Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.6 0.65 0.14 0.03 0.47 2.38 0.35 11.55 1.78 2.5 0.65 1.4 1.38 1.4 0.78 0.79 1.3 0.69 1.24
0.0 0.09 0.0 0.0 0.19 0.53 1.12 0.0 0.0 0.52 0.79 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.54 0.14 0.0
0.0 0.25 0.21 0.0 0.0 0.46 1.4 0.0 0.98 0.52 3.18 0.0 0.29 0.31 0.06 0.0 0.08 0.81 0.39 1.24
0.0 8.83 5.52 0.5 0.26 1.59 0.18 0.93 0.42 0.06 2.01 0.0 1.11 0.67 0.0 0.0 3.58 1.08 0.67 10.94
1.93 14.97 4.66 15.25 20.12 13.46 8.94 8.15 21.12 8.26 11.35 5.07 7.81 7.05 4.3 5.39 10.82 5.83 2.98 18.54
0.0 5.73 2.33 0.37 0.41 0.0 0.0 0.0 4.09 5.2 1.86 0.0 2.9 1.85 0.0 0.1 3.5 1.42 1.25 3.19
0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.65 0.0 1.88 0.0 0.43 0.24 0.48 0.29 0.0 0.47 0.23 2.41
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.54 0.0 1.19 1.52 2.48 0.49 0.64 0.71 1.32 0.98 0.19 1.44 0.5 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 2.21 0.69 1.4 0.0 0.11 0.33 0.0 0.0 0.16 0.43 0.21 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.65 1.34 0.9 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.04 0.31 0.09 0.0
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.26 1.67 0.0 0.35 1.34 2.46 0.0 0.0 0.23 0.33 0.0 0.14 0.98 0.59 0.0
0.0 0.13 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.09 0.69 0.0 0.06 0.06 0.0 0.07 0.1 0.54 0.26 0.0
0.0 0.15 0.6 0.08 0.09 0.66 4.72 2.07 0.7 1.62 9.28 1.21 0.81 0.47 0.42 0.15 0.3 2.31 2.26 0.0
0.0 1.47 0.0 1.27 0.48 0.88 4.21 0.49 9.0 4.8 4.81 1.6 1.38 1.46 1.15 0.56 1.85 2.34 1.87 0.0
0.0 0.06 0.56 0.0 0.0 0.12 1.45 0.0 0.98 0.4 2.28 0.45 0.61 1.03 0.16 0.53 0.1 1.35 0.59 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.24 0.0 1.87 0.0 0.0 0.0 1.21 1.45 0.35 0.0
0.0 0.81 0.76 0.0 0.0 0.0 9.15 0.33 4.88 2.36 9.78 0.91 0.45 0.71 0.32 0.38 0.53 1.77 1.93 0.0
0.0 0.19 0.0 0.12 0.13 0.0 5.45 0.19 2.78 2.76 6.86 0.35 0.74 0.43 0.41 0.25 0.17 1.79 2.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 2.53 0.26 2.25 1.14 6.59 0.0 1.22 0.41 0.0 0.0 0.25 1.68 1.77 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.05 0.41 4.35 0.0 1.84 1.38 11.91 0.0 0.26 0.24 0.44 0.12 0.19 1.46 1.5 0.26
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.23 2.85 0.09 0.0 0.08 0.0 0.04 0.01 0.64 0.09 0.0
0.0 0.05 0.19 0.0 0.0 0.17 3.13 0.66 0.22 0.5 1.55 0.15 0.26 0.63 0.38 0.0 0.1 1.04 0.55 0.0
0.0 10.07 10.93 4.65 2.82 5.62 1.11 3.4 2.14 6.49 5.13 0.49 1.98 2.28 0.75 0.69 6.2 1.81 1.06 0.0
0.0 0.0 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 1.87 0.91 0.45 0.0 0.0 0.37 0.51 1.05 0.64 0.0
0.0 0.88 0.94 0.0 0.05 0.28 3.37 0.27 0.55 4.91 6.49 1.51 1.32 1.66 0.87 0.5 1.62 2.47 2.14 4.74
