Heatmap: Cluster_108 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.24 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.0 0.1 0.15 0.0
0.52 0.62 0.4 0.78 0.69 0.39 0.35 0.19 1.0 0.33 0.49 0.24 0.62 0.61 0.33 0.64 0.44 0.33 0.39 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.38 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.2 0.14 0.0
0.18 0.18 0.13 0.07 0.02 0.15 0.0 0.06 1.0 0.04 0.06 0.02 0.2 0.34 0.0 0.27 0.12 0.16 0.19 0.0
0.22 0.39 0.3 0.26 0.26 0.26 0.34 0.37 1.0 0.41 0.34 0.21 0.42 0.63 0.2 0.44 0.34 0.31 0.31 0.48
0.0 0.21 0.75 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.03 1.0 0.43 0.08 0.14 0.18 0.0 0.25 0.02 0.24 0.28 0.0
0.0 0.09 0.01 0.03 0.05 0.02 0.01 0.02 1.0 0.05 0.03 0.03 0.15 0.22 0.06 0.13 0.12 0.12 0.14 0.07
0.16 0.64 0.89 1.0 0.46 0.82 0.01 0.47 0.93 0.17 0.57 0.06 0.62 0.66 0.09 0.9 0.29 0.2 0.32 0.67
0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.06 0.02 0.18 0.0 0.06 0.03 0.09 0.11 0.33
0.0 0.14 0.04 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 1.0 0.16 0.07 0.02 0.14 0.26 0.0 0.03 0.06 0.07 0.03 0.06
0.25 0.61 0.4 0.2 0.43 0.07 0.0 0.12 0.2 0.24 0.39 0.0 0.09 0.14 0.0 0.36 0.28 0.2 0.3 1.0
0.15 0.64 0.52 0.87 1.0 0.31 0.12 0.42 0.35 0.05 0.5 0.21 0.44 0.69 0.24 0.82 0.28 0.36 0.42 0.29
0.52 0.53 0.31 0.3 0.13 0.27 0.0 0.0 1.0 0.34 0.31 0.25 0.18 0.67 0.0 0.15 0.24 0.26 0.23 0.0
0.37 0.43 0.28 0.29 0.19 0.24 0.0 0.18 0.69 0.1 0.3 0.1 0.4 1.0 0.01 0.62 0.21 0.41 0.3 0.19
0.41 0.08 0.06 0.05 0.02 0.04 0.0 0.38 1.0 0.16 0.08 0.0 0.16 0.48 0.0 0.74 0.06 0.23 0.31 0.28
0.79 0.77 0.85 0.92 0.56 0.51 0.84 0.48 1.0 0.69 0.6 0.97 0.69 0.71 0.72 0.53 0.77 0.73 0.62 0.78
0.0 0.15 0.0 0.96 0.83 1.0 0.02 0.0 0.89 0.03 0.57 0.12 0.19 0.5 0.04 0.07 0.27 0.34 0.18 0.35
0.38 0.51 0.53 0.49 0.3 0.29 0.0 0.24 0.87 0.28 0.36 0.3 0.58 0.82 0.0 1.0 0.32 0.49 0.37 0.85
0.0 0.67 0.18 0.33 0.46 0.0 0.16 0.0 0.35 0.52 0.26 0.48 0.63 0.2 0.33 0.51 0.33 0.52 0.99 1.0
0.18 1.0 0.88 0.61 0.36 0.44 0.56 0.17 0.65 0.3 0.42 0.54 0.56 0.8 0.37 0.67 0.63 0.52 0.43 0.21
0.0 0.6 0.0 0.0 0.1 0.14 0.04 0.4 0.0 0.6 0.13 0.0 0.33 0.11 0.0 0.62 1.0 0.25 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.96 0.0
0.09 0.14 0.11 0.06 0.04 0.05 0.01 0.05 1.0 0.04 0.07 0.02 0.16 0.24 0.01 0.14 0.07 0.11 0.07 0.43
0.36 0.4 0.28 0.82 0.66 0.33 0.24 0.36 0.9 0.56 0.5 0.32 0.45 0.59 0.45 0.23 0.39 0.33 0.35 1.0
0.47 0.73 0.55 1.0 0.8 0.64 0.39 0.49 0.11 0.24 0.53 0.46 0.79 0.89 0.45 0.46 0.45 0.55 0.42 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.74 0.31 0.0 0.33 0.39 0.84 0.0 0.32 0.46 0.33 0.0
