Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.42 0.3 0.15 0.22 0.14 0.33 0.21 0.15 0.15 1.0 0.13 0.32 0.16 0.21 0.1 0.17 0.19 0.14 0.14 0.21 0.35 0.17 0.19
0.64 0.8 0.51 0.96 0.56 0.98 0.47 0.19 0.76 0.89 0.38 0.68 0.2 1.0 0.38 0.49 0.53 0.18 0.17 0.32 0.56 0.66 0.84
0.75 0.55 0.47 0.69 0.57 0.74 0.8 0.56 0.42 0.83 0.68 0.62 0.58 0.66 0.49 0.65 0.5 0.27 0.3 0.55 0.69 1.0 0.87
0.79 0.74 0.48 0.86 0.75 1.0 0.61 0.32 0.32 0.52 0.42 0.46 0.17 0.65 0.25 0.54 0.47 0.27 0.25 0.34 0.6 0.55 0.87
0.21 0.33 0.27 0.24 0.13 0.68 0.8 0.19 0.14 0.56 0.12 1.0 0.27 0.05 0.06 0.07 0.04 0.04 0.04 0.34 0.26 0.1 0.2
1.0 0.82 0.11 0.46 0.57 0.31 0.7 0.32 0.36 0.22 0.15 0.38 0.21 0.13 0.08 0.56 0.81 0.19 0.21 0.6 0.46 0.57 0.5
0.15 0.19 0.03 0.49 0.11 0.61 0.05 0.0 0.48 0.42 0.0 0.89 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.13 1.0 0.36
0.92 0.95 0.8 0.86 0.59 0.89 0.65 0.55 0.36 0.8 1.0 0.39 0.59 0.86 0.51 0.67 0.76 0.47 0.44 0.38 0.92 0.59 0.51
1.0 0.37 0.1 0.26 0.23 0.55 0.5 0.28 0.31 0.36 0.16 0.53 0.15 0.18 0.33 0.15 0.3 0.3 0.29 0.59 0.48 0.47 0.59
0.3 0.38 0.07 0.12 0.09 0.44 0.2 0.17 0.1 0.88 0.15 1.0 0.19 0.14 0.11 0.08 0.06 0.16 0.13 0.12 0.31 0.15 0.32
0.86 1.0 0.29 0.43 0.32 0.63 0.84 0.5 0.2 0.46 0.51 0.43 0.24 0.68 0.13 0.32 0.55 0.32 0.3 0.49 0.55 0.48 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.42 0.01 0.47 0.19 1.0 0.06 0.01 0.11 0.25 0.01 0.88 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.18 0.26 0.24
0.26 1.0 0.07 0.31 0.08 0.35 0.16 0.08 0.2 0.18 0.22 0.95 0.06 0.08 0.05 0.04 0.08 0.18 0.16 0.24 0.21 0.28 0.3
0.54 0.9 0.28 0.42 0.43 0.6 0.41 0.34 0.35 0.56 0.38 1.0 0.47 0.54 0.21 0.28 0.27 0.31 0.3 0.4 0.49 0.71 0.87
0.07 1.0 0.73 0.45 0.4 0.34 0.14 0.08 0.01 0.06 0.56 0.23 0.23 0.55 0.34 0.44 0.44 0.0 0.0 0.25 0.62 0.55 0.57
0.58 1.0 0.14 0.71 0.26 0.54 0.24 0.06 0.49 0.45 0.2 0.57 0.11 0.6 0.09 0.23 0.22 0.03 0.03 0.08 0.37 0.32 0.41
0.0 0.02 0.02 0.17 0.01 0.25 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0
0.0 0.82 1.0 0.38 0.29 0.49 0.11 0.07 0.02 0.06 0.08 0.16 0.29 0.65 0.41 0.41 0.48 0.01 0.01 0.09 0.54 0.47 0.35
0.68 1.0 0.14 0.35 0.21 0.5 0.34 0.38 0.3 0.27 0.29 0.36 0.2 0.28 0.1 0.28 0.26 0.27 0.26 0.24 0.51 0.38 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.98 0.85 0.36 0.75 0.87 0.56 0.72 0.56 0.4 0.4 0.75 0.47 0.41 0.5 0.55 0.84 0.88 0.49 0.47 0.65 1.0 0.91 0.9
