1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.29 0.96 0.45 0.87 0.71 0.48 0.51 0.45 0.2 0.16 0.45 0.54 0.52 0.49 0.73 0.41 0.85 1.0 0.44 0.41
0.47 0.44 0.38 0.28 0.16 0.15 0.5 0.12 1.0 0.87 0.44 0.16 0.26 0.34 0.3 0.22 0.38 0.76 0.4 0.2
0.48 0.72 0.68 0.69 0.82 0.22 0.63 0.47 0.81 0.74 0.69 0.33 0.37 0.42 0.56 0.37 0.58 1.0 0.58 0.31
0.85 0.86 0.52 0.46 0.34 0.34 0.44 0.39 0.55 0.61 0.53 0.31 0.48 0.37 0.83 0.34 0.76 1.0 0.53 0.71
0.6 0.56 0.48 0.16 0.11 0.09 0.44 0.12 0.48 0.55 0.29 0.56 0.46 0.42 0.55 0.42 0.52 0.68 0.26 1.0
0.1 0.84 0.25 0.64 0.4 0.43 0.21 0.48 0.13 0.07 0.26 0.46 0.98 0.6 0.58 0.52 0.74 1.0 0.36 0.44
0.86 0.9 0.65 0.37 0.52 0.52 0.73 0.54 0.48 0.26 0.61 0.52 0.27 0.32 0.59 0.41 1.0 0.89 0.47 0.53
0.46 0.43 0.27 0.58 0.36 0.41 0.51 0.38 0.77 1.0 0.54 0.34 0.44 0.56 0.29 0.4 0.39 0.71 0.41 0.4
0.18 0.73 0.36 0.48 0.53 0.61 0.41 0.75 0.26 0.15 0.56 0.36 0.31 0.31 0.4 0.47 0.96 1.0 0.4 0.19
0.64 1.0 0.7 0.61 0.41 0.31 0.75 0.23 0.91 0.57 0.45 0.62 0.6 0.62 0.74 0.47 0.86 0.89 0.42 0.4
0.39 0.94 0.55 0.92 0.9 0.85 0.62 0.93 0.93 0.5 0.81 0.54 0.58 0.6 0.67 0.6 0.88 1.0 0.38 0.75
0.28 0.81 0.47 0.81 0.83 0.66 0.86 0.92 0.51 0.18 0.58 0.57 0.59 0.54 0.65 0.57 0.95 1.0 0.43 0.58
0.21 0.74 0.3 0.97 0.83 0.5 0.27 0.67 0.16 0.2 0.53 0.57 0.53 0.4 0.87 0.49 0.72 1.0 0.36 0.59
0.1 0.22 0.14 0.11 0.09 0.06 0.2 0.06 1.0 0.56 0.21 0.11 0.09 0.11 0.11 0.12 0.14 0.18 0.08 0.11
0.41 0.76 0.58 0.76 0.56 0.58 0.9 0.54 0.36 0.31 0.52 0.58 0.53 0.58 0.51 0.5 0.82 1.0 0.45 0.8
0.58 0.63 0.56 1.0 0.78 0.72 0.63 0.75 0.49 0.34 0.62 0.4 0.54 0.52 0.51 0.37 0.61 0.82 0.36 0.97
0.19 0.78 0.6 0.21 0.12 0.19 1.0 0.09 0.66 0.57 0.37 0.87 0.5 0.59 0.42 0.52 0.67 0.91 0.35 0.41
0.54 0.79 0.59 0.8 0.57 0.51 1.0 0.45 0.3 0.18 0.48 0.63 0.55 0.48 0.47 0.4 0.85 0.9 0.39 0.76
0.55 0.87 0.63 0.33 0.27 0.29 0.49 0.29 0.43 0.47 0.59 0.45 0.31 0.34 0.47 0.51 0.86 1.0 0.42 0.37
0.56 0.98 0.64 0.79 0.54 0.56 0.41 0.39 0.86 0.31 0.45 0.36 0.46 0.52 0.55 0.4 0.78 1.0 0.43 0.76
0.51 0.86 0.97 0.38 0.12 0.27 1.0 0.19 0.59 0.45 0.38 0.76 0.35 0.49 0.57 0.53 0.69 0.82 0.55 0.98
0.24 0.58 0.63 0.15 0.13 0.15 0.52 0.14 0.55 1.0 0.45 0.44 0.23 0.28 0.34 0.24 0.53 0.65 0.36 0.09
0.05 0.64 0.64 0.71 0.5 0.55 0.27 0.44 0.32 0.39 0.42 0.54 0.34 0.45 0.23 0.41 0.7 1.0 0.52 0.09
0.33 0.55 0.54 0.17 0.13 0.25 1.0 0.15 0.97 0.92 0.42 0.4 0.26 0.33 0.32 0.29 0.47 0.6 0.38 0.39
0.0 0.69 1.0 0.71 0.28 0.11 0.61 0.09 0.23 0.62 0.53 0.27 0.18 0.4 0.32 0.36 0.66 0.82 0.44 0.0
0.51 1.0 0.78 0.36 0.37 0.37 0.81 0.59 0.93 0.42 0.53 0.7 0.44 0.45 0.64 0.42 0.95 1.0 0.52 0.81