0.01 0.13 0.11 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 1.0 0.11 0.05 0.08 0.18 0.26 0.06 0.12 0.07 0.09 0.09 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.25 0.06 0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.18 0.0
0.42 0.64 0.64 0.61 0.44 0.37 0.13 0.3 0.32 0.24 0.44 0.19 0.37 0.48 0.23 0.14 0.34 0.42 0.24 1.0
0.0 0.04 0.2 0.06 0.03 0.09 0.0 0.0 0.72 1.0 0.31 0.0 0.45 0.77 0.0 0.13 0.36 0.22 0.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.37 0.0
0.27 0.59 0.55 0.59 0.38 0.57 0.01 0.85 0.46 0.05 0.42 0.0 0.28 0.28 0.0 1.0 0.19 0.12 0.36 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.32 0.46 0.0 1.0 0.0 0.1 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.38 0.06 0.02 0.01 0.06 0.1 0.09 0.06 0.41 0.01 0.11 1.0 0.0
0.14 0.74 0.84 0.71 0.52 0.93 0.01 1.0 0.04 0.15 0.48 0.54 0.27 0.37 0.17 0.51 0.85 0.36 0.29 0.49
0.25 0.66 0.63 0.63 0.55 0.35 0.2 0.37 0.64 0.28 0.48 0.49 0.46 0.59 0.42 0.48 0.53 0.48 0.35 1.0
0.03 0.53 0.3 0.63 0.37 0.68 0.86 0.21 0.51 0.29 0.45 0.48 0.75 1.0 0.35 0.5 0.47 0.58 0.52 0.24
0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 1.0 0.05 0.03 0.06 0.04 0.06 0.01 0.09 0.03 0.06 0.02 0.21
0.06 0.28 0.27 0.23 0.22 0.76 0.02 1.0 0.06 0.01 0.24 0.35 0.21 0.25 0.2 0.29 0.28 0.25 0.23 0.08
0.22 0.56 0.42 0.23 0.25 0.13 0.28 0.12 0.2 0.11 0.29 0.18 0.4 0.43 0.21 0.33 0.33 0.25 0.24 1.0
0.07 0.09 0.11 0.2 0.1 0.02 0.12 0.05 1.0 0.2 0.11 0.11 0.09 0.15 0.1 0.14 0.09 0.11 0.07 0.05
0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.07 0.04 0.02 0.0 0.19 0.02 0.07 0.04 0.06 0.33 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.4 0.0 0.34 0.33 0.17 0.66 0.1 0.36 0.32 0.0
0.39 0.93 0.91 0.59 0.61 0.24 0.86 0.17 0.81 0.76 0.67 0.55 0.55 0.67 0.65 0.6 0.72 0.63 0.48 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.11 0.16 0.11 1.0
0.0 0.51 0.1 1.0 0.33 0.35 0.16 0.23 0.06 0.08 0.23 0.44 0.46 0.63 0.51 0.55 0.7 0.78 0.93 0.42
0.42 0.99 0.91 0.76 0.65 0.44 0.34 0.25 0.19 0.23 0.49 0.48 0.54 0.74 0.45 0.33 0.87 0.59 0.5 1.0
0.21 0.52 0.33 0.63 0.49 0.22 0.1 0.16 1.0 0.28 0.39 0.38 0.57 0.5 0.4 0.22 0.41 0.28 0.25 0.51
0.49 1.0 0.93 0.23 0.23 0.27 0.72 0.04 0.53 0.3 0.61 0.45 0.81 0.81 0.58 0.88 0.72 0.59 0.62 0.63
0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.28 1.0 0.5 0.08 0.35 0.14 0.24 0.23 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.22 0.18 0.01 0.0 0.07 1.0 0.0 0.67 0.03 0.3 0.19 0.0
0.44 0.76 0.63 1.0 0.51 0.35 0.48 0.29 0.13 0.27 0.38 0.58 0.62 0.75 0.48 0.52 0.59 0.59 0.47 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.15 1.0 0.27 0.02 0.03 0.06 0.45 0.79 0.19 0.41 0.06 0.34 0.44 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)