Heatmap: Cluster_15 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.03 0.05 1.0 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.01 0.05 0.03 0.05 0.07 0.02 0.34 0.01 0.01 0.01 0.0 0.48 0.03 0.01 0.02
0.11 0.16 0.18 0.11 0.0 0.0 0.3 0.29 0.4 0.48 0.04 0.31 0.29 0.09 0.07 0.07 0.02 0.22 0.23 1.0 0.06 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.01 0.03 0.03 0.05 0.0 0.01 0.01 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.25 0.22 0.04 0.0 0.0 0.36 0.12 0.74 0.0 0.0 0.0 0.34 0.08 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.04 0.34 0.01 0.34 0.04 0.05 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.44 0.9 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.08 0.23 0.01 0.08 0.35 0.06 0.48 0.09 0.22 0.01 0.01 1.0 0.14 0.05 0.04
0.09 0.38 1.0 0.1 0.08 0.09 0.35 0.16 0.23 0.3 0.14 0.15 0.17 0.32 0.27 0.13 0.19 0.09 0.07 0.94 0.15 0.1 0.07
0.09 0.02 0.16 0.01 0.0 0.01 0.09 0.03 0.1 0.02 0.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.05 1.0 0.01 0.01 0.0
0.04 0.04 0.23 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.05 0.03 0.01 0.01 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0
0.04 0.12 0.78 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.04 0.07 0.0 0.01 0.18 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0
0.02 0.08 0.94 0.04 0.04 0.03 0.4 0.11 0.12 0.3 0.09 0.08 0.44 0.03 0.38 0.03 0.02 0.04 0.01 1.0 0.09 0.08 0.11
0.13 0.12 0.22 0.11 0.02 0.03 0.12 0.04 0.01 0.07 0.0 0.23 0.03 0.04 0.08 0.03 0.03 0.01 0.03 1.0 0.44 0.04 0.0
0.14 0.51 1.0 0.04 0.0 0.02 0.73 0.83 0.2 0.11 0.19 0.13 0.17 0.12 0.07 0.09 0.16 0.09 0.02 1.0 0.26 0.39 0.12
0.11 0.19 0.45 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.56 0.05 0.01 0.01 0.99 0.03 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.09 0.08 0.0 0.17 0.0 0.05 0.05 0.0 0.29 0.09 0.11 0.08 0.07 0.04 0.0 0.0 1.0 0.41 0.0 0.0
0.03 0.03 0.29 0.09 0.01 0.1 0.04 0.01 0.08 0.01 0.0 0.01 0.04 0.12 0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.07 0.27 0.04 0.01 0.13 0.02 0.0 0.03 1.0 0.01 0.72 0.07 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.03 0.03
0.13 0.44 1.0 0.04 0.04 0.01 0.11 0.07 0.1 0.2 0.6 0.08 0.19 0.13 0.17 0.02 0.04 0.02 0.01 0.87 0.17 0.0 0.06
0.0 0.42 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.47 0.86 0.16 0.03 0.06 0.03 0.09 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.67 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 0.02 1.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.04 0.59 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.02 0.08 0.04 0.22 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.07 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.08 0.01 0.09 0.0 0.0 0.01 0.02 1.0 0.03 0.0 0.0
0.06 0.1 0.59 0.01 0.01 0.03 0.08 0.02 0.03 0.03 0.01 0.1 0.06 0.05 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.12 0.01 0.02
0.02 0.08 0.35 0.01 0.0 0.01 0.08 0.02 0.04 0.07 0.01 0.03 0.05 0.02 0.16 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01
0.18 0.26 0.6 0.01 0.01 0.02 0.24 0.08 0.48 0.13 1.0 0.03 0.28 0.39 0.64 0.01 0.04 0.01 0.01 0.98 0.2 0.04 0.03
0.01 0.11 0.75 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.03 0.0 0.01 0.09 0.02 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0
0.02 0.01 0.2 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.06 0.01 1.0 0.11 0.09 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.64 0.01 0.0 0.0
0.0 0.07 0.31 0.02 0.01 0.01 0.13 0.03 0.13 0.61 0.03 0.9 0.5 0.11 0.18 0.01 0.02 0.0 0.01 1.0 0.07 0.06 0.0
0.01 0.06 0.33 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.0 0.05 0.21 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.04 0.02
