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Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
-0.42 -0.02 -0.42 -0.15 -0.43 -0.37 -0.78 -1.52 0.54 -0.65 0.91 -0.55 -0.01 -0.33 -0.32 -0.2 -1.59 -0.38 -1.32 -0.64 0.44 1.65 1.17 0.79 1.4 0.79 0.76 0.7 1.36 -0.83 -1.29 -0.14 -0.53 -0.95 -0.63 -1.15 -0.09 -0.19 0.15 0.05 -0.3 -0.84 -0.49 -0.49 -0.34 -0.23 -2.25 -0.37 0.28 -0.54 -0.49
-0.62 -1.06 -0.77 0.18 -1.05 -1.03 -0.34 -1.76 -0.68 -1.23 -0.8 -1.6 -0.53 -0.99 -1.14 0.06 -1.12 -1.28 -1.59 -0.62 0.96 2.92 0.55 0.12 2.61 2.11 -0.1 -0.38 0.22 -1.54 -2.11 0.71 -0.55 -2.12 -1.17 -1.35 -0.4 -0.71 0.91 0.22 0.09 -0.64 -0.55 -1.49 -1.47 -0.83 -1.13 -0.64 -1.68 -1.73 -1.11
-1.38 -0.89 -0.72 0.09 -0.81 -0.15 -0.42 -1.47 0.54 -2.62 0.67 -0.71 -0.39 0.72 0.47 -0.84 -1.15 0.37 -0.79 0.58 0.31 1.04 0.56 0.68 1.17 -0.56 0.58 0.86 1.16 0.11 0.19 0.35 -0.8 -0.4 -0.75 -1.03 0.92 -0.62 0.42 0.21 0.12 -0.28 -0.81 -2.54 -2.07 -1.97 -2.27 -0.51 1.02 0.31 -0.42
-1.75 -2.92 -0.8 0.06 -0.07 -0.95 -1.18 -1.61 0.02 -1.07 0.58 -2.93 -1.42 -0.58 0.05 -1.18 - -0.51 -1.74 -1.45 2.18 0.85 0.12 1.77 0.64 2.35 1.82 1.08 1.07 0.03 -0.26 -1.73 -1.51 -2.74 -3.27 -3.2 0.72 -0.99 -2.34 -3.83 -3.25 -2.12 -0.66 -0.79 -1.06 -1.5 -0.77 -1.99 1.72 0.77 -0.02
-0.71 -1.45 -3.21 -5.05 -4.52 -1.0 -2.91 -2.68 -0.19 -0.6 -1.42 -4.62 -1.29 -1.78 -1.6 0.09 -3.04 -1.35 -2.06 -1.29 1.45 -0.27 1.12 2.7 -0.0 0.09 2.41 0.46 4.11 -3.13 -4.85 -3.73 -0.34 -2.55 -3.32 -2.7 -0.76 -4.28 -5.03 -3.3 -3.76 -1.53 -1.58 -1.39 -1.1 -0.92 -1.0 -2.68 -2.27 -2.68 -2.65
0.38 0.2 -0.93 0.39 -0.55 -1.26 -0.47 -0.48 -0.08 0.14 0.14 0.56 -0.53 -0.85 -0.81 -0.78 -1.81 -0.79 -0.48 -0.47 0.63 1.55 0.7 0.64 1.42 0.48 0.05 0.09 0.4 0.57 0.52 -0.13 -0.6 -0.8 -1.88 -0.36 0.3 -1.5 -0.28 -0.33 -0.3 0.15 -0.59 0.12 0.07 -0.04 -0.36 -0.38 0.03 0.13 0.03
1.13 0.04 -0.26 0.8 -1.6 -1.13 0.02 -0.82 -0.01 -1.4 -0.1 0.26 -0.13 -0.62 -0.6 -0.12 -1.23 -0.58 0.03 -0.55 0.01 1.2 0.23 1.02 1.1 -0.45 0.8 0.71 0.9 -0.04 -0.21 0.28 -0.27 -0.18 -1.3 -0.01 -0.44 -1.09 0.1 0.08 -0.02 0.17 -0.1 -1.96 -1.58 -1.76 -0.59 0.32 0.15 0.17 0.23
