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Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
1.15 0.9 0.35 -1.82 0.08 0.46 0.7 -0.22 -0.23 0.7 -0.09 0.89 0.03 0.0 0.06 -0.02 0.32 0.12 -0.5 0.16 -1.0 -0.64 -1.21 -0.63 -0.65 -1.12 -0.82 -0.86 -0.51 -0.36 -0.48 0.27 -0.13 -0.15 -0.12 0.51 0.32 -0.3 0.14 0.23 0.23 -0.03 -0.26 0.11 0.25 0.29 0.35 0.31 -0.72 -1.32 -0.7
0.59 0.28 -0.02 -1.22 -1.07 0.67 0.81 0.15 0.47 0.02 0.72 0.06 0.05 0.5 0.34 0.12 0.6 0.5 -0.33 0.53 -0.65 -1.24 -0.76 -0.8 -1.19 -1.06 -0.4 0.1 -0.46 -0.38 -0.18 0.07 0.25 0.2 0.12 0.42 0.39 -0.47 -0.19 0.06 -0.03 -0.08 -0.35 -0.36 -0.32 -0.3 -0.27 0.42 -0.19 -0.41 -0.19
0.27 0.61 -0.13 -2.64 -0.78 0.1 0.61 -0.2 0.43 0.9 0.69 0.62 0.06 0.15 0.07 -0.1 -0.54 0.09 -0.88 0.7 -0.7 -0.91 -0.86 -0.49 -0.97 -0.69 -0.55 -0.38 -0.64 -0.65 -0.44 -0.1 -0.03 0.01 -1.01 0.53 0.89 -0.76 -0.21 -0.36 -0.28 -0.54 -0.27 1.33 1.22 0.99 0.03 0.31 -1.08 -1.63 -0.92
0.2 0.47 0.26 -2.49 -0.28 1.38 0.69 -0.33 0.48 0.06 0.62 -0.76 -0.05 0.77 0.8 0.09 0.33 0.94 -1.7 0.79 -1.27 -0.84 -1.12 -0.43 -1.03 -0.84 -0.54 -0.75 0.14 -1.02 -0.78 0.43 -0.4 -0.4 0.28 0.17 0.45 0.21 0.33 0.49 0.45 0.02 -0.36 -0.29 -0.15 -0.12 -0.31 0.22 -1.69 -1.51 -0.87
-0.37 0.28 -0.61 -1.85 0.98 1.08 -0.06 -2.02 0.21 0.92 0.38 -0.05 -0.15 0.45 0.43 0.01 0.17 0.69 -1.58 0.83 -1.27 -0.2 0.51 -0.37 -0.45 -0.27 -0.36 -0.08 0.32 -1.58 -1.43 0.09 -0.72 -0.83 0.63 -0.37 1.16 0.23 -0.22 0.26 0.16 -0.74 -1.29 0.11 0.42 -0.1 -1.12 -0.23 -0.57 -0.83 0.3
0.38 0.4 -0.35 -2.02 -0.38 0.49 0.63 -0.6 0.8 0.91 1.02 -1.51 -0.44 0.12 0.11 -0.4 0.03 0.11 -0.68 0.61 -1.27 -0.84 -0.63 -0.42 -0.98 -0.38 -0.43 -0.33 -0.31 -0.5 -0.42 0.43 -0.79 -0.49 -0.56 0.17 1.05 0.18 0.52 0.79 0.56 0.34 -0.67 0.68 0.87 0.58 -0.42 0.27 -1.87 -3.05 -2.34
0.28 0.36 0.4 -1.2 -0.29 0.87 0.01 -0.02 0.68 0.5 0.68 0.2 0.17 0.68 0.66 0.15 0.22 0.73 -0.58 0.73 -0.36 -1.17 -1.33 -0.67 -0.84 -1.16 -0.79 -0.2 -0.75 -0.92 -0.71 0.21 -0.05 -0.44 0.18 0.1 0.55 -0.11 0.21 0.37 0.25 0.07 0.02 -0.16 -0.29 -0.1 -0.04 -0.13 -0.79 -1.05 -0.79
