Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.5 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.39 0.0 1.0 0.0 0.28 0.17 0.14 0.0
0.12 0.39 0.27 0.04 0.08 0.14 0.22 0.06 0.41 1.0 0.39 0.36 0.33 0.49 0.33 0.23 0.36 0.35 0.38 0.5
0.27 0.65 0.63 0.49 0.32 0.35 0.34 0.42 0.98 1.0 0.63 0.46 0.29 0.35 0.24 0.54 0.49 0.37 0.5 0.3
0.93 0.55 0.72 0.18 0.14 0.56 1.0 0.47 0.4 0.82 0.42 0.73 0.28 0.31 0.5 0.33 0.73 0.51 0.8 0.1
0.52 0.88 0.95 1.0 0.5 0.39 0.32 0.25 0.31 0.32 0.52 0.39 0.52 0.54 0.33 0.36 0.66 0.52 0.47 0.54
0.5 0.65 0.53 0.2 0.21 0.17 0.69 0.12 1.0 0.99 0.52 0.71 0.71 0.79 0.69 0.58 0.6 0.6 0.67 0.77
0.26 0.7 0.78 0.5 0.14 0.31 1.0 0.2 0.29 0.71 0.39 0.87 0.56 0.65 0.68 0.47 0.83 0.75 0.84 0.17
0.09 0.66 0.49 0.33 0.36 0.25 0.6 0.25 0.45 1.0 0.61 0.39 0.45 0.45 0.53 0.36 0.55 0.47 0.53 0.69
0.42 0.44 0.33 0.44 0.29 0.22 0.28 0.14 0.22 0.14 0.34 0.39 0.36 0.39 0.53 0.22 0.48 0.28 0.26 1.0
0.75 0.53 0.51 0.44 0.3 0.29 0.88 0.35 0.15 0.25 0.4 0.41 0.48 0.43 0.77 0.31 0.73 0.5 0.79 1.0
0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.76 0.29 0.02 0.06 0.09 0.04 0.09 0.06 0.05 0.13 0.1
0.33 0.83 1.0 0.77 0.39 0.46 0.33 0.39 0.31 0.58 0.56 0.63 0.67 0.71 0.72 0.42 0.75 0.59 0.7 0.4
0.82 0.6 0.57 0.46 0.46 0.36 0.72 0.42 0.18 0.25 0.47 0.46 0.44 0.45 0.69 0.34 0.56 0.49 0.62 1.0
0.42 0.56 0.44 0.55 0.36 0.18 0.38 0.15 0.64 0.74 0.46 0.4 0.59 0.6 0.51 0.34 0.39 0.38 0.41 1.0
0.08 0.8 0.95 0.99 0.44 1.0 0.01 0.7 0.01 0.19 0.44 0.82 0.32 0.4 0.46 0.38 0.91 0.45 0.62 0.0
0.2 0.6 0.59 0.36 0.42 0.27 0.69 0.22 0.56 1.0 0.69 0.67 0.48 0.47 0.66 0.3 0.67 0.54 0.75 0.58
0.18 0.54 0.4 0.11 0.06 0.11 0.69 0.14 0.45 1.0 0.37 0.63 0.35 0.35 0.47 0.38 0.6 0.42 0.41 0.37
0.24 0.31 0.3 0.09 0.08 0.0 0.05 0.01 0.31 0.2 0.17 0.07 0.09 0.14 0.05 0.02 0.13 0.11 0.11 1.0
0.41 0.75 0.79 1.0 0.78 0.84 0.84 0.84 0.48 0.81 0.68 0.71 0.88 0.91 0.78 0.71 0.64 0.63 0.85 0.88
0.47 1.0 0.75 0.34 0.23 0.34 0.43 0.24 0.24 0.36 0.43 0.98 0.67 0.71 0.73 0.66 0.94 0.78 0.84 0.73
0.25 0.55 0.48 0.14 0.15 0.19 0.6 0.11 0.33 0.8 0.41 0.42 0.42 0.57 0.45 0.39 0.47 0.38 0.42 1.0
0.34 0.51 0.45 0.41 0.46 0.17 1.0 0.16 0.52 0.44 0.5 0.72 0.67 0.73 0.66 0.67 0.57 0.54 0.5 0.63