-8.11 - - -8.57 3.79 -2.31 -5.72 -7.67 1.66 -5.27 -0.2 -9.43 -0.97 -2.12 -2.3 -2.71 - -2.16 -5.9 -5.55 -2.52 3.08 2.21 1.15 3.25 1.35 0.61 -4.69 1.02 -7.71 -6.92 -6.83 -5.04 -6.49 -8.05 -6.7 -4.62 -5.27 -6.33 -6.83 -8.0 -5.82 -4.93 -4.44 -4.39 -5.0 -5.91 -6.45 -5.63 -8.17 -9.28
0.82 0.3 -1.14 0.12 -0.09 0.54 -2.99 -4.92 1.04 -0.01 0.9 -0.93 0.13 -0.86 -0.62 0.1 -1.97 -0.91 -0.99 -0.79 -0.46 2.48 1.01 1.27 2.14 0.07 1.05 0.26 2.13 -2.24 -3.89 -2.17 -0.45 -1.6 -0.91 -3.0 -1.17 -0.78 -1.68 -1.75 -2.43 -1.57 -1.27 -0.04 0.09 0.13 -5.28 -2.41 -0.48 -1.71 -2.11
0.26 0.76 -0.02 0.89 -0.84 -0.57 -0.72 0.28 0.41 -0.98 0.37 -1.43 -0.15 -0.61 -0.54 -0.29 -0.6 -0.67 -0.55 -1.26 1.0 1.46 0.14 0.95 1.32 0.74 0.66 0.16 1.05 0.2 0.51 -0.73 -0.48 -1.25 -0.6 -1.32 -0.96 -0.6 -0.29 -0.39 -0.34 -0.71 -0.27 0.27 0.15 0.31 -0.5 -0.82 -0.77 -1.18 -1.63
-0.54 -1.02 -1.61 0.65 -0.06 -0.48 -0.04 -3.16 -0.3 -1.87 -0.31 -1.68 -0.57 -0.72 -0.82 -0.16 -0.98 -0.8 -1.44 -0.98 0.09 0.93 -0.4 1.45 1.17 -0.41 1.86 1.2 2.06 -0.82 -0.95 0.42 -0.58 -0.28 0.13 -0.66 -1.18 0.85 0.48 0.38 0.11 -0.27 -0.5 -0.62 0.02 -0.52 -2.61 -0.09 -0.01 -0.55 -1.54
-2.46 0.01 -1.87 -1.51 -0.89 -0.69 -0.9 -1.36 0.58 -3.82 0.69 -1.76 0.18 -0.03 -0.02 0.28 -0.81 -0.06 -0.97 -1.2 0.15 2.46 1.0 1.0 2.51 1.3 1.5 0.39 1.79 -2.06 -1.95 -0.73 -0.37 -1.11 -0.75 -0.95 -1.53 -0.65 -0.81 -0.78 -0.79 -1.05 -0.74 -3.7 -3.1 -3.02 -1.3 -0.83 -0.45 -0.64 -0.84
-1.07 -0.15 -0.82 0.51 -1.11 -0.47 0.09 0.0 -0.85 -2.76 -0.12 -0.36 -0.4 -0.48 -0.49 -0.69 -0.46 -0.46 -0.3 -1.02 0.8 1.23 -0.05 0.99 1.27 -0.13 0.9 1.13 1.26 0.18 0.27 0.28 -0.73 -0.56 0.02 -0.64 -0.9 -0.84 -0.17 0.32 0.56 0.12 -0.68 -2.07 -1.42 -1.56 -1.51 0.31 0.8 0.6 -0.12
0.09 1.17 -0.31 0.56 -1.61 -1.54 -0.26 -3.55 -0.56 -4.0 -0.84 -1.14 -1.34 -0.29 -0.35 -1.25 -0.48 -0.52 -0.74 -0.86 -0.49 1.56 1.48 0.83 1.39 0.46 0.8 1.0 1.48 -0.62 -1.64 0.06 -1.68 -2.07 0.46 -1.59 0.1 -0.57 0.15 0.32 0.68 -1.19 -1.9 -2.21 -1.17 -1.56 -3.41 -0.46 0.92 1.13 0.78
-0.23 0.02 0.28 -0.03 -0.99 -1.32 -0.43 -0.54 -0.03 -1.73 0.1 -0.5 0.14 -0.69 -0.72 -0.07 -1.7 -0.75 -1.0 -0.69 0.74 1.81 1.07 1.21 1.59 0.94 0.72 0.71 1.33 0.22 0.43 0.09 0.24 -1.12 -1.37 -0.96 -0.68 -1.37 -0.04 0.03 -0.18 -0.48 -0.16 -1.85 -1.52 -1.55 -1.09 -0.29 -0.14 -0.84 -0.74