0.36 2.08 0.29 -1.17 -0.07 0.46 0.43 -1.09 0.3 0.89 0.44 0.46 0.32 -0.63 -0.49 0.4 -0.48 -0.34 -0.79 0.66 -0.31 -0.63 -0.79 -0.19 -0.88 -0.05 -0.15 -0.61 0.47 -1.35 -0.93 0.22 0.22 -0.54 -0.26 -0.27 0.73 0.31 -0.08 -0.16 -0.12 -0.83 -0.05 0.03 0.25 0.25 -1.35 0.27 -1.76 -1.95 -0.8
-0.19 0.64 -0.65 -0.47 -0.28 0.42 0.27 0.09 0.86 -0.12 0.86 0.02 -0.08 0.45 0.2 -0.08 -0.06 0.16 -0.34 0.6 -0.73 -1.14 -2.25 -0.44 -0.72 -1.78 -0.21 0.36 -0.86 0.05 0.38 0.36 -0.15 -0.09 -0.39 -0.1 0.52 0.29 0.5 0.47 0.4 0.39 -0.09 -0.79 -0.16 -0.74 -0.5 0.28 0.05 -0.35 -0.26
0.39 0.53 -0.24 -1.94 -0.92 0.18 0.94 -0.62 0.02 1.07 0.1 0.09 -0.3 0.01 -0.15 -0.39 -0.12 -0.15 -0.67 0.4 -0.77 -1.31 -1.01 -0.11 -1.34 -0.58 -0.22 -0.21 -0.91 -0.45 -0.33 0.69 -0.22 0.33 -1.56 0.44 0.45 -1.22 0.39 -0.04 0.01 0.12 0.0 0.72 1.15 0.74 -0.2 0.73 -0.42 -0.41 -0.02
0.42 0.69 -0.0 -1.4 -0.44 0.21 0.43 -0.71 0.01 0.98 0.17 0.18 0.17 -0.33 -0.32 0.02 -0.12 -0.12 -1.24 0.59 -1.09 -0.15 -0.55 -0.44 -0.12 -0.82 -0.43 -0.42 0.04 -0.92 -0.88 0.39 0.22 0.11 0.16 -0.06 0.58 0.27 0.71 0.15 0.28 -0.58 -0.14 0.55 0.79 0.58 -0.79 0.05 -0.48 -0.87 -0.36
0.55 0.81 0.12 -1.99 0.15 0.99 0.73 -0.41 0.28 0.44 0.44 -0.07 -0.07 -0.21 -0.21 -0.05 0.7 -0.02 -0.99 0.54 -0.42 -0.52 -0.74 -0.23 -0.83 -1.05 -0.15 0.07 0.04 -0.89 -0.5 0.11 -0.17 0.11 0.45 0.31 0.24 0.76 -0.07 -0.03 0.16 -0.42 -0.52 0.16 0.3 0.23 -0.49 0.23 -0.87 -1.84 -1.22
1.51 1.08 0.74 -2.13 -0.18 0.08 0.24 -0.1 -0.19 0.66 0.08 0.59 -0.1 0.02 0.12 -0.31 0.12 0.18 0.0 0.69 -1.36 -0.28 -0.63 -0.87 -0.28 -0.66 -1.12 -0.56 -0.85 -0.24 -0.29 -0.52 -0.11 -0.11 0.55 0.22 0.57 -0.02 -1.02 -0.59 -0.3 -0.24 -0.46 -0.15 0.2 0.15 -0.1 -0.19 -0.43 -0.28 0.52
0.25 -0.12 -0.1 -2.17 -0.91 0.27 0.7 -0.44 0.4 0.08 0.69 0.19 -0.14 0.5 0.6 -0.17 -0.15 0.62 -0.58 0.77 -0.81 0.03 -0.28 -0.54 0.01 -0.66 -0.54 -0.01 -0.55 -0.81 -0.63 0.49 -0.26 -0.17 -0.26 0.37 0.21 -0.73 0.39 0.54 0.45 0.18 -0.22 -0.34 -0.22 -0.33 -0.01 0.38 -0.35 -0.42 0.33
