Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.63 0.55 0.39 0.78 0.68 0.4 1.0 0.53 0.1 0.53 0.56 0.63 0.42 0.37 0.93 0.35 0.71 0.54 0.23 0.78
0.36 0.24 0.24 0.21 0.19 0.05 1.0 0.03 0.24 0.25 0.19 0.13 0.13 0.11 0.33 0.17 0.22 0.21 0.15 0.14
0.72 0.68 0.76 0.59 0.39 0.4 1.0 0.17 0.38 0.16 0.35 0.53 0.69 0.85 0.52 0.3 0.54 0.56 0.31 0.64
0.22 0.46 0.37 0.43 0.36 0.18 0.39 0.17 0.38 0.31 0.32 0.37 0.52 0.34 0.86 0.3 0.41 0.37 0.24 1.0
0.16 0.7 0.58 0.4 0.26 0.18 0.97 0.08 0.57 0.21 0.35 0.68 0.98 0.8 0.84 0.48 0.51 0.68 0.45 1.0
0.23 0.92 0.56 0.44 0.18 0.15 0.7 0.09 0.26 0.26 0.22 0.91 0.61 0.5 0.99 0.53 0.62 0.63 0.32 1.0
0.36 0.62 0.35 0.48 0.18 0.21 0.16 0.15 1.0 0.29 0.32 0.23 0.67 0.86 0.29 0.47 0.53 0.48 0.2 0.81
0.28 0.73 0.51 0.5 0.35 0.32 0.51 0.23 0.37 0.24 0.34 0.49 0.53 0.44 0.64 0.43 0.53 0.44 0.31 1.0
0.18 0.93 0.6 0.73 0.26 0.26 0.31 0.11 1.0 0.3 0.38 0.29 0.78 0.76 0.33 0.53 0.56 0.41 0.19 0.72
0.46 0.66 0.64 0.46 0.39 0.34 1.0 0.38 0.59 0.24 0.38 0.3 0.51 0.47 0.45 0.31 0.5 0.42 0.27 0.99
0.38 0.42 0.35 0.41 0.18 0.19 1.0 0.16 0.47 0.25 0.24 0.42 0.41 0.39 0.43 0.25 0.44 0.38 0.25 0.65
0.31 0.41 0.36 0.31 0.3 0.19 0.51 0.18 1.0 0.58 0.35 0.36 0.39 0.38 0.37 0.27 0.38 0.32 0.16 0.33
0.0 0.3 0.15 0.41 0.38 0.11 1.0 0.06 0.14 0.09 0.16 0.25 0.19 0.18 0.48 0.2 0.19 0.21 0.07 0.25
0.08 0.26 0.09 0.43 0.3 0.12 1.0 0.02 0.33 0.17 0.16 0.17 0.08 0.17 0.18 0.16 0.14 0.2 0.1 0.01
0.33 0.47 0.55 0.25 0.21 0.1 0.61 0.1 1.0 0.67 0.37 0.42 0.5 0.51 0.51 0.34 0.42 0.42 0.29 0.51
0.23 1.0 0.61 0.78 0.44 0.37 0.2 0.33 0.91 0.27 0.41 0.24 0.75 0.86 0.32 0.3 0.5 0.44 0.17 0.8
0.41 0.38 0.35 0.48 0.32 0.26 1.0 0.04 0.34 0.45 0.38 0.83 0.94 0.79 0.82 0.27 0.69 0.78 0.58 0.57
0.39 0.56 0.51 0.51 0.41 0.27 0.63 0.18 0.85 1.0 0.52 0.41 0.51 0.59 0.46 0.42 0.41 0.5 0.29 0.5
0.15 0.34 0.41 0.23 0.12 0.14 0.42 0.19 0.76 1.0 0.49 0.24 0.28 0.25 0.43 0.22 0.3 0.4 0.25 0.36
0.6 0.7 0.62 0.84 0.5 0.39 0.87 0.29 0.79 0.92 0.58 0.7 0.74 0.75 0.66 0.49 0.61 0.7 0.54 1.0