0.01 0.57 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.5 0.01 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0
0.0 0.06 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.11 0.09 0.0 0.09 0.0 0.05 0.29 0.53 0.0 0.0 0.0 0.03 0.84 0.2 0.0 0.0
0.12 0.1 0.2 0.06 0.06 0.06 0.06 0.04 0.06 0.13 0.09 0.05 0.07 0.13 0.67 0.06 0.04 0.04 0.04 1.0 0.35 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.09 0.12 0.04 0.02 0.08 0.05 0.06 0.03 0.04 0.21 0.18 0.04 0.98 0.63 0.06 0.11 0.03 0.03 1.0 0.39 0.05 0.07
0.02 0.1 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.28 0.22 0.02 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 0.97 0.02 0.03 0.06
0.04 0.05 1.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.47 0.15 0.03 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.06 0.15 0.09
0.02 0.1 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.63 0.24 0.03 0.31 0.01 0.01 0.0 0.0 0.81 0.12 0.17 0.14
0.04 0.08 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.05 0.35 0.0 0.01 0.0 0.0 0.51 0.08 0.05 0.03
0.08 0.04 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.11 0.07 0.41 0.0 0.01 0.0 0.0 0.63 0.09 0.07 0.04
0.0 0.07 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.13 0.1 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.76 0.05 0.06 0.11
0.25 0.65 0.4 0.03 0.04 0.03 0.13 0.06 0.04 0.03 0.1 0.14 0.3 0.04 0.29 0.04 0.06 0.07 0.08 1.0 0.25 0.02 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.29 1.0 0.11 0.22 0.06 0.12 0.04 0.28 0.13 0.29 0.15 0.25 0.32 0.3 0.21 0.2 0.03 0.03 0.5 0.16 0.15 0.12
0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.23 0.03 0.24 0.18 0.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.37 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.8 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.17 1.0 0.01 0.0 0.02 0.18 0.04 0.16 0.2 0.02 0.1 0.36 0.03 0.55 0.01 0.02 0.01 0.01 0.8 0.11 0.04 0.01
0.05 0.09 0.21 0.0 0.0 0.02 0.13 0.02 0.05 0.19 0.0 0.02 0.3 0.01 0.34 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.01
0.16 0.24 1.0 0.03 0.02 0.04 0.34 0.15 0.57 0.08 0.03 0.02 0.31 0.05 0.02 0.07 0.13 0.06 0.06 0.63 0.06 0.07 0.08
0.34 0.53 0.27 0.06 0.1 0.05 0.35 0.17 0.37 0.1 0.12 0.04 0.88 0.13 0.24 0.24 0.09 0.15 0.15 1.0 0.21 0.27 0.16
0.15 0.29 1.0 0.01 0.01 0.03 0.21 0.09 0.1 0.06 0.03 0.02 0.33 0.1 0.44 0.02 0.04 0.01 0.01 0.76 0.1 0.03 0.01
0.02 0.08 1.0 0.0 0.01 0.01 0.25 0.15 0.07 0.09 0.01 0.03 0.21 0.06 0.24 0.03 0.05 0.01 0.01 0.69 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0
0.08 0.1 0.33 0.05 0.05 0.2 0.58 0.13 0.11 0.11 0.29 0.03 0.14 0.56 0.47 0.19 0.1 0.03 0.04 1.0 0.04 0.07 0.04
0.09 0.05 0.83 0.03 0.04 0.04 0.54 0.1 0.15 0.19 0.79 0.02 0.08 0.31 0.24 0.1 0.07 0.02 0.03 1.0 0.07 0.06 0.08
0.06 0.27 1.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.02 0.5 0.27 0.01 0.03 0.19 0.07 0.84 0.02 0.03 0.01 0.01 0.6 0.13 0.02 0.01
0.3 0.34 1.0 0.3 0.34 0.28 0.26 0.2 0.24 0.15 0.36 0.16 0.35 0.09 0.33 0.19 0.15 0.1 0.13 0.91 0.2 0.27 0.24
0.09 0.17 1.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.01 0.15 0.08 0.01 0.0 0.02 0.08 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.05 0.01 0.0
0.07 0.19 0.13 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.19 0.03 0.0 0.01 0.49 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.03 0.0
0.07 0.02 0.56 0.01 0.0 0.02 0.08 0.01 0.15 0.18 0.0 0.52 0.02 0.01 0.22 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.04 0.04 0.01
0.31 0.12 0.92 0.13 0.07 0.05 0.32 0.0 0.44 0.18 0.03 0.24 0.05 0.78 0.09 0.06 0.06 0.04 0.04 1.0 0.04 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)