0.19 0.74 0.14 -2.41 -0.5 0.4 -0.15 -0.23 1.45 0.33 1.41 0.27 0.12 0.37 0.48 -0.04 -0.76 0.42 -1.34 0.89 -0.3 -0.66 -1.13 -0.15 -0.8 -0.04 -0.51 -0.0 -0.23 -0.97 -0.51 -0.17 -0.14 -0.69 -0.72 -0.16 1.17 -0.34 -0.19 -0.13 -0.12 -0.3 -0.01 0.16 0.42 0.03 -0.04 -0.09 -1.64 -1.33 -0.64
0.59 0.18 -0.52 -1.43 -1.26 0.0 0.45 -0.14 0.27 0.49 0.24 0.46 0.39 -0.09 -0.0 0.41 0.22 0.04 -0.46 0.39 -0.65 -0.41 -0.74 -0.53 -0.13 -1.73 -0.37 -0.07 -0.35 -0.16 -0.11 0.41 0.53 0.33 -0.05 0.22 0.37 -0.09 0.7 0.61 0.09 -0.03 0.18 0.05 0.18 0.17 -0.46 0.17 -0.74 -1.09 -1.07
0.92 0.57 0.42 -2.08 -0.11 0.11 0.25 -0.31 0.22 0.44 0.45 -0.03 -0.04 0.44 0.62 -0.09 0.15 0.73 -1.15 0.77 -0.74 -0.05 -1.02 -0.25 -0.25 0.15 -0.6 -0.15 -0.09 -0.59 -0.51 -0.04 -0.26 -0.24 0.29 0.08 0.73 -0.25 0.09 0.1 0.16 -0.3 -0.36 -0.23 -0.12 -0.24 -0.44 -0.12 -0.67 -0.95 0.05
1.05 0.13 -0.49 -0.47 -2.06 -0.6 0.84 -0.5 0.02 0.02 -0.16 -0.09 0.36 -0.13 -0.11 0.25 -0.23 -0.06 -0.23 0.91 -0.18 -0.76 -0.35 -0.28 -0.7 -1.33 0.3 0.32 -0.37 -0.27 -0.43 0.55 0.34 0.69 -0.71 0.62 0.76 -1.24 0.3 0.26 0.12 0.27 0.04 -0.39 0.18 -0.32 -0.52 0.61 -0.28 -0.72 -0.54
1.08 1.46 0.51 -3.15 0.17 1.55 0.61 -0.23 0.53 1.15 0.6 -0.67 0.19 -0.15 0.19 0.69 -1.11 0.19 -1.06 0.64 -2.12 -1.93 -1.5 -1.29 -1.59 -1.04 -1.79 -3.43 -1.13 -0.76 -0.25 0.21 0.45 -2.55 -1.75 0.55 0.75 -0.93 -0.45 0.01 0.13 -0.76 -0.13 0.59 0.71 0.61 0.13 0.15 -1.04 -1.16 -0.4
-0.48 -0.28 -0.39 -1.74 -1.46 0.47 0.38 -1.72 1.3 0.37 1.45 0.14 0.01 0.8 0.92 -0.26 0.1 0.99 -0.21 0.89 -0.36 -1.29 -0.31 -0.67 -1.41 -0.83 -0.45 0.07 -0.46 -0.47 -1.03 0.24 -0.49 -0.27 0.39 -0.09 0.9 -0.24 0.19 0.18 0.15 -0.18 -0.61 -0.23 -0.03 0.07 -0.85 0.27 -0.52 -1.17 -0.91
-0.09 0.38 0.33 -1.32 -0.79 0.26 -0.14 0.18 1.18 0.31 1.3 -0.21 0.67 0.12 0.38 0.33 -1.18 0.35 -0.99 0.84 -0.51 -1.37 -1.02 -0.47 -1.38 0.04 -0.57 -0.0 -0.72 -0.42 0.02 -0.02 0.47 -0.63 -0.55 0.13 0.96 -0.22 -0.09 0.14 0.04 -0.12 0.42 -0.19 -0.22 0.03 0.33 -0.28 -1.44 -1.04 -0.22