0.47 0.61 0.51 0.6 0.3 0.24 0.71 0.2 0.28 0.49 0.45 0.56 0.65 0.66 0.67 0.43 0.56 0.47 0.53 1.0
0.16 0.16 0.08 0.01 0.02 0.07 0.08 0.08 1.0 0.76 0.25 0.06 0.24 0.11 0.23 0.14 0.12 0.09 0.23 0.22
0.19 0.39 0.34 0.2 0.45 0.15 0.93 0.2 0.19 0.66 0.48 0.84 0.76 0.41 1.0 0.47 0.81 0.65 0.79 0.59
0.14 0.25 0.21 0.01 0.01 0.02 0.09 0.02 1.0 0.67 0.22 0.24 0.19 0.22 0.26 0.16 0.26 0.16 0.22 0.24
0.32 0.75 0.65 0.38 0.27 0.23 0.64 0.2 0.81 1.0 0.44 0.71 0.54 0.54 0.67 0.43 0.56 0.53 0.5 0.37
0.41 0.52 0.63 0.27 0.09 0.13 1.0 0.08 0.15 0.75 0.33 0.32 0.3 0.32 0.65 0.19 0.65 0.38 0.44 0.8
0.64 0.47 0.55 0.11 0.05 0.11 0.56 0.06 0.3 0.56 0.27 0.52 0.32 0.33 0.63 0.33 0.4 0.33 0.37 1.0
0.27 0.5 0.49 0.3 0.25 0.21 0.49 0.17 0.61 1.0 0.49 0.28 0.37 0.47 0.36 0.53 0.36 0.44 0.4 0.58
0.03 0.59 0.23 0.0 0.0 0.04 0.21 0.01 0.48 1.0 0.28 0.28 0.34 0.3 0.51 0.18 0.34 0.24 0.26 0.78
0.86 0.51 0.47 0.47 0.47 0.54 1.0 0.48 0.0 0.53 0.54 0.39 0.23 0.35 0.38 0.22 0.45 0.48 0.6 0.0
0.55 0.57 0.58 0.53 0.37 0.29 0.17 0.13 0.86 1.0 0.56 0.55 0.49 0.56 0.45 0.5 0.49 0.49 0.47 0.41
0.67 0.78 0.76 0.65 0.58 0.99 0.82 0.7 0.85 0.77 0.6 0.63 0.79 1.0 0.76 0.61 0.84 0.67 0.78 0.48
0.86 0.87 1.0 0.42 0.43 0.47 0.55 0.55 0.35 0.64 0.71 0.59 0.47 0.58 0.75 0.59 0.81 0.68 0.74 0.73
0.49 0.71 0.63 0.38 0.22 0.31 0.66 0.21 0.63 1.0 0.53 0.66 0.43 0.54 0.56 0.58 0.69 0.51 0.54 0.38
0.73 0.78 0.84 0.85 0.62 0.47 0.39 0.37 0.48 1.0 0.72 0.68 0.68 0.72 0.89 0.61 0.78 0.59 0.58 0.57
0.48 0.91 0.78 0.75 0.39 0.4 1.0 0.29 0.48 0.72 0.54 0.52 0.62 0.66 0.68 0.56 0.85 0.66 0.77 0.7
0.16 0.4 0.4 0.15 0.16 0.01 0.18 0.0 0.69 1.0 0.46 0.16 0.15 0.24 0.22 0.11 0.24 0.17 0.28 0.94
0.3 0.63 0.51 1.0 0.38 0.48 0.61 0.4 0.26 0.47 0.54 0.61 0.58 0.63 0.59 0.38 0.63 0.54 0.67 0.67
0.49 0.77 0.66 0.15 0.14 0.24 0.3 0.2 0.75 1.0 0.5 0.79 0.66 0.63 0.74 0.71 0.69 0.68 0.73 0.47
0.5 0.8 0.64 0.62 0.45 0.21 0.65 0.17 0.05 0.07 0.4 0.72 0.44 0.44 0.67 0.45 1.0 0.58 0.71 0.41
0.19 0.19 0.23 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 1.0 0.2 0.12 0.05 0.05 0.09 0.0 0.07 0.09 0.07 0.08 0.22
0.44 0.39 0.46 0.29 0.29 0.23 0.27 0.27 0.15 0.07 0.4 0.46 0.37 0.36 0.58 0.32 0.45 0.32 0.3 1.0
0.98 0.9 0.92 0.87 0.32 0.36 0.59 0.08 0.65 0.85 0.6 0.82 0.86 1.0 0.85 0.35 0.83 0.86 0.94 0.76
