Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.52 0.41 1.0 0.52 0.52 0.49 0.6 0.33 0.81 0.21 0.41 0.27 0.43 0.76 1.0 0.43 0.33 0.27 0.25 0.34 0.78 0.39 0.33
0.1 0.09 1.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.01 0.13 0.13 0.04 0.01 0.02 0.15 0.12 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0
0.0 0.21 1.0 0.05 0.0 0.0 0.21 0.0 0.06 0.12 0.11 0.32 0.17 0.69 0.53 0.03 0.11 0.0 0.03 0.12 0.49 0.0 0.0
0.32 0.62 0.47 0.72 1.0 0.82 0.95 0.55 0.3 0.49 0.36 0.61 0.22 0.17 0.16 0.36 0.34 0.27 0.26 0.3 0.32 0.71 0.74
0.27 0.24 0.6 0.27 0.28 0.26 1.0 0.32 0.34 0.1 0.08 0.19 0.25 0.3 0.41 0.21 0.14 0.11 0.12 0.24 0.2 0.47 0.46
0.3 0.43 1.0 0.32 0.28 0.3 0.31 0.23 0.15 0.12 0.18 0.18 0.12 0.12 0.09 0.36 0.2 0.09 0.1 0.15 0.22 0.4 0.34
0.7 0.85 0.9 0.72 0.74 0.62 1.0 0.53 0.45 0.43 0.53 0.42 0.68 0.61 0.35 0.54 0.35 0.27 0.28 0.4 0.5 0.68 0.5
0.26 0.25 0.36 0.82 0.65 0.77 1.0 0.29 0.47 0.1 0.09 0.42 0.16 0.46 0.42 0.5 0.34 0.16 0.14 0.15 0.41 0.32 0.36
0.28 0.38 1.0 0.27 0.13 0.11 0.13 0.13 0.18 0.19 0.04 0.04 0.06 0.43 0.12 0.62 0.27 0.05 0.04 0.12 0.15 0.14 0.1
0.0 0.19 1.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.11 0.0 0.0 0.08 0.11 0.22 0.2 0.24 0.02 0.02 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 1.0 0.16 0.12 0.09 0.63 0.12 0.27 0.03 0.04 0.05 0.04 0.13 0.09 0.12 0.08 0.05 0.05 0.14 0.05 0.0 0.0
0.42 0.45 1.0 0.61 0.74 0.58 0.73 0.39 0.37 0.13 0.4 0.3 0.22 0.39 0.31 0.32 0.23 0.17 0.15 0.25 0.29 0.25 0.19
0.55 0.63 0.95 0.84 0.86 1.0 0.45 0.41 0.7 0.51 0.58 0.55 0.56 0.55 0.46 0.52 0.36 0.35 0.29 0.38 0.44 0.63 0.63
0.39 0.43 1.0 0.4 0.46 0.32 0.64 0.19 0.27 0.25 0.22 0.15 0.24 0.25 0.25 0.41 0.27 0.11 0.12 0.17 0.22 0.34 0.34
0.45 0.5 0.39 0.88 1.0 0.82 0.67 0.79 0.27 0.21 0.41 0.79 0.53 0.31 0.25 0.52 0.24 0.55 0.57 0.59 0.35 0.76 0.64
0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.11 0.08 0.05 0.09 0.03 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.61 0.7 0.82 0.83 0.68 0.68 0.62 0.3 0.81 1.0 0.48 0.4 0.37 0.47 0.42 0.53 0.33 0.16 0.15 0.34 0.49 0.74 0.68
0.18 0.35 1.0 0.45 0.39 0.26 0.22 0.21 0.58 0.15 0.25 0.13 0.14 0.4 0.3 0.35 0.39 0.15 0.16 0.17 0.2 0.17 0.14
0.59 0.61 0.82 0.73 1.0 0.34 0.5 0.23 0.27 0.34 0.28 0.31 0.31 0.37 0.22 0.45 0.3 0.11 0.1 0.29 0.42 0.32 0.26
0.0 0.41 0.09 0.95 1.0 0.85 0.29 0.19 0.14 0.1 0.6 0.48 0.78 0.0 0.12 0.51 0.05 0.16 0.12 0.49 0.42 0.0 0.0
0.59 0.77 1.0 0.7 0.47 0.72 0.96 0.66 0.42 0.46 0.33 0.5 0.32 0.65 0.35 0.62 0.43 0.34 0.31 0.43 0.46 0.61 0.67
0.29 0.4 0.2 0.84 0.65 1.0 0.21 0.21 0.2 0.52 0.43 0.72 0.22 0.48 0.65 0.61 0.32 0.24 0.23 0.18 0.52 0.69 0.55
0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.14 0.79 0.73 0.0 0.05 0.0 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0
