Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.3 0.27 0.22 1.0 0.59 0.46 0.37 0.4 0.2 0.13 0.37 0.25 0.43 0.46 0.29 0.25 0.3 0.29 0.28 0.25
0.36 0.54 0.55 1.0 0.74 0.85 0.5 0.87 0.46 0.29 0.57 0.55 0.54 0.51 0.56 0.39 0.56 0.48 0.55 0.39
0.17 0.66 0.39 0.6 0.47 0.34 1.0 0.41 0.33 0.39 0.41 0.49 0.58 0.65 0.49 0.53 0.61 0.54 0.59 0.9
0.42 0.4 0.3 1.0 0.73 0.39 0.43 0.93 0.35 0.15 0.39 0.54 0.64 0.68 0.51 0.4 0.51 0.45 0.44 0.44
0.18 0.35 0.26 1.0 0.6 0.66 0.19 0.45 0.09 0.13 0.43 0.22 0.36 0.39 0.34 0.22 0.38 0.33 0.31 0.43
0.49 0.5 0.32 0.85 0.67 0.96 0.16 0.87 0.54 1.0 0.78 0.44 0.56 0.58 0.64 0.38 0.57 0.48 0.47 0.14
0.02 0.42 0.08 1.0 0.78 0.53 0.12 0.5 0.07 0.02 0.29 0.17 0.34 0.37 0.35 0.3 0.55 0.26 0.36 0.28
0.3 0.42 0.36 1.0 0.71 0.54 0.41 0.43 0.08 0.34 0.51 0.39 0.46 0.48 0.38 0.46 0.38 0.45 0.39 0.28
0.25 0.29 0.23 1.0 0.62 0.44 0.36 0.31 0.07 0.1 0.36 0.31 0.67 0.62 0.44 0.28 0.33 0.35 0.35 0.35
0.33 0.35 0.3 0.19 0.38 0.48 0.21 1.0 0.03 0.02 0.27 0.24 0.18 0.2 0.33 0.16 0.41 0.21 0.31 0.82
0.01 0.16 0.04 1.0 0.69 0.61 0.03 0.67 0.07 0.09 0.35 0.23 0.53 0.42 0.49 0.28 0.27 0.32 0.25 0.07
0.55 0.62 0.71 0.39 0.29 0.36 0.16 0.2 0.34 0.47 0.43 0.32 0.64 1.0 0.42 0.38 0.49 0.47 0.66 0.3
0.42 0.34 0.37 0.94 0.99 1.0 0.65 0.63 0.2 0.25 0.55 0.58 0.61 0.85 0.56 0.34 0.43 0.55 0.4 0.44
0.31 0.63 0.72 1.0 0.77 0.43 0.76 0.42 0.13 0.16 0.5 0.82 0.61 0.6 0.54 0.52 0.63 0.52 0.5 0.46
0.17 0.29 0.26 1.0 0.95 0.59 0.28 0.69 0.37 0.22 0.58 0.33 0.63 0.62 0.36 0.42 0.33 0.45 0.37 0.25
0.17 0.29 0.19 1.0 0.98 0.47 0.08 0.57 0.6 0.14 0.48 0.25 0.8 0.67 0.48 0.34 0.32 0.34 0.3 0.79
0.3 0.5 0.45 0.75 0.32 0.32 0.39 0.35 1.0 0.25 0.44 0.3 0.41 0.36 0.49 0.29 0.49 0.38 0.43 0.32
0.28 0.59 0.51 1.0 0.61 0.46 0.52 0.24 0.57 0.65 0.58 0.46 0.63 0.64 0.61 0.52 0.63 0.51 0.62 0.75
0.9 0.7 0.86 1.0 0.96 0.84 0.75 0.93 0.26 0.19 0.8 0.57 0.65 0.73 0.63 0.54 0.81 0.61 0.69 0.57
0.66 0.49 0.45 0.49 0.52 0.41 0.24 0.49 0.75 0.19 0.48 0.44 0.66 0.63 0.61 0.37 0.47 0.39 0.5 1.0