-0.66 -0.88 -0.48 -0.79 -1.86 -0.63 0.5 -0.5 -0.91 -0.61 -0.12 -0.78 -1.45 -0.18 -0.22 -0.45 -0.56 -0.21 -0.49 -0.34 0.33 1.69 0.19 0.72 1.68 -0.17 0.74 0.55 1.0 0.14 0.3 0.37 -1.15 -0.37 -0.41 0.4 -0.58 -0.73 0.45 0.85 0.65 0.38 -1.24 -1.36 -0.93 -0.98 -0.33 0.74 -0.28 -0.94 -0.98
-0.76 0.32 0.04 -1.9 0.56 0.16 -1.11 -0.85 0.12 0.18 0.68 0.55 -0.79 0.53 0.63 -1.3 -1.72 0.35 -1.31 -0.16 0.61 2.2 1.18 0.59 1.69 1.64 -0.39 -0.7 0.48 -0.37 -0.13 -1.46 -1.11 -1.57 -1.54 -1.28 -0.13 -0.71 -1.08 -1.04 -1.1 -0.96 -0.41 -0.37 -0.44 -0.15 -1.89 -1.44 -0.47 -0.42 -0.33
-0.78 -0.77 -0.39 -0.18 -1.85 -2.02 -1.53 0.47 -0.01 -0.72 0.28 -0.36 -0.24 -0.15 -0.32 -0.65 -2.13 -0.48 -0.52 -0.68 1.23 1.71 0.47 1.26 1.72 0.66 0.62 0.16 0.48 1.04 1.19 -0.88 -0.17 -0.82 -2.47 -0.51 -1.06 -1.32 -1.19 -0.93 -1.08 -0.16 -0.17 -0.73 -0.49 -0.37 -0.92 -0.97 0.73 0.57 -0.02
-1.55 -1.52 -0.91 0.29 -2.87 -1.65 -1.65 0.05 0.37 -0.52 0.33 -1.29 0.01 -0.79 -0.78 -0.07 -1.52 -0.79 -0.77 -1.09 1.8 1.53 1.12 1.48 1.35 0.99 1.6 0.47 1.24 0.24 0.62 -0.51 -0.17 -1.65 -1.77 -0.65 -1.38 -1.48 -0.87 -0.82 -0.88 -0.3 -0.1 -0.23 -0.2 -0.32 -0.36 -0.8 -0.4 -0.78 -1.27
-0.4 -0.73 0.26 -0.21 -0.9 -0.44 -0.7 0.44 -0.09 -3.05 -0.02 -0.84 -0.11 0.24 0.13 -0.3 -0.33 -0.0 -0.16 0.43 1.41 1.53 0.56 0.97 1.72 -0.37 0.8 0.87 0.33 0.33 0.49 -0.49 -0.08 -0.49 -0.9 -0.66 -0.54 -0.49 -0.81 -0.67 -0.6 0.19 0.06 -2.57 -2.39 -2.45 -0.8 -0.55 -0.32 -0.36 -0.3
0.53 -0.13 0.11 -0.01 -1.67 -1.0 -0.51 0.36 0.02 -2.41 -0.27 -0.3 -0.06 -0.72 -0.77 0.04 -1.43 -0.85 0.15 -0.1 0.73 1.63 0.55 1.22 1.57 -0.19 0.87 0.0 1.21 0.81 0.91 -0.29 0.38 -0.47 -1.77 -0.09 -0.74 -1.27 -0.58 -0.75 -1.06 0.28 -0.11 -1.96 -1.69 -1.66 -0.31 -0.17 -0.22 -0.54 -0.91
-7.51 -7.66 -7.14 -4.05 1.65 -0.86 -1.02 -7.72 0.4 -5.71 0.27 -1.21 -0.36 0.69 0.23 -1.84 -4.16 0.75 -5.33 -4.96 -1.17 2.98 0.8 0.28 3.23 0.14 -0.26 -2.66 1.43 -6.11 -6.01 1.4 -1.16 -2.92 -6.12 -2.49 -2.26 -6.42 2.15 0.56 0.55 -2.23 -3.34 -6.05 -4.82 -4.82 -3.95 -0.48 -3.05 -2.52 -2.81