0.39 0.52 0.42 0.47 0.2 0.46 1.0 0.31 0.09 0.16 0.32 0.53 0.38 0.36 0.43 0.32 0.63 0.54 0.73 0.41
0.25 0.5 0.4 0.09 0.17 0.27 0.15 0.23 1.0 0.64 0.32 0.36 0.4 0.49 0.33 0.41 0.38 0.32 0.45 0.34
0.51 0.68 0.54 0.18 0.13 0.19 0.32 0.15 0.54 1.0 0.46 0.53 0.24 0.37 0.37 0.37 0.58 0.41 0.45 0.84
0.39 0.61 0.63 0.18 0.16 0.14 0.28 0.1 0.56 0.99 0.47 0.62 0.27 0.48 0.38 0.39 0.58 0.41 0.28 1.0
0.21 0.35 0.25 0.27 0.13 0.14 0.28 0.12 1.0 0.71 0.27 0.26 0.23 0.29 0.27 0.18 0.31 0.25 0.29 0.2
0.9 0.63 0.45 0.03 0.02 0.05 0.66 0.08 0.15 0.15 0.21 0.67 0.28 0.37 0.84 0.47 1.0 0.58 0.66 0.6
0.67 0.71 0.55 0.31 0.1 0.18 0.6 0.12 0.06 0.21 0.3 0.89 0.71 0.75 1.0 0.58 0.8 0.76 0.66 0.73
0.29 0.68 0.72 0.19 0.15 0.27 0.39 0.16 0.71 1.0 0.45 0.64 0.5 0.59 0.6 0.52 0.65 0.49 0.5 0.66
0.15 0.37 0.28 0.22 0.07 0.11 0.44 0.05 1.0 0.92 0.33 0.31 0.36 0.44 0.31 0.29 0.26 0.3 0.26 0.24
0.08 0.89 0.54 0.51 0.36 0.21 1.0 0.11 0.28 0.35 0.37 0.88 0.6 0.8 0.84 0.52 0.83 0.59 0.57 0.76
0.61 0.65 0.7 0.12 0.04 0.13 0.43 0.07 0.26 0.82 0.37 1.0 0.64 0.66 0.68 0.71 0.59 0.66 0.62 0.66
0.83 0.63 0.77 0.64 0.45 0.56 0.68 0.64 1.0 0.83 0.64 0.45 0.57 0.62 0.57 0.45 0.53 0.49 0.71 0.81
0.16 0.39 0.33 0.18 0.11 0.14 0.46 0.11 1.0 0.43 0.27 0.36 0.37 0.39 0.3 0.3 0.32 0.28 0.28 0.45
0.7 0.53 0.6 0.79 0.56 0.46 0.88 0.59 0.7 0.58 0.61 0.6 0.79 0.87 0.96 0.57 0.9 0.74 0.84 1.0
0.38 1.0 0.92 0.88 0.21 0.28 0.94 0.27 0.13 0.43 0.56 0.62 0.66 0.63 0.73 0.45 0.81 0.57 0.55 0.95
0.41 0.72 0.5 0.18 0.13 0.2 0.37 0.13 0.6 1.0 0.47 0.56 0.5 0.55 0.59 0.52 0.71 0.52 0.57 0.31
0.28 0.88 0.55 0.69 0.49 0.25 0.24 0.26 0.67 0.48 0.5 0.54 0.49 0.55 0.71 0.45 0.58 0.41 0.4 1.0
0.21 0.45 0.52 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02 0.73 1.0 0.38 0.09 0.09 0.19 0.03 0.02 0.19 0.15 0.15 0.19
0.38 0.77 0.78 0.12 0.06 0.12 0.54 0.06 0.58 1.0 0.47 0.9 0.45 0.44 0.66 0.52 0.71 0.52 0.52 0.63
0.36 0.58 0.56 1.0 0.77 0.53 0.75 0.52 0.05 0.13 0.56 0.68 0.49 0.59 0.46 0.32 0.57 0.56 0.65 0.29
0.86 0.76 0.74 0.82 0.54 0.49 0.9 0.38 0.5 0.62 0.67 0.64 0.6 0.76 0.66 0.62 0.66 0.62 0.74 1.0
0.36 0.51 0.49 0.31 0.23 0.25 0.31 0.19 0.72 1.0 0.49 0.36 0.29 0.31 0.39 0.32 0.45 0.33 0.38 0.39
