Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.3 0.44 0.44 0.2 0.1 0.13 0.19 0.08 0.21 0.0 0.16 0.1 0.57 0.36 0.59 0.23 0.34 0.25 0.2 1.0
0.35 0.47 0.46 0.5 0.39 0.42 0.46 0.32 0.27 0.41 0.42 0.59 0.55 0.57 0.67 0.41 0.48 0.48 0.72 1.0
0.73 0.88 0.82 0.61 0.52 0.59 0.88 0.59 0.58 0.85 0.75 0.68 0.58 0.65 0.75 0.54 0.76 0.52 0.7 1.0
0.07 0.6 0.18 0.0 0.01 0.04 0.31 0.02 0.55 0.31 0.12 0.4 0.38 0.44 1.0 0.34 0.63 0.38 0.6 0.6
0.26 0.43 0.32 0.33 0.31 0.31 0.15 0.33 0.92 0.01 0.45 0.6 1.0 0.81 0.42 0.62 0.99 0.33 0.28 0.87
0.11 0.16 0.14 0.13 0.12 0.1 0.12 0.12 1.0 0.03 0.14 0.23 0.36 0.26 0.21 0.24 0.36 0.15 0.16 0.42
0.16 0.37 0.33 0.0 0.01 0.08 0.25 0.02 0.47 0.02 0.11 0.87 0.31 0.28 0.28 0.25 0.24 0.21 0.24 1.0
0.4 0.75 0.53 0.65 0.43 0.46 0.75 0.49 0.5 0.29 0.45 0.66 0.79 0.7 1.0 0.54 0.87 0.61 0.6 0.84
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 1.0 0.08 0.02 0.05 0.13 0.15 0.1 0.05 0.05 0.06 0.11 0.06
0.06 1.0 0.63 0.01 0.03 0.11 0.64 0.05 0.02 0.02 0.15 0.11 0.11 0.23 0.89 0.43 0.82 0.41 0.62 0.31
0.23 0.29 0.25 0.24 0.17 0.2 0.21 0.23 1.0 0.19 0.23 0.45 0.39 0.38 0.26 0.28 0.31 0.24 0.22 0.43
0.62 0.63 0.45 0.31 0.27 0.25 0.65 0.18 0.22 0.12 0.33 0.65 0.5 0.5 0.66 0.5 0.6 0.45 0.44 1.0
0.23 0.54 0.4 0.42 0.27 0.26 0.31 0.16 1.0 0.9 0.46 0.67 0.64 0.67 0.69 0.5 0.54 0.46 0.58 0.83
0.59 0.64 0.94 0.25 0.21 0.26 1.0 0.19 0.57 0.71 0.51 0.5 0.5 0.61 0.57 0.38 0.52 0.37 0.41 0.74
0.21 0.64 0.71 0.22 0.18 0.22 0.8 0.18 0.61 0.4 0.3 0.72 0.64 0.53 0.53 0.53 0.46 0.4 0.43 1.0
0.4 0.58 0.44 1.0 0.58 0.53 0.69 0.63 0.17 0.1 0.41 0.6 0.91 0.95 0.76 0.69 0.61 0.55 0.62 0.64
0.32 0.92 0.67 0.75 0.57 0.55 0.84 0.74 0.34 0.49 0.61 0.74 0.72 0.79 0.96 0.46 0.8 0.65 0.62 1.0
0.43 0.81 0.61 0.54 0.4 0.33 1.0 0.27 0.38 0.19 0.42 0.96 0.74 0.73 0.67 0.62 0.68 0.63 0.56 0.88
0.3 0.75 0.62 0.67 0.56 0.47 1.0 0.49 0.53 0.4 0.56 0.88 0.66 0.79 0.63 0.57 0.66 0.55 0.52 0.43
0.5 0.7 0.63 0.68 0.42 0.33 1.0 0.22 0.42 0.45 0.46 0.85 0.76 0.72 0.69 0.62 0.74 0.63 0.63 0.74
0.05 0.17 0.13 0.07 0.02 0.05 0.18 0.01 1.0 0.25 0.1 0.07 0.07 0.12 0.17 0.07 0.11 0.07 0.13 0.11
0.91 0.69 0.61 0.22 0.31 0.42 0.53 0.42 0.48 0.5 0.57 0.7 0.35 0.43 0.61 0.5 0.72 0.49 0.62 1.0
0.5 0.67 0.69 0.52 0.38 0.3 0.84 0.26 1.0 0.78 0.58 0.45 0.51 0.6 0.39 0.46 0.51 0.48 0.49 0.62
0.37 0.72 0.64 0.71 0.49 0.74 0.63 0.69 0.04 0.04 0.45 0.73 0.54 0.51 0.71 0.42 0.61 0.5 0.68 1.0
0.53 0.87 0.78 0.34 0.32 0.28 0.68 0.25 0.45 0.31 0.43 0.71 0.65 0.53 0.68 0.62 0.81 0.48 0.53 1.0
0.62 0.67 0.5 0.67 0.56 0.27 0.51 0.28 0.28 0.13 0.47 0.69 0.79 0.59 1.0 0.52 0.68 0.56 0.46 0.97
0.49 0.78 0.96 0.75 0.58 0.82 1.0 0.67 0.38 0.27 0.66 0.67 0.52 0.58 0.61 0.55 0.85 0.54 0.68 0.59