0.61 0.68 0.81 0.97 1.0 0.74 0.36 0.68 0.56 0.17 0.78 0.54 0.83 0.74 0.76 0.56 0.67 0.62 0.76 0.67
0.22 0.58 0.16 0.18 0.08 0.1 0.08 0.07 1.0 0.39 0.21 0.24 0.63 0.57 0.6 0.41 0.43 0.29 0.57 0.53
0.07 0.16 0.07 0.92 0.59 0.23 0.01 0.02 1.0 0.16 0.32 0.13 0.47 0.31 0.32 0.23 0.22 0.18 0.19 0.39
0.44 0.37 0.52 1.0 0.68 0.49 0.64 0.38 0.04 0.06 0.46 0.25 0.54 0.57 0.4 0.2 0.48 0.4 0.34 0.26
0.19 0.27 0.46 0.9 1.0 0.76 0.48 0.87 0.43 0.29 0.59 0.66 0.7 0.8 0.42 0.28 0.3 0.59 0.31 0.35
0.8 0.39 0.42 0.54 1.0 0.38 0.05 0.38 0.05 0.04 0.44 0.16 0.19 0.28 0.39 0.18 0.37 0.2 0.31 0.9
0.01 0.07 0.01 1.0 0.73 0.52 0.02 0.59 0.0 0.01 0.27 0.08 0.71 0.37 0.29 0.17 0.14 0.19 0.16 0.03
0.57 0.49 0.47 0.62 0.55 0.58 0.22 0.55 1.0 0.9 0.69 0.53 0.42 0.5 0.49 0.43 0.47 0.43 0.43 0.32
0.25 0.42 0.43 1.0 0.6 0.44 0.62 0.46 0.08 0.13 0.4 0.37 0.38 0.46 0.35 0.25 0.38 0.35 0.31 0.56
0.46 0.44 0.22 1.0 0.68 0.34 0.03 0.28 0.22 0.19 0.46 0.37 0.92 0.79 0.77 0.44 0.5 0.5 0.48 0.46
0.53 0.6 0.54 1.0 0.69 0.58 0.58 0.55 0.59 0.18 0.55 0.49 0.68 0.56 0.68 0.32 0.48 0.47 0.51 0.88
0.48 0.31 0.32 1.0 0.5 0.38 0.34 0.37 0.27 0.28 0.36 0.4 0.6 0.49 0.62 0.3 0.39 0.4 0.39 0.44
0.29 0.53 0.43 0.71 0.64 0.43 0.52 0.51 0.63 0.25 0.5 0.35 0.36 0.47 0.48 0.29 0.46 0.34 0.44 1.0
0.39 0.58 0.47 1.0 0.92 0.61 0.3 0.47 0.86 0.6 0.69 0.6 0.8 0.82 0.66 0.69 0.57 0.59 0.56 0.32
0.01 0.08 0.01 1.0 0.42 0.36 0.02 0.46 0.22 0.02 0.24 0.18 0.67 0.29 0.22 0.15 0.13 0.22 0.13 0.05
0.47 0.66 0.35 0.83 0.64 0.26 0.55 0.3 0.64 0.32 0.44 0.5 1.0 0.86 0.95 0.61 0.66 0.5 0.5 0.46
0.32 0.76 0.73 1.0 0.5 0.45 0.9 0.57 0.48 0.45 0.54 0.62 0.71 0.71 0.67 0.51 0.66 0.6 0.67 0.73
0.33 0.39 0.22 1.0 0.58 0.4 0.14 0.42 0.14 0.05 0.42 0.48 0.48 0.51 0.61 0.4 0.49 0.37 0.49 0.59
0.25 0.43 0.38 0.97 1.0 0.55 0.15 0.58 0.07 0.12 0.49 0.25 0.29 0.38 0.36 0.26 0.38 0.3 0.42 0.83
0.42 0.48 0.43 0.78 0.53 0.64 0.2 0.48 0.62 1.0 0.65 0.48 0.52 0.58 0.37 0.49 0.41 0.42 0.54 0.24
0.38 0.12 0.06 0.42 0.65 0.63 0.04 1.0 0.34 0.05 0.34 0.17 0.46 0.36 0.46 0.28 0.25 0.19 0.29 0.33
