Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.45 0.44 0.4 1.0 0.72 0.77 0.34 0.34 0.37 0.56 0.76 0.42 0.55 0.26 0.4 0.56 0.28 0.19 0.23 0.26 0.45 0.7 0.55
0.69 0.68 1.0 0.52 0.63 0.42 1.0 0.62 0.35 0.55 0.65 0.37 0.53 0.29 0.29 0.67 0.64 0.22 0.23 0.44 0.65 0.38 0.31
0.64 0.63 1.0 0.6 0.73 0.6 0.61 0.55 0.18 0.2 0.37 0.35 0.35 0.4 0.22 0.62 0.68 0.34 0.33 0.34 0.45 0.43 0.45
0.63 0.95 0.45 0.76 0.59 0.5 1.0 0.95 0.27 0.43 0.73 0.63 0.54 0.38 0.16 0.75 0.8 0.39 0.33 0.36 0.73 0.33 0.5
0.9 1.0 0.65 0.56 0.64 0.59 0.69 0.64 0.26 0.3 0.47 0.48 0.51 0.33 0.27 0.72 0.73 0.42 0.44 0.43 0.62 0.53 0.46
1.0 0.76 0.56 0.45 0.47 0.52 0.66 0.68 0.33 0.3 0.45 0.34 0.31 0.48 0.19 0.71 0.83 0.48 0.5 0.62 0.58 0.57 0.51
0.4 0.83 0.68 0.87 0.45 0.7 1.0 0.77 0.37 0.59 0.88 0.48 0.54 0.63 0.31 0.88 0.92 0.43 0.37 0.45 0.91 0.65 0.62
0.91 0.79 0.53 0.42 0.44 0.4 1.0 0.73 0.33 0.6 0.59 0.46 0.47 0.57 0.23 0.63 0.76 0.58 0.56 0.59 0.71 0.54 0.51
0.77 0.82 0.74 0.69 1.0 0.72 0.51 0.58 0.32 0.27 0.49 0.66 0.36 0.32 0.26 0.87 0.65 0.42 0.43 0.34 0.57 0.73 0.68
1.0 0.92 0.82 0.55 0.83 0.64 0.98 0.65 0.69 0.41 0.59 0.45 0.62 0.59 0.45 0.84 0.9 0.53 0.6 0.61 0.6 0.68 0.59
0.67 0.75 0.53 0.67 0.81 0.63 0.56 0.59 0.42 0.45 0.85 0.33 0.39 0.52 0.22 0.99 1.0 0.34 0.35 0.39 0.52 0.77 0.79
0.53 0.67 1.0 0.63 0.75 0.55 0.63 0.53 0.27 0.15 0.27 0.38 0.29 0.2 0.4 0.78 0.72 0.3 0.3 0.49 0.38 0.56 0.6
1.0 0.96 0.66 0.51 0.66 0.57 0.82 0.61 0.62 0.41 0.93 0.43 0.67 0.7 0.36 0.85 0.9 0.43 0.47 0.43 0.53 0.53 0.61
0.69 0.53 0.39 0.52 0.68 0.52 0.93 0.56 0.92 0.5 0.97 0.61 0.75 0.57 0.72 0.61 0.7 0.49 0.51 1.0 0.54 0.79 0.74
0.41 0.49 0.18 0.35 0.46 0.51 0.55 0.42 0.53 0.36 1.0 0.85 0.8 0.47 0.72 0.44 0.48 0.52 0.5 0.61 0.72 0.71 0.65
1.0 0.73 0.96 0.9 0.73 0.79 0.76 0.53 0.48 0.53 0.86 0.58 0.72 0.44 0.42 0.69 0.45 0.39 0.41 0.56 0.69 0.86 0.83
0.48 0.46 0.33 0.7 0.98 0.73 0.69 0.78 0.61 0.47 0.97 0.88 0.73 0.67 0.85 0.87 1.0 0.76 0.82 0.77 0.67 0.87 0.77
0.39 0.44 0.29 0.48 0.6 0.55 0.9 0.88 0.57 0.39 0.71 0.62 0.55 0.61 1.0 0.58 0.66 0.68 0.69 0.97 0.72 0.7 0.66
0.81 0.58 1.0 0.49 0.59 0.35 0.65 0.88 0.27 0.18 0.2 0.28 0.31 0.24 0.25 0.57 0.55 0.47 0.46 0.33 0.31 0.52 0.49
0.77 0.76 0.51 0.77 0.97 0.75 0.78 0.78 0.36 0.45 0.8 0.6 0.59 0.35 0.38 1.0 0.84 0.48 0.5 0.58 0.69 0.77 0.82
