Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.13 1.0 0.67 1.0 0.91 0.65 0.22 0.76 0.6 0.41 0.7 0.43 0.45 0.71 0.46 0.61 0.65 0.63 0.44 0.46
0.38 0.56 0.53 0.26 0.23 0.19 1.0 0.22 0.26 0.23 0.34 0.52 0.32 0.29 0.45 0.27 0.58 0.41 0.4 0.62
0.19 0.26 0.39 0.65 0.39 0.66 0.25 0.48 0.0 0.07 0.33 0.45 0.31 0.35 0.14 0.18 0.6 1.0 0.5 0.38
0.35 0.39 0.34 0.25 0.16 0.12 0.56 0.04 1.0 1.0 0.4 0.43 0.28 0.3 0.36 0.19 0.38 0.31 0.24 0.77
0.45 0.74 0.85 0.45 0.44 0.48 1.0 0.43 0.72 0.91 0.79 0.67 0.33 0.48 0.38 0.52 0.71 0.91 0.74 0.32
0.04 0.28 0.32 0.07 0.05 0.12 0.11 0.09 0.36 1.0 0.33 0.17 0.07 0.11 0.1 0.12 0.28 0.24 0.2 0.04
0.43 0.92 0.91 0.55 0.37 0.43 0.81 0.38 0.44 0.7 0.59 0.47 0.55 0.62 0.52 0.41 0.62 0.6 0.48 1.0
0.87 0.94 1.0 0.5 0.33 0.33 0.61 0.26 0.42 0.98 0.65 0.71 0.53 0.74 0.66 0.55 0.85 0.71 0.6 0.58
0.8 0.78 0.74 0.36 0.23 0.38 1.0 0.22 0.57 0.75 0.47 0.45 0.32 0.43 0.61 0.45 0.88 0.69 0.71 0.68
0.39 0.81 1.0 0.18 0.08 0.46 0.81 0.32 0.15 0.89 0.43 0.47 0.3 0.46 0.35 0.41 0.66 0.8 0.78 0.1
0.34 0.54 0.52 0.39 0.31 0.17 0.59 0.11 0.54 1.0 0.53 0.21 0.14 0.22 0.28 0.24 0.36 0.29 0.22 0.78
0.27 0.41 0.31 0.12 0.04 0.09 0.55 0.06 0.66 1.0 0.35 0.5 0.42 0.4 0.36 0.32 0.4 0.5 0.46 0.15
0.39 0.98 0.76 0.29 0.33 0.33 0.52 0.2 0.72 1.0 0.55 0.38 0.21 0.3 0.66 0.53 0.94 0.69 0.65 0.6
0.44 0.74 0.64 0.37 0.1 0.24 1.0 0.16 0.11 0.26 0.23 0.69 0.33 0.43 0.96 0.27 0.61 0.77 0.8 0.84
0.25 0.3 0.37 0.1 0.07 0.07 0.38 0.02 0.82 1.0 0.38 0.24 0.21 0.25 0.17 0.14 0.24 0.28 0.17 0.33
0.14 1.0 0.81 0.82 0.51 0.37 0.86 0.4 0.07 0.09 0.39 0.56 0.37 0.41 0.5 0.31 0.9 0.72 0.59 0.6
0.09 0.58 0.2 0.47 0.14 0.21 0.4 0.12 0.19 0.08 0.11 1.0 0.72 0.56 0.68 0.32 0.61 0.55 0.47 0.32
0.42 0.98 1.0 0.42 0.34 0.3 0.7 0.27 0.17 0.41 0.39 0.75 0.37 0.43 0.57 0.38 0.77 0.65 0.54 0.87
0.26 1.0 0.93 0.33 0.19 0.31 0.37 0.21 0.12 0.15 0.26 0.42 0.29 0.34 0.43 0.3 0.78 0.41 0.37 0.52
0.35 0.76 0.7 0.46 0.37 0.43 1.0 0.51 0.68 0.2 0.45 0.83 0.5 0.36 0.85 0.46 0.92 0.65 0.39 0.64