0.74 1.0 0.69 0.46 0.45 0.67 0.72 0.21 0.64 0.8 0.46 0.85 0.43 0.52 0.86 0.29 0.33 0.13 0.15 0.44 0.89 0.36 0.33
0.1 0.12 0.04 0.18 0.07 0.65 0.02 0.0 0.03 0.31 0.06 1.0 0.05 0.04 0.15 0.01 0.01 0.01 0.0 0.13 0.11 0.05 0.04
0.11 0.03 0.03 0.11 0.03 0.27 0.13 0.05 0.13 0.19 0.03 1.0 0.06 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.16 0.09 0.03 0.04
0.55 1.0 0.75 0.54 0.38 0.55 0.6 0.38 0.43 0.57 0.59 0.46 0.47 0.63 0.6 0.47 0.54 0.27 0.25 0.42 0.85 0.45 0.46
0.6 0.66 0.57 0.69 0.49 0.61 1.0 0.67 0.83 0.51 0.7 0.44 0.6 0.74 0.45 0.89 0.59 0.25 0.25 0.37 0.43 0.68 0.53
1.0 0.54 0.02 0.42 0.26 0.4 0.82 0.95 0.22 0.26 0.05 0.54 0.08 0.01 0.06 0.05 0.07 0.29 0.26 0.45 0.47 0.89 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.71 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.73 0.06 0.72 0.46 0.88 0.81 0.26 0.47 1.0 0.04 0.94 0.12 0.0 0.17 0.01 0.01 0.05 0.03 0.57 0.83 0.84 0.7
0.0 0.23 0.82 1.0 0.59 0.48 0.67 0.0 0.0 0.0 0.62 0.67 0.46 0.39 0.54 0.0 0.18 0.0 0.0 0.17 0.27 0.0 0.0
0.22 1.0 0.24 0.11 0.09 0.19 0.04 0.03 0.05 0.11 0.2 0.29 0.15 0.28 0.1 0.23 0.26 0.01 0.03 0.28 0.54 0.2 0.24
0.28 1.0 0.09 0.22 0.11 0.59 0.21 0.07 0.26 0.17 0.03 0.07 0.06 0.08 0.04 0.07 0.07 0.14 0.14 0.16 0.11 0.5 0.45
0.41 0.57 0.14 0.84 0.58 0.74 0.49 0.19 0.48 0.97 0.03 0.56 0.1 0.13 0.19 0.31 0.34 0.09 0.09 0.17 0.54 0.52 1.0
0.11 0.15 0.03 0.37 0.11 0.85 0.06 0.03 0.12 1.0 0.03 0.41 0.27 0.01 0.03 0.02 0.01 0.05 0.04 0.19 0.41 0.28 0.21
0.77 0.63 0.77 0.42 0.48 0.41 0.63 0.41 0.32 0.38 0.25 0.31 0.28 0.63 0.4 0.49 0.48 0.39 0.36 0.42 1.0 0.4 0.41
0.86 0.93 0.6 0.64 0.77 0.81 0.6 0.57 0.23 0.39 0.71 0.44 0.29 0.93 0.68 0.76 0.79 0.43 0.43 0.51 1.0 0.81 0.79
0.3 1.0 0.26 0.4 0.63 0.7 0.68 0.57 0.26 0.26 0.41 0.63 0.41 0.47 0.33 0.49 0.48 0.47 0.46 0.62 0.72 0.88 0.91
0.31 0.17 0.05 0.41 0.88 0.58 0.13 0.04 0.55 1.0 0.02 0.59 0.06 0.08 0.43 0.07 0.05 0.03 0.02 0.34 0.38 0.19 0.16
0.35 0.53 0.03 0.66 0.95 1.0 0.03 0.3 0.04 0.15 0.2 0.73 0.1 0.81 0.19 0.65 0.51 0.43 0.47 0.17 0.54 0.92 0.99
0.59 0.56 0.41 0.26 0.19 0.41 1.0 0.19 0.36 0.23 0.22 0.36 0.21 0.26 0.35 0.08 0.08 0.07 0.06 0.26 0.22 0.51 0.48