0.35 0.63 0.81 0.72 0.47 0.38 0.81 0.26 1.0 0.77 0.56 0.68 0.45 0.7 0.31 0.31 0.41 0.64 0.39 0.69
0.45 0.5 0.81 0.56 0.24 0.3 1.0 0.26 0.62 0.23 0.33 0.37 0.33 0.4 0.38 0.33 0.41 0.46 0.32 0.28
0.18 0.4 0.34 0.32 0.25 0.21 0.36 0.17 0.46 0.42 0.32 0.2 0.28 0.36 0.25 0.22 0.3 0.29 0.19 1.0
0.18 1.0 0.59 0.75 0.53 0.35 0.16 0.18 0.7 0.17 0.42 0.17 0.55 0.68 0.14 0.13 0.43 0.42 0.05 0.29
0.73 0.47 0.53 0.2 0.18 0.17 0.97 0.1 0.43 1.0 0.53 0.57 0.38 0.48 0.57 0.53 0.54 0.74 0.46 0.35
0.17 0.57 0.38 0.47 0.16 0.14 0.46 0.15 1.0 0.22 0.23 0.33 0.94 0.69 0.7 0.44 0.59 0.44 0.15 0.53
0.2 0.8 0.54 0.9 0.66 0.65 0.6 0.69 1.0 0.5 0.6 0.54 0.7 0.73 0.66 0.47 0.79 0.65 0.5 0.95
0.47 0.82 1.0 0.6 0.35 0.42 0.7 0.4 0.89 0.7 0.58 0.69 0.49 0.49 0.59 0.37 0.61 0.59 0.41 0.68
0.37 0.55 0.54 0.34 0.29 0.2 1.0 0.21 0.29 0.24 0.33 0.35 0.36 0.38 0.35 0.23 0.5 0.39 0.24 0.48
0.3 0.53 0.59 0.19 0.1 0.18 1.0 0.09 0.21 0.22 0.26 0.26 0.29 0.37 0.28 0.32 0.41 0.34 0.22 0.48
0.13 0.17 0.17 0.21 0.15 0.09 0.27 0.07 1.0 0.1 0.14 0.19 0.16 0.18 0.17 0.13 0.18 0.18 0.08 0.12
0.27 1.0 0.87 0.32 0.24 0.23 0.76 0.15 0.8 0.8 0.51 0.8 0.83 0.98 0.81 0.64 0.77 0.82 0.35 0.86
0.24 0.41 0.37 0.51 0.28 0.24 0.36 0.15 1.0 0.7 0.38 0.35 0.38 0.38 0.39 0.34 0.4 0.42 0.31 0.57
0.38 0.48 0.48 0.18 0.16 0.13 1.0 0.02 0.52 0.48 0.3 0.54 0.58 0.47 0.61 0.41 0.58 0.49 0.32 0.26
0.29 0.66 0.57 0.43 0.32 0.24 1.0 0.32 0.59 0.29 0.38 0.45 0.51 0.58 0.55 0.49 0.59 0.44 0.34 0.53
0.32 0.58 0.47 0.65 0.43 0.2 1.0 0.17 0.89 0.28 0.36 0.35 0.58 0.54 0.52 0.39 0.44 0.37 0.23 0.7
0.23 0.63 0.31 0.53 0.26 0.14 0.18 0.13 0.54 0.13 0.22 0.35 0.98 1.0 0.44 0.4 0.47 0.4 0.13 0.68
0.27 0.88 0.62 0.59 0.12 0.38 0.77 0.16 0.55 0.63 0.37 0.74 1.0 0.86 0.98 0.54 0.76 0.9 0.72 0.53
0.44 0.7 0.64 0.56 0.5 0.34 1.0 0.36 0.95 0.23 0.47 0.43 0.55 0.51 0.46 0.35 0.65 0.43 0.28 0.93
0.28 0.48 0.33 0.41 0.14 0.17 0.33 0.08 1.0 0.28 0.24 0.19 0.55 0.65 0.23 0.38 0.38 0.37 0.19 0.35
0.3 0.53 0.53 0.35 0.16 0.21 1.0 0.23 0.33 0.31 0.24 0.22 0.27 0.31 0.32 0.24 0.32 0.28 0.17 0.46
