1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_57 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
ATCC 44394, early decay stage, 0-5 mm
ATCC 44394, middle late decay stage, 15-20 mm
ATCC 44394, late decay stage, 30-35 mm
SB12
MAD698-R, early decay stage, 0-5 mm
MAD698-R, middle late decay stage, 15-20 mm
MAD698-R, late decay stage, 30-35 mm
MAD698-R
Pure culture
week 6, furfural alcohol (FA10) treated wood
week 6, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 6, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 9, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 3, untreated wood
week 4, untreated wood
week 3, furfural alcohol (FA10) treated wood
week 3, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 3, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 9, furfural alcohol (FA10) treated wood
week 9, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 12, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 12, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 15, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 15, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 18, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 18, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 1, untreated wood
week 2, untreated wood
week 5, untreated wood
0.71 0.28 0.26 0.03 0.62 0.28 0.26 1.0 0.8 0.25 0.53 0.64 0.41 0.39 0.41 0.62 0.52 0.46 0.22 0.63 0.36 0.39 0.43 0.67 0.55 0.82 0.71 0.41 0.34
0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.04 1.0 0.05 0.05 0.14 0.07 0.07 0.07 0.04 0.02 0.1 0.07 0.03 0.07 0.17 0.04 0.12 0.08 0.41 0.28 0.05 0.08
0.18 0.08 0.09 0.0 0.21 0.08 0.09 0.55 0.87 0.27 0.65 0.76 0.46 0.44 0.39 0.64 0.81 0.99 0.25 0.86 0.53 0.57 0.36 0.67 0.59 0.46 1.0 0.38 0.31
0.25 0.04 0.04 0.9 0.26 0.04 0.04 0.42 1.0 0.32 0.33 0.39 0.31 0.24 0.48 0.33 0.38 0.33 0.38 0.36 0.35 0.28 0.5 0.44 0.42 0.44 0.49 0.21 0.44
0.3 0.07 0.05 0.08 0.26 0.07 0.05 0.15 0.82 0.22 0.05 0.28 0.09 0.17 0.24 0.13 0.05 0.22 0.1 0.28 0.15 0.39 0.21 0.54 0.57 0.5 1.0 0.11 0.17
0.3 0.24 0.15 0.04 0.3 0.24 0.15 1.0 0.98 0.32 0.25 0.46 0.36 0.36 0.29 0.38 0.31 0.59 0.14 0.4 0.3 0.37 0.34 0.35 0.36 0.5 0.44 0.32 0.23
0.07 0.04 0.05 0.0 0.07 0.04 0.05 0.07 1.0 0.09 0.15 0.33 0.28 0.13 0.09 0.11 0.17 0.38 0.05 0.42 0.17 0.43 0.08 0.31 0.18 0.64 0.14 0.14 0.1
0.52 0.24 0.21 0.02 0.5 0.24 0.21 0.88 0.67 0.23 0.44 0.74 0.43 0.39 0.32 0.42 0.3 0.41 0.34 0.78 0.38 0.54 0.32 0.53 0.59 0.75 1.0 0.47 0.32
