Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.56 0.39 0.34 0.35 0.37 0.56 1.0 0.62 0.45 0.22 0.4 0.24 0.6 0.45 0.49 0.39 0.56 0.55 0.26 0.83
0.0 0.69 0.38 0.47 0.33 0.36 0.41 0.35 0.26 0.19 0.35 0.49 0.39 0.34 0.66 0.0 1.0 0.93 0.16 0.4
0.44 0.46 0.35 0.47 0.46 0.68 1.0 0.69 0.76 0.49 0.5 0.28 0.66 0.66 0.63 0.44 0.66 0.66 0.39 0.81
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 1.0 0.52 0.47 0.0 0.24 0.69 0.04 0.0
0.29 0.74 0.66 0.79 0.53 0.4 0.77 0.3 0.55 0.29 0.54 0.6 0.74 0.66 0.79 0.5 0.72 0.62 0.38 1.0
0.36 0.41 0.3 0.28 0.3 0.2 0.06 0.2 0.66 0.26 0.34 0.27 0.53 0.47 0.46 0.3 0.38 0.38 0.23 1.0
0.22 0.74 0.5 0.52 0.51 0.46 0.26 0.38 0.83 0.25 0.47 0.73 0.92 0.55 1.0 0.65 0.64 0.81 0.39 0.95
0.33 0.78 0.53 0.83 0.59 0.28 1.0 0.29 0.45 0.17 0.36 0.56 0.78 0.84 0.66 0.72 0.74 0.81 0.4 0.49
0.76 0.69 0.59 0.71 0.6 0.32 0.53 0.32 0.47 0.26 0.56 0.36 0.54 0.43 0.6 0.34 0.71 0.6 0.34 1.0
1.0 0.75 0.64 0.47 0.47 0.61 0.99 0.55 0.72 0.29 0.49 0.69 0.83 0.59 0.86 0.52 0.98 0.81 0.47 0.93
0.41 0.63 0.52 0.64 0.45 0.32 1.0 0.24 0.45 0.16 0.38 0.32 0.42 0.5 0.37 0.39 0.51 0.48 0.28 0.83
0.69 0.71 0.65 0.45 0.39 0.42 1.0 0.33 0.68 0.31 0.5 0.6 0.73 0.71 0.69 0.55 0.78 0.65 0.41 0.59
0.56 0.51 0.42 0.81 0.74 0.42 0.32 0.45 0.47 0.19 0.5 0.29 0.58 0.5 0.6 0.33 0.58 0.52 0.35 1.0
0.0 0.66 0.0 1.0 0.79 0.87 0.02 0.21 0.1 0.19 0.39 0.79 0.36 0.38 0.3 0.54 0.74 0.97 0.29 0.0
0.41 0.5 0.46 0.68 0.42 0.38 0.69 0.44 1.0 0.41 0.4 0.43 0.58 0.58 0.5 0.47 0.45 0.57 0.31 0.55
0.65 0.74 0.57 0.67 0.71 0.66 1.0 0.5 0.5 0.16 0.56 0.44 0.87 0.73 0.52 0.44 0.81 0.69 0.31 0.85
0.24 0.82 0.51 0.25 0.22 0.28 0.44 0.27 0.92 0.41 0.31 1.0 1.0 0.75 0.77 0.68 0.65 0.7 0.43 0.88
0.82 0.29 0.18 0.27 0.29 0.56 0.45 0.68 0.23 0.11 0.31 0.21 0.54 0.36 0.44 0.27 0.53 0.57 0.33 1.0
0.55 0.46 0.46 0.46 0.48 0.42 0.7 0.39 0.28 0.11 0.43 0.27 0.42 0.4 0.36 0.24 0.49 0.37 0.22 1.0
0.1 0.22 0.12 0.18 0.17 0.17 0.1 0.2 0.37 0.08 0.18 0.05 0.26 0.21 0.27 0.14 0.18 0.24 0.13 1.0
0.34 0.41 0.36 0.43 0.36 0.75 1.0 0.31 0.65 0.24 0.48 0.17 0.58 0.68 0.41 0.47 0.59 0.65 0.27 0.45
0.72 0.72 0.65 0.43 0.37 0.31 0.93 0.29 0.54 0.16 0.45 0.52 0.67 0.64 0.52 0.44 0.8 0.59 0.29 1.0
0.55 0.68 0.66 0.61 0.55 0.56 1.0 0.59 0.45 0.25 0.49 0.5 0.53 0.54 0.52 0.42 0.68 0.59 0.44 0.72
0.53 0.23 0.18 0.31 0.33 0.78 0.79 1.0 0.43 0.13 0.3 0.18 0.43 0.36 0.27 0.3 0.37 0.48 0.21 0.76
0.3 0.4 0.34 0.2 0.19 0.15 0.42 0.12 0.73 0.28 0.26 1.0 0.77 0.48 0.91 0.36 0.53 0.63 0.23 0.47
0.27 0.51 0.38 0.36 0.11 0.01 0.55 0.0 0.36 0.15 0.17 0.38 0.3 0.44 0.42 0.08 0.51 0.5 0.11 1.0
0.39 0.71 0.53 0.5 0.44 0.32 0.82 0.31 0.76 0.29 0.49 0.82 0.61 0.64 0.63 0.49 0.74 0.68 0.38 1.0
