Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.33 0.46 0.49 0.19 0.21 0.28 1.0 0.46 0.35 0.23 0.31 0.25 0.4 0.34 0.37 0.32 0.41 0.4 0.25 0.43
0.58 0.56 0.5 0.29 0.28 0.18 1.0 0.18 0.53 0.32 0.37 0.35 0.27 0.29 0.47 0.33 0.54 0.56 0.35 0.52
0.42 0.6 0.65 0.36 0.23 0.25 1.0 0.22 0.22 0.18 0.34 0.43 0.26 0.29 0.36 0.31 0.55 0.48 0.27 0.81
0.69 0.81 1.0 0.22 0.13 0.2 0.75 0.15 0.47 0.97 0.55 0.43 0.34 0.34 0.58 0.32 0.64 0.61 0.45 0.85
0.85 0.93 1.0 0.32 0.3 0.35 0.89 0.27 0.37 0.51 0.57 0.68 0.35 0.43 0.55 0.46 0.79 0.7 0.51 0.76
0.42 0.57 0.54 0.19 0.18 0.19 1.0 0.13 0.23 0.2 0.29 0.32 0.19 0.23 0.28 0.24 0.5 0.35 0.23 0.48
0.22 0.61 0.53 0.48 0.25 0.2 0.62 0.2 0.58 0.55 0.36 0.4 0.24 0.27 0.47 0.28 0.49 0.47 0.28 1.0
0.71 0.84 0.89 0.45 0.45 0.33 1.0 0.31 0.55 0.75 0.61 0.48 0.35 0.41 0.56 0.4 0.68 0.69 0.46 0.95
0.53 0.65 0.91 0.21 0.16 0.18 0.9 0.17 0.96 1.0 0.48 0.46 0.26 0.25 0.49 0.28 0.62 0.64 0.31 0.64
0.24 0.7 0.69 0.61 0.27 0.39 1.0 0.3 0.66 0.91 0.52 0.44 0.16 0.26 0.33 0.34 0.63 0.59 0.4 0.4
0.28 0.64 0.44 0.65 0.59 0.42 1.0 0.66 0.49 0.12 0.56 0.52 0.45 0.46 0.55 0.41 0.61 0.53 0.32 0.75
0.19 0.41 0.4 0.07 0.07 0.1 1.0 0.21 0.48 0.36 0.24 0.34 0.26 0.19 0.35 0.15 0.42 0.42 0.23 0.51
0.24 0.77 0.64 0.72 0.79 0.64 1.0 0.75 0.55 0.18 0.64 0.4 0.36 0.41 0.43 0.42 0.74 0.57 0.4 0.83
0.5 0.6 0.54 0.44 0.49 0.59 0.82 0.67 0.59 0.13 0.48 0.42 0.37 0.32 0.48 0.39 0.59 0.49 0.29 1.0
0.35 0.85 0.85 0.47 0.35 0.29 1.0 0.25 0.9 0.74 0.58 0.5 0.26 0.36 0.36 0.38 0.66 0.67 0.36 0.57
0.42 0.63 0.64 0.17 0.17 0.2 1.0 0.15 0.33 0.29 0.33 0.53 0.2 0.23 0.33 0.28 0.57 0.57 0.34 0.45
0.61 0.73 0.96 0.13 0.11 0.19 1.0 0.22 0.54 0.6 0.45 0.54 0.32 0.35 0.62 0.34 0.66 0.84 0.36 0.68
0.81 0.86 1.0 0.28 0.15 0.22 0.98 0.16 0.23 0.42 0.39 0.77 0.3 0.35 0.53 0.38 0.82 0.81 0.52 0.83
0.59 0.67 0.72 0.42 0.31 0.34 1.0 0.41 0.29 0.22 0.41 0.3 0.25 0.24 0.44 0.3 0.6 0.51 0.28 0.55
0.82 0.58 0.78 0.24 0.17 0.21 1.0 0.19 0.22 0.22 0.3 0.33 0.32 0.35 0.39 0.27 0.58 0.45 0.26 0.79