0.34 0.65 0.7 0.25 0.15 0.13 0.9 0.11 0.88 1.0 0.44 0.37 0.41 0.45 0.42 0.35 0.46 0.53 0.3 0.57
0.27 0.59 0.53 0.44 0.27 0.16 0.6 0.12 0.44 0.19 0.27 0.24 0.33 0.36 0.31 0.33 0.42 0.36 0.23 1.0
0.62 0.77 0.54 0.96 0.56 0.43 0.83 0.39 0.95 0.76 0.61 0.91 0.86 1.0 0.75 0.55 0.74 0.76 0.45 0.4
0.47 0.9 1.0 1.0 0.66 0.59 0.8 0.69 0.47 0.46 0.68 0.55 0.58 0.71 0.61 0.52 0.77 0.64 0.49 0.97
0.32 0.5 0.36 0.38 0.28 0.23 1.0 0.16 0.91 0.27 0.31 0.42 0.5 0.48 0.45 0.31 0.4 0.43 0.29 0.58
0.32 0.56 0.4 0.58 0.47 0.29 1.0 0.25 0.46 0.22 0.31 0.38 0.56 0.54 0.46 0.37 0.52 0.37 0.28 0.77
0.36 0.72 0.53 0.45 0.21 0.21 0.69 0.06 1.0 0.92 0.46 0.8 0.7 0.8 0.67 0.52 0.47 0.61 0.45 0.63
0.24 0.82 0.49 0.83 0.47 0.26 0.65 0.2 0.6 0.16 0.34 0.74 0.88 1.0 0.56 0.54 0.59 0.66 0.32 0.51
0.76 1.0 0.84 0.92 0.71 0.57 0.98 0.54 0.64 0.59 0.75 0.73 0.77 0.79 0.81 0.52 0.95 0.69 0.6 1.0
0.54 0.72 0.85 0.85 0.62 0.28 1.0 0.3 0.54 0.35 0.52 0.57 0.5 0.55 0.66 0.49 0.61 0.63 0.35 0.98
0.5 0.72 0.86 0.35 0.29 0.29 1.0 0.27 0.69 0.68 0.55 0.63 0.69 0.66 0.62 0.63 0.55 0.58 0.42 0.65
0.7 0.64 0.67 0.37 0.32 0.33 0.96 0.27 0.27 0.28 0.43 0.78 0.66 0.65 0.7 0.51 0.53 0.61 0.42 1.0
0.42 0.69 0.6 0.49 0.4 0.35 1.0 0.37 0.16 0.09 0.37 0.41 0.36 0.42 0.54 0.28 0.55 0.4 0.3 0.61
0.78 0.57 0.6 0.62 0.24 0.13 0.87 0.04 0.65 0.69 0.4 0.57 0.81 0.78 0.77 0.47 0.64 0.64 0.44 1.0
0.33 0.68 0.68 0.33 0.28 0.25 1.0 0.19 0.12 0.09 0.35 0.41 0.45 0.53 0.61 0.35 0.6 0.47 0.36 0.86
0.35 0.74 0.64 1.0 0.75 0.52 0.82 0.52 0.78 0.57 0.6 0.64 0.62 0.64 0.61 0.56 0.7 0.58 0.35 0.5
0.33 0.62 0.71 0.34 0.24 0.23 1.0 0.14 0.4 0.47 0.41 0.48 0.44 0.53 0.5 0.3 0.55 0.49 0.34 0.74
0.1 0.37 0.38 0.15 0.05 0.1 0.64 0.04 1.0 0.55 0.25 0.25 0.25 0.26 0.24 0.17 0.27 0.28 0.12 0.28
0.42 0.34 0.37 0.31 0.18 0.24 0.65 0.25 0.34 0.47 0.28 0.25 0.24 0.27 0.25 0.19 0.29 0.33 0.24 1.0
0.24 0.43 0.26 0.28 0.19 0.11 0.34 0.09 1.0 0.71 0.32 0.41 0.45 0.49 0.57 0.36 0.4 0.4 0.2 0.39
0.49 0.53 0.17 0.38 0.21 0.14 0.54 0.09 0.23 0.09 0.18 0.83 0.68 1.0 0.59 0.97 0.54 0.68 0.27 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)