0.12 0.11 1.0 0.4 0.32 0.19 0.22 0.13 0.2 0.04 0.04 0.11 0.07 0.17 0.45 0.24 0.23 0.02 0.02 0.1 0.15 0.0 0.02
0.0 0.0 0.49 0.31 0.72 0.69 0.0 0.0 0.66 0.0 0.25 0.0 0.35 0.97 0.84 0.64 1.0 0.18 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0
0.19 0.2 1.0 0.47 0.62 0.38 0.21 0.25 0.31 0.06 0.14 0.2 0.22 0.21 0.13 0.38 0.34 0.16 0.18 0.33 0.14 0.06 0.04
0.89 0.87 1.0 0.68 0.35 0.47 0.99 0.35 0.69 0.23 0.3 0.47 0.47 0.47 0.38 0.16 0.13 0.14 0.15 0.34 0.65 0.31 0.28
0.47 0.61 0.47 0.66 1.0 0.34 0.53 0.16 0.4 0.54 0.33 0.49 0.26 0.19 0.49 0.68 0.55 0.11 0.14 0.31 0.72 0.64 0.53
0.45 0.26 0.79 0.5 0.46 0.48 1.0 0.65 0.24 0.12 0.12 0.38 0.47 0.59 0.5 0.33 0.25 0.23 0.25 0.53 0.43 0.14 0.1
0.0 0.04 1.0 0.29 0.49 0.23 0.25 0.11 0.07 0.02 0.1 0.04 0.1 0.07 0.21 0.29 0.04 0.01 0.09 0.2 0.0 0.0 0.0
0.52 0.64 0.92 0.64 0.64 0.55 1.0 0.56 0.12 0.12 0.64 0.31 0.49 0.17 0.35 0.5 0.22 0.21 0.2 0.31 0.51 0.63 0.57
0.0 0.0 1.0 0.12 0.07 0.04 0.0 0.11 0.13 0.28 0.08 0.07 0.03 0.03 0.13 0.12 0.22 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.67 0.65 0.69 0.5 0.26 0.52 0.57 0.28 1.0 0.44 0.57 0.29 0.69 1.0 0.96 0.62 0.52 0.16 0.17 0.53 0.53 0.32 0.29
0.0 0.0 1.0 0.37 0.58 0.23 0.36 0.11 0.05 0.04 0.14 0.51 0.31 0.26 0.12 0.27 0.23 0.08 0.08 0.32 0.0 0.0 0.0
0.66 0.77 1.0 0.71 0.64 0.7 0.64 0.39 0.49 0.61 0.63 0.64 0.49 0.58 0.46 0.51 0.45 0.25 0.26 0.47 0.61 0.28 0.39
0.0 0.04 1.0 0.05 0.02 0.09 0.02 0.01 0.14 0.03 0.09 0.06 0.13 0.19 0.21 0.06 0.09 0.01 0.03 0.09 0.17 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.2 0.44 1.0 0.36 0.4 0.45 0.68 0.31 0.19 0.08 0.11 0.24 0.23 0.22 0.17 0.2 0.19 0.08 0.07 0.2 0.56 0.14 0.11
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.3 0.56 1.0 0.7 0.54 0.88 0.52 0.53 0.21 0.45 0.23 0.44 0.22 0.32 0.72 0.18 0.22 0.22 0.7 0.34 0.56 0.54
0.73 0.58 1.0 0.55 0.46 0.5 0.72 0.44 0.27 0.28 0.64 0.35 0.58 0.36 0.31 0.49 0.38 0.23 0.22 0.39 0.6 0.49 0.44
0.48 0.64 0.29 0.55 0.64 0.46 0.6 0.21 0.59 0.74 0.33 0.38 0.22 0.23 0.14 0.16 0.27 0.07 0.07 0.29 0.42 0.9 1.0
0.0 0.16 1.0 0.3 0.0 0.19 0.23 0.0 0.1 0.07 0.09 0.11 0.28 0.29 0.25 0.07 0.12 0.03 0.02 0.16 0.14 0.0 0.0
0.33 0.39 1.0 0.36 0.38 0.38 0.41 0.38 0.25 0.15 0.15 0.26 0.18 0.26 0.29 0.45 0.38 0.14 0.17 0.23 0.41 0.39 0.37
1.0 0.53 0.91 0.55 0.47 0.53 0.65 0.4 0.4 0.36 0.63 0.35 0.35 0.34 0.66 0.75 0.67 0.19 0.2 0.46 0.77 0.75 0.63
0.99 0.59 1.0 0.59 0.28 0.45 0.7 0.47 0.43 0.38 0.63 0.31 0.38 0.4 0.98 0.5 0.49 0.21 0.22 0.41 0.86 0.57 0.54
0.51 0.54 1.0 0.32 0.24 0.37 0.77 0.41 0.14 0.08 0.13 0.29 0.19 0.26 0.14 0.16 0.1 0.09 0.09 0.17 0.38 0.15 0.19