0.42 0.74 0.49 0.62 0.62 0.36 0.97 0.68 0.83 0.31 0.65 0.6 0.55 0.57 0.83 0.6 0.79 0.68 0.45 1.0
0.26 1.0 0.59 0.29 0.17 0.22 0.75 0.16 0.24 0.46 0.32 0.47 0.27 0.4 0.3 0.42 0.81 0.77 0.47 0.23
0.55 0.91 0.82 0.52 0.34 0.24 0.89 0.18 0.91 0.82 0.54 0.63 0.65 0.57 0.73 0.55 0.78 0.79 0.53 1.0
0.35 0.88 0.72 0.16 0.11 0.2 1.0 0.2 0.18 0.13 0.25 0.45 0.19 0.25 0.32 0.38 0.7 0.5 0.32 0.39
0.3 0.75 0.77 0.42 0.29 0.29 0.87 0.2 0.55 1.0 0.53 0.44 0.27 0.34 0.45 0.39 0.59 0.67 0.44 0.27
0.65 0.75 0.88 0.22 0.2 0.18 1.0 0.13 0.17 0.1 0.3 0.46 0.22 0.2 0.42 0.28 0.57 0.46 0.22 0.45
0.72 0.94 0.79 0.38 0.26 0.27 1.0 0.3 0.95 0.88 0.46 0.6 0.33 0.41 0.6 0.39 0.87 0.87 0.58 0.49
0.4 1.0 0.81 0.84 0.88 0.56 0.85 0.34 0.74 0.54 0.83 0.71 0.32 0.4 0.5 0.58 0.86 0.93 0.63 0.61
0.56 0.69 0.69 0.25 0.21 0.19 1.0 0.18 0.49 0.39 0.39 0.46 0.34 0.34 0.37 0.34 0.54 0.5 0.29 0.79
0.64 0.86 1.0 0.24 0.13 0.24 0.94 0.18 0.57 0.59 0.42 0.74 0.35 0.37 0.59 0.42 0.84 0.89 0.53 0.45
0.26 0.62 0.65 0.38 0.34 0.29 0.82 0.24 0.73 1.0 0.57 0.59 0.38 0.41 0.47 0.43 0.66 0.56 0.38 0.6
0.56 0.81 1.0 0.42 0.27 0.53 0.62 0.26 0.89 0.96 0.55 0.46 0.31 0.33 0.43 0.28 0.64 0.61 0.4 0.73
0.46 0.72 0.56 0.47 0.46 0.39 1.0 0.7 0.96 0.32 0.51 0.33 0.3 0.32 0.45 0.42 0.58 0.49 0.35 0.6
0.36 0.86 1.0 0.39 0.28 0.27 0.87 0.13 0.19 0.52 0.46 0.44 0.23 0.29 0.38 0.3 0.58 0.61 0.38 0.48
0.47 0.61 0.56 0.55 0.61 0.46 1.0 0.55 0.46 0.25 0.52 0.38 0.4 0.4 0.41 0.42 0.55 0.52 0.37 0.52
0.25 0.58 0.53 0.17 0.16 0.15 1.0 0.23 0.38 0.21 0.31 0.41 0.23 0.24 0.39 0.33 0.46 0.4 0.22 0.45
0.43 0.69 0.91 0.25 0.18 0.16 1.0 0.11 0.37 0.56 0.44 0.67 0.39 0.36 0.45 0.38 0.7 0.66 0.36 0.66
0.42 0.63 0.68 0.34 0.16 0.27 1.0 0.2 0.23 0.21 0.28 0.43 0.29 0.26 0.35 0.31 0.55 0.47 0.32 0.42
0.68 0.69 0.81 0.37 0.25 0.33 0.81 0.28 0.65 0.94 0.53 0.5 0.29 0.35 0.58 0.33 0.63 0.57 0.49 1.0
0.29 0.43 0.45 0.17 0.17 0.21 1.0 0.27 0.31 0.25 0.31 0.19 0.21 0.21 0.35 0.21 0.41 0.43 0.24 0.41
0.56 0.72 0.73 0.22 0.11 0.14 0.88 0.08 0.36 0.48 0.37 0.47 0.25 0.31 0.56 0.29 0.59 0.62 0.33 1.0