0.44 0.56 0.27 0.55 0.48 0.44 1.0 0.7 0.42 0.38 0.49 0.38 0.45 0.46 0.35 0.69 0.73 0.27 0.24 0.54 0.8 0.86 0.57
0.45 0.74 0.43 0.5 0.3 0.37 1.0 0.8 0.15 0.16 0.33 0.21 0.24 0.2 0.21 0.72 0.87 0.33 0.3 0.27 0.38 0.35 0.3
0.46 0.96 0.48 0.56 0.7 0.5 0.53 0.36 0.32 0.41 0.71 0.33 0.39 0.39 0.33 0.9 1.0 0.42 0.41 0.44 0.74 0.61 0.53
0.95 0.83 0.86 0.6 0.52 0.57 1.0 0.61 0.27 0.22 0.86 0.35 0.38 0.64 0.33 0.85 0.74 0.42 0.39 0.43 0.63 0.49 0.48
0.26 0.29 0.35 0.4 0.44 0.35 0.45 0.29 0.46 0.3 0.29 0.28 0.25 0.82 0.32 0.38 0.2 0.3 0.28 0.3 0.28 1.0 0.9
0.84 1.0 0.63 0.56 0.77 0.62 0.72 0.69 0.21 0.25 0.49 0.36 0.47 0.37 0.21 0.72 0.76 0.4 0.43 0.46 0.54 0.45 0.47
0.19 0.17 0.07 0.64 0.81 0.45 0.31 0.46 0.09 0.11 0.36 0.22 0.11 0.11 0.15 0.71 0.28 0.27 0.26 0.29 0.32 1.0 0.79
0.66 1.0 0.55 0.54 0.4 0.52 0.8 0.71 0.64 0.78 0.83 0.44 0.47 0.56 0.29 0.52 0.46 0.4 0.37 0.4 0.76 0.6 0.58
1.0 0.74 0.91 0.47 0.62 0.47 0.75 0.76 0.42 0.27 0.46 0.35 0.55 0.33 0.29 0.72 0.76 0.44 0.45 0.41 0.58 0.45 0.41
0.74 0.79 0.44 0.68 0.69 0.57 1.0 0.74 0.17 0.3 0.48 0.51 0.55 0.45 0.47 0.93 0.99 0.43 0.42 0.41 0.71 0.53 0.45
0.42 0.44 0.61 0.7 0.95 0.75 0.41 0.45 0.22 0.13 0.54 0.6 0.44 0.26 0.41 0.61 0.44 0.44 0.45 0.45 0.45 0.94 1.0
1.0 0.78 0.51 0.55 0.59 0.47 0.92 0.88 0.34 0.44 0.88 0.35 0.38 0.54 0.24 0.89 0.9 0.49 0.5 0.48 0.58 0.63 0.55
1.0 0.78 0.61 0.62 0.64 0.6 0.93 0.68 0.31 0.35 0.7 0.55 0.63 0.41 0.24 0.71 0.75 0.43 0.45 0.4 0.68 0.56 0.53
0.84 0.96 0.98 0.78 1.0 0.71 0.74 0.67 0.2 0.19 0.49 0.47 0.48 0.44 0.36 0.84 0.83 0.42 0.43 0.46 0.7 0.58 0.6
1.0 0.72 0.85 0.41 0.5 0.52 0.55 0.75 0.4 0.63 0.66 0.46 0.42 0.68 0.3 0.78 0.71 0.59 0.53 0.48 0.58 0.51 0.7
0.89 0.97 0.94 0.68 1.0 0.7 0.57 0.69 0.44 0.35 0.67 0.55 0.62 0.68 0.39 0.85 0.92 0.49 0.49 0.38 0.59 0.64 0.71
0.44 0.65 1.0 0.64 0.51 0.47 0.56 0.49 0.22 0.26 0.83 0.31 0.4 0.53 0.2 0.63 0.64 0.31 0.27 0.34 0.66 0.45 0.4
0.43 0.48 1.0 0.59 0.54 0.49 0.23 0.24 0.06 0.08 0.5 0.17 0.24 0.36 0.16 0.47 0.48 0.18 0.13 0.18 0.64 0.05 0.26
1.0 0.68 0.8 0.5 0.62 0.43 0.57 0.56 0.38 0.36 0.62 0.41 0.7 0.51 0.46 0.7 0.8 0.41 0.41 0.49 0.81 0.55 0.57
0.66 0.44 0.85 0.65 0.79 0.88 0.26 0.39 0.28 0.12 0.97 0.19 0.34 0.62 0.44 1.0 0.99 0.48 0.52 0.29 0.3 0.39 0.45
0.8 0.73 0.64 0.45 0.47 0.6 1.0 0.87 0.41 0.42 0.48 0.35 0.47 0.39 0.28 0.78 0.6 0.39 0.41 0.46 0.52 0.45 0.52
