Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.05 0.06 0.01 0.0 0.04 0.21 0.03 1.0 0.15 0.22 0.06 0.12 0.12 0.12 0.07 0.07 0.11 0.06 0.11
0.0 0.08 0.0 0.0 0.17 0.47 1.0 0.0 0.0 0.46 0.7 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.48 0.13 0.0
0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.14 0.44 0.0 0.31 0.16 1.0 0.0 0.09 0.1 0.02 0.0 0.03 0.25 0.12 0.39
0.0 0.81 0.5 0.05 0.02 0.15 0.02 0.09 0.04 0.01 0.18 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0 0.33 0.1 0.06 1.0
0.09 0.71 0.22 0.72 0.95 0.64 0.42 0.39 1.0 0.39 0.54 0.24 0.37 0.33 0.2 0.26 0.51 0.28 0.14 0.88
0.0 1.0 0.41 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.71 0.91 0.33 0.0 0.51 0.32 0.0 0.02 0.61 0.25 0.22 0.56
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.27 0.0 0.78 0.0 0.18 0.1 0.2 0.12 0.0 0.2 0.1 1.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.48 0.62 1.0 0.2 0.26 0.29 0.53 0.4 0.08 0.58 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.31 0.63 0.0 0.05 0.15 0.0 0.0 0.07 0.19 0.1 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.81 0.55 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.02 0.19 0.05 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.11 0.68 0.0 0.14 0.55 1.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.0 0.06 0.4 0.24 0.0
0.0 0.19 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.14 1.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.1 0.14 0.78 0.37 0.0
0.0 0.02 0.06 0.01 0.01 0.07 0.51 0.22 0.08 0.17 1.0 0.13 0.09 0.05 0.05 0.02 0.03 0.25 0.24 0.0
0.0 0.16 0.0 0.14 0.05 0.1 0.47 0.05 1.0 0.53 0.54 0.18 0.15 0.16 0.13 0.06 0.21 0.26 0.21 0.0
0.0 0.03 0.24 0.0 0.0 0.05 0.64 0.0 0.43 0.18 1.0 0.2 0.27 0.45 0.07 0.23 0.04 0.59 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.37 0.45 0.11 0.0
0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.94 0.03 0.5 0.24 1.0 0.09 0.05 0.07 0.03 0.04 0.05 0.18 0.2 0.0
0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.79 0.03 0.4 0.4 1.0 0.05 0.11 0.06 0.06 0.04 0.02 0.26 0.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.38 0.04 0.34 0.17 1.0 0.0 0.18 0.06 0.0 0.0 0.04 0.26 0.27 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.37 0.0 0.15 0.12 1.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.01 0.02 0.12 0.13 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 1.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.23 0.03 0.0
0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.05 1.0 0.21 0.07 0.16 0.5 0.05 0.08 0.2 0.12 0.0 0.03 0.33 0.17 0.0
0.0 0.92 1.0 0.43 0.26 0.51 0.1 0.31 0.2 0.59 0.47 0.04 0.18 0.21 0.07 0.06 0.57 0.17 0.1 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.83 0.4 0.2 0.0 0.0 0.16 0.23 0.46 0.29 0.0
0.0 0.13 0.14 0.0 0.01 0.04 0.52 0.04 0.08 0.76 1.0 0.23 0.2 0.26 0.13 0.08 0.25 0.38 0.33 0.73
0.0 0.36 0.18 0.12 0.2 0.0 0.0 0.0 0.25 0.08 1.0 0.0 0.33 0.44 0.0 0.32 0.22 0.62 0.05 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.39 1.0 0.71 0.0 0.28 0.15 0.0 0.25 0.05 0.72 0.3 0.0
0.08 1.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.14 0.2 0.01 0.01 0.0 0.23 0.18 0.02 0.02 0.68 0.16 0.04 0.21
0.0 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.85 0.55 1.0 0.15 0.09 0.19 0.11 0.09 0.14 0.37 0.21 0.28
0.0 0.04 0.19 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.11 0.62 1.0 0.16 0.15 0.09 0.05 0.0 0.02 0.33 0.15 0.0
0.0 0.08 0.09 0.06 0.01 0.04 0.23 0.05 1.0 0.12 0.62 0.1 0.15 0.17 0.04 0.08 0.11 0.27 0.23 0.08
0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.51 0.0 0.64 0.0 0.33 0.93 0.0 0.0 0.37 1.0 0.44 0.0