0.68 0.56 0.15 0.39 0.1 1.0 0.12 0.14 0.5 0.74 0.19 0.97 0.24 0.02 0.16 0.01 0.01 0.07 0.07 0.19 0.44 0.12 0.08
1.0 0.96 0.48 0.7 0.52 0.71 0.43 0.38 0.59 0.97 0.79 0.59 0.33 0.71 0.23 0.61 0.77 0.43 0.46 0.41 0.57 0.77 0.76
0.45 1.0 0.1 0.29 0.06 0.45 0.7 0.14 0.53 0.42 0.16 0.51 0.15 0.17 0.13 0.08 0.15 0.06 0.06 0.41 0.77 0.41 0.59
0.6 0.94 0.71 0.61 0.6 0.67 0.83 0.72 0.23 0.48 0.52 0.36 0.36 0.62 0.28 0.7 1.0 0.33 0.38 0.35 0.76 0.52 0.51
0.93 1.0 0.48 0.53 0.49 0.54 0.55 0.4 0.38 0.3 0.32 0.34 0.17 0.74 0.1 0.54 0.56 0.26 0.26 0.37 0.33 0.45 0.66
0.0 0.96 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.18 0.1 0.33 0.0 0.2 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.42 0.0
0.04 0.02 0.02 0.11 0.06 0.11 0.28 0.03 0.28 1.0 0.02 0.27 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.51 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.47 0.1 0.2 0.16 0.68 0.21 0.11 0.2 0.19 0.18 1.0 0.1 0.16 0.11 0.07 0.1 0.06 0.06 0.26 0.3 0.29 0.24
0.05 1.0 0.6 0.12 0.01 0.1 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.08 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.48 0.12 0.16
0.56 0.98 0.47 0.64 0.55 0.81 0.76 0.47 0.59 0.72 0.75 0.87 0.69 0.64 0.61 0.55 0.45 0.41 0.41 0.63 0.69 1.0 0.96
0.65 0.57 0.12 0.49 0.43 1.0 0.36 0.11 0.51 0.48 0.06 0.52 0.16 0.04 0.1 0.09 0.07 0.25 0.23 0.31 0.44 0.69 0.64
0.25 0.18 0.08 0.46 0.1 1.0 0.08 0.06 0.06 0.29 0.14 0.78 0.08 0.04 0.13 0.0 0.01 0.02 0.02 0.14 0.46 0.12 0.04
0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.32 0.51 0.23 0.65 0.92 1.0 0.22 0.16 0.16 0.24 0.28 0.3 0.11 0.45 0.07 0.44 0.37 0.15 0.15 0.11 0.15 0.6 0.84
0.13 1.0 0.4 0.96 0.48 0.76 0.16 0.15 0.05 0.02 0.02 0.16 0.01 0.14 0.15 0.02 0.04 0.26 0.24 0.09 0.08 0.33 0.75
0.26 1.0 0.3 0.71 0.32 0.68 0.67 0.23 0.49 0.58 0.12 0.76 0.31 0.69 0.1 0.46 0.47 0.1 0.09 0.26 0.44 0.5 0.71
0.72 1.0 0.83 0.86 0.59 0.83 0.74 0.6 0.52 0.62 0.68 0.55 0.52 0.9 0.36 0.84 0.98 0.29 0.26 0.46 1.0 0.77 0.87
0.69 0.44 0.13 0.2 0.13 0.22 1.0 0.19 0.31 0.12 0.19 0.34 0.07 0.13 0.16 0.11 0.16 0.16 0.17 0.39 0.26 0.42 0.48
0.12 0.08 0.02 0.2 0.05 0.51 0.28 0.03 0.12 0.29 0.01 1.0 0.07 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.15 0.13 0.07 0.06
0.71 0.9 0.45 0.3 0.15 0.55 0.75 0.28 0.25 0.89 0.16 1.0 0.32 0.07 0.16 0.08 0.09 0.15 0.14 0.57 0.7 0.55 0.45