1.0 0.89 0.38 0.72 0.71 0.66 0.93 0.83 0.67 0.44 0.98 0.76 0.77 0.46 0.33 0.84 0.96 0.5 0.49 0.41 0.82 0.65 0.62
0.31 0.56 0.36 0.63 0.6 0.74 0.16 0.14 0.25 0.45 1.0 0.56 0.72 0.89 0.74 0.58 0.54 0.66 0.71 0.55 0.67 0.86 0.7
0.68 0.66 0.64 0.65 0.92 0.74 0.21 0.39 0.41 0.42 0.92 0.32 0.37 0.96 0.32 0.73 1.0 0.61 0.62 0.3 0.38 0.38 0.59
0.8 0.96 0.54 0.59 0.71 0.62 0.53 0.55 0.38 0.28 0.81 0.36 0.5 0.41 0.25 0.87 1.0 0.4 0.38 0.31 0.79 0.47 0.53
0.66 0.64 0.5 0.64 0.74 0.49 1.0 0.81 0.31 0.27 0.4 0.52 0.63 0.3 0.39 0.77 0.72 0.35 0.36 0.48 0.75 0.7 0.6
1.0 0.96 0.65 0.69 0.73 0.81 0.71 0.69 0.35 0.51 0.82 0.5 0.63 0.59 0.36 0.95 0.85 0.47 0.49 0.42 0.69 0.58 0.67
0.05 0.19 0.0 0.2 1.0 0.08 0.13 0.04 0.04 0.34 0.6 0.05 0.01 0.79 0.01 0.35 0.2 0.11 0.17 0.03 0.09 0.32 0.89
0.96 0.97 0.42 0.63 0.96 0.6 1.0 0.85 0.59 0.55 0.98 0.54 0.59 0.42 0.33 0.96 0.98 0.53 0.52 0.54 0.67 0.77 0.76
0.66 0.77 0.89 0.81 1.0 0.66 0.94 0.79 0.35 0.33 0.54 0.36 0.45 0.34 0.57 0.9 0.96 0.39 0.4 0.37 0.53 0.57 0.55
0.16 0.06 0.02 0.36 0.77 0.14 0.18 0.2 0.06 0.03 0.02 0.29 0.05 0.03 0.18 0.33 0.06 0.22 0.21 0.15 0.08 1.0 0.71
1.0 0.83 0.9 0.83 0.65 0.65 0.78 0.6 0.4 0.43 0.83 0.45 0.54 0.28 0.43 0.79 0.57 0.32 0.36 0.51 0.88 0.78 0.71
0.58 0.41 0.35 0.86 0.89 0.82 1.0 0.36 0.49 0.43 0.47 0.39 0.44 0.28 0.3 0.46 0.24 0.26 0.23 0.32 0.5 0.82 0.73
0.82 0.94 0.96 0.47 0.36 0.47 1.0 0.79 0.17 0.31 0.28 0.35 0.35 0.5 0.15 0.55 0.53 0.61 0.56 0.55 0.61 0.31 0.32
1.0 0.98 0.76 0.63 0.76 0.7 0.9 0.75 0.37 0.38 0.71 0.5 0.61 0.65 0.37 0.85 0.91 0.52 0.55 0.53 0.82 0.71 0.66
0.61 1.0 0.35 0.67 0.71 0.43 0.0 0.18 0.0 0.0 0.97 0.32 0.29 0.39 0.29 0.94 0.81 0.18 0.15 0.31 0.53 0.86 0.68
0.82 0.69 1.0 0.73 0.84 0.68 0.46 0.3 0.33 0.23 0.55 0.49 0.7 0.39 0.44 0.57 0.42 0.24 0.26 0.34 0.65 0.73 0.69
0.92 0.85 0.79 0.58 0.64 0.61 0.66 0.73 0.36 0.28 0.94 0.4 0.47 0.5 0.36 1.0 0.95 0.39 0.4 0.39 0.65 0.58 0.52
1.0 0.8 0.73 0.67 0.62 0.72 0.6 0.85 0.3 0.3 0.59 0.32 0.35 0.47 0.26 0.9 0.88 0.46 0.47 0.33 0.49 0.68 0.59
0.93 0.83 0.62 0.73 0.89 0.7 0.74 0.87 0.24 0.22 0.4 0.29 0.35 0.47 0.3 1.0 0.99 0.52 0.56 0.39 0.49 0.57 0.57
0.94 0.86 1.0 0.65 0.66 0.74 0.72 0.62 0.4 0.36 0.72 0.55 0.59 0.59 0.31 0.75 0.79 0.44 0.42 0.43 0.8 0.65 0.6
0.79 0.71 0.59 0.72 0.51 0.63 0.92 0.71 0.5 0.64 0.77 0.56 0.76 0.46 0.46 1.0 0.99 0.42 0.43 0.41 0.86 0.83 0.72