0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.54 0.02 0.27 0.23 1.0 0.03 0.05 0.03 0.07 0.0 0.03 0.22 0.12 0.0
0.0 0.08 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.09 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.12 0.08 0.13 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.8 1.0 0.78 0.18 0.05 0.12 0.0 0.0 0.04 0.16 0.06 0.0
0.0 0.11 0.02 0.01 0.01 0.03 0.14 0.0 1.0 0.2 0.15 0.1 0.17 0.15 0.2 0.1 0.1 0.12 0.09 0.07
0.06 0.03 0.06 0.0 0.0 0.03 0.99 0.01 0.45 0.23 1.0 0.11 0.1 0.08 0.07 0.02 0.02 0.18 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.12 0.08 0.71 0.12 0.06 0.03 0.03 0.0 0.03 0.2 0.16 0.0
0.0 0.41 0.8 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.27 0.51 1.0 0.0 0.22 0.21 0.0 0.0 0.1 0.43 0.16 0.0
0.0 0.07 0.05 0.0 0.01 0.02 0.81 0.02 0.38 0.19 1.0 0.08 0.04 0.06 0.01 0.06 0.03 0.33 0.11 0.0
0.11 0.34 0.12 0.23 0.29 0.38 0.94 0.18 0.07 0.16 1.0 0.96 0.15 0.22 0.32 0.16 0.39 0.58 0.43 0.2
0.0 0.44 0.47 0.04 0.0 0.07 0.9 0.0 0.65 0.19 1.0 0.25 0.4 0.49 0.45 0.1 0.4 0.68 0.55 0.13
0.0 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.18 0.39 0.0 0.12 0.04 0.05 0.04 0.08 0.25 0.09 0.77
0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 1.0 0.03 0.11 0.13 0.51 0.05 0.1 0.14 0.06 0.08 0.01 0.27 0.1 0.0
0.35 0.12 0.37 0.01 0.04 0.09 0.88 0.04 0.35 0.46 1.0 0.2 0.07 0.1 0.06 0.02 0.06 0.22 0.17 0.26
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.73 0.48 1.0 0.44 0.13 0.03 0.1 0.06 0.04 0.36 0.29 0.47
0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.45 1.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.08 0.47 0.11 0.0
0.0 0.13 0.17 0.09 0.0 0.05 0.45 0.0 0.73 0.16 1.0 0.0 0.25 0.08 0.04 0.04 0.03 0.37 0.15 0.0
0.0 0.79 0.11 0.01 0.0 0.03 0.91 0.15 0.63 0.54 1.0 0.37 0.33 0.4 0.25 0.17 0.22 0.44 0.41 0.19
0.0 0.55 0.47 1.0 0.57 0.13 0.23 0.05 0.21 0.05 0.25 0.09 0.15 0.23 0.14 0.0 0.24 0.19 0.04 0.0
0.0 0.23 0.0 0.29 0.17 0.0 0.6 0.0 0.62 0.47 1.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.44 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.13 0.04 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.25 0.05 0.55
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.53 0.78 1.0 0.0 0.02 0.04 0.1 0.08 0.05 0.26 0.15 0.0
0.0 0.05 0.0 0.07 0.65 0.22 0.36 0.3 0.35 0.18 1.0 0.32 0.11 0.06 0.04 0.08 0.11 0.19 0.14 0.17
0.0 0.26 0.03 0.02 0.03 0.05 0.36 0.05 1.0 0.35 0.66 0.2 0.18 0.25 0.36 0.07 0.2 0.32 0.37 0.26
0.0 0.3 0.37 0.01 0.02 0.0 0.33 0.0 0.24 1.0 0.7 0.41 0.04 0.2 0.39 0.1 0.2 0.33 0.44 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.37 1.0 0.0 0.07 0.09 0.1 0.0 0.02 0.18 0.09 0.0
0.0 0.0 0.9 0.12 0.14 0.79 0.16 0.0 0.53 0.76 1.0 0.0 0.29 0.2 0.0 0.0 0.06 0.79 0.12 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.89 0.3 1.0 0.08 0.16 0.32 0.08 0.1 0.13 0.58 0.22 0.0
0.0 0.07 0.14 0.11 0.02 0.05 0.55 0.0 0.83 1.0 0.55 0.09 0.05 0.1 0.13 0.11 0.03 0.21 0.11 0.24
0.0 0.23 0.0 0.12 0.15 0.0 0.21 0.1 0.74 0.62 1.0 0.24 0.32 0.38 0.35 0.36 0.22 0.4 0.27 0.81
0.0 0.05 0.0 0.02 0.01 0.0 0.46 0.05 1.0 0.46 1.0 0.09 0.06 0.06 0.07 0.07 0.05 0.23 0.13 0.0
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.44 1.0 0.87 0.4 0.09 0.09 0.07 0.0 0.12 0.38 0.26 0.0
0.5 0.22 0.15 0.31 0.58 0.07 0.84 0.26 0.78 0.78 0.91 0.6 0.11 0.17 0.17 0.39 0.14 0.73 0.32 1.0
0.19 0.04 0.23 0.02 0.25 0.05 0.71 0.07 1.0 0.41 0.63 0.14 0.09 0.15 0.11 0.13 0.05 0.32 0.22 0.22
0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.3 0.18 0.71 0.04 1.0 0.01 0.07 0.03 0.06 0.01 0.03 0.23 0.08 0.13
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.67 0.0 1.0 0.0 0.18 0.21 0.0 0.0 0.06 0.42 0.1 0.0
0.0 1.0 0.78 0.67 0.24 0.28 0.0 0.45 0.24 0.25 0.48 0.0 0.21 0.23 0.0 0.0 0.46 0.14 0.02 0.41