0.36 0.32 0.34 0.73 0.39 0.32 0.34 0.66 0.91 0.58 0.64 0.78 0.63 0.62 0.56 0.7 0.53 0.9 0.48 0.82 0.75 0.68 0.68 0.89 0.91 1.0 0.6 0.71 0.47
0.21 0.21 0.18 0.08 0.21 0.21 0.18 0.6 1.0 0.57 0.36 0.46 0.44 0.47 0.42 0.5 0.28 0.51 0.48 0.57 0.6 0.41 0.55 0.57 0.71 0.59 0.35 0.45 0.48
0.09 0.07 0.04 0.21 0.09 0.07 0.04 0.71 1.0 0.37 0.31 0.57 0.29 0.23 0.16 0.32 0.54 0.78 0.29 0.48 0.31 0.73 0.37 0.62 0.44 0.78 0.5 0.4 0.16
0.06 0.06 0.07 0.08 0.06 0.06 0.07 0.19 1.0 0.2 0.17 0.16 0.2 0.17 0.21 0.25 0.15 0.21 0.16 0.16 0.25 0.19 0.26 0.23 0.33 0.16 0.33 0.22 0.25
0.16 0.13 0.11 0.21 0.16 0.13 0.11 0.3 1.0 0.47 0.33 0.58 0.49 0.48 0.47 0.51 0.42 0.75 0.31 0.47 0.43 0.46 0.42 0.65 0.59 0.58 0.84 0.55 0.51
0.94 0.75 0.76 0.06 0.86 0.75 0.76 0.44 0.03 0.08 0.11 0.83 0.06 0.06 0.11 0.07 0.36 0.34 0.11 0.59 0.08 0.15 0.19 0.52 0.26 0.6 1.0 0.04 0.12
0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 1.0 0.2 0.18 0.3 0.26 0.33 0.3 0.2 0.27 0.43 0.12 0.4 0.22 0.27 0.28 0.3 0.32 0.39 0.43 0.18 0.27
0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.05 0.07 0.17 0.09 0.05 0.06 0.06 0.06 0.05 0.01 0.09 0.05 0.09 0.04 0.1 0.1 0.19 0.22 0.06 0.06
0.52 0.02 0.01 0.01 0.65 0.02 0.01 0.11 1.0 0.14 0.18 0.52 0.2 0.16 0.2 0.18 0.43 0.47 0.2 0.4 0.24 0.28 0.23 0.48 0.37 0.35 0.42 0.35 0.13
0.05 0.03 0.03 0.04 0.05 0.03 0.03 0.04 1.0 0.22 0.26 0.37 0.32 0.23 0.19 0.26 0.38 0.38 0.27 0.36 0.36 0.38 0.36 0.43 0.45 0.57 0.31 0.26 0.19
0.07 0.07 0.04 0.29 0.06 0.07 0.04 0.18 1.0 0.1 0.19 0.39 0.17 0.26 0.23 0.2 0.05 0.24 0.12 0.27 0.27 0.17 0.18 0.3 0.24 0.44 0.26 0.09 0.21
0.45 0.21 0.23 0.04 0.46 0.21 0.23 0.68 1.0 0.29 0.35 0.45 0.29 0.36 0.39 0.37 0.25 0.5 0.22 0.41 0.32 0.31 0.26 0.44 0.39 0.6 0.55 0.29 0.4
0.26 0.31 0.5 0.83 0.25 0.31 0.5 0.47 1.0 0.36 0.34 0.66 0.43 0.25 0.51 0.41 0.55 0.35 0.38 0.35 0.39 0.41 0.61 0.58 0.48 0.34 0.58 0.27 0.51
0.17 0.08 0.07 0.91 0.16 0.08 0.07 0.29 1.0 0.28 0.21 0.29 0.15 0.15 0.16 0.22 0.32 0.28 0.24 0.14 0.17 0.16 0.27 0.28 0.31 0.37 0.58 0.23 0.11
0.14 0.03 0.09 0.73 0.16 0.03 0.09 0.11 0.55 0.15 0.04 0.05 0.14 0.2 0.2 0.09 0.09 0.49 0.24 0.28 0.24 0.04 0.2 0.13 0.26 0.46 1.0 0.11 0.25
0.1 0.04 0.04 0.0 0.09 0.04 0.04 0.11 1.0 0.23 0.15 0.28 0.14 0.16 0.18 0.25 0.07 0.2 0.14 0.2 0.08 0.17 0.12 0.26 0.17 0.24 0.33 0.23 0.16