0.04 0.26 0.15 1.0 0.73 0.45 0.06 0.4 0.31 0.08 0.36 0.28 0.56 0.48 0.45 0.24 0.34 0.27 0.29 0.15
0.39 0.5 0.32 0.95 0.43 0.34 0.58 0.31 0.29 0.17 0.32 0.52 1.0 0.77 0.7 0.54 0.48 0.44 0.43 0.41
0.92 0.34 0.25 0.6 0.84 0.58 0.08 0.78 0.43 0.06 0.51 0.29 0.69 0.69 0.66 0.35 0.47 0.33 0.45 1.0
0.79 0.34 0.84 1.0 0.48 0.61 0.61 0.51 0.03 0.08 0.45 0.42 0.45 0.37 0.33 0.18 0.35 0.33 0.4 0.43
0.09 0.25 0.22 0.54 0.73 0.7 0.44 0.76 0.07 0.04 0.49 1.0 0.86 0.83 0.66 0.52 0.41 0.69 0.52 0.69
0.27 0.36 0.27 0.9 1.0 0.73 0.07 0.75 0.09 0.04 0.49 0.42 0.77 0.77 0.77 0.42 0.37 0.41 0.62 0.74
0.25 0.22 0.2 1.0 0.54 0.4 0.31 0.53 0.05 0.06 0.32 0.49 0.64 0.69 0.56 0.31 0.28 0.35 0.46 0.4
0.04 0.51 0.19 1.0 0.72 0.5 0.09 0.4 0.01 0.01 0.27 0.16 0.28 0.31 0.3 0.19 0.26 0.21 0.24 0.37
0.0 0.97 0.84 1.0 0.77 0.68 0.64 0.66 0.68 0.53 0.62 0.85 0.8 0.78 0.82 0.34 0.81 0.61 0.74 0.25
0.51 0.64 0.72 0.52 0.44 0.52 0.35 0.27 0.19 0.26 0.59 0.61 0.92 1.0 0.61 0.67 0.63 0.57 0.77 0.51
0.98 0.54 0.54 0.59 0.68 0.51 0.32 0.48 0.85 1.0 0.79 0.53 0.58 0.65 0.76 0.52 0.56 0.51 0.58 0.77
0.01 0.3 0.16 0.75 0.64 0.56 0.48 0.56 0.02 0.02 0.4 0.19 0.23 0.39 0.18 0.11 0.27 0.26 0.21 1.0
0.71 0.59 0.6 1.0 0.58 0.46 0.59 0.38 0.5 0.43 0.54 0.56 0.66 0.65 0.8 0.6 0.65 0.56 0.65 0.76
0.48 0.6 0.62 0.32 0.37 0.28 0.38 0.44 0.65 0.29 0.67 0.41 0.58 0.61 0.64 0.33 0.65 0.5 0.62 1.0
0.36 0.58 0.47 0.78 0.58 0.37 0.32 0.37 0.39 0.5 0.53 0.36 0.52 0.51 0.76 0.42 0.57 0.46 0.51 1.0
0.17 1.0 0.89 0.48 0.55 0.61 0.53 0.8 0.02 0.07 0.56 0.25 0.2 0.32 0.22 0.28 0.79 0.39 0.65 0.85
0.45 0.32 0.4 1.0 0.22 0.39 0.11 0.17 0.23 0.05 0.24 0.29 0.78 0.84 0.55 0.35 0.56 0.42 0.54 0.34
0.01 0.2 0.04 1.0 0.66 0.37 0.07 0.68 0.01 0.01 0.24 0.14 0.29 0.25 0.43 0.08 0.23 0.17 0.15 0.27
0.06 0.59 0.28 0.87 1.0 0.7 0.35 0.77 0.13 0.21 0.65 0.42 0.43 0.47 0.63 0.28 0.55 0.41 0.54 0.58
0.1 0.26 0.09 0.75 0.84 0.6 0.11 0.57 0.11 0.07 0.35 0.46 1.0 0.75 0.66 0.33 0.32 0.43 0.35 0.15