0.73 0.62 0.43 0.53 0.66 0.59 0.67 0.6 0.57 0.46 1.0 0.44 0.58 0.45 0.57 0.98 0.81 0.42 0.41 0.51 0.67 1.0 0.89
0.96 0.64 0.47 0.75 0.58 0.49 1.0 0.93 0.34 0.5 0.67 0.44 0.45 0.52 0.33 0.9 0.96 0.42 0.44 0.35 0.56 0.59 0.54
0.64 0.64 0.48 0.63 0.76 0.58 0.32 0.43 0.28 0.31 0.65 0.37 0.44 0.47 0.31 0.9 1.0 0.39 0.4 0.29 0.43 0.61 0.61
0.56 0.32 0.58 0.48 0.45 0.42 0.25 0.3 0.34 0.21 0.52 0.26 0.34 0.17 0.24 0.6 0.25 0.21 0.22 0.22 0.31 1.0 0.83
0.97 0.63 0.52 0.54 0.61 0.56 0.56 0.6 0.3 0.29 0.45 0.35 0.4 0.46 0.28 0.97 1.0 0.5 0.56 0.36 0.52 0.6 0.61
0.4 0.83 0.08 0.72 0.76 0.97 0.98 0.79 0.51 0.59 0.83 0.93 0.61 1.0 0.45 0.86 0.85 0.91 0.86 0.79 0.46 0.86 0.62
1.0 0.6 0.8 0.63 0.78 0.6 0.77 0.74 0.24 0.27 0.56 0.3 0.46 0.59 0.34 0.94 1.0 0.46 0.45 0.4 0.67 0.42 0.39
0.81 0.28 0.72 0.9 1.0 0.74 0.55 0.34 0.21 0.29 0.64 0.63 0.37 0.22 0.26 0.61 0.19 0.19 0.11 0.39 0.64 0.33 0.53
0.92 0.73 0.54 0.79 0.62 0.81 0.39 0.71 0.33 0.48 0.77 0.44 0.44 0.42 0.29 1.0 0.99 0.34 0.4 0.4 0.62 0.74 0.78
0.35 0.39 1.0 0.42 0.45 0.32 0.95 0.5 0.46 0.56 0.44 0.41 0.59 0.6 0.31 0.47 0.4 0.23 0.24 0.71 0.46 0.51 0.41
1.0 0.63 0.35 0.64 0.65 0.59 0.99 0.88 0.32 0.46 0.65 0.29 0.45 0.35 0.37 0.87 0.76 0.38 0.41 0.49 0.81 0.61 0.56
0.96 0.58 0.7 0.77 1.0 0.85 0.41 0.49 0.25 0.18 0.8 0.55 0.52 0.26 0.34 0.72 0.53 0.34 0.39 0.35 0.61 0.87 0.87
0.36 0.31 0.41 0.35 0.44 0.33 0.28 0.39 0.14 0.15 0.06 0.36 0.15 0.05 0.12 0.15 0.03 0.29 0.26 0.16 0.17 1.0 0.87
0.86 1.0 0.78 0.61 0.78 0.78 0.41 0.45 0.48 0.44 0.88 0.46 0.52 0.68 0.47 0.7 0.71 0.5 0.51 0.47 0.58 0.9 0.85
1.0 0.71 0.77 0.57 0.71 0.56 0.58 0.55 0.37 0.31 0.67 0.57 0.62 0.62 0.5 0.68 0.68 0.44 0.42 0.38 0.95 0.43 0.48
0.85 0.52 0.33 0.64 0.81 0.66 0.78 0.7 0.5 0.29 0.66 0.38 0.39 0.4 0.62 0.95 1.0 0.45 0.47 0.58 0.66 0.75 0.66
1.0 0.66 0.36 0.49 0.63 0.6 0.59 0.76 0.45 0.47 0.75 0.41 0.34 0.37 0.26 0.73 0.71 0.34 0.36 0.38 0.61 0.5 0.52
0.48 0.68 0.93 1.0 0.58 0.39 0.86 0.41 0.28 0.09 0.51 0.17 0.25 0.88 0.53 0.42 0.35 0.02 0.03 0.41 0.8 0.0 0.0
0.51 0.33 0.32 0.67 0.76 0.64 0.43 0.33 0.34 0.45 0.38 0.4 0.32 0.16 0.29 0.7 0.24 0.22 0.24 0.31 0.4 1.0 0.87
0.69 0.81 0.67 0.81 0.7 0.58 1.0 0.81 0.3 0.39 0.5 0.67 0.55 0.31 0.51 0.73 0.55 0.34 0.33 0.42 0.61 0.75 0.75

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)