0.12 0.25 0.31 -1.75 -0.36 0.8 0.82 -0.15 0.11 1.03 0.25 0.67 -0.39 0.21 0.05 -0.13 -0.03 0.06 -0.58 0.03 -0.81 -1.0 -0.77 -0.89 -0.87 0.13 -0.95 -1.16 -0.93 -1.16 -0.97 0.27 -0.37 -0.01 -0.36 0.13 0.23 -0.35 0.63 0.94 1.04 -0.74 -0.46 0.76 0.99 0.86 -0.34 0.5 -1.68 -2.26 -1.46
1.29 0.57 -0.47 -2.73 -2.17 0.72 1.44 -0.43 0.17 0.05 -0.02 -0.41 0.06 0.24 0.05 0.16 0.91 0.22 0.4 0.3 -0.83 -3.41 -2.3 -1.04 -3.02 -3.02 0.06 -0.93 -1.43 -0.31 -0.54 0.7 -0.04 0.5 -1.46 1.08 1.0 -2.47 0.04 0.06 -0.14 0.45 -0.36 -0.47 0.04 -0.29 -0.3 1.24 -0.17 -0.56 -0.24
0.45 0.29 -0.4 -0.71 -0.96 1.26 0.2 -1.0 0.66 0.28 0.84 -0.53 0.09 0.4 0.32 0.23 0.33 0.49 -0.48 1.1 -1.1 -0.86 -1.12 -0.85 -0.89 -1.35 -0.34 -0.2 -0.55 -0.89 -0.64 0.35 0.13 -0.12 0.02 0.21 0.39 0.8 0.44 0.47 0.32 -0.26 -0.67 -0.09 0.2 0.18 -0.49 -0.08 -0.62 -1.58 -0.89
1.13 1.23 0.12 -0.96 -1.25 -0.31 1.11 -0.99 -0.06 0.92 0.16 0.16 -0.25 -0.09 -0.03 -0.18 -0.41 0.03 -0.48 0.78 -0.72 -1.52 -1.22 -0.5 -1.57 -2.07 -0.23 0.14 -0.81 -0.77 -0.71 0.79 -0.37 0.04 -0.76 0.53 1.09 -0.85 0.22 0.34 0.19 0.43 -0.53 -0.16 0.48 0.27 -0.91 0.86 -0.27 -1.22 -0.57
- -5.82 - -7.58 - - -4.2 - -5.89 -3.27 -6.22 - -6.37 - -7.25 -9.76 - -8.12 - -3.5 -7.65 -4.65 - -4.42 -5.02 -5.41 -6.33 -7.33 -4.87 -7.47 - -1.26 -6.33 -6.15 - -4.23 -2.02 -6.48 -3.94 -3.83 -5.42 5.6 -6.01 -1.96 -1.44 -1.86 - -6.16 - - -
0.29 0.39 0.2 -2.19 -0.37 0.82 0.88 0.19 0.7 0.63 0.94 -0.02 0.03 0.45 0.48 0.0 0.24 0.5 -0.8 0.61 -0.76 -1.2 -0.79 -1.03 -1.29 -1.32 -0.73 -0.44 -0.84 -0.63 -0.06 0.22 -0.12 -0.2 -0.27 0.53 0.32 -0.55 0.16 0.37 0.29 0.05 -0.28 0.12 0.38 0.21 0.03 0.32 -1.09 -1.96 -1.12
1.02 0.75 -0.3 -1.73 0.56 -0.31 0.03 -1.09 1.14 1.62 1.3 0.17 -0.28 0.13 0.25 -0.31 -1.8 0.33 -0.54 0.5 -0.87 -0.75 -0.64 -0.97 -0.96 0.43 -1.02 -0.53 -0.74 -0.64 -1.23 -0.53 -0.7 -0.35 -1.17 -0.56 1.62 -0.43 -0.85 -0.68 -0.64 -0.45 -0.76 0.91 0.78 0.92 -0.23 -0.27 -0.8 -1.42 -0.56
