Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.05 0.19 0.44 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.22 0.02 0.0 0.01 1.0 0.11 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.04 0.0 0.0
0.1 0.16 0.78 0.0 0.0 0.0 0.19 0.04 0.36 0.04 0.0 0.01 1.0 0.12 0.45 0.0 0.01 0.0 0.0 0.72 0.07 0.0 0.0
0.0 0.22 1.0 0.2 0.12 0.0 0.27 0.36 0.52 0.0 0.06 0.0 0.51 0.04 0.22 0.16 0.15 0.12 0.0 0.39 0.22 0.0 0.0
0.61 0.46 0.9 0.0 0.08 0.09 0.37 0.0 1.0 0.0 0.09 0.08 0.26 0.27 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.15 0.0 0.0
0.29 0.1 0.38 0.04 0.01 0.03 0.38 0.09 1.0 0.16 0.02 0.03 0.16 0.14 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.39 0.13 0.0 0.03
0.36 0.29 0.54 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.06 0.06 0.08 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.03 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0
0.17 0.09 1.0 0.25 0.28 0.83 0.11 0.06 0.91 0.59 0.2 0.49 0.1 0.12 0.03 0.05 0.05 0.1 0.1 0.05 0.12 0.27 0.37
0.31 0.15 0.0 0.23 0.04 0.02 0.39 0.0 1.0 0.05 0.06 0.16 0.25 0.04 0.08 0.15 0.04 0.02 0.0 0.24 0.06 0.0 0.1
0.47 0.05 0.17 0.07 0.06 0.07 0.21 0.33 1.0 0.08 0.02 0.42 0.05 0.05 0.06 0.03 0.02 0.48 0.47 0.1 0.03 0.1 0.13
0.36 0.49 0.07 0.07 0.05 0.06 0.13 0.05 0.37 0.23 0.06 0.31 0.18 0.05 0.09 0.04 0.08 0.03 0.03 1.0 0.13 0.18 0.3
0.0 0.0 0.43 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.07 0.15 0.05 0.07 1.0 0.07 0.44 0.0 0.0 0.01 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.01 0.19 0.01 0.0 0.0 0.65 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.06 0.35 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 1.0 0.22 0.01 0.01 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.22 0.08 0.55 0.02 0.0 0.01 0.13 0.0 1.0 0.33 0.06 0.03 0.16 0.03 0.67 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.48 0.09 0.0
0.15 0.65 0.0 0.13 0.18 0.23 0.49 0.57 0.32 0.23 0.62 0.21 0.22 0.69 0.27 0.23 0.19 0.12 0.07 1.0 0.55 0.14 0.51
0.19 0.27 0.13 0.02 0.0 0.05 1.0 0.11 0.85 0.12 0.07 0.12 1.0 0.07 0.05 0.02 0.01 0.03 0.03 0.86 0.17 0.0 0.06
0.0 0.26 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.38 0.96 1.0 0.27 0.0 0.1 0.09 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
0.22 0.39 0.23 0.45 0.1 0.16 0.69 0.13 1.0 0.94 0.04 0.24 0.14 0.07 0.32 0.02 0.02 0.06 0.04 0.18 0.64 0.11 0.05
0.46 0.11 0.11 0.04 0.07 0.05 0.31 0.15 1.0 0.53 0.03 0.34 0.19 0.06 0.06 0.01 0.01 0.03 0.03 0.1 0.23 0.21 0.2
0.0 0.0 1.0 0.22 0.18 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.96 0.0 0.13 0.6 0.33 0.18 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0
0.32 0.78 0.45 0.05 0.0 0.04 1.0 0.07 0.64 0.27 0.14 0.2 0.79 0.48 0.14 0.06 0.05 0.01 0.01 0.53 0.27 0.08 0.0
0.24 0.42 0.69 0.07 0.05 0.17 0.17 0.1 1.0 0.49 0.08 0.13 0.35 0.09 0.03 0.06 0.1 0.07 0.08 0.13 0.15 0.1 0.13
0.23 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.19 0.05 1.0 0.04 0.01 0.01 0.3 0.02 0.27 0.0 0.0 0.01 0.01 0.1 0.08 0.01 0.01
0.17 0.17 0.04 0.01 0.09 0.02 0.45 0.07 1.0 0.2 0.04 0.07 0.95 0.07 0.05 0.11 0.09 0.03 0.04 0.69 0.11 0.04 0.03
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.95 1.0 0.0 0.17 0.0 0.23 0.25 0.0 0.0 0.0 0.21 0.16 0.0 0.0 0.0
0.31 0.07 0.64 0.13 0.05 0.13 0.68 0.1 1.0 0.1 0.06 0.06 0.21 0.14 0.24 0.23 0.09 0.06 0.12 0.73 0.27 0.11 0.0
0.08 0.33 0.04 0.24 0.22 0.26 0.21 0.05 1.0 0.48 0.11 0.17 0.1 0.08 0.17 0.08 0.06 0.08 0.07 0.14 0.32 0.21 0.39
0.13 0.23 0.05 0.18 0.09 0.04 1.0 0.08 0.82 0.04 0.0 0.09 0.31 0.07 0.02 0.07 0.0 0.05 0.06 0.42 0.06 0.0 0.05
0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 0.3 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.07 0.02 0.0 0.0 0.01 0.67 0.08 1.0 0.02 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01
