1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
ATCC 44394, early decay stage, 0-5 mm
ATCC 44394, middle late decay stage, 15-20 mm
ATCC 44394, late decay stage, 30-35 mm
SB12
MAD698-R, early decay stage, 0-5 mm
MAD698-R, middle late decay stage, 15-20 mm
MAD698-R, late decay stage, 30-35 mm
MAD698-R
Pure culture
week 6, furfural alcohol (FA10) treated wood
week 6, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 6, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 9, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 3, untreated wood
week 4, untreated wood
week 3, furfural alcohol (FA10) treated wood
week 3, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 3, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 9, furfural alcohol (FA10) treated wood
week 9, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 12, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 12, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 15, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 15, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 18, furfural alcohol (FA40) treated wood
week 18, furfural alcohol (FA70) treated wood
week 1, untreated wood
week 2, untreated wood
week 5, untreated wood
0.34 0.68 1.0 0.14 0.3 0.68 1.0 0.59 0.07 0.35 0.0 0.1 0.38 0.26 0.15 0.36 0.0 0.02 0.59 0.36 0.2 0.2 0.02 0.77 0.61 0.05 0.08 0.31 0.22
0.47 0.16 0.21 0.67 0.37 0.16 0.21 1.0 0.78 0.89 0.0 0.25 0.1 0.2 0.12 0.07 0.74 0.4 0.17 0.01 0.61 0.0 0.0 0.26 0.17 0.0 0.0 0.6 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.3 0.29 0.0 0.35 0.3 0.29 0.29 0.36 0.37 0.0 0.11 0.0 0.07 0.17 0.06 1.0 0.19 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.69 0.0 0.13 0.04
0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.26 0.11 1.0 0.92 0.17 0.52 0.48 0.68 0.22 0.32 0.29 0.73 0.86 0.38 0.85 0.74 0.51 0.53 0.26 0.07 0.64 0.52
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.3 0.48 0.32 0.04 0.23 0.0 0.8 0.38 0.19 0.13 0.16 0.27 0.08 0.09 0.09 0.0 0.07 0.0
0.41 0.7 0.62 0.43 0.38 0.7 0.62 0.03 0.12 0.4 0.21 0.45 0.07 0.03 0.05 0.19 0.72 0.23 1.0 0.53 0.01 0.03 0.18 0.18 0.48 0.26 0.08 0.34 0.13
1.0 0.8 0.56 0.94 0.96 0.8 0.56 0.94 0.97 0.38 0.11 0.45 0.11 0.43 0.45 0.37 0.48 0.33 0.27 0.45 0.37 0.43 0.07 0.38 0.37 0.35 0.77 0.39 0.29
0.64 0.71 0.69 0.4 0.68 0.71 0.69 0.48 1.0 0.41 0.45 0.41 0.47 0.6 0.54 0.63 0.37 0.56 0.65 0.39 0.52 0.35 0.42 0.53 0.5 0.34 0.6 0.65 0.47