0.37 0.72 0.83 1.0 0.81 0.8 0.41 0.59 0.29 0.63 0.82 0.63 0.66 0.76 0.49 0.52 0.66 0.64 0.66 0.34
0.38 0.45 0.41 1.0 0.63 0.52 0.24 0.53 0.11 0.08 0.42 0.23 0.41 0.4 0.38 0.24 0.44 0.33 0.43 0.77
0.35 0.45 0.3 0.44 0.48 0.27 0.09 0.39 0.6 0.17 0.4 0.38 0.48 0.5 0.54 0.34 0.41 0.33 0.5 1.0
0.17 0.28 0.23 0.53 0.42 0.35 0.23 0.35 1.0 0.08 0.3 0.24 0.44 0.47 0.29 0.27 0.3 0.3 0.27 0.15
0.13 0.71 0.21 1.0 0.74 0.65 0.07 0.75 0.28 0.24 0.44 0.44 0.77 0.69 0.68 0.42 0.92 0.48 0.6 0.5
0.25 0.33 0.25 1.0 0.66 0.46 0.17 0.64 0.06 0.04 0.34 0.24 0.48 0.48 0.34 0.25 0.33 0.27 0.35 0.84
0.39 0.6 0.2 0.99 1.0 0.8 0.19 0.92 0.29 0.14 0.55 0.28 0.58 0.63 0.7 0.43 0.81 0.46 0.59 0.5
0.22 0.34 0.42 0.13 0.12 0.1 0.21 0.06 0.35 0.25 0.18 0.21 0.26 0.24 0.36 0.19 0.28 0.2 0.21 1.0
0.17 0.33 0.27 1.0 0.59 0.38 0.57 0.38 0.07 0.06 0.37 0.25 0.45 0.48 0.4 0.2 0.39 0.37 0.37 0.4
0.31 0.88 1.0 0.85 0.62 0.64 0.96 0.58 0.2 0.26 0.59 0.74 0.8 0.78 0.8 0.5 0.82 0.66 0.61 0.7
0.55 0.89 0.78 1.0 0.4 0.53 0.75 0.37 0.21 0.32 0.42 0.56 0.69 0.59 0.79 0.53 0.78 0.57 0.62 1.0
0.2 0.31 0.34 1.0 0.52 0.47 0.66 0.4 0.03 0.09 0.37 0.3 0.44 0.48 0.4 0.23 0.28 0.36 0.36 0.34
0.64 0.7 0.54 0.61 1.0 0.66 0.14 0.72 0.75 0.26 0.89 0.61 0.86 0.81 0.98 0.64 0.78 0.63 0.75 0.98
0.19 0.24 0.29 0.55 0.59 0.34 0.25 0.35 0.05 0.08 0.35 0.18 0.2 0.2 0.19 0.13 0.17 0.17 0.17 1.0
0.01 0.15 0.13 0.3 1.0 0.11 0.05 0.08 0.01 0.01 0.38 0.11 0.42 0.44 0.26 0.09 0.22 0.3 0.1 0.11
0.42 0.74 0.65 0.86 0.37 0.5 1.0 0.42 0.55 0.35 0.4 0.59 0.61 0.6 0.6 0.46 0.53 0.55 0.58 0.91
0.5 0.5 0.36 1.0 0.75 0.68 0.2 0.71 0.64 0.17 0.5 0.32 0.79 0.73 0.61 0.43 0.56 0.39 0.48 0.62
0.29 0.55 0.45 0.71 0.47 0.56 0.6 0.71 0.47 0.34 0.4 0.46 0.42 0.44 0.41 0.33 0.5 0.41 0.45 1.0
0.29 0.79 0.63 1.0 0.57 0.6 0.68 0.45 0.12 0.09 0.4 0.64 0.56 0.7 0.54 0.53 0.62 0.58 0.67 0.55
0.12 1.0 0.74 0.97 0.88 0.58 0.95 0.34 0.17 0.02 0.59 0.32 0.51 0.57 0.4 0.61 0.65 0.46 0.59 0.97
0.39 0.45 0.32 1.0 0.43 0.47 0.34 0.43 0.27 0.39 0.42 0.56 0.97 0.88 0.75 0.44 0.47 0.52 0.5 0.6