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 0.51 0.57 1.0 0.0 0.08 0.07 0.2 0.1 0.11 0.21 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.8 0.34 0.0
0.0 0.41 0.07 0.28 0.35 0.23 0.34 0.2 0.31 0.18 0.79 0.05 0.22 0.33 0.0 0.02 0.08 0.31 0.15 1.0
0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.08 0.24 0.0 1.0 0.3 0.19 0.04 0.05 0.1 0.12 0.05 0.03 0.12 0.07 0.0
0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.11 1.0 0.04 0.46 0.16 0.61 0.0 0.0 0.13 0.04 0.01 0.13 0.24 0.09 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.95 0.04 0.0 0.09 1.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.23 0.11 0.0
0.0 0.17 0.39 0.01 0.0 0.06 0.32 0.02 1.0 0.15 0.51 0.42 0.18 0.45 0.44 0.44 0.11 0.41 0.18 0.7
0.0 0.49 0.63 1.0 0.79 0.58 0.02 0.64 0.26 0.12 0.6 0.01 0.14 0.24 0.05 0.01 0.14 0.11 0.02 0.96
0.0 0.32 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.09 0.0 0.76 0.0 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0
0.0 0.18 0.14 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.31 0.09 0.32 0.0 0.13 0.19 0.0 0.0 0.17 0.08 0.01 1.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.06 0.37 1.0 0.0 0.02 0.09 0.03 0.02 0.04 0.2 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.53 0.52 1.0 0.44 0.08 0.08 0.2 0.07 0.03 0.35 0.18 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.06 0.42 0.0 0.08 0.35 1.0 0.22 0.16 0.34 0.0 0.08 0.03 0.37 0.19 0.0
0.0 0.0 0.47 0.13 0.0 0.0 0.54 0.2 0.83 0.28 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.5 0.23 0.4
0.0 0.27 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.14 0.13 0.05 0.24 0.82 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.33 0.0 0.3 0.53 1.0 0.08 0.1 0.08 0.13 0.06 0.06 0.26 0.12 0.0
0.0 0.12 0.04 0.03 0.03 0.05 0.27 0.02 1.0 0.11 0.4 0.05 0.12 0.11 0.12 0.02 0.09 0.15 0.12 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.04 0.08 0.17 0.05 0.28 0.3 0.11 0.07 0.15 0.15 0.09 1.0
0.0 0.36 0.23 0.25 0.47 0.42 0.45 0.44 1.0 0.34 0.32 0.0 0.21 0.23 0.2 0.16 0.36 0.2 0.11 0.18
0.0 0.74 0.1 0.0 0.0 0.08 0.39 0.08 0.22 0.48 1.0 0.69 0.24 0.26 0.86 0.36 0.8 0.8 0.74 0.32
0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.15 0.73 0.16 0.1 0.11 0.04 0.1 0.02 0.16 0.12 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.81 0.55 1.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.25 0.0
0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 1.0 0.64 0.29 0.12 0.5 0.4 0.3 0.11 0.14 0.0 0.12 0.6 0.25 0.0
0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.13 0.13 0.77 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18 0.1 0.0
0.05 0.79 0.11 0.11 0.22 0.19 0.49 0.16 0.78 0.3 0.74 0.22 0.4 0.53 0.3 0.17 0.37 0.34 0.26 1.0
0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.08 0.32 0.03 0.14 0.59 1.0 0.08 0.01 0.08 0.09 0.04 0.1 0.24 0.12 0.35
0.0 0.14 0.11 0.23 0.09 0.08 0.91 0.08 0.89 0.26 1.0 0.18 0.37 0.22 0.27 0.1 0.16 0.55 0.21 0.84
0.0 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.38 0.12 0.0 0.06 0.0 0.07 0.13 0.17 0.01 0.8
0.0 0.75 0.0 0.03 0.24 0.11 0.26 0.11 0.15 0.34 1.0 0.41 0.24 0.14 0.07 0.4 0.44 0.44 0.32 0.22
0.17 0.05 0.17 0.0 0.0 0.06 1.0 0.01 0.62 0.22 0.79 0.21 0.14 0.13 0.08 0.2 0.08 0.24 0.07 0.15
0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.08 0.75 0.03 0.37 0.25 1.0 0.15 0.05 0.04 0.02 0.0 0.01 0.14 0.11 0.26
0.04 0.13 0.17 0.0 0.0 0.01 0.22 0.01 1.0 0.49 0.21 0.05 0.15 0.13 0.15 0.05 0.11 0.12 0.11 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.3 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.06 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)