0.19 0.17 0.05 0.01 0.01 0.02 1.0 0.2 0.76 0.01 0.08 0.03 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02
0.27 0.36 0.25 0.18 0.41 0.18 0.26 0.08 1.0 0.74 0.17 0.13 0.11 0.16 0.05 0.18 0.21 0.08 0.08 0.14 0.24 0.19 0.29
0.18 0.18 0.17 0.37 0.57 0.49 0.25 0.39 1.0 0.47 0.13 0.38 0.11 0.32 0.05 0.34 0.33 0.37 0.39 0.1 0.08 0.29 0.41
0.35 0.39 0.59 0.0 0.0 0.0 0.22 0.04 1.0 0.19 0.06 0.03 0.81 0.05 0.42 0.0 0.01 0.0 0.0 0.82 0.26 0.02 0.0
0.14 0.42 0.13 0.41 0.39 0.29 0.28 0.08 1.0 0.46 0.34 0.29 0.09 0.07 0.11 0.17 0.14 0.18 0.22 0.31 0.18 0.36 0.44
0.49 0.67 0.35 0.23 0.37 0.56 0.29 0.24 1.0 0.63 0.4 0.34 0.17 0.29 0.09 0.27 0.24 0.27 0.25 0.37 0.2 0.35 0.37
0.09 0.2 0.48 0.01 0.0 0.0 0.96 0.04 1.0 0.13 0.42 0.1 0.35 0.06 0.02 0.02 0.01 0.0 0.04 0.15 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.92 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.46 0.33 0.37 0.59 1.0 0.36 0.34 0.53 0.43 0.07 0.33 0.23 0.33 0.05 0.52 0.45 0.48 0.49 0.28 0.17 0.38 0.64
0.29 0.61 0.06 0.51 0.2 0.43 0.54 0.28 1.0 0.83 0.05 0.32 0.4 0.02 0.24 0.05 0.08 0.09 0.05 0.13 0.4 0.65 0.25
0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 1.0 0.23 0.07 0.0 0.06 0.09 0.49 0.0 0.08 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.52 0.35 1.0 0.05 0.02 0.04 0.71 0.21 0.31 0.31 0.14 0.11 0.47 0.01 0.21 0.02 0.03 0.03 0.02 0.53 0.31 0.08 0.09
0.1 0.04 0.0 0.02 0.01 0.02 0.09 0.0 1.0 0.04 0.07 0.01 0.01 0.03 0.04 0.03 0.01 0.05 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0
0.49 0.31 0.0 0.04 0.04 0.04 0.61 0.12 1.0 0.04 0.07 0.04 0.03 0.11 0.03 0.12 0.15 0.21 0.19 0.08 0.0 0.09 0.08
0.3 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.94 0.1 1.0 0.04 0.04 0.01 0.81 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.44 0.07 0.01 0.0
0.33 0.2 0.13 0.14 0.15 0.14 0.55 0.15 1.0 0.48 0.5 0.12 0.16 0.18 0.09 0.15 0.13 0.12 0.12 0.13 0.16 0.22 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.2 0.21 1.0 0.08 0.05 0.08 0.19 0.11 0.14 0.6 0.2 0.15 0.27 0.1 0.19 0.08 0.1 0.06 0.06 0.51 0.34 0.15 0.14
0.55 0.06 0.3 0.06 0.04 0.06 0.49 0.25 0.12 0.1 0.2 0.05 0.13 0.74 0.08 0.23 0.29 0.03 0.04 1.0 0.06 0.06 0.09
1.0 0.7 0.1 0.28 0.25 0.27 0.52 0.45 0.91 0.5 0.25 0.29 0.82 0.56 0.25 0.41 0.58 0.38 0.36 0.36 0.34 0.39 0.55
0.51 0.24 0.23 0.3 0.23 0.4 0.69 0.72 0.96 0.37 0.16 1.0 0.22 0.3 0.18 0.17 0.13 0.34 0.31 0.28 0.3 0.54 0.67
0.14 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.15 0.68 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.04 0.02 0.0
0.55 0.25 0.49 0.05 0.09 0.22 1.0 0.13 0.19 0.95 0.08 0.22 0.12 0.27 0.21 0.01 0.07 0.07 0.0 0.53 0.2 0.0 0.0
0.65 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.15 1.0 0.0 0.0 0.1 0.4 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.8 0.07 0.0 0.0
0.11 0.15 0.07 0.02 0.01 0.01 0.65 0.18 1.0 0.13 0.44 0.06 0.11 0.02 0.03 0.02 0.01 0.05 0.07 0.02 0.06 0.04 0.03
0.06 0.08 1.0 0.01 0.01 0.01 0.08 0.02 0.59 0.37 0.02 0.03 0.73 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.26 0.21 0.07 0.07
0.11 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.35 0.04 1.0 0.02 0.03 0.01 0.07 0.05 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.07 0.01 0.02
0.28 0.13 0.2 0.45 0.26 0.43 0.5 0.65 1.0 0.0 0.09 0.17 0.03 0.11 0.46 0.43 0.24 0.52 0.18 0.16 0.33 0.48 0.65
0.22 0.96 0.27 0.02 0.05 0.01 1.0 0.11 0.77 0.56 0.0 0.32 0.54 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.06 0.01 0.0
0.34 0.24 0.17 0.06 0.05 0.05 0.4 0.28 1.0 0.19 0.07 0.03 0.47 0.03 0.07 0.08 0.04 0.09 0.1 0.53 0.35 0.09 0.1
0.07 0.11 0.08 0.01 0.01 0.02 0.37 0.12 1.0 0.12 0.02 0.05 0.41 0.12 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.33 0.06 0.03 0.02
0.2 0.24 1.0 0.01 0.02 0.02 0.38 0.08 0.74 0.37 0.54 0.02 0.77 0.15 0.5 0.04 0.05 0.02 0.02 0.43 0.27 0.03 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)