0.49 0.1 0.07 0.25 0.45 0.1 0.07 0.47 1.0 0.02 0.01 0.06 0.05 0.03 0.02 0.06 0.11 0.25 0.0 0.19 0.01 0.11 0.04 0.45 0.03 0.23 0.21 0.02 0.03
0.49 0.37 0.37 0.0 0.47 0.37 0.37 0.62 0.59 0.34 0.48 0.89 0.43 0.54 0.45 0.51 0.5 0.61 0.27 0.62 0.58 0.47 0.56 0.67 0.68 0.74 1.0 0.4 0.45
0.14 0.1 0.08 0.02 0.14 0.1 0.08 0.23 1.0 0.27 0.36 0.34 0.35 0.33 0.35 0.27 0.11 0.4 0.18 0.47 0.26 0.32 0.34 0.43 0.51 0.56 0.6 0.21 0.31
0.46 0.37 0.38 0.53 0.45 0.37 0.38 0.53 1.0 0.35 0.38 0.31 0.37 0.42 0.47 0.46 0.36 0.44 0.36 0.34 0.45 0.38 0.47 0.47 0.56 0.53 0.65 0.47 0.45
0.44 0.12 0.13 0.77 0.43 0.12 0.13 0.61 1.0 0.32 0.31 0.37 0.23 0.28 0.47 0.3 0.24 0.42 0.4 0.3 0.33 0.34 0.32 0.51 0.25 0.38 0.52 0.23 0.43
0.81 0.18 0.21 0.96 0.81 0.18 0.21 1.0 0.7 0.09 0.03 0.12 0.01 0.05 0.05 0.13 0.0 0.24 0.01 0.16 0.04 0.25 0.04 0.4 0.04 0.21 0.1 0.05 0.05
0.4 0.32 0.27 0.52 0.43 0.32 0.27 0.58 1.0 0.49 0.38 0.61 0.45 0.41 0.52 0.48 0.37 0.66 0.37 0.51 0.53 0.37 0.52 0.61 0.68 0.58 0.76 0.36 0.47
0.41 0.14 0.08 0.01 0.51 0.14 0.08 1.0 0.81 0.24 0.33 0.57 0.18 0.34 0.34 0.32 0.39 0.49 0.11 0.58 0.2 0.26 0.12 0.33 0.25 0.33 0.97 0.4 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.37 0.24 0.49 0.32 0.29 0.28 0.48 0.42 0.62 0.5 0.39 0.3 0.36 0.33 0.4 0.62 0.41 0.5 0.17 0.26
0.04 0.06 0.06 0.1 0.04 0.06 0.06 0.05 1.0 0.18 0.21 0.25 0.23 0.19 0.22 0.21 0.13 0.19 0.17 0.27 0.2 0.23 0.29 0.32 0.26 0.29 0.4 0.14 0.23
0.18 0.11 0.07 0.0 0.19 0.11 0.07 0.55 1.0 0.23 0.25 0.38 0.29 0.26 0.3 0.43 0.34 0.43 0.13 0.51 0.21 0.37 0.14 0.33 0.24 0.51 0.67 0.3 0.27
0.07 0.13 0.15 0.26 0.11 0.13 0.15 0.21 1.0 0.09 0.13 0.19 0.07 0.21 0.2 0.2 0.25 0.16 0.13 0.22 0.18 0.02 0.16 0.13 0.12 0.07 0.4 0.17 0.15
0.12 0.14 0.15 0.74 0.13 0.14 0.15 0.68 0.57 0.24 0.31 1.0 0.34 0.36 0.25 0.34 0.62 0.8 0.2 0.58 0.52 0.53 0.6 0.72 0.45 1.0 0.63 0.3 0.2
0.46 0.42 0.47 0.29 0.49 0.42 0.47 0.55 0.67 0.5 0.59 0.98 0.67 0.57 0.51 0.66 0.55 0.81 0.4 0.83 0.62 0.71 0.67 0.94 0.85 0.84 1.0 0.63 0.59
0.05 0.04 0.04 1.0 0.04 0.04 0.04 0.49 0.88 0.36 0.2 0.16 0.2 0.22 0.26 0.36 0.16 0.15 0.29 0.13 0.32 0.12 0.24 0.37 0.33 0.34 0.18 0.18 0.28
0.25 0.05 0.06 0.17 0.18 0.05 0.06 0.33 1.0 0.14 0.05 0.11 0.12 0.09 0.18 0.14 0.05 0.06 0.11 0.09 0.17 0.2 0.09 0.33 0.27 0.29 0.55 0.08 0.13
0.22 0.12 0.11 0.0 0.21 0.12 0.11 0.18 1.0 0.25 0.28 0.48 0.26 0.32 0.31 0.33 0.55 0.41 0.23 0.47 0.24 0.34 0.27 0.5 0.37 0.45 0.44 0.26 0.28