0.31 0.68 0.58 0.45 0.35 0.29 0.31 0.24 0.62 0.16 0.43 0.33 1.0 0.53 0.86 0.32 0.6 0.49 0.19 0.82
0.03 0.34 0.15 0.03 0.22 0.03 1.0 0.01 0.16 0.09 0.24 0.49 0.66 0.61 0.6 0.07 0.48 0.61 0.14 0.36
0.59 0.27 0.23 0.26 0.29 0.22 0.41 0.2 0.48 0.17 0.3 0.13 0.43 0.35 0.31 0.21 0.31 0.32 0.17 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 1.0
0.0 0.62 0.09 0.0 0.0 0.03 0.15 0.0 0.13 0.04 0.03 0.63 1.0 0.94 0.78 0.71 0.47 0.75 0.31 0.35
0.54 0.85 0.65 0.43 0.33 0.26 0.88 0.3 0.2 0.13 0.37 0.67 0.8 0.79 0.73 0.49 0.79 0.8 0.4 1.0
0.32 0.75 0.66 0.32 0.29 0.38 0.41 0.37 0.78 0.34 0.39 0.63 0.74 0.6 0.83 0.48 0.63 0.55 0.28 1.0
1.0 0.7 0.39 0.29 0.29 0.14 0.74 0.14 0.13 0.1 0.32 0.24 0.33 0.4 0.29 0.34 0.5 0.51 0.29 0.26
0.39 0.72 0.61 0.64 0.53 0.45 0.81 0.57 0.46 0.23 0.58 0.52 0.82 0.66 0.66 0.44 0.71 0.6 0.25 1.0
0.93 0.72 0.53 0.75 0.68 0.83 0.82 0.9 0.67 0.3 0.69 0.62 1.0 0.82 0.82 0.62 0.88 0.81 0.46 0.79
0.5 0.69 0.48 0.32 0.27 0.21 0.15 0.18 0.46 0.34 0.4 0.3 0.41 0.41 0.49 0.41 0.48 0.43 0.23 1.0
0.78 0.43 0.28 0.48 0.4 0.45 0.53 0.4 0.96 0.18 0.38 0.19 0.75 0.51 0.56 0.33 0.54 0.51 0.28 1.0
0.37 0.52 0.4 0.63 0.44 0.35 0.9 0.37 0.51 0.12 0.32 0.46 0.84 0.62 0.49 0.55 0.53 0.53 0.31 1.0
0.46 0.51 0.67 1.0 0.61 0.6 0.47 0.66 0.5 0.19 0.48 0.44 0.58 0.47 0.42 0.39 0.52 0.64 0.21 0.71
0.25 0.37 0.3 0.27 0.24 0.21 1.0 0.29 0.37 0.19 0.26 0.21 0.4 0.34 0.33 0.22 0.36 0.36 0.18 0.42
0.47 0.65 0.54 0.59 0.33 0.42 1.0 0.33 0.63 0.23 0.37 0.31 0.55 0.55 0.48 0.3 0.55 0.53 0.24 0.45
0.6 0.98 0.74 0.75 0.62 0.53 0.99 0.48 0.63 0.58 0.71 0.72 0.75 0.79 0.8 0.57 1.0 0.78 0.48 1.0
0.31 0.38 0.35 0.35 0.29 0.23 1.0 0.2 0.46 0.17 0.3 0.27 0.4 0.42 0.35 0.3 0.41 0.4 0.21 0.34
0.56 0.64 0.42 0.66 0.63 0.49 0.36 0.62 1.0 0.34 0.57 0.35 0.81 0.63 0.69 0.54 0.69 0.79 0.33 0.73
0.32 0.46 0.33 0.32 0.25 0.16 1.0 0.15 0.75 0.16 0.36 0.36 0.79 0.66 0.58 0.39 0.46 0.47 0.18 0.87
0.59 0.88 0.77 0.87 0.56 0.45 0.87 0.43 1.0 0.51 0.56 0.51 0.72 0.85 0.6 0.48 0.82 0.74 0.39 0.85
0.22 0.56 0.47 0.33 0.25 0.25 1.0 0.19 0.3 0.14 0.35 0.83 0.74 0.74 0.55 0.5 0.54 0.67 0.28 0.55
0.49 0.73 0.53 0.74 0.57 0.48 1.0 0.43 0.63 0.37 0.57 0.51 0.51 0.54 0.62 0.44 0.73 0.63 0.43 0.5
0.47 0.61 0.49 0.35 0.33 0.29 0.56 0.29 0.49 0.34 0.38 0.42 0.45 0.4 0.56 0.33 0.59 0.43 0.29 1.0
0.58 0.27 0.2 0.24 0.27 0.25 1.0 0.22 0.61 0.27 0.28 0.13 0.44 0.46 0.46 0.22 0.31 0.36 0.19 0.54
0.19 0.61 0.52 0.39 0.29 0.31 1.0 0.28 0.53 0.21 0.28 0.34 0.4 0.44 0.38 0.31 0.41 0.45 0.25 0.54
0.18 0.4 0.24 0.23 0.17 0.14 0.13 0.12 0.31 0.15 0.18 0.3 0.44 0.3 0.41 0.27 0.32 0.28 0.13 1.0
0.53 0.7 0.57 0.78 0.72 0.5 1.0 0.46 0.24 0.21 0.62 0.45 0.73 0.57 0.62 0.45 0.75 0.72 0.3 0.77

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)