0.13 0.31 0.21 0.79 0.8 0.51 0.66 1.0 0.65 0.39 0.47 0.5 0.62 0.46 0.67 0.39 0.46 0.52 0.52 0.39
0.33 0.48 0.48 0.2 0.16 0.16 0.42 0.13 0.61 1.0 0.44 0.39 0.33 0.37 0.36 0.31 0.4 0.39 0.34 0.4
0.16 0.31 0.3 0.26 0.2 0.11 0.38 0.11 0.94 1.0 0.38 0.23 0.23 0.26 0.34 0.22 0.25 0.3 0.21 0.37
0.26 0.91 1.0 0.72 0.45 0.48 0.82 0.43 0.1 0.29 0.58 0.58 0.56 0.71 0.78 0.58 0.81 0.92 0.82 0.56
0.71 0.86 0.84 0.5 0.49 0.51 1.0 0.67 0.5 0.34 0.65 0.82 0.56 0.64 0.77 0.65 0.98 0.98 0.77 0.76
0.77 0.64 0.7 0.49 0.66 0.49 0.63 0.51 0.77 1.0 0.75 0.71 0.4 0.44 0.58 0.71 0.68 0.83 0.82 0.61
0.42 0.52 0.41 0.72 0.44 0.28 0.36 0.34 0.89 1.0 0.69 0.47 0.6 0.47 0.75 0.42 0.63 0.69 0.55 0.58
0.41 0.86 0.52 0.87 0.46 0.35 0.59 0.85 0.51 0.42 0.72 0.86 0.68 0.79 0.78 0.68 1.0 0.9 0.7 0.43
0.31 0.65 0.51 0.46 0.47 0.55 0.46 0.57 0.73 1.0 0.76 0.57 0.49 0.54 0.6 0.36 0.72 0.61 0.59 0.63
0.46 0.84 0.76 0.46 0.49 0.38 1.0 0.33 0.9 0.66 0.68 0.59 0.66 0.67 0.76 0.47 0.8 0.69 0.58 0.96
0.27 0.85 0.59 0.91 0.95 0.6 0.91 0.83 0.82 0.3 0.71 0.64 0.53 0.63 0.76 0.54 1.0 0.73 0.57 0.65
0.18 0.53 0.41 0.84 0.56 0.46 0.31 0.91 0.6 0.66 0.56 0.82 1.0 0.79 0.73 0.46 0.77 0.91 0.5 0.56
0.54 0.6 0.58 0.83 0.36 0.4 0.39 0.36 0.64 1.0 0.64 0.46 0.44 0.54 0.49 0.54 0.57 0.62 0.42 0.27
0.31 0.75 0.6 0.32 0.32 0.17 0.61 0.2 0.28 0.26 0.36 0.42 0.42 0.37 0.56 0.43 0.69 0.59 0.51 1.0
0.35 0.28 0.29 0.09 0.08 0.13 0.47 0.09 0.51 1.0 0.37 0.24 0.14 0.18 0.2 0.24 0.3 0.37 0.31 0.03
0.26 0.98 0.84 0.14 0.05 0.16 1.0 0.07 0.37 0.61 0.28 0.6 0.37 0.43 0.66 0.41 0.85 0.86 0.61 0.58
0.38 0.44 0.35 0.32 0.27 0.24 0.5 0.31 0.27 0.34 0.37 0.33 0.28 0.29 0.45 0.21 0.35 0.33 0.29 1.0
0.54 0.66 0.73 0.49 0.27 0.28 0.51 0.39 0.36 0.14 0.33 0.32 0.31 0.35 0.37 0.23 0.58 0.39 0.31 1.0
0.35 0.36 0.54 0.18 0.18 0.17 0.27 0.15 1.0 0.94 0.49 0.28 0.16 0.18 0.19 0.19 0.36 0.24 0.18 0.34
0.2 0.21 0.27 0.05 0.06 0.07 0.38 0.07 1.0 0.79 0.32 0.18 0.1 0.1 0.12 0.11 0.2 0.14 0.1 0.16
0.58 0.58 0.76 0.18 0.13 0.13 0.66 0.11 0.42 1.0 0.51 0.36 0.24 0.33 0.33 0.26 0.47 0.45 0.31 0.63
