Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.44 0.55 0.31 0.36 0.39 0.24 0.08 0.26 0.46 0.15 0.38 0.5 1.0 0.74 0.53 0.54 0.62 0.48 0.33 0.9
0.5 0.65 0.57 0.57 0.45 0.4 0.85 0.36 0.53 0.31 0.42 0.73 0.97 1.0 0.62 0.71 0.55 0.66 0.47 0.63
0.17 0.54 0.27 1.0 0.72 0.43 0.06 0.49 0.68 0.25 0.5 0.19 0.41 0.45 0.16 0.16 0.35 0.24 0.07 0.96
0.21 0.44 0.25 0.22 0.14 0.1 0.43 0.13 1.0 0.4 0.25 0.41 0.9 0.9 0.55 0.48 0.5 0.39 0.36 0.27
0.32 0.47 0.24 0.6 0.59 0.33 0.12 0.54 0.57 0.09 0.39 0.35 1.0 0.67 0.57 0.46 0.54 0.47 0.34 0.75
0.13 0.47 0.2 1.0 0.63 0.41 0.26 0.28 0.43 0.19 0.32 0.29 0.58 0.53 0.58 0.35 0.56 0.35 0.26 0.55
0.34 0.61 0.23 0.99 0.98 0.9 0.29 1.0 0.44 0.09 0.62 0.28 0.64 0.78 0.55 0.5 0.75 0.49 0.34 0.38
0.08 0.67 0.29 0.54 0.25 0.26 0.42 0.23 0.31 0.13 0.23 0.25 0.71 0.58 0.4 0.39 0.47 0.36 0.3 1.0
0.57 0.36 0.37 0.26 0.24 0.19 0.37 0.17 0.32 0.15 0.25 0.22 0.72 0.47 0.46 0.25 0.36 0.28 0.23 1.0
0.22 0.33 0.23 0.17 0.16 0.15 0.32 0.14 0.98 0.14 0.21 0.32 1.0 0.75 0.31 0.3 0.36 0.39 0.18 0.32
0.2 0.85 0.49 0.45 0.34 0.14 0.95 0.14 0.7 0.11 0.37 0.5 0.76 0.88 0.61 0.55 0.8 0.42 0.2 1.0
0.21 0.43 0.35 0.37 0.4 0.37 0.11 0.47 0.46 0.17 0.45 0.2 0.47 0.43 0.23 0.17 0.37 0.18 0.14 1.0
0.1 0.3 0.13 0.43 0.6 0.32 0.04 0.51 0.33 0.09 0.32 0.31 1.0 0.66 0.59 0.53 0.31 0.38 0.24 0.69
0.52 0.93 0.58 0.89 0.65 0.51 1.0 0.65 0.21 0.12 0.47 0.59 0.94 0.98 0.55 0.62 0.84 0.57 0.43 0.66
0.04 0.13 0.08 0.09 0.13 0.11 0.04 0.14 0.13 0.03 0.12 0.2 1.0 0.43 0.18 0.2 0.17 0.16 0.09 0.16
0.28 0.44 0.4 0.03 0.03 0.05 0.07 0.01 0.48 0.06 0.14 0.36 1.0 0.56 0.7 0.3 0.39 0.36 0.16 0.92
0.32 0.46 0.35 0.72 0.69 0.58 0.21 0.45 0.33 0.06 0.44 0.46 0.52 0.64 0.47 0.32 0.43 0.43 0.36 1.0
0.28 0.42 0.26 0.44 0.4 0.31 0.18 0.34 0.95 0.33 0.4 0.9 1.0 0.85 0.65 0.68 0.51 0.57 0.35 0.65
0.37 0.63 0.38 0.72 0.62 0.54 0.14 0.77 0.69 0.23 0.54 0.52 0.88 0.89 0.78 0.65 0.64 0.44 0.32 1.0
0.24 0.4 0.3 0.34 0.5 0.26 0.19 0.25 0.33 0.08 0.45 0.4 0.77 0.6 0.49 0.33 0.47 0.36 0.25 1.0
0.27 0.69 0.35 1.0 0.9 0.34 0.25 0.27 0.43 0.19 0.45 0.24 0.5 0.52 0.28 0.45 0.41 0.31 0.22 0.88
1.0 0.27 0.32 0.53 0.57 0.38 0.19 0.36 0.74 0.17 0.59 0.22 0.5 0.46 0.34 0.22 0.45 0.26 0.2 0.67
0.22 0.34 0.12 0.14 0.15 0.08 0.02 0.09 0.16 0.08 0.17 0.28 1.0 0.46 0.52 0.53 0.28 0.28 0.24 0.94
0.47 0.73 0.45 1.0 0.82 0.57 0.57 0.67 0.82 0.46 0.67 0.53 0.52 0.6 0.58 0.45 0.71 0.5 0.4 0.44
0.13 0.53 0.35 0.39 0.33 0.31 0.3 0.3 0.41 0.08 0.29 1.0 0.76 0.87 0.59 0.77 0.66 0.6 0.51 0.43
0.53 0.42 0.27 0.25 0.23 0.17 0.08 0.22 0.42 0.06 0.21 0.5 1.0 0.79 0.93 0.48 0.5 0.37 0.29 0.85