0.32 0.3 0.19 0.02 0.04 0.18 0.31 0.13 0.0 0.41 0.29 0.27 0.07 0.18 1.0 0.18 0.54 0.32 0.56 0.63
0.3 0.68 0.76 0.61 0.5 0.69 0.8 0.93 0.9 0.2 0.5 0.56 0.75 0.74 0.73 0.4 0.66 0.48 1.0 0.83
1.0 0.44 0.49 0.1 0.12 0.17 0.53 0.15 0.99 0.83 0.43 0.51 0.28 0.4 0.46 0.31 0.42 0.32 0.47 0.65
0.43 0.56 0.59 0.2 0.2 0.22 0.72 0.18 1.0 0.27 0.36 0.71 0.58 0.59 0.51 0.48 0.5 0.44 0.44 0.61
1.0 0.79 0.78 0.23 0.18 0.28 0.56 0.24 0.51 0.25 0.48 0.79 0.55 0.54 0.76 0.59 0.84 0.55 0.67 0.85
0.98 0.78 0.93 0.32 0.29 0.63 1.0 0.66 0.14 0.09 0.53 0.68 0.28 0.3 0.42 0.39 0.91 0.4 0.55 0.57
0.66 0.68 0.61 0.59 0.34 0.37 0.71 0.41 0.41 0.24 0.38 0.41 1.0 0.99 0.7 0.63 0.61 0.53 0.59 0.43
0.53 0.92 0.69 0.43 0.47 0.49 0.83 0.44 0.71 0.4 0.63 0.88 0.71 0.68 0.87 0.7 0.94 0.6 0.64 1.0
0.22 0.44 0.5 0.46 0.33 0.29 1.0 0.3 0.15 0.27 0.45 0.57 0.36 0.37 0.5 0.51 0.41 0.41 0.35 0.48
0.24 0.84 0.3 0.49 0.34 0.35 0.82 0.42 0.41 0.25 0.36 0.38 0.4 0.51 0.59 0.46 0.82 0.55 0.64 1.0
0.05 0.39 0.31 0.0 0.01 0.07 0.2 0.02 0.11 0.01 0.08 0.53 0.58 0.54 0.39 0.41 0.26 0.27 0.38 1.0
0.41 0.76 0.78 0.32 0.38 0.38 0.84 0.17 0.39 0.33 0.46 0.7 0.97 1.0 0.65 0.55 0.6 0.6 0.67 0.96
0.38 0.84 1.0 0.19 0.04 0.25 0.85 0.12 0.12 0.09 0.26 0.57 0.68 0.78 0.8 0.59 0.64 0.6 0.7 0.86
0.31 0.38 0.36 0.22 0.14 0.36 0.03 0.08 0.05 0.06 0.14 0.22 0.23 0.43 0.31 0.24 0.68 0.29 0.91 1.0
0.85 0.68 1.0 0.93 0.46 0.6 0.94 0.47 0.12 0.24 0.59 0.46 0.88 0.77 0.68 0.42 0.65 0.53 0.77 0.94
0.56 0.85 0.68 0.24 0.13 0.18 0.42 0.12 0.84 0.14 0.43 0.61 0.79 0.85 1.0 0.7 0.66 0.54 0.64 0.72
0.27 0.31 0.24 0.1 0.06 0.07 0.18 0.05 1.0 0.38 0.24 0.26 0.3 0.39 0.38 0.28 0.27 0.21 0.34 0.58
0.68 0.48 0.44 0.37 0.42 0.33 0.36 0.24 0.28 0.53 0.46 0.56 0.55 0.53 1.0 0.39 0.51 0.43 0.63 0.89
0.33 0.52 0.46 0.42 0.35 0.46 0.27 0.34 0.1 0.2 0.32 0.45 0.43 0.47 0.52 0.36 0.5 0.37 0.46 1.0
0.05 0.25 0.14 0.0 0.0 0.04 0.14 0.01 0.01 0.02 0.04 0.43 0.36 0.35 0.53 0.52 0.27 0.26 0.57 1.0
0.06 0.5 0.13 0.0 0.0 0.03 0.2 0.0 0.03 0.0 0.04 0.46 0.77 0.47 0.41 0.25 0.39 0.24 0.22 1.0
0.31 0.59 0.65 0.29 0.03 0.16 1.0 0.14 0.06 0.04 0.28 0.7 0.64 0.43 0.55 0.79 0.52 0.48 0.46 0.51
0.17 0.82 0.27 0.38 0.18 0.16 0.69 0.08 0.1 0.03 0.19 0.69 1.0 0.89 0.83 0.68 0.83 0.59 0.5 0.57
0.52 0.93 0.7 0.68 0.49 0.39 0.72 0.33 0.87 0.39 0.56 1.0 0.81 0.89 0.73 0.7 0.79 0.63 0.56 0.98
0.42 0.57 0.52 0.23 0.19 0.26 0.37 0.1 1.0 0.82 0.41 0.75 0.43 0.44 0.67 0.38 0.66 0.42 0.52 0.6
0.05 0.22 0.16 0.0 0.0 0.03 0.15 0.01 1.0 0.08 0.09 0.3 0.22 0.22 0.2 0.13 0.16 0.12 0.17 0.52
0.45 0.79 0.69 0.44 0.15 0.19 0.88 0.16 0.5 0.56 0.48 0.89 0.7 1.0 0.71 0.56 0.63 0.65 0.9 0.64
0.51 0.84 0.74 0.43 0.16 0.26 0.61 0.31 0.68 0.39 0.38 1.0 0.97 0.99 0.92 0.72 0.76 0.61 0.78 0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)