Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
- - - - - - -0.32 - - - - - - - - - - 4.26 -5.4 -
- - - - - - 1.11 - - - - - - - - - - 4.15 -3.3 -
- - - - - - 0.93 - - - - - - - - - - 4.18 - -
- - - - - - 0.24 - - - - - - - - - - 4.23 -4.42 -
- - - - - - -0.61 - - - - - - - - - - 4.27 -3.67 -
- -0.38 - - - - 0.31 - - - - - - - - - - 4.17 - -
- 0.57 - - - - -0.31 - - - - - - - - - - 4.14 -5.66 -
- - - - - - 1.65 - - - - - - - - - - 4.07 -4.87 -
- - - - - - -0.0 - - - - - - - - - - 4.24 -4.1 -
- - - - - - 1.38 - - - - - - - - - - 4.11 -3.39 -
- - - - - - 0.37 - - - - - - - - - -2.09 4.2 -3.69 -
- - - - - - -1.39 - -0.07 - - - - - - -0.91 -1.5 4.15 -6.37 -
- - - - - - 0.37 - 1.36 - - - - -1.53 - - -2.83 3.94 -1.6 -
- 0.48 - - - - -0.69 - - - - - - -0.26 - - - 4.1 -6.15 -
- - - - - - 0.49 - - - - - - - - - - 4.21 -3.62 -
- - - - - - -1.12 - - - - - - - - - - 4.29 -4.99 -
- - - - - - 0.97 - - - - - - - - - - 4.16 -2.19 -
- - - - - - 1.45 - - - - - - - - - - 4.1 -3.45 -
- - - - - - -0.07 - - - - - - - - - - 4.25 - -
- - - - - - 0.51 - - - - - - - - - - 4.21 -4.41 -
- - - - - - 0.53 - - - - - - - - - - 4.21 -4.94 -
- - - - - - -0.52 - - - - - - - - - - 4.26 -3.02 -
- - - - - - 1.6 - - - - - - - - - 0.24 3.98 -4.75 -
- - - - - - -0.5 - - - - - - - - - - 4.26 -3.07 -
- - - - - - 0.37 - - - - - - - - - - 4.22 -4.73 -
- - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - 4.24 -4.2 -
- - - - - - 1.27 - - - - - - - - - - 4.13 -4.03 -
- -0.43 - - - - 0.3 - 0.98 - - - - - - - - 4.0 -3.8 -
- - - - - - 0.54 - - - - -0.1 - - - - -3.24 4.12 -3.97 -
- - - - - - 0.24 - - - - - - - - - - 4.23 -4.2 -
- - - - - - -0.08 - - - - - - - - - - 4.25 -5.49 -
- - - - - - 0.05 - - - - - - 0.47 - - - 4.14 - -
- - - - - - -0.81 - - - - - - - - - -1.69 4.26 -5.9 -
- - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - 4.14 -3.76 -
- - - - - - 1.34 - - - - - - - - - - 4.13 - -
- - - - - - 0.89 - - - - - - - - - - 4.17 -2.8 -
- - - - - - 0.49 - - - - - - - - - -1.12 4.18 -4.19 -
- 0.4 - - - - -0.07 - - - - 0.7 - -1.13 - - -2.95 3.95 -4.48 -
- - - - - - 0.36 - - - - - - - - - - 4.22 -4.99 -
- - - - - - 1.48 - - - - - - - - - - 4.11 - -
- - - - - - -0.78 - - - - - - - - - - 4.28 - -
- - - - - - -0.12 - - - - - - - - - - 4.25 -3.53 -
- - - - - - 0.79 - - - - - - - - - - 4.19 -5.25 -
- - - - - - 1.24 - - - - - - - - - - 4.13 -3.39 -
- -0.74 - - - - -1.65 - - - - - - - - 0.83 - 4.1 -3.05 -
- - - - - - 0.54 - - - - - - - - - - 4.21 - -
- - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - 4.14 - -
- - - - - - 0.15 - - - - - - - - - -0.73 4.19 -3.43 -
- - - - - - 1.15 - - - - - - - - - - 4.15 - -
- - - - - - -0.6 - - - - - - - - - - 4.27 -3.97 -
- - - - - - 1.2 - - - - - - - - - - 4.15 - -
- - - - - - 0.96 - - - - - - - - - - 4.17 - -
- - - - - - 1.42 - - - - - - - - - - 4.11 - -
- - - - - - 0.37 - - - - - - - - - - 4.23 - -
- - - - - - 1.11 - - - - - - - - - -0.5 4.09 -4.55 -
- - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - 4.13 -3.44 -
- - - - - - 1.72 - - - - - - - - - - 4.06 - -
- - - - - - 1.23 - - - - - - - - - - 4.13 -2.78 -
- - - - - - -0.77 - - - - - - - - - - 4.28 -4.53 -
- - - - - - 1.52 - - - - - - 0.14 - - -1.16 3.95 -2.83 -
- - - - - - 0.41 - - - - - - - - - - 4.2 -1.7 -
- - - - - - 0.27 - - - - - - - - - -0.34 4.16 -3.47 -
- - - - - - -0.05 - - - - - - - -0.31 -0.55 - 4.12 -2.93 -
- - - - - - 0.91 - - - - - - - - - - 4.18 - -
- - - - - - 1.59 - - - - - - - - - - 4.09 - -
- - - - - - 0.71 - - - - - 1.16 - - - - 4.01 - -
- - - - - - 0.36 - - - - - - - - - - 4.22 -4.99 -
- - - - - - 0.09 - - - - - - - - - -0.28 4.17 -3.04 -
- - - - - - 0.81 - - - - - - - - - - 4.19 - -
- - - - - - 1.61 - - - - - - - - - - 4.07 -3.31 -
- - - - - - 1.27 - - - - - - - - - - 4.13 -3.92 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.