1.0 0.23 0.13 0.0 0.9 0.23 0.13 0.29 0.66 0.16 0.3 0.48 0.25 0.27 0.31 0.28 0.26 0.41 0.19 0.48 0.21 0.27 0.16 0.36 0.28 0.43 0.55 0.29 0.31
0.05 0.06 0.04 0.69 0.08 0.06 0.04 0.13 1.0 0.15 0.19 0.14 0.14 0.09 0.18 0.18 0.29 0.38 0.14 0.17 0.2 0.24 0.38 0.24 0.38 0.38 0.93 0.11 0.14
0.86 0.04 0.15 0.0 0.61 0.04 0.15 1.0 0.43 0.12 0.09 0.53 0.31 0.13 0.18 0.47 0.18 0.52 0.29 0.39 0.16 0.29 0.02 0.49 0.08 0.19 0.25 0.03 0.12
0.31 0.26 0.28 0.69 0.33 0.26 0.28 0.92 0.61 0.5 0.54 0.66 0.6 0.53 0.55 0.57 0.38 0.93 0.64 0.84 0.71 0.68 0.72 0.79 0.96 0.71 1.0 0.61 0.48
0.34 0.41 0.37 0.0 0.32 0.41 0.37 0.84 0.67 0.42 0.55 0.64 0.42 0.43 0.4 0.54 0.43 0.55 0.28 0.57 0.41 0.4 0.68 0.74 0.54 0.67 1.0 0.47 0.42
0.03 0.04 0.07 0.28 0.03 0.04 0.07 0.13 1.0 0.24 0.24 0.22 0.23 0.26 0.23 0.22 0.27 0.38 0.19 0.25 0.28 0.22 0.26 0.25 0.44 0.26 0.59 0.21 0.29
0.08 0.08 0.05 0.35 0.06 0.08 0.05 0.07 1.0 0.19 0.17 0.22 0.26 0.24 0.21 0.19 0.34 0.28 0.2 0.33 0.23 0.36 0.23 0.29 0.39 0.49 0.25 0.16 0.26
0.08 0.14 0.22 0.0 0.15 0.14 0.22 0.09 1.0 0.07 0.2 0.18 0.13 0.21 0.15 0.12 0.4 0.22 0.21 0.25 0.21 0.28 0.3 0.39 0.5 0.45 0.19 0.22 0.15
0.1 0.07 0.06 0.26 0.11 0.07 0.06 0.18 1.0 0.16 0.25 0.25 0.22 0.23 0.2 0.23 0.36 0.37 0.15 0.25 0.25 0.25 0.27 0.4 0.38 0.35 0.39 0.19 0.13
0.75 0.29 0.29 0.43 0.68 0.29 0.29 0.7 1.0 0.38 0.23 0.36 0.28 0.35 0.45 0.32 0.31 0.45 0.35 0.36 0.29 0.39 0.24 0.41 0.34 0.44 0.46 0.3 0.41
0.24 0.18 0.11 0.0 0.3 0.18 0.11 0.27 1.0 0.06 0.1 0.31 0.11 0.02 0.11 0.07 0.17 0.34 0.09 0.24 0.08 0.26 0.21 0.46 0.09 0.15 0.1 0.03 0.1
0.24 0.14 0.15 0.15 0.21 0.14 0.15 0.63 1.0 0.24 0.15 0.24 0.19 0.21 0.26 0.36 0.26 0.31 0.21 0.24 0.21 0.16 0.25 0.27 0.35 0.38 0.59 0.31 0.23
0.21 0.26 0.25 0.09 0.17 0.26 0.25 0.23 1.0 0.2 0.16 0.2 0.2 0.19 0.28 0.24 0.13 0.29 0.15 0.15 0.25 0.19 0.28 0.26 0.42 0.18 0.38 0.22 0.29
0.25 0.83 0.68 0.24 0.26 0.83 0.68 0.25 0.24 0.51 0.38 0.66 0.33 0.36 0.4 0.43 0.4 0.45 0.43 0.56 0.4 0.44 0.5 0.6 0.46 0.62 1.0 0.41 0.4
0.35 1.0 0.95 0.43 0.35 1.0 0.95 0.34 0.29 0.42 0.27 0.63 0.23 0.22 0.26 0.26 0.44 0.31 0.29 0.43 0.31 0.35 0.4 0.53 0.39 0.62 0.94 0.27 0.28
0.17 0.1 0.06 0.36 0.17 0.1 0.06 0.15 1.0 0.46 0.43 0.52 0.49 0.38 0.42 0.48 0.26 0.63 0.45 0.52 0.54 0.5 0.47 0.66 0.68 0.62 0.65 0.34 0.41
0.25 0.01 0.02 0.04 0.2 0.01 0.02 0.22 1.0 0.07 0.07 0.28 0.16 0.08 0.11 0.26 0.18 0.34 0.15 0.24 0.1 0.15 0.02 0.29 0.03 0.09 0.13 0.02 0.05