0.47 0.41 0.62 0.66 0.47 0.41 0.62 0.22 0.27 0.73 0.86 0.52 0.77 0.68 0.7 1.0 0.52 0.53 0.88 0.72 0.83 0.91 0.67 0.86 0.64 0.38 0.57 0.81 0.43
0.32 0.35 0.11 0.74 0.39 0.35 0.11 0.55 0.39 0.78 0.13 0.63 0.36 0.66 0.52 0.39 0.12 0.74 0.16 0.62 0.47 0.65 0.35 1.0 0.67 0.23 0.95 0.46 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.33 0.42 0.48 0.29 0.33 0.42 0.41 1.0 0.65 0.83 0.87 0.74 0.6 0.45 0.58 0.52 0.58 0.67 0.81 0.92 0.99 0.97 0.64 0.64 0.99 0.54 0.94 0.35
0.52 0.2 0.32 0.0 0.82 0.2 0.32 0.33 0.58 0.0 0.57 1.0 0.36 0.14 0.24 0.53 0.97 0.21 0.06 0.13 0.19 0.09 0.08 0.6 0.45 0.04 0.86 0.0 0.24
0.67 0.21 0.25 0.08 0.52 0.21 0.25 0.3 0.64 0.71 0.54 0.6 0.67 0.29 0.44 0.36 0.49 0.49 0.73 0.49 1.0 0.5 0.45 0.67 0.49 0.35 0.62 0.46 0.49
0.09 0.29 0.05 0.0 0.06 0.29 0.05 0.11 0.43 0.25 0.16 0.15 0.47 0.07 0.24 0.27 0.23 0.1 0.35 0.45 0.25 0.41 0.47 1.0 0.16 0.0 0.42 0.34 0.09
0.59 0.08 0.16 0.0 0.47 0.08 0.16 0.4 0.0 0.17 0.03 0.43 0.13 0.66 0.07 0.0 0.54 0.0 1.0 0.24 0.2 0.0 0.0 0.05 0.55 0.0 0.0 0.47 0.12
0.16 0.38 0.19 0.0 0.23 0.38 0.19 0.26 0.68 0.36 0.64 0.58 0.63 0.84 0.51 0.57 0.56 0.86 0.58 0.54 0.45 0.52 0.69 0.75 1.0 0.4 0.73 0.63 0.81
0.13 0.0 0.06 0.07 0.12 0.0 0.06 0.01 0.05 0.21 0.72 0.24 0.36 0.41 0.22 0.37 1.0 0.45 0.08 0.59 0.35 0.44 0.32 0.52 0.75 0.87 0.99 0.2 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.16 0.03 0.15 0.86 0.15 0.03 0.15 0.29 1.0 0.09 0.51 0.0 0.19 0.08 0.19 0.0 0.55 0.3 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.34 0.01 0.0 0.09 0.14 0.0
0.41 0.26 0.27 1.0 0.4 0.26 0.27 0.47 0.54 0.53 0.06 0.28 0.28 0.29 0.28 0.28 0.13 0.23 0.22 0.36 0.3 0.26 0.39 0.53 0.43 0.37 0.54 0.23 0.21
0.44 0.27 0.22 1.0 0.37 0.27 0.22 0.42 0.52 0.28 0.66 0.65 0.53 0.26 0.28 0.41 0.19 0.76 0.85 0.45 0.55 0.64 0.56 0.53 0.54 0.54 0.36 0.58 0.32
1.0 0.69 0.69 0.3 0.9 0.69 0.69 0.99 0.92 0.4 0.26 0.35 0.55 0.09 0.15 0.38 0.53 0.2 0.24 0.18 0.6 0.74 0.65 0.02 0.63 0.23 0.11 0.45 0.18
0.08 0.07 0.08 1.0 0.11 0.07 0.08 0.12 0.11 0.02 0.14 0.15 0.11 0.04 0.09 0.05 0.23 0.1 0.01 0.11 0.17 0.13 0.02 0.19 0.11 0.05 0.21 0.07 0.14
0.33 0.28 0.19 0.0 0.3 0.28 0.19 0.43 0.76 0.16 0.02 0.29 0.15 0.08 0.2 0.24 0.13 0.61 0.2 0.72 0.28 0.28 0.05 1.0 0.42 0.42 0.67 0.52 0.39
0.65 0.48 0.45 0.83 0.63 0.48 0.45 0.88 0.46 0.43 0.66 0.51 0.47 0.65 0.65 0.33 0.25 0.6 0.45 0.19 0.56 0.53 0.42 0.72 0.22 0.1 1.0 0.55 0.38
0.16 0.06 0.17 0.0 0.21 0.06 0.17 0.37 1.0 0.3 0.16 0.74 0.35 0.37 0.18 0.33 0.14 0.23 0.25 0.19 0.31 0.18 0.11 0.33 0.38 0.58 0.46 0.27 0.28