0.31 0.89 0.53 0.76 0.53 0.4 0.59 0.47 0.52 0.35 0.48 0.42 0.45 0.57 0.52 0.47 0.78 1.0 0.39 0.47
0.36 0.61 0.46 0.37 0.34 0.29 0.7 0.2 0.39 0.22 0.33 0.44 0.44 0.39 0.56 0.39 0.56 0.68 0.35 1.0
0.12 0.34 0.4 0.14 0.12 0.16 0.19 0.14 0.44 1.0 0.41 0.22 0.12 0.17 0.16 0.15 0.32 0.38 0.19 0.07
0.64 1.0 0.7 0.61 0.41 0.31 0.75 0.23 0.91 0.57 0.45 0.62 0.6 0.62 0.74 0.47 0.86 0.89 0.42 0.4
0.44 0.86 0.66 0.74 0.64 0.74 0.88 0.8 0.75 0.28 0.59 0.7 0.78 0.76 0.55 0.55 0.88 1.0 0.4 0.55
0.19 0.84 0.51 0.71 0.55 0.47 1.0 0.41 0.23 0.24 0.44 0.53 0.38 0.5 0.37 0.42 0.85 0.96 0.39 0.39
0.64 0.56 0.58 0.12 0.1 0.2 1.0 0.33 0.22 0.16 0.28 0.53 0.3 0.38 0.63 0.42 0.72 0.96 0.45 0.25
0.18 0.61 0.28 0.55 0.38 0.29 0.39 0.23 0.25 0.56 0.47 0.34 0.25 0.33 0.32 0.36 0.6 1.0 0.44 0.16
0.37 0.94 0.94 0.18 0.09 0.26 0.39 0.15 0.28 0.31 0.26 0.42 0.27 0.33 0.3 0.34 0.93 1.0 0.44 0.03
0.29 1.0 0.54 0.32 0.18 0.2 0.79 0.14 0.11 0.17 0.26 0.41 0.26 0.39 0.48 0.39 0.74 0.92 0.55 0.33
0.92 0.73 1.0 0.26 0.28 0.34 0.82 0.35 0.16 0.2 0.47 0.78 0.25 0.3 0.29 0.34 0.71 0.77 0.39 0.52
0.51 0.87 0.6 0.58 0.53 0.47 0.88 0.33 0.51 0.17 0.45 0.49 0.65 0.62 0.55 0.49 0.82 0.74 0.3 1.0
0.37 0.83 0.94 0.06 0.01 0.09 1.0 0.06 0.34 0.57 0.31 0.43 0.25 0.39 0.47 0.3 0.89 1.0 0.5 0.75
0.27 0.69 0.37 0.52 0.48 0.35 0.51 0.42 0.23 0.12 0.38 0.66 0.47 0.38 0.51 0.45 0.93 1.0 0.45 0.31
0.22 0.6 0.46 1.0 0.5 0.4 0.26 0.38 0.26 0.16 0.39 0.42 0.32 0.39 0.33 0.39 0.59 0.8 0.36 0.56
0.44 0.74 0.48 0.32 0.35 0.32 0.86 0.54 1.0 0.63 0.55 0.51 0.41 0.54 0.8 0.43 0.83 0.92 0.55 0.78
0.44 0.62 0.64 0.13 0.13 0.12 0.32 0.07 0.95 1.0 0.43 0.36 0.24 0.28 0.33 0.28 0.59 0.51 0.33 0.13
0.24 0.72 1.0 0.36 0.22 0.3 0.84 0.17 0.29 0.71 0.49 0.65 0.38 0.35 0.51 0.4 0.61 0.9 0.46 0.8
0.3 0.45 0.48 0.14 0.09 0.17 0.4 0.14 0.75 1.0 0.41 0.43 0.22 0.31 0.27 0.27 0.49 0.63 0.34 0.12
0.61 1.0 0.82 0.59 0.56 0.43 0.69 0.33 0.58 0.29 0.68 0.69 0.43 0.49 0.5 0.58 0.94 0.97 0.48 0.52
0.27 0.76 0.71 0.21 0.15 0.19 1.0 0.17 0.69 0.53 0.35 0.83 0.4 0.35 0.53 0.38 0.66 0.7 0.37 0.5
0.72 0.78 0.7 0.36 0.37 0.44 0.31 0.51 1.0 0.5 0.53 0.64 0.41 0.44 0.49 0.42 0.82 0.76 0.52 0.3
0.77 0.83 0.73 0.4 0.33 0.43 1.0 0.49 0.38 0.14 0.45 0.39 0.36 0.36 0.51 0.46 0.96 0.91 0.35 0.65
0.14 0.48 0.21 0.3 0.32 0.31 0.26 0.23 0.25 0.12 0.33 0.32 0.41 0.32 0.65 0.34 0.64 1.0 0.36 0.12
0.29 0.9 0.59 0.86 1.0 0.66 0.4 0.69 0.5 0.3 0.72 0.49 0.67 0.66 0.52 0.49 0.83 0.97 0.36 0.79
0.31 0.48 0.52 0.24 0.21 0.24 0.56 0.37 0.74 1.0 0.53 0.4 0.25 0.27 0.28 0.39 0.43 0.55 0.29 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)