-2.75 -2.62 -2.31 -3.29 2.31 -1.62 0.54 -0.88 -0.56 -5.16 -0.32 -4.08 -1.03 -0.62 -0.94 -1.16 -2.51 -0.77 0.42 -1.82 -1.11 0.28 0.06 1.83 0.33 -0.08 2.11 -0.85 2.88 -0.44 -1.27 0.34 -1.49 -2.41 -3.06 -0.4 -2.06 0.94 0.75 -0.0 -1.16 1.06 -2.32 -6.03 -3.38 -3.93 0.66 0.53 -0.84 -0.85 -0.75
-0.23 -0.54 -0.37 0.14 -0.31 -0.21 -0.53 -0.66 -0.44 -1.23 -0.33 -0.95 0.07 -0.28 -0.53 -0.05 -0.72 -0.54 -0.83 -0.54 0.37 1.93 1.11 0.91 1.81 0.81 0.76 0.27 1.52 -0.84 -0.86 -0.25 0.04 -0.53 -0.71 -0.81 -0.86 -0.06 0.38 0.07 -0.41 -0.74 -0.36 -1.4 -1.0 -1.03 -0.78 -0.48 -0.27 -0.36 -0.45
0.26 -0.49 -0.44 0.69 -2.4 -2.2 -0.12 -0.62 -0.1 -1.48 -0.22 -0.17 -0.38 -0.58 -0.71 -0.32 -1.72 -0.69 -0.17 -0.12 0.42 1.3 0.08 1.24 1.15 -0.46 0.87 0.76 1.22 0.53 0.36 0.55 -0.47 -0.41 -1.66 -0.09 -0.13 -1.13 0.55 0.46 0.33 0.05 -0.33 -1.67 -1.4 -1.57 -0.81 0.41 0.09 -0.0 -0.13
-0.56 0.4 0.46 -0.29 -0.36 -1.36 0.39 -1.29 -1.19 -1.68 -0.84 -0.1 -0.97 -0.11 -0.39 -1.5 -1.37 -0.46 -1.66 -1.03 0.79 2.3 1.05 0.06 2.1 0.74 -0.31 -0.38 -0.06 0.27 0.58 0.8 -0.86 -0.78 -0.93 -0.76 -1.18 -1.27 0.89 0.88 0.84 -0.28 -0.98 -1.87 -1.71 -1.78 -1.91 0.41 -1.2 -0.35 -0.17
-0.76 -0.52 -0.66 0.96 -2.07 -0.95 0.02 -0.58 0.01 -1.2 0.14 -0.62 0.13 -0.24 -0.41 -0.0 -1.17 -0.5 -0.54 -0.58 0.79 0.78 0.17 1.31 0.97 -0.5 1.07 0.76 1.18 0.94 0.77 0.17 -0.0 -0.1 -1.08 -0.06 -1.24 -0.66 0.47 0.31 0.07 -0.04 -0.01 -1.9 -1.48 -1.36 -1.05 -0.04 0.11 -0.54 -1.07
-0.18 -1.3 -0.59 0.56 -2.4 -1.23 0.02 -0.19 0.08 -3.94 0.27 -1.42 -0.08 -0.5 -0.58 -0.17 -1.1 -0.51 -0.19 -1.11 1.03 1.18 0.46 1.05 1.25 -0.32 2.07 0.92 1.48 0.61 0.64 0.11 -0.25 -0.81 -1.95 -0.32 -1.05 -0.83 -0.46 0.04 0.11 0.07 -0.25 -4.11 -3.3 -3.27 -1.49 0.31 0.04 -0.28 -0.49
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-0.37 -0.48 -0.42 -1.05 -1.42 -0.85 -0.65 0.26 0.55 -1.84 0.67 -1.3 -0.69 0.21 -0.07 -0.46 -0.78 -0.13 -0.58 -0.25 1.47 1.45 0.85 0.64 1.25 0.57 0.75 0.29 0.47 0.66 0.65 0.31 -0.62 -1.17 -1.72 -0.14 0.02 -0.66 0.04 0.19 0.05 0.3 -0.47 -1.18 -1.05 -1.06 0.66 -0.42 -1.01 -1.95 -1.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.