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0.1 -0.2 0.1 -2.62 -1.26 0.91 1.28 -0.35 0.25 0.68 0.43 -0.12 -0.45 0.49 0.27 -0.41 0.38 0.32 -0.26 0.9 -1.04 -1.73 -1.15 -0.8 -1.57 -1.73 -0.34 -0.07 -0.99 -0.74 -0.37 0.74 -0.49 0.47 -0.3 0.74 0.66 -0.89 0.13 0.08 0.3 -0.16 -0.49 0.17 0.19 0.26 -0.15 0.8 -0.27 -0.67 -0.12
0.43 0.55 -0.39 -1.91 1.51 0.81 -0.06 -1.17 0.61 0.84 0.7 0.62 0.65 -0.0 -0.01 -0.03 -0.27 0.24 -0.94 0.52 -0.96 -0.47 -0.43 -0.86 -0.6 -0.89 -0.73 -0.76 -0.23 -1.55 -1.51 0.12 0.25 -0.48 -0.46 -0.41 0.97 -0.25 0.01 -0.41 -0.55 -0.59 -0.9 0.68 0.82 0.72 -0.92 -0.45 0.14 -0.85 -0.25
1.11 1.05 0.09 -0.9 -0.21 0.0 0.02 -0.46 0.92 1.07 1.16 0.82 -0.4 0.11 -0.13 -0.46 -0.85 -0.07 -0.7 0.67 -0.62 -0.65 -0.12 -0.8 -0.72 -0.25 -0.81 -0.13 -0.66 -0.92 -1.16 0.43 -0.28 -0.09 -0.62 -0.12 0.85 -0.53 -0.12 -0.04 -0.19 -0.38 -0.96 0.46 0.5 0.52 -0.24 0.02 -0.43 -1.27 -0.71
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0.21 0.06 -0.58 -1.57 -2.43 -0.08 0.31 -0.41 1.06 0.91 1.02 -0.38 0.09 0.38 -0.0 -0.12 0.06 0.15 -0.4 0.76 -0.63 -1.51 -0.96 -0.72 -1.78 -1.29 -0.27 0.26 -1.31 0.14 0.57 0.87 -0.19 -0.21 -0.77 -0.13 0.32 -0.55 1.47 0.26 0.48 0.45 -0.07 0.25 0.53 0.21 -0.78 0.11 -1.35 -1.78 -1.39
0.93 1.29 0.0 -1.77 -0.18 0.36 0.66 -0.31 0.25 0.37 0.45 0.11 0.11 -0.33 -0.35 0.13 0.18 -0.2 -0.35 0.35 -0.77 -0.7 -0.31 -0.41 -0.74 -0.75 -0.3 -0.21 -0.3 -0.31 -0.09 0.54 0.23 0.27 -0.09 0.42 0.13 0.09 0.75 -0.07 -0.06 -0.02 0.05 -0.06 -0.06 -0.08 0.04 0.19 -1.27 -2.15 -1.76
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0.08 -0.01 -0.49 -0.61 -2.55 0.05 0.08 0.32 0.95 0.5 0.76 -1.32 0.46 0.86 0.61 0.53 -0.22 0.54 -0.66 1.13 -0.52 -1.62 -2.51 -0.32 -1.23 -1.92 0.36 0.51 -0.41 0.26 0.31 0.04 0.39 -0.31 -0.96 -0.14 0.5 0.05 0.67 -0.05 -0.48 0.05 0.16 0.25 0.47 0.27 -0.45 -0.54 -1.31 -1.65 -1.4
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.