Heatmap: Cluster_102 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.69 0.49 0.59 0.7 0.36 0.5 0.74 0.43 0.68 0.76 0.5 0.77 1.0 0.87 0.88 0.79 0.65 0.78 0.95 0.28
0.0 0.37 0.08 0.0 0.0 0.02 0.08 0.02 1.0 0.2 0.09 0.16 0.51 0.35 0.33 0.01 0.3 0.22 0.16 0.56
0.36 0.88 0.69 0.24 0.16 0.17 0.37 0.13 0.19 0.21 0.27 1.0 0.68 0.73 0.75 0.63 0.77 0.61 0.59 0.99
0.19 0.54 0.23 0.43 0.16 0.1 0.07 0.0 0.02 0.01 0.21 0.28 0.85 0.82 0.74 0.19 0.6 0.43 0.25 1.0
0.49 0.85 0.87 0.62 0.6 0.41 1.0 0.36 0.7 0.75 0.72 0.79 0.94 0.93 0.79 0.88 0.71 0.77 0.68 0.68
0.4 0.98 0.47 0.39 0.39 0.37 0.68 0.31 0.5 0.43 0.51 0.72 0.43 0.48 0.48 0.47 0.72 0.54 0.51 1.0
0.05 0.74 0.23 0.81 0.57 0.35 0.42 0.25 0.08 0.04 0.29 0.68 0.84 0.6 0.81 0.44 1.0 0.55 0.57 0.55
0.43 0.52 0.46 1.0 0.87 0.5 0.32 0.48 0.37 0.13 0.52 0.5 0.72 0.61 0.61 0.48 0.54 0.43 0.28 0.25
0.51 0.4 0.36 1.0 0.48 0.46 0.35 0.49 0.44 0.43 0.46 0.95 0.71 0.72 0.52 0.62 0.47 0.57 0.39 0.45
0.26 0.5 0.47 0.36 0.29 0.3 0.33 0.29 0.46 0.11 0.32 0.46 0.48 0.55 0.4 0.47 0.42 0.39 0.33 1.0
0.29 0.89 0.52 0.49 0.37 0.24 1.0 0.16 0.47 0.64 0.45 0.88 0.69 0.83 0.75 0.69 0.84 0.75 0.61 0.78
0.53 0.89 0.79 0.76 0.58 0.61 0.7 0.66 0.66 0.35 0.71 0.82 1.0 0.83 0.84 0.69 0.95 0.64 0.5 0.79
1.0 0.71 0.58 0.52 0.36 0.47 0.51 0.49 0.1 0.08 0.29 0.72 0.63 0.52 0.51 0.49 0.68 0.43 0.38 0.92
0.12 0.96 0.15 0.02 0.03 0.08 0.35 0.03 0.15 0.06 0.1 1.0 0.81 0.84 0.77 0.72 0.88 0.73 0.75 0.59
0.04 0.73 0.68 0.05 0.21 0.28 0.4 0.16 1.0 0.31 0.29 0.46 0.43 0.66 0.52 0.34 0.56 0.51 0.47 0.9
0.61 0.85 1.0 0.78 0.47 0.55 0.73 0.42 0.44 0.9 0.7 0.9 0.83 0.89 0.86 0.8 0.72 0.72 0.79 0.51
0.33 0.62 0.61 0.5 0.38 0.13 1.0 0.12 0.61 0.73 0.48 0.67 0.75 0.89 0.78 0.51 0.6 0.61 0.45 0.9
0.36 0.5 0.45 0.3 0.26 0.16 0.79 0.11 0.17 0.14 0.34 0.43 0.56 0.43 0.58 0.44 0.38 0.33 0.28 1.0
0.58 0.64 0.58 0.52 0.47 0.39 0.43 0.29 0.68 0.33 0.46 0.88 1.0 0.72 0.84 0.77 0.59 0.62 0.51 0.89
0.52 0.52 0.58 0.63 0.32 0.33 0.59 0.26 0.29 0.24 0.36 0.71 0.57 0.65 0.55 0.44 0.49 0.5 0.46 1.0