0.47 0.47 0.81 0.68 0.27 1.0 0.12 0.18 0.16 0.5 0.24 0.47 0.12 0.34 0.27 0.15 0.18 0.18 0.14 0.12 0.53 0.47 0.3
0.0 0.43 0.0 0.3 0.83 0.3 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.18 0.21 0.92 1.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0
0.81 0.83 0.59 0.79 0.79 0.96 0.5 0.32 0.38 0.6 0.25 0.55 0.17 0.67 0.33 0.43 0.5 0.27 0.27 0.27 0.49 0.64 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.61 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.55 0.41 0.64 0.43 0.53 0.59 0.33 0.3 0.59 0.63 0.64 0.41 0.41 0.66 0.58 0.32 0.26 0.25 0.41 0.5 1.0 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.59 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.98 0.35 0.26 0.0 0.0 0.0
0.29 0.41 0.08 0.71 0.16 1.0 0.19 0.03 0.32 0.57 0.04 0.83 0.09 0.05 0.04 0.04 0.02 0.03 0.03 0.35 0.43 0.28 0.14
0.74 1.0 0.39 0.77 0.69 0.62 0.97 0.77 0.48 0.53 0.62 0.54 0.5 0.85 0.59 0.56 0.51 0.32 0.37 0.68 0.52 0.77 0.79
0.54 1.0 0.73 0.37 0.43 0.46 0.73 0.48 0.19 0.2 0.82 0.29 0.59 0.45 0.45 0.39 0.79 0.5 0.5 0.49 0.93 0.25 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 1.0 0.37 0.33 0.0 0.78 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.78 1.0 0.37 0.19 0.08 0.46 0.58 0.18 0.57 0.48 0.15 0.49 0.18 0.65 0.16 0.08 0.1 0.1 0.07 0.51 0.58 0.2 0.21
0.02 0.02 0.01 0.29 0.0 1.0 0.03 0.0 0.04 0.12 0.0 0.8 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0
0.03 0.15 0.01 0.27 0.01 0.88 0.05 0.01 0.02 0.18 0.03 1.0 0.24 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.2 0.03 0.01
0.61 1.0 0.21 0.59 0.65 0.61 0.41 0.45 0.22 0.22 0.36 0.46 0.16 0.4 0.36 0.52 0.24 0.28 0.28 0.54 0.56 0.97 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.76 0.5 0.15 0.47 0.47 0.79 0.41 0.41 0.16 0.32 0.06 0.72 0.11 0.19 0.04 0.52 0.33 0.46 0.44 0.3 0.31 0.83 1.0
1.0 0.68 0.37 0.73 0.65 0.69 0.45 0.49 0.29 0.75 0.88 0.69 0.6 0.48 0.62 0.53 0.57 0.38 0.37 0.48 0.68 0.86 0.82
0.0 0.0 1.0 0.0 0.37 0.19 0.0 0.0 0.45 0.24 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.38 0.3 0.0 0.33 0.0 0.0
0.49 0.85 0.3 0.4 0.31 0.72 0.36 0.13 0.3 0.42 0.21 0.42 0.13 0.45 0.25 0.17 0.32 0.12 0.11 0.13 0.41 0.62 1.0
0.79 0.93 0.25 0.49 0.43 1.0 0.67 0.42 0.25 0.45 0.52 0.5 0.28 0.96 0.27 0.55 0.63 0.32 0.29 0.28 0.46 0.52 0.76