0.16 0.16 0.14 0.01 0.15 0.16 0.14 0.33 1.0 0.2 0.19 0.32 0.21 0.12 0.17 0.18 0.18 0.22 0.12 0.27 0.24 0.22 0.19 0.38 0.39 0.45 0.26 0.12 0.23
0.43 0.27 0.28 0.38 0.4 0.27 0.28 0.47 0.93 0.31 0.47 0.62 0.41 0.33 0.34 0.39 0.61 0.52 0.34 0.76 0.52 0.58 0.4 1.0 0.59 0.78 0.64 0.44 0.27
0.48 0.23 0.22 0.48 0.49 0.23 0.22 0.59 1.0 0.38 0.33 0.27 0.32 0.31 0.41 0.33 0.33 0.34 0.31 0.29 0.45 0.41 0.43 0.44 0.66 0.49 0.45 0.3 0.36
0.23 0.18 0.23 0.43 0.27 0.18 0.23 0.5 1.0 0.61 0.43 0.67 0.48 0.41 0.6 0.56 0.42 0.67 0.57 0.51 0.62 0.42 0.74 0.7 0.85 0.66 0.86 0.41 0.51
0.07 0.09 0.09 0.48 0.07 0.09 0.09 0.26 1.0 0.08 0.07 0.22 0.09 0.17 0.18 0.16 0.06 0.12 0.1 0.12 0.12 0.11 0.03 0.19 0.16 0.19 0.35 0.13 0.17
0.07 0.07 0.16 0.0 0.08 0.07 0.16 0.12 1.0 0.13 0.16 0.23 0.13 0.07 0.13 0.12 0.07 0.36 0.2 0.27 0.15 0.27 0.14 0.33 0.13 0.38 0.32 0.1 0.17
0.87 0.54 0.53 0.5 0.78 0.54 0.53 1.0 0.95 0.38 0.38 0.54 0.35 0.45 0.45 0.56 0.4 0.56 0.31 0.42 0.39 0.37 0.43 0.58 0.52 0.59 0.61 0.53 0.41
0.18 0.09 0.08 0.38 0.18 0.09 0.08 0.2 1.0 0.1 0.34 0.2 0.25 0.27 0.22 0.22 0.1 0.4 0.09 0.28 0.21 0.22 0.09 0.32 0.24 0.33 0.47 0.16 0.23
0.14 0.06 0.03 0.46 0.17 0.06 0.03 0.35 0.64 0.16 0.18 0.79 0.26 0.21 0.32 0.24 0.56 0.53 0.24 0.53 0.3 0.46 0.59 0.57 0.37 0.62 1.0 0.21 0.17
0.09 0.1 0.12 0.04 0.08 0.1 0.12 0.28 0.8 0.51 0.46 0.66 0.52 0.51 0.46 0.61 0.48 0.74 0.37 0.68 0.53 0.56 0.55 0.75 0.71 1.0 0.7 0.45 0.49
0.27 0.41 0.37 0.0 0.23 0.41 0.37 0.24 0.81 0.25 0.49 0.37 0.53 0.21 0.32 0.42 0.5 0.55 0.33 0.75 0.38 0.86 0.5 0.87 0.8 1.0 0.43 0.3 0.36
0.04 0.03 0.03 0.15 0.04 0.03 0.03 0.15 1.0 0.28 0.21 0.31 0.2 0.2 0.3 0.28 0.16 0.27 0.24 0.23 0.26 0.28 0.38 0.39 0.43 0.36 0.5 0.26 0.28
0.33 0.29 0.28 0.11 0.33 0.29 0.28 0.54 1.0 0.48 0.39 0.75 0.5 0.45 0.45 0.47 0.64 0.66 0.35 0.63 0.45 0.47 0.54 0.61 0.57 0.61 0.88 0.38 0.54
0.18 0.24 0.27 1.0 0.17 0.24 0.27 0.38 0.6 0.2 0.39 0.35 0.38 0.26 0.33 0.31 0.27 0.31 0.3 0.33 0.33 0.29 0.32 0.38 0.43 0.73 0.59 0.38 0.28
0.11 0.13 0.13 0.37 0.13 0.13 0.13 0.44 1.0 0.1 0.08 0.24 0.13 0.12 0.11 0.12 0.18 0.21 0.13 0.18 0.05 0.11 0.06 0.11 0.13 0.26 0.26 0.13 0.18
0.23 0.21 0.21 0.12 0.24 0.21 0.21 0.31 1.0 0.29 0.25 0.34 0.33 0.34 0.34 0.42 0.37 0.36 0.26 0.4 0.33 0.3 0.37 0.41 0.43 0.46 0.26 0.33 0.38
0.69 0.52 0.61 0.0 0.73 0.52 0.61 1.0 0.32 0.39 0.52 0.77 0.41 0.48 0.38 0.75 0.36 0.57 0.24 0.82 0.46 0.34 0.3 0.83 0.38 0.72 0.48 0.47 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)