0.22 0.33 1.0 0.4 0.3 0.49 0.5 0.38 0.08 0.03 0.05 0.12 0.13 0.1 0.12 0.21 0.05 0.08 0.07 0.11 0.23 0.23 0.24
0.16 0.13 1.0 0.19 0.22 0.24 0.19 0.02 0.16 0.04 0.06 0.18 0.44 0.07 0.06 0.15 0.05 0.0 0.01 0.11 0.14 0.07 0.0
0.21 0.2 1.0 0.35 0.22 0.22 0.21 0.1 0.69 0.19 0.16 0.09 0.21 0.44 0.43 0.24 0.2 0.07 0.06 0.13 0.25 0.08 0.04
0.12 0.02 1.0 0.18 0.09 0.03 0.0 0.24 0.0 0.12 0.0 0.04 0.0 0.05 0.13 0.09 0.21 0.04 0.02 0.04 0.13 0.25 0.0
1.0 0.6 0.99 0.99 0.44 0.64 0.42 0.24 0.79 0.74 0.41 0.44 0.45 0.58 0.74 0.61 0.25 0.19 0.18 0.3 0.91 0.67 0.68
0.5 0.5 1.0 0.49 0.5 0.44 0.77 0.43 0.28 0.27 0.39 0.26 0.33 0.27 0.31 0.44 0.39 0.18 0.17 0.3 0.43 0.47 0.41
0.06 0.01 0.75 0.19 0.11 0.2 1.0 0.13 0.05 0.0 0.02 0.1 0.1 0.11 0.3 0.08 0.05 0.01 0.01 0.16 0.06 0.0 0.0
0.17 0.26 0.23 0.66 0.58 1.0 0.64 0.29 0.32 0.15 0.14 0.48 0.15 0.39 0.2 0.24 0.16 0.12 0.07 0.08 0.11 0.46 0.46
0.34 0.28 0.22 0.83 0.7 0.69 1.0 0.23 0.25 0.12 0.16 0.2 0.24 0.25 0.49 0.36 0.17 0.16 0.14 0.36 0.36 0.38 0.4
0.13 0.15 1.0 0.21 0.27 0.14 0.09 0.07 0.18 0.03 0.03 0.11 0.08 0.05 0.12 0.15 0.04 0.03 0.02 0.06 0.37 0.06 0.05
0.12 0.06 0.43 0.37 0.47 0.23 1.0 0.35 0.09 0.07 0.07 0.14 0.23 0.13 0.41 0.23 0.16 0.06 0.06 0.2 0.14 0.09 0.12
0.66 0.89 0.43 0.72 0.76 0.61 0.8 0.32 0.32 0.5 0.52 0.61 0.73 0.29 1.0 0.7 0.56 0.23 0.24 0.41 0.82 0.72 0.76
0.0 0.0 1.0 0.2 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.29 0.43 0.48 0.13 0.48 0.11 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0
0.19 0.23 0.19 0.25 0.39 0.14 1.0 0.58 0.27 0.15 0.04 0.18 0.13 0.17 0.15 0.18 0.17 0.06 0.07 0.23 0.04 0.0 0.0
0.0 0.43 1.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.13 0.11 0.06 0.1 0.05 0.31 0.28 0.17 0.09 0.08 0.02 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.88 0.56 0.82 0.0 0.0 0.0 0.2 0.21 0.39 0.0 1.0 0.85 0.58 0.52 0.38 0.0 0.25 0.4 0.0 0.0 0.0
0.05 0.32 0.59 0.83 0.88 0.57 1.0 0.8 0.08 0.02 0.06 0.16 0.04 0.15 0.12 0.38 0.12 0.11 0.06 0.16 0.14 0.14 0.17
0.56 0.91 0.65 0.69 0.43 0.7 0.93 0.46 0.85 0.76 0.78 0.61 0.85 0.54 0.87 0.53 0.4 0.24 0.22 0.43 1.0 0.93 0.75
0.5 0.73 1.0 0.44 0.58 0.46 0.55 0.51 0.21 0.15 0.42 0.36 0.32 0.35 0.25 0.47 0.37 0.24 0.27 0.29 0.37 0.45 0.55
0.32 0.0 1.0 0.06 0.11 0.03 0.23 0.0 0.16 0.16 0.06 0.12 0.02 0.07 0.08 0.09 0.02 0.0 0.0 0.04 0.19 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.5 0.91 0.5 0.35 0.4 1.0 0.3 0.71 0.56 0.32 0.36 0.46 0.59 0.48 0.41 0.43 0.18 0.17 0.47 0.44 0.3 0.4
0.43 0.41 0.58 0.48 0.5 0.7 1.0 0.46 0.2 0.04 0.15 0.3 0.28 0.25 0.22 0.31 0.1 0.11 0.12 0.24 0.27 0.06 0.11
0.5 0.41 0.3 0.65 0.68 1.0 0.58 0.18 0.07 0.13 0.17 0.45 0.19 0.26 0.35 0.4 0.14 0.14 0.15 0.4 0.49 0.58 0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)