0.0 0.54 0.27 0.18 0.29 0.0 0.0 0.0 0.37 0.11 1.49 0.0 0.49 0.65 0.0 0.48 0.32 0.93 0.07 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.47 0.0 0.74 1.91 1.36 0.0 0.54 0.28 0.0 0.47 0.1 1.37 0.58 0.0
0.5 6.51 0.0 0.04 0.05 0.13 0.19 0.9 1.32 0.09 0.09 0.0 1.52 1.18 0.1 0.11 4.4 1.06 0.26 1.39
0.0 0.31 0.51 0.0 0.0 0.0 3.52 0.0 4.47 2.93 5.29 0.82 0.49 0.99 0.57 0.47 0.72 1.94 1.09 1.5
0.0 0.1 0.46 0.0 0.0 0.0 2.27 0.0 0.27 1.46 2.36 0.37 0.36 0.21 0.13 0.0 0.05 0.77 0.35 0.0
0.0 0.49 0.58 0.37 0.05 0.26 1.4 0.31 6.17 0.75 3.85 0.59 0.91 1.03 0.28 0.47 0.65 1.65 1.42 0.49
0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.54 0.0 0.67 0.0 0.34 0.97 0.0 0.0 0.39 1.05 0.47 0.0
0.0 0.33 0.34 0.0 0.0 0.3 4.45 0.15 2.2 1.94 8.27 0.27 0.4 0.23 0.61 0.0 0.27 1.85 0.95 0.0
0.0 0.15 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 2.0 0.7 0.17 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.24 0.17 0.27 0.0
0.0 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 3.84 0.0 4.66 5.85 4.56 1.06 0.28 0.72 0.0 0.0 0.24 0.93 0.35 0.0
0.0 1.53 0.28 0.11 0.13 0.43 2.06 0.0 14.27 2.83 2.16 1.39 2.41 2.12 2.8 1.42 1.47 1.76 1.3 1.05
0.51 0.25 0.46 0.0 0.0 0.27 8.05 0.07 3.69 1.89 8.14 0.86 0.84 0.63 0.57 0.14 0.17 1.5 1.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.58 0.28 0.55 0.38 3.27 0.53 0.28 0.15 0.12 0.0 0.12 0.92 0.73 0.0
0.0 1.93 3.76 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 1.26 2.4 4.72 0.0 1.03 0.97 0.0 0.0 0.49 2.02 0.76 0.0
0.0 0.24 0.17 0.0 0.03 0.08 2.83 0.07 1.33 0.67 3.48 0.28 0.13 0.2 0.05 0.2 0.09 1.14 0.38 0.0
0.74 2.22 0.77 1.5 1.86 2.49 6.1 1.19 0.45 1.04 6.48 6.23 0.98 1.43 2.08 1.07 2.53 3.76 2.81 1.31
0.0 1.34 1.43 0.13 0.0 0.21 2.71 0.0 1.96 0.56 3.01 0.77 1.21 1.49 1.35 0.31 1.2 2.05 1.67 0.4
0.0 0.27 0.0 0.03 0.0 0.0 0.24 0.0 1.93 0.35 0.75 0.0 0.24 0.08 0.1 0.08 0.15 0.48 0.18 1.49
0.0 0.0 0.0 0.12 0.25 0.0 6.74 0.18 0.72 0.88 3.42 0.33 0.68 0.97 0.43 0.52 0.04 1.79 0.67 0.0
2.92 1.01 3.13 0.1 0.3 0.77 7.43 0.3 2.96 3.91 8.4 1.68 0.61 0.85 0.53 0.18 0.53 1.83 1.42 2.2
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.76 0.0 1.43 0.95 1.96 0.87 0.25 0.06 0.2 0.12 0.08 0.7 0.57 0.91
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.15 0.34 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.03 0.16 0.04 0.0
0.0 0.34 0.45 0.23 0.0 0.13 1.2 0.0 1.92 0.42 2.64 0.0 0.66 0.22 0.12 0.11 0.08 0.97 0.38 0.0
0.0 5.24 0.75 0.05 0.0 0.17 6.01 0.97 4.2 3.61 6.63 2.42 2.22 2.66 1.66 1.11 1.47 2.91 2.7 1.27
0.0 4.75 4.07 8.71 4.98 1.12 2.0 0.44 1.79 0.41 2.21 0.82 1.3 2.03 1.22 0.0 2.07 1.64 0.38 0.0