1.0 0.84 0.31 0.29 0.18 0.47 0.71 0.44 0.38 0.55 0.74 0.69 0.5 0.47 0.15 0.25 0.47 0.28 0.28 0.58 0.79 0.5 0.56
0.56 1.0 0.3 0.48 0.42 0.67 0.35 0.25 0.33 0.39 0.25 0.32 0.14 0.48 0.1 0.44 0.56 0.28 0.27 0.23 0.24 0.46 0.65
0.31 0.29 0.04 0.85 1.0 0.68 0.14 0.1 0.19 0.85 0.11 0.29 0.03 0.03 0.05 0.19 0.1 0.12 0.13 0.26 0.37 0.89 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.9 0.33 0.5 0.4 0.58 1.0 0.91 0.43 0.64 0.57 0.49 0.27 0.34 0.17 0.3 0.4 0.35 0.37 0.31 0.4 0.5 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.03 0.49 0.22 0.26 0.24 1.0 0.78 0.49 0.68 0.24 0.1 0.12 0.73 0.61 0.15 0.1 0.4 0.29 0.36 0.4 0.0 0.13
0.06 1.0 0.75 0.35 0.25 0.23 0.03 0.0 0.04 0.01 0.0 0.15 0.15 0.34 0.11 0.23 0.25 0.0 0.0 0.08 0.13 0.16 0.39
1.0 0.68 0.19 0.38 0.49 0.51 0.6 0.47 0.45 0.44 0.51 0.38 0.32 0.27 0.31 0.44 0.29 0.37 0.37 0.53 0.99 0.98 0.85
0.02 1.0 0.22 0.59 0.41 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.33 0.19 0.63 0.62 0.0 0.0 0.06 0.45 0.35 0.43
0.11 0.15 0.02 0.35 0.17 0.81 0.17 0.03 0.1 0.11 0.02 1.0 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.21 0.11 0.53 0.47
0.73 1.0 0.13 0.37 0.27 0.69 0.22 0.27 0.37 0.44 0.26 0.97 0.21 0.43 0.12 0.25 0.42 0.43 0.42 0.42 0.56 0.72 0.6
0.24 0.98 0.03 0.16 0.18 0.56 0.52 0.63 1.0 0.55 0.15 0.32 0.09 0.13 0.04 0.23 0.19 0.37 0.33 0.08 0.28 0.42 0.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 0.64 1.0 0.35 0.41 0.36 0.49 0.34 0.37 0.65 0.75 0.36 0.41 0.32 0.41 0.4 0.49 0.28 0.28 0.49 0.56 0.62 0.64
0.37 1.0 0.52 0.77 0.71 0.75 0.4 0.16 0.1 0.16 0.85 0.55 0.4 0.64 0.35 0.99 0.97 0.02 0.03 0.24 0.71 0.69 0.7
0.05 0.25 0.55 0.38 0.13 1.0 0.04 0.0 0.08 0.47 0.05 0.23 0.03 0.03 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.12 0.06 0.0 0.0
0.06 0.0 0.02 0.04 0.03 0.03 1.0 0.9 0.02 0.17 0.0 0.08 0.08 0.42 0.1 0.05 0.02 0.56 0.51 0.24 0.11 0.0 0.0
0.14 0.02 0.3 0.17 0.6 0.18 1.0 0.72 0.28 0.31 0.41 0.61 0.03 0.1 0.02 0.02 0.01 0.43 0.43 0.23 0.02 0.22 0.07
0.84 0.92 0.56 0.43 0.28 0.67 0.68 0.31 0.28 0.54 0.29 1.0 0.4 0.42 0.17 0.3 0.42 0.28 0.27 0.56 0.89 0.5 0.43
0.89 1.0 0.45 0.47 0.3 0.57 0.58 0.51 0.49 0.38 0.59 0.49 0.28 0.55 0.31 0.33 0.37 0.3 0.26 0.43 0.67 0.61 0.71

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)