0.26 0.49 0.32 0.18 0.16 0.14 0.29 0.12 0.52 0.19 0.21 0.64 0.52 0.41 0.54 0.42 0.46 0.35 0.32 1.0
0.58 0.85 0.69 0.87 0.74 0.68 0.92 0.72 1.0 0.64 0.65 0.92 0.79 0.79 0.87 0.94 0.84 0.67 0.64 0.84
0.49 0.45 0.25 0.28 0.37 0.26 0.24 0.29 0.78 0.19 0.43 0.74 1.0 0.82 0.68 0.56 0.58 0.52 0.39 0.89
0.42 0.7 0.43 0.2 0.32 0.29 0.37 0.21 0.75 0.43 0.48 0.84 0.7 0.65 0.76 0.64 0.66 0.56 0.55 1.0
0.37 0.81 0.76 0.83 0.46 0.58 0.76 0.47 0.75 0.61 0.59 0.71 0.74 0.8 0.64 0.66 0.67 0.6 0.55 1.0
0.84 0.73 0.62 0.55 0.45 0.54 0.77 0.44 0.69 0.44 0.54 0.97 0.85 0.84 1.0 0.77 0.75 0.75 0.82 0.92
0.31 0.83 0.67 0.58 0.38 0.31 0.8 0.41 0.66 0.82 0.61 0.83 1.0 0.91 0.72 0.73 0.71 0.6 0.58 0.84
0.54 0.48 0.53 0.58 0.31 0.22 1.0 0.2 0.29 0.12 0.29 0.66 0.64 0.7 0.54 0.44 0.47 0.5 0.43 0.78
0.35 0.69 0.58 0.46 0.41 0.29 0.52 0.24 0.54 0.4 0.5 0.71 0.61 0.63 0.61 0.53 0.63 0.51 0.44 1.0
0.51 0.71 0.57 0.46 0.48 0.31 0.48 0.28 0.79 0.37 0.51 0.84 0.79 0.92 0.68 0.82 0.64 0.53 0.57 1.0
0.27 0.77 0.26 0.68 0.53 0.44 0.32 0.63 0.47 0.19 0.45 0.87 0.98 0.97 0.85 0.86 0.83 0.69 0.74 1.0
0.37 0.99 0.78 0.76 0.75 0.5 0.17 0.48 0.74 0.46 0.64 0.86 0.83 0.67 0.99 0.68 0.89 0.62 0.5 1.0
0.48 0.7 0.61 0.5 0.47 0.31 0.8 0.22 0.53 0.54 0.53 0.76 0.84 1.0 0.64 0.83 0.64 0.65 0.6 0.63
0.51 0.78 0.66 0.72 0.59 0.39 0.75 0.36 0.78 0.33 0.52 0.95 1.0 0.99 0.79 0.73 0.64 0.63 0.51 0.88
0.55 0.84 0.55 0.35 0.42 0.42 0.62 0.32 0.81 0.36 0.54 1.0 0.78 0.84 0.79 0.78 0.85 0.77 0.71 0.8
0.13 0.26 0.12 0.92 0.53 0.56 0.02 0.64 0.4 0.1 0.37 0.32 1.0 0.96 0.62 0.41 0.4 0.41 0.37 0.44
0.24 0.52 0.45 0.36 0.24 0.23 0.42 0.23 0.71 0.17 0.27 0.79 0.71 0.57 1.0 0.68 0.61 0.5 0.46 0.69
0.48 0.59 0.42 0.45 0.54 0.43 0.33 0.42 0.78 0.2 0.52 0.63 1.0 0.77 0.69 0.6 0.76 0.55 0.51 0.87
0.41 0.54 0.48 0.43 0.18 0.45 1.0 0.29 0.45 0.37 0.33 0.67 0.65 0.82 0.5 0.66 0.46 0.58 0.56 0.59
0.65 0.6 0.32 0.16 0.22 0.24 0.44 0.33 0.32 0.18 0.39 1.0 0.25 0.41 0.5 0.4 0.7 0.49 0.53 0.43