0.0 2.0 0.0 2.46 1.43 0.0 5.18 0.0 5.32 4.0 8.59 7.29 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 3.79 1.46 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.0 0.17 0.05 1.27 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.32 0.06 0.69
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.8 0.0 2.03 2.98 3.82 0.0 0.09 0.14 0.36 0.3 0.19 1.0 0.58 0.0
0.0 0.95 0.0 1.36 12.87 4.35 7.18 5.95 6.95 3.52 19.9 6.35 2.24 1.13 0.77 1.51 2.15 3.7 2.77 3.33
0.0 2.21 0.23 0.13 0.21 0.4 3.0 0.39 8.33 2.94 5.51 1.66 1.49 2.08 2.96 0.56 1.71 2.66 3.09 2.13
0.0 4.37 5.32 0.09 0.31 0.0 4.81 0.0 3.51 14.4 10.14 5.88 0.65 2.95 5.64 1.4 2.9 4.75 6.4 2.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 3.12 8.51 0.0 0.62 0.78 0.82 0.0 0.19 1.5 0.73 0.0
0.0 0.0 1.11 0.15 0.17 0.98 0.2 0.0 0.65 0.94 1.24 0.0 0.36 0.25 0.0 0.0 0.07 0.98 0.15 0.0
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 1.42 0.47 1.6 0.13 0.25 0.51 0.14 0.16 0.21 0.93 0.35 0.0
0.0 0.4 0.8 0.61 0.12 0.27 3.08 0.0 4.6 5.57 3.04 0.49 0.29 0.56 0.71 0.6 0.19 1.16 0.62 1.36
0.0 0.78 0.0 0.42 0.51 0.0 0.73 0.33 2.53 2.11 3.41 0.81 1.08 1.31 1.21 1.23 0.74 1.35 0.92 2.78
0.0 0.27 0.0 0.08 0.04 0.0 2.3 0.23 5.03 2.29 5.01 0.43 0.31 0.29 0.33 0.34 0.26 1.14 0.63 0.0
0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 2.95 0.0 1.62 3.7 3.22 1.48 0.34 0.35 0.26 0.0 0.45 1.42 0.98 0.0
0.57 0.25 0.17 0.35 0.66 0.07 0.95 0.29 0.89 0.89 1.04 0.68 0.12 0.2 0.2 0.44 0.16 0.83 0.36 1.14
1.07 0.22 1.27 0.11 1.41 0.28 3.98 0.41 5.6 2.31 3.51 0.77 0.51 0.87 0.64 0.75 0.26 1.79 1.23 1.21
0.19 0.15 0.0 0.01 0.0 0.1 0.89 0.52 2.1 0.11 2.97 0.04 0.21 0.09 0.19 0.04 0.08 0.69 0.24 0.37
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.74 0.0 1.11 0.0 0.2 0.23 0.0 0.0 0.07 0.47 0.11 0.0
0.0 38.11 29.55 25.48 8.97 10.72 0.0 17.03 8.98 9.6 18.39 0.0 8.01 8.79 0.0 0.0 17.56 5.21 0.93 15.69
0.0 1.36 0.0 0.0 0.0 0.27 1.51 0.0 4.74 5.27 9.24 0.0 0.71 0.63 1.83 0.95 1.04 1.95 1.37 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 1.87 0.8 0.0
0.0 1.44 0.23 0.98 1.22 0.82 1.21 0.7 1.09 0.64 2.77 0.19 0.77 1.15 0.0 0.06 0.29 1.1 0.52 3.52
0.0 0.18 0.7 0.0 0.0 1.23 3.8 0.0 15.56 4.73 2.92 0.56 0.82 1.5 1.82 0.8 0.5 1.81 1.1 0.0
0.0 0.35 0.19 0.0 0.0 0.41 3.83 0.16 1.77 0.62 2.34 0.0 0.0 0.49 0.16 0.05 0.49 0.91 0.35 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.09 0.0 3.12 0.13 0.0 0.29 3.29 0.0 0.06 0.11 0.08 0.11 0.14 0.76 0.36 0.0
0.0 0.7 1.61 0.05 0.0 0.24 1.29 0.08 4.09 0.62 2.07 1.72 0.73 1.83 1.8 1.78 0.47 1.69 0.74 2.86
0.0 12.09 15.52 24.82 19.71 14.46 0.44 15.81 6.36 3.01 15.0 0.2 3.52 5.96 1.12 0.16 3.36 2.66 0.48 23.92
0.0 0.59 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.16 0.0 1.42 0.0 0.41 0.05 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 1.87