0.62 0.26 0.33 0.14 0.04 0.09 0.59 0.1 0.25 0.18 0.19 0.59 1.0 0.7 0.43 0.49 0.29 0.61 0.31 0.4
0.22 0.67 0.35 0.59 0.38 0.18 0.83 0.12 0.66 0.35 0.33 0.55 0.93 1.0 0.81 0.52 0.55 0.54 0.31 0.37
1.0 0.31 0.28 0.56 0.45 0.3 0.23 0.32 0.42 0.13 0.42 0.16 0.87 0.7 0.41 0.27 0.54 0.29 0.18 0.9
0.26 0.57 0.42 0.54 0.36 0.36 0.16 0.49 0.19 0.14 0.29 0.49 1.0 0.61 0.73 0.57 0.55 0.48 0.27 0.42
0.36 0.41 0.25 0.49 0.56 0.31 0.16 0.28 0.14 0.03 0.44 0.23 0.73 0.53 0.32 0.29 0.49 0.23 0.12 1.0
0.39 0.23 0.17 0.24 0.11 0.25 0.2 0.25 1.0 0.17 0.14 0.63 0.82 0.71 0.42 0.41 0.34 0.67 0.55 0.34
0.33 0.28 0.2 0.23 0.11 0.15 0.29 0.13 0.23 0.04 0.12 0.53 1.0 0.61 0.39 0.37 0.34 0.44 0.21 0.62
0.54 0.33 0.29 0.47 0.49 0.34 0.18 0.4 0.27 0.06 0.43 0.3 0.5 0.42 0.45 0.25 0.44 0.31 0.24 1.0
0.53 0.55 0.36 0.48 0.47 0.26 0.18 0.29 0.3 0.08 0.4 0.34 0.89 0.61 0.63 0.39 0.68 0.37 0.27 1.0
0.43 0.48 0.31 1.0 0.69 0.51 0.35 0.57 0.78 0.12 0.58 0.67 0.95 0.53 0.85 0.41 0.62 0.49 0.34 0.53
0.29 0.83 0.46 0.53 0.5 0.26 0.94 0.21 0.58 0.21 0.39 0.6 0.78 0.79 0.67 0.52 0.69 0.55 0.38 1.0
0.13 0.16 0.08 0.13 0.15 0.19 0.1 0.26 0.05 0.03 0.15 0.36 1.0 0.41 0.49 0.23 0.45 0.34 0.2 0.29
0.33 0.52 0.43 0.4 0.34 0.23 0.22 0.26 0.21 0.11 0.34 0.41 1.0 0.78 0.53 0.54 0.48 0.42 0.27 0.84
0.27 0.51 0.31 0.45 0.25 0.18 0.43 0.15 0.8 0.24 0.23 0.78 0.8 1.0 0.61 0.49 0.49 0.55 0.26 0.18
0.34 0.87 0.74 0.76 0.56 0.37 0.91 0.27 0.9 0.21 0.52 0.81 1.0 0.97 0.82 0.68 0.81 0.64 0.41 0.95
0.28 0.58 0.29 0.24 0.21 0.21 0.13 0.17 0.46 0.09 0.24 0.46 0.86 0.57 0.74 0.35 0.44 0.41 0.21 1.0
0.45 0.48 0.35 0.47 0.4 0.42 0.69 0.48 0.46 0.15 0.34 0.33 0.61 0.51 0.46 0.35 0.4 0.32 0.28 1.0
0.22 0.32 0.26 0.2 0.19 0.16 0.32 0.12 0.84 0.06 0.23 0.41 0.86 0.85 0.65 0.36 0.63 0.37 0.23 1.0
0.29 0.82 0.64 0.52 0.4 0.38 0.69 0.28 0.46 0.18 0.4 0.62 0.62 0.58 0.61 0.57 0.71 0.49 0.39 1.0
0.26 0.24 0.17 0.37 0.42 0.24 0.08 0.3 0.11 0.03 0.23 0.32 1.0 0.61 0.59 0.32 0.39 0.27 0.24 0.68
0.66 0.46 0.46 0.3 0.31 0.28 0.39 0.33 0.44 0.18 0.29 0.22 0.43 0.37 0.39 0.27 0.39 0.3 0.28 1.0
0.59 0.64 0.54 0.94 0.64 0.36 1.0 0.27 0.81 0.42 0.47 0.64 0.86 0.88 0.68 0.73 0.57 0.63 0.41 0.46
0.47 0.75 0.58 0.56 0.47 0.32 0.75 0.3 0.97 0.28 0.4 0.57 1.0 0.84 0.7 0.58 0.74 0.57 0.45 0.97
0.13 0.46 0.17 0.13 0.09 0.11 0.07 0.09 0.55 0.19 0.14 0.64 1.0 0.51 0.46 0.38 0.51 0.4 0.32 0.77
0.24 0.43 0.28 0.27 0.25 0.13 0.14 0.11 0.52 0.07 0.23 0.39 0.85 0.65 0.5 0.35 0.4 0.32 0.14 1.0
0.6 0.57 0.61 0.28 0.29 0.24 0.34 0.22 0.77 0.49 0.47 0.66 1.0 0.62 0.78 0.6 0.59 0.44 0.32 0.82

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)