0.45 0.9 0.97 0.46 0.22 0.28 1.0 0.18 0.09 0.15 0.3 0.69 0.48 0.48 0.49 0.42 0.78 0.65 0.44 0.8
0.34 0.6 0.68 0.32 0.19 0.16 1.0 0.13 0.29 0.24 0.29 0.7 0.24 0.26 0.39 0.41 0.57 0.66 0.49 0.9
0.44 0.78 0.98 0.3 0.19 0.2 0.99 0.27 0.25 0.19 0.46 0.49 0.3 0.3 0.37 0.51 0.64 1.0 0.58 0.46
0.4 0.76 1.0 0.3 0.21 0.26 0.94 0.17 0.2 0.38 0.42 0.63 0.28 0.35 0.41 0.3 0.65 0.67 0.4 0.52
0.35 0.52 0.46 0.35 0.35 0.28 1.0 0.42 0.45 0.23 0.42 0.4 0.34 0.3 0.43 0.4 0.5 0.47 0.28 0.6
0.46 0.84 0.86 0.27 0.22 0.19 1.0 0.14 0.34 0.53 0.41 0.71 0.39 0.42 0.57 0.5 0.77 0.84 0.6 0.53
0.21 0.82 0.72 0.53 0.41 0.22 1.0 0.27 0.67 0.82 0.57 0.53 0.28 0.3 0.43 0.45 0.64 0.74 0.48 0.34
0.11 0.84 0.7 0.28 0.2 0.24 1.0 0.33 0.3 0.52 0.41 0.81 0.33 0.48 0.61 0.52 0.95 0.98 0.6 0.26
0.22 0.62 0.58 0.3 0.29 0.32 0.8 0.21 0.53 0.39 0.46 0.34 0.34 0.37 0.48 0.24 0.56 0.55 0.34 1.0
0.45 0.79 0.77 0.21 0.26 0.33 0.91 0.21 1.0 0.66 0.5 0.56 0.34 0.34 0.58 0.37 0.81 0.61 0.35 0.91
0.45 0.69 1.0 0.42 0.2 0.43 0.86 0.19 0.28 0.85 0.54 0.64 0.26 0.27 0.45 0.35 0.65 0.91 0.54 0.37
0.56 0.54 0.55 0.23 0.24 0.31 1.0 0.37 0.45 0.2 0.41 0.43 0.35 0.37 0.53 0.33 0.59 0.6 0.34 0.86
0.94 0.77 0.74 0.26 0.22 0.22 0.66 0.22 0.62 0.69 0.5 0.63 0.53 0.44 1.0 0.42 0.75 0.83 0.5 0.6
0.97 0.8 0.67 0.66 0.31 0.24 0.84 0.21 0.46 0.6 0.54 0.71 0.39 0.42 0.53 0.37 0.9 1.0 0.52 0.66
0.47 0.97 0.9 0.43 0.26 0.22 0.75 0.21 0.63 0.78 0.57 0.63 0.54 0.57 0.95 0.49 0.82 0.84 0.49 1.0
0.6 0.9 0.96 0.18 0.09 0.2 0.9 0.12 0.5 0.82 0.41 0.41 0.38 0.37 0.61 0.4 0.71 0.66 0.48 1.0
0.65 0.68 0.74 0.23 0.19 0.26 0.71 0.25 0.81 1.0 0.6 0.59 0.29 0.33 0.43 0.34 0.74 0.65 0.38 0.84
0.33 0.68 0.59 0.15 0.06 0.12 0.68 0.05 0.42 0.27 0.2 0.36 0.18 0.24 0.33 0.26 0.58 0.44 0.33 1.0
0.95 0.83 0.97 0.59 0.26 0.27 1.0 0.16 0.19 0.16 0.38 0.59 0.38 0.45 0.47 0.42 0.8 0.67 0.52 0.57
0.21 1.0 0.58 0.4 0.21 0.23 0.6 0.16 0.41 0.36 0.33 0.37 0.33 0.43 0.41 0.34 0.73 0.53 0.35 0.37
0.55 0.84 0.64 0.51 0.29 0.25 1.0 0.24 0.85 0.65 0.45 0.6 0.53 0.47 0.91 0.45 0.72 0.76 0.52 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)