0.65 0.41 0.51 0.24 0.15 0.2 0.67 0.13 0.39 1.0 0.49 0.26 0.34 0.37 0.29 0.32 0.35 0.35 0.25 0.56
0.79 0.2 0.24 0.06 0.07 0.06 0.46 0.04 0.86 1.0 0.36 0.21 0.13 0.14 0.29 0.11 0.2 0.26 0.19 0.61
0.25 0.29 0.23 0.09 0.08 0.07 0.32 0.05 0.62 1.0 0.34 0.24 0.17 0.19 0.35 0.19 0.25 0.29 0.21 0.41
0.6 0.95 1.0 0.87 0.3 0.38 0.98 0.16 0.12 0.64 0.54 0.75 0.78 0.66 0.72 0.68 0.82 0.9 0.76 0.65
0.73 0.84 0.4 0.58 0.61 0.3 0.86 0.24 0.53 0.98 0.69 0.67 0.52 0.6 0.74 0.68 0.7 1.0 0.82 0.63
0.1 0.18 0.04 0.19 0.14 0.16 0.14 0.15 0.72 1.0 0.38 0.21 0.57 0.28 0.36 0.11 0.29 0.55 0.22 0.26
0.34 0.39 0.34 0.37 0.29 0.17 0.27 0.15 0.84 1.0 0.46 0.28 0.28 0.27 0.3 0.25 0.37 0.27 0.21 0.49
0.23 1.0 0.9 0.97 0.86 0.8 0.44 0.79 0.45 0.88 0.91 0.58 0.59 0.78 0.66 0.54 0.78 0.86 0.63 0.4
0.68 0.89 0.73 0.29 0.13 0.25 1.0 0.22 0.44 0.39 0.27 0.74 0.29 0.37 0.76 0.46 0.95 0.75 0.66 0.53
0.81 0.72 0.58 0.31 0.18 0.23 0.69 0.14 0.3 0.56 0.37 1.0 0.83 0.87 0.89 0.63 0.79 0.93 0.73 0.61
0.54 0.63 0.65 0.53 0.39 0.36 0.77 0.37 0.74 1.0 0.6 0.58 0.51 0.59 0.61 0.48 0.58 0.59 0.59 0.56
0.18 0.72 0.54 0.9 0.47 0.47 0.87 0.37 0.38 1.0 0.66 0.68 0.61 0.65 0.37 0.5 0.56 0.88 0.75 0.15
0.53 0.9 0.91 0.77 0.6 0.72 1.0 0.55 0.2 0.4 0.57 0.87 0.84 0.79 0.8 0.67 0.81 0.9 0.83 0.71
0.2 0.75 0.46 0.73 0.49 0.39 0.55 0.3 0.35 0.23 0.39 1.0 0.87 0.82 0.77 0.54 0.71 0.86 0.71 0.5
0.27 0.34 0.24 0.11 0.13 0.14 0.32 0.13 0.37 1.0 0.42 0.21 0.12 0.18 0.35 0.16 0.34 0.31 0.31 0.13
0.29 1.0 0.74 0.54 0.2 0.32 0.71 0.32 0.5 0.4 0.34 0.75 0.51 0.59 0.59 0.54 0.9 0.75 0.69 0.33
0.23 0.34 0.19 0.96 0.4 0.14 0.74 0.79 0.47 0.55 0.35 0.48 0.77 0.47 0.85 0.21 0.54 1.0 0.52 0.16
0.51 0.39 0.42 0.14 0.08 0.2 0.39 0.11 0.3 1.0 0.44 0.32 0.19 0.26 0.32 0.22 0.4 0.35 0.42 0.29
0.31 0.48 0.41 0.3 0.27 0.27 0.24 0.39 1.0 0.44 0.47 0.38 0.58 0.49 0.55 0.51 0.42 0.49 0.35 0.98
0.41 0.54 0.61 0.42 0.26 0.2 0.84 0.19 0.61 0.64 0.48 0.32 0.37 0.41 0.59 0.42 0.47 0.43 0.48 1.0
0.25 0.53 0.35 0.7 0.49 0.33 0.23 0.45 0.84 0.27 0.45 0.44 0.68 0.48 0.62 0.47 0.52 0.6 0.48 1.0