0.34 0.41 0.36 0.52 0.42 0.5 0.52 0.46 0.38 0.15 0.33 0.35 1.0 0.75 0.53 0.61 0.47 0.45 0.4 0.64
0.03 0.32 0.17 0.49 0.39 0.32 0.07 0.37 0.12 0.02 0.23 0.33 1.0 0.68 0.47 0.49 0.44 0.35 0.3 0.5
0.51 0.71 0.94 0.79 0.46 0.35 0.58 0.21 0.29 0.23 0.48 0.69 0.78 0.8 0.67 0.5 0.6 0.53 0.44 1.0
0.42 0.98 0.42 0.16 0.18 0.18 0.27 0.13 0.41 0.23 0.32 0.78 0.56 0.46 0.63 0.52 0.71 0.48 0.35 1.0
0.48 0.63 0.67 0.56 0.4 0.38 1.0 0.33 0.73 0.47 0.45 0.73 0.68 0.75 0.6 0.49 0.55 0.52 0.48 0.38
0.25 0.84 0.86 0.58 0.62 0.39 0.83 0.6 1.0 0.81 0.77 0.82 0.58 0.7 0.56 0.55 0.75 0.63 0.62 0.79
0.73 0.63 0.69 0.39 0.2 0.31 1.0 0.23 0.17 0.14 0.32 0.69 0.64 0.7 0.64 0.31 0.59 0.56 0.5 0.64
0.59 0.71 0.42 0.23 0.11 0.15 0.55 0.1 0.08 0.06 0.18 0.58 0.43 0.33 0.53 0.33 0.84 0.38 0.39 1.0
0.36 0.75 0.73 0.68 0.36 0.44 0.87 0.33 0.64 0.79 0.51 1.0 0.92 0.88 0.68 0.95 0.61 0.68 0.68 0.81
0.2 0.74 0.68 0.53 0.56 0.2 1.0 0.27 0.1 0.16 0.54 0.57 0.91 0.84 0.98 0.53 0.61 0.6 0.39 0.25
0.69 0.68 0.66 0.45 0.44 0.35 0.37 0.31 1.0 0.39 0.51 0.87 0.88 0.91 0.78 0.79 0.68 0.62 0.56 0.71
0.33 0.71 0.78 0.51 0.36 0.43 0.56 0.41 0.24 0.09 0.38 0.69 0.52 0.58 0.53 0.42 0.62 0.46 0.35 1.0
0.54 0.65 0.51 0.36 0.2 0.23 0.5 0.21 0.25 0.12 0.22 0.51 0.96 0.73 0.83 0.46 0.63 0.55 0.49 1.0
0.82 0.69 0.74 0.89 0.73 0.57 0.77 0.52 0.76 0.45 0.7 1.0 0.7 0.67 0.81 0.59 0.78 0.65 0.62 0.96
0.26 1.0 0.27 0.16 0.12 0.12 0.23 0.16 0.29 0.11 0.17 0.64 0.6 0.54 0.85 0.41 0.99 0.56 0.61 0.58
0.31 0.73 0.55 0.4 0.33 0.3 0.41 0.34 0.52 0.23 0.44 0.7 0.78 0.71 0.82 0.49 0.66 0.56 0.48 1.0
0.27 0.58 0.61 0.48 0.36 0.32 1.0 0.24 0.73 0.42 0.46 0.64 0.69 0.73 0.63 0.39 0.54 0.58 0.44 0.62
0.47 0.74 0.67 0.5 0.28 0.29 0.33 0.44 0.6 0.38 0.37 0.72 1.0 0.99 0.63 0.71 0.69 0.55 0.49 0.55
0.23 0.56 0.3 0.22 0.25 0.2 0.43 0.19 0.36 0.15 0.25 0.48 0.52 0.47 0.48 0.31 0.53 0.33 0.29 1.0
0.28 0.68 0.45 0.32 0.04 0.2 0.73 0.06 0.36 0.32 0.21 1.0 0.93 0.85 0.59 0.75 0.53 0.62 0.47 0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)