0.0 4.12 3.3 0.94 0.15 0.1 0.1 0.13 7.19 2.0 7.4 0.0 3.12 4.45 0.05 0.0 3.86 1.92 0.27 23.32
0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.16 0.4 0.0 0.41 2.52 6.74 0.0 0.12 0.63 0.24 0.12 0.25 1.38 0.9 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.91 0.0 4.21 4.14 7.9 3.46 0.61 0.59 1.61 0.54 0.22 2.75 1.41 0.0
0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.19 1.38 0.0 0.26 1.16 3.26 0.71 0.51 1.12 0.0 0.26 0.1 1.22 0.63 0.0
0.0 0.0 1.54 0.44 0.0 0.0 1.77 0.66 2.71 0.93 3.26 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.14 1.63 0.76 1.3
0.0 0.23 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.06 0.12 0.11 0.04 0.2 0.7 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.01 0.0 0.92 1.59 3.03 0.25 0.29 0.24 0.39 0.18 0.17 0.78 0.37 0.0
0.0 2.74 0.87 0.6 0.77 1.15 6.08 0.5 22.2 2.44 8.82 1.16 2.66 2.34 2.58 0.55 1.92 3.31 2.55 0.0
0.0 2.64 0.0 0.0 0.0 0.29 0.46 0.0 0.38 0.84 1.67 0.52 2.8 2.95 1.12 0.65 1.44 1.52 0.9 9.87
0.0 2.67 1.68 1.84 3.51 3.15 3.33 3.25 7.42 2.54 2.36 0.0 1.58 1.74 1.47 1.17 2.64 1.45 0.79 1.33
0.0 1.3 0.17 0.0 0.0 0.15 0.68 0.14 0.39 0.85 1.76 1.22 0.42 0.46 1.51 0.64 1.4 1.41 1.3 0.57
0.0 0.33 0.29 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 4.37 0.64 3.18 0.71 0.42 0.49 0.17 0.43 0.08 0.71 0.54 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.64 0.43 0.79 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.19 0.0
0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 1.3 0.83 0.38 0.16 0.65 0.52 0.4 0.15 0.18 0.0 0.16 0.78 0.33 0.0
0.0 0.08 0.34 0.0 0.0 0.0 6.07 0.0 0.8 0.81 4.67 0.27 0.15 0.0 0.13 0.0 0.0 1.09 0.58 0.0
0.37 5.44 0.76 0.77 1.52 1.29 3.38 1.12 5.36 2.03 5.09 1.49 2.78 3.67 2.05 1.15 2.57 2.31 1.76 6.88
0.0 0.49 0.26 0.0 0.0 0.56 2.36 0.22 1.05 4.41 7.47 0.62 0.11 0.58 0.64 0.28 0.78 1.78 0.92 2.59
0.0 0.63 0.48 1.06 0.4 0.36 4.17 0.39 4.08 1.19 4.58 0.82 1.71 1.02 1.24 0.44 0.74 2.52 0.96 3.82
0.0 0.59 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 3.48 1.31 0.41 0.0 0.21 0.0 0.23 0.44 0.6 0.02 2.79
0.0 2.67 0.0 0.12 0.85 0.4 0.92 0.39 0.53 1.2 3.57 1.46 0.86 0.49 0.25 1.44 1.58 1.55 1.13 0.77
1.38 0.37 1.33 0.01 0.03 0.45 8.0 0.09 5.0 1.76 6.32 1.65 1.11 1.0 0.67 1.62 0.6 1.95 0.57 1.21
0.0 0.31 0.47 0.0 0.0 0.63 5.68 0.2 2.78 1.87 7.56 1.14 0.4 0.29 0.18 0.0 0.11 1.04 0.85 2.0
0.47 1.7 2.26 0.0 0.02 0.19 2.86 0.12 13.19 6.46 2.81 0.68 1.98 1.67 1.99 0.62 1.44 1.53 1.4 2.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.34 0.66 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.07 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)