0.05 0.35 0.34 0.33 0.3 0.42 0.57 0.39 0.4 1.0 0.53 0.33 0.21 0.36 0.24 0.25 0.35 0.45 0.51 0.17
0.55 0.94 0.71 0.73 0.53 0.32 0.78 0.27 0.58 0.68 0.57 0.81 0.71 0.73 1.0 0.6 0.79 0.64 0.77 0.98
0.46 0.7 0.61 1.0 0.43 0.44 0.96 0.44 0.36 0.83 0.68 0.51 0.59 0.62 0.65 0.4 0.6 0.47 0.54 0.9
0.44 0.78 0.76 0.95 0.53 0.44 1.0 0.19 0.23 0.26 0.5 0.45 0.53 0.65 0.6 0.3 0.6 0.51 0.54 0.44
0.47 0.6 0.56 0.27 0.27 0.34 0.51 0.29 1.0 1.0 0.62 0.52 0.55 0.72 0.58 0.52 0.58 0.53 0.68 0.82
1.0 0.33 0.51 0.25 0.2 0.22 0.55 0.23 0.07 0.44 0.34 0.35 0.34 0.34 0.48 0.34 0.4 0.42 0.67 0.29
0.62 0.71 0.63 0.85 0.29 0.31 0.89 0.33 0.26 0.7 0.53 0.85 0.72 0.82 0.61 0.5 0.77 0.77 1.0 0.48
0.46 0.41 0.47 0.63 0.33 0.28 0.46 0.21 0.53 1.0 0.51 0.37 0.44 0.55 0.39 0.41 0.35 0.41 0.38 0.44
0.29 0.44 0.27 0.42 0.37 0.2 0.17 0.15 0.29 0.08 0.25 0.32 0.31 0.31 0.51 0.26 0.34 0.26 0.25 1.0
0.64 0.63 0.72 0.78 0.71 0.46 1.0 0.5 0.32 0.24 0.56 0.52 0.63 0.58 0.73 0.34 0.56 0.5 0.53 0.99
0.36 0.85 0.92 0.41 0.29 0.32 0.83 0.22 0.64 0.62 0.49 0.39 0.56 0.61 0.83 0.38 0.71 0.54 0.63 1.0
0.92 0.58 1.0 0.81 0.37 0.53 0.74 0.18 0.39 0.38 0.64 0.67 0.53 0.67 0.58 0.56 0.67 0.63 0.75 0.55
0.42 0.47 0.4 0.11 0.15 0.16 0.48 0.14 0.74 1.0 0.45 0.51 0.28 0.36 0.32 0.36 0.45 0.42 0.4 0.31
0.49 0.79 0.53 0.75 0.53 0.47 0.63 0.24 1.0 0.75 0.61 0.75 0.51 0.64 0.75 0.55 0.62 0.58 0.53 0.66
0.48 0.67 0.58 0.59 0.29 0.35 0.65 0.09 0.55 0.93 0.53 0.58 0.57 0.57 0.68 0.42 0.74 0.53 0.61 1.0
0.48 0.82 0.51 0.3 0.15 0.27 0.22 0.2 0.81 0.39 0.41 0.32 0.61 0.84 0.35 0.55 0.41 0.43 0.59 1.0
0.37 0.58 0.5 0.38 0.39 0.28 0.45 0.27 0.5 1.0 0.59 0.4 0.36 0.4 0.46 0.34 0.47 0.38 0.43 0.76
0.63 0.72 0.78 0.22 0.18 0.28 0.66 0.26 0.61 0.46 0.46 1.0 0.66 0.69 0.59 0.63 0.68 0.62 0.7 0.95
0.02 0.64 0.21 0.17 0.18 0.08 0.22 0.03 0.62 1.0 0.34 0.45 0.47 0.49 0.62 0.35 0.58 0.39 0.37 0.23
0.23 0.39 0.3 0.33 0.22 0.17 0.15 0.09 0.66 0.13 0.25 0.28 0.25 0.32 0.25 0.1 0.3 0.19 0.17 1.0
0.37 0.45 0.34 0.59 0.21 0.24 0.41 0.24 0.48 0.47 0.33 0.39 0.46 0.47 0.46 0.3 0.4 0.34 0.37 1.0
0.3 0.73 0.54 0.38 0.31 0.14 0.17 0.12 0.4 0.21 0.3 0.62 0.64 0.6 0.93 0.45 0.63 0.44 0.38 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)