23 0.15 0.07 0.03 0.04 0.04 0.19 0.04 0.08 0.07
0.17 0.19 0.81 0.0 0.0 0.0 0.6 0.07 1.0 0.01 0.03 0.01 0.64 0.14 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.11 0.01 0.0
0.11 0.24 1.0 0.01 0.0 0.01 0.45 0.08 0.84 0.09 0.09 0.08 0.62 0.03 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.08 0.1 0.03 0.02
0.16 0.12 1.0 0.1 0.01 0.05 0.09 0.02 0.41 0.08 0.04 0.15 0.06 0.2 0.3 0.02 0.03 0.01 0.01 0.04 0.25 0.01 0.02
0.17 0.11 0.4 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.22 0.08 0.18 0.19 0.23 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0
0.23 0.15 1.0 0.01 0.01 0.01 0.2 0.05 0.25 0.12 0.19 0.02 0.1 0.01 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.11 0.11 0.01 0.01
0.32 0.25 0.74 0.14 0.11 0.11 0.18 0.14 0.59 0.11 1.0 0.1 0.33 0.64 0.47 0.26 0.18 0.07 0.07 0.11 0.46 0.1 0.08
0.0 0.13 1.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.32 0.15 0.02 0.02 0.18 0.09 0.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0
0.0 0.17 1.0 0.0 0.02 0.02 0.09 0.0 0.44 0.07 0.03 0.1 0.14 0.16 0.13 0.01 0.02 0.0 0.02 0.07 0.15 0.0 0.0
0.69 0.67 1.0 0.31 0.38 0.39 0.73 0.39 0.25 0.35 0.58 0.32 0.41 0.58 0.61 0.45 0.36 0.17 0.2 0.9 0.61 0.35 0.37
0.21 0.21 1.0 0.01 0.01 0.02 0.23 0.04 0.1 0.2 0.03 0.03 0.1 0.04 0.1 0.01 0.01 0.0 0.0 0.19 0.14 0.01 0.02
0.78 0.41 0.8 0.19 0.13 0.27 1.0 0.61 0.62 0.31 0.1 0.07 0.46 0.45 0.23 0.04 0.05 0.01 0.01 0.47 0.36 0.15 0.09
0.08 0.2 1.0 0.05 0.02 0.14 0.41 0.0 0.11 0.15 0.13 0.13 0.21 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.12 0.0 0.13
0.12 0.13 1.0 0.07 0.06 0.05 0.07 0.01 0.31 0.07 0.29 0.03 0.1 0.25 0.39 0.04 0.02 0.01 0.01 0.04 0.17 0.03 0.03
0.09 0.1 1.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.01 0.1 0.01 0.01 0.0 0.1 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0
0.21 0.31 1.0 0.02 0.0 0.1 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.04 0.0
0.37 0.46 1.0 0.04 0.01 0.04 0.55 0.15 0.78 0.39 0.17 0.29 0.58 0.7 0.62 0.2 0.06 0.03 0.02 0.51 0.49 0.22 0.03
0.39 0.13 1.0 0.01 0.01 0.03 0.21 0.07 0.12 0.12 0.13 0.22 0.17 0.26 0.6 0.19 0.1 0.02 0.02 0.45 0.22 0.1 0.07
0.32 0.17 1.0 0.04 0.01 0.02 0.16 0.06 0.91 0.07 0.1 0.06 0.24 0.29 0.09 0.01 0.02 0.01 0.01 0.16 0.05 0.08 0.05
0.23 0.22 1.0 0.03 0.01 0.01 0.13 0.06 0.66 0.01 0.06 0.06 0.17 0.23 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.07 0.02 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)