0.4 0.46 0.43 0.13 0.14 0.18 0.4 0.17 0.56 1.0 0.45 0.44 0.18 0.22 0.28 0.25 0.46 0.39 0.3 0.18
0.46 0.91 1.0 0.53 0.18 0.47 0.6 0.24 0.42 0.53 0.37 0.69 0.32 0.38 0.48 0.34 0.77 0.64 0.61 0.74
0.16 0.96 0.83 0.68 0.51 0.57 0.78 0.44 0.2 0.29 0.5 0.65 0.48 0.63 0.83 0.54 1.0 0.74 0.66 0.78
0.46 0.8 0.64 0.59 0.47 0.47 1.0 0.51 0.6 0.53 0.53 0.56 0.54 0.59 0.9 0.72 0.75 0.73 0.84 0.75
0.6 0.65 0.67 0.37 0.44 0.34 1.0 0.33 0.42 0.65 0.59 0.55 0.32 0.34 0.77 0.58 0.58 0.65 0.62 0.71
0.44 0.7 0.55 0.57 0.67 0.48 0.93 0.44 0.92 0.68 0.87 0.91 0.7 0.81 0.71 0.66 0.9 1.0 0.74 0.73
0.29 1.0 0.97 0.64 0.37 0.42 0.83 0.45 0.28 0.39 0.47 0.59 0.51 0.56 0.64 0.43 0.8 0.64 0.52 0.6
0.99 0.63 0.8 0.69 0.5 0.33 1.0 0.29 0.37 0.82 0.56 0.47 0.33 0.42 0.47 0.52 0.53 0.63 0.5 0.72
0.77 0.87 1.0 0.35 0.4 0.64 0.39 0.73 0.95 0.96 0.66 0.59 0.32 0.44 0.51 0.59 0.74 0.8 0.92 0.72
0.29 0.77 0.8 0.41 0.07 0.22 0.48 0.15 0.38 0.95 0.48 0.5 0.63 0.52 1.0 0.41 0.55 0.55 0.53 0.76
0.32 0.7 0.69 1.0 0.56 0.6 0.69 0.54 0.53 0.18 0.55 0.67 0.67 0.66 0.54 0.63 0.62 0.81 0.69 0.45
0.23 0.89 1.0 0.48 0.21 0.36 0.57 0.38 0.12 0.24 0.36 0.39 0.34 0.36 0.46 0.3 0.6 0.56 0.48 0.3
0.1 0.32 0.3 0.2 0.08 0.04 0.29 0.12 1.0 1.0 0.38 0.18 0.15 0.21 0.16 0.09 0.23 0.22 0.2 0.37
0.31 1.0 0.84 0.26 0.21 0.35 0.66 0.58 0.26 0.39 0.45 0.52 0.38 0.49 0.46 0.41 0.73 0.66 0.62 0.8
0.47 0.71 0.71 0.45 0.31 0.29 0.6 0.18 0.65 1.0 0.48 0.4 0.24 0.27 0.3 0.22 0.47 0.41 0.34 0.65
0.32 0.72 1.0 0.25 0.23 0.32 0.8 0.26 0.44 0.8 0.49 0.57 0.31 0.44 0.47 0.49 0.66 0.71 0.63 0.39
0.33 0.73 0.65 0.52 0.23 0.34 0.41 0.31 0.22 0.15 0.28 0.48 0.51 0.49 0.57 0.5 0.77 0.59 0.56 1.0
0.14 0.57 0.33 0.69 0.55 0.57 0.44 0.85 1.0 0.37 0.59 0.26 0.35 0.27 0.37 0.15 0.54 0.35 0.22 0.38
0.44 0.45 0.49 0.18 0.21 0.19 0.68 0.23 0.31 0.34 0.39 0.33 0.37 0.32 0.55 0.28 0.41 0.43 0.38 1.0
0.95 0.71 0.72 0.38 0.32 0.34 0.95 0.38 0.44 0.35 0.52 0.57 0.66 0.6 0.77 0.44 0.62 0.57 0.52 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)