0.29 0.25 0.19 0.81 1.0 0.55 0.04 0.58 0.33 0.13 0.58 0.3 0.71 0.56 0.55 0.39 0.3 0.32 0.35 0.8
0.68 0.85 0.48 0.87 0.74 0.6 0.68 0.72 1.0 0.29 0.73 0.66 0.96 1.0 0.72 0.68 0.79 0.65 0.71 0.74
0.01 0.74 0.2 0.63 1.0 0.66 0.08 0.67 0.01 0.04 0.54 0.14 0.17 0.23 0.42 0.23 0.61 0.28 0.48 0.33
0.32 0.46 0.36 1.0 0.79 0.58 0.61 0.45 0.65 0.16 0.6 0.71 0.8 0.82 0.82 0.37 0.71 0.69 0.63 0.76
0.25 0.39 0.27 0.87 1.0 0.38 0.08 0.49 0.18 0.06 0.48 0.41 0.93 0.63 0.76 0.47 0.41 0.4 0.37 0.58
0.2 0.57 0.57 1.0 0.5 0.74 0.48 0.7 0.11 0.14 0.46 0.27 0.34 0.45 0.32 0.31 0.56 0.38 0.51 0.59
0.28 0.44 0.4 1.0 0.65 0.6 0.34 0.54 0.53 0.33 0.58 0.42 0.55 0.59 0.37 0.48 0.44 0.42 0.43 0.4
0.07 0.53 0.48 0.69 0.54 0.47 0.5 0.51 0.09 0.08 0.35 0.26 0.25 0.42 0.27 0.11 0.4 0.28 0.27 1.0
0.36 0.54 0.55 1.0 0.74 0.85 0.5 0.87 0.46 0.29 0.57 0.55 0.54 0.51 0.56 0.39 0.56 0.48 0.55 0.39
0.28 0.42 0.36 1.0 0.49 0.21 0.54 0.28 0.46 0.13 0.32 0.36 0.47 0.5 0.37 0.46 0.35 0.38 0.35 0.32
0.27 0.26 0.35 1.0 0.55 0.47 0.33 0.57 0.04 0.04 0.31 0.15 0.32 0.37 0.24 0.12 0.26 0.21 0.28 0.59
0.14 0.34 0.17 0.93 0.9 1.0 0.04 0.94 0.08 0.07 0.49 0.47 0.68 0.57 0.51 0.65 0.39 0.47 0.48 0.34
0.38 0.53 0.52 1.0 0.96 0.53 0.63 0.6 0.13 0.05 0.5 0.24 0.29 0.32 0.42 0.26 0.46 0.26 0.34 0.76
0.02 0.11 0.0 0.98 0.71 1.0 0.13 0.73 0.01 0.04 0.45 0.36 0.51 0.68 0.28 0.2 0.35 0.47 0.28 0.03
0.51 0.54 0.57 0.44 0.31 0.3 0.2 0.18 0.6 0.66 0.51 0.37 0.45 0.4 0.66 0.32 0.47 0.36 0.38 1.0
0.17 0.45 0.38 0.95 0.58 1.0 0.43 0.91 0.29 0.42 0.5 0.31 0.39 0.41 0.48 0.31 0.51 0.39 0.56 0.38
0.16 0.74 0.36 0.93 1.0 0.85 0.52 0.74 0.27 0.25 0.62 0.73 0.62 0.6 0.67 0.46 0.69 0.52 0.66 0.42
0.21 0.48 0.45 1.0 0.63 0.35 0.58 0.44 0.18 0.1 0.43 0.34 0.53 0.59 0.58 0.33 0.52 0.42 0.48 0.4
0.23 0.76 0.47 0.99 0.68 0.41 0.8 0.3 0.21 0.21 0.41 0.47 0.58 0.61 0.67 0.45 0.66 0.48 0.55 1.0
0.4 0.55 0.48 1.0 0.79 0.73 0.23 0.77 0.19 0.05 0.61 0.5 0.81 0.81 0.75 0.49 0.63 0.54 0.64 0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)