0.16 0.3 0.14 1.0 0.27 0.3 0.14 0.35 0.52 0.33 0.65 0.43 0.32 0.56 0.51 0.27 0.18 0.47 0.24 0.23 0.1 0.93 0.29 0.4 0.59 0.11 0.22 0.23 0.37
0.47 0.53 0.56 0.89 0.45 0.53 0.56 0.57 0.96 0.8 0.73 0.66 0.69 0.64 0.64 0.46 0.31 0.58 0.68 0.59 0.72 0.83 1.0 0.89 0.91 0.79 0.61 0.39 0.67
0.39 0.52 0.42 0.0 0.38 0.52 0.42 1.0 0.97 0.23 0.19 0.26 0.21 0.35 0.32 0.44 0.44 0.35 0.23 0.66 0.31 0.27 0.34 0.4 0.4 0.29 0.65 0.35 0.33
0.17 0.05 0.13 1.0 0.11 0.05 0.13 0.34 0.15 0.11 0.24 0.61 0.36 0.28 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.22 0.98 0.36 0.0 0.16
0.13 0.17 0.13 0.39 0.22 0.17 0.13 0.61 0.43 0.52 0.19 1.0 0.4 0.37 0.5 0.42 0.09 0.62 0.62 0.33 0.32 0.75 0.49 0.54 0.33 0.67 0.59 0.73 0.46
0.05 0.19 0.06 0.04 0.03 0.19 0.06 0.98 0.45 0.17 0.31 0.76 0.23 0.49 0.64 0.07 0.63 0.52 0.14 0.88 0.06 0.05 0.3 0.38 0.22 1.0 0.59 0.65 0.32
0.14 0.1 0.08 1.0 0.17 0.1 0.08 0.31 0.09 0.0 0.15 0.47 0.12 0.08 0.08 0.1 0.33 0.66 0.03 0.32 0.03 0.16 0.02 0.14 0.25 0.18 0.5 0.12 0.04
0.22 0.09 0.21 0.09 0.18 0.09 0.21 0.17 0.41 0.43 0.26 0.24 0.57 0.51 0.38 0.79 0.36 0.41 1.0 0.49 0.24 0.31 0.32 0.47 0.16 0.41 0.96 0.31 0.24
0.99 0.53 0.56 1.0 0.78 0.53 0.56 0.71 0.17 0.21 0.17 0.0 0.29 0.39 0.25 0.27 0.0 0.48 0.33 0.23 0.42 0.15 0.0 0.85 0.31 0.0 0.38 0.54 0.43
0.58 0.43 0.53 0.61 0.56 0.43 0.53 0.56 0.79 0.55 0.84 0.29 0.72 0.56 0.52 0.38 0.07 0.7 0.7 0.65 0.68 0.73 0.71 0.83 1.0 0.76 0.94 0.73 0.62
0.72 1.0 0.98 0.0 0.96 1.0 0.98 0.61 0.73 0.08 0.0 0.04 0.09 0.52 0.24 0.04 0.0 0.05 0.88 0.0 0.0 0.24 0.0 0.53 0.08 0.0 0.07 0.62 0.32
0.68 0.14 0.14 0.12 0.73 0.14 0.14 0.46 0.39 0.02 0.48 0.03 0.14 0.18 0.46 0.16 0.0 0.1 0.41 0.32 0.22 0.1 0.18 1.0 0.07 0.71 0.41 0.13 0.38
0.3 0.23 0.26 0.29 0.25 0.23 0.26 0.22 1.0 0.23 0.32 0.81 0.35 0.23 0.24 0.33 0.5 0.4 0.52 0.46 0.6 0.36 0.7 0.69 0.76 0.84 0.29 0.18 0.34
0.43 0.39 0.57 0.09 0.39 0.39 0.57 0.16 0.2 0.35 0.24 0.21 0.43 0.52 0.48 0.62 0.75 0.31 0.31 0.48 0.66 0.35 0.36 1.0 0.56 0.08 0.5 0.76 0.4
0.53 0.22 0.34 0.16 0.59 0.22 0.34 0.17 0.25 0.41 0.63 0.49 0.66 0.4 0.45 0.43 0.3 0.3 0.92 0.44 1.0 0.52 0.78 0.65 0.92 0.53 0.93 0.38 0.55
0.27 0.58 0.55 0.0 0.33 0.58 0.55 1.0 0.42 0.23 0.3 0.26 0.39 0.46 0.39 0.34 0.39 0.46 0.32 0.47 0.41 0.6 0.31 0.39 0.48 0.32 0.84 0.44 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.08 0.19 0.09 0.03 0.69 0.69 0.05 0.07 0.01 1.0 0.0 0.18 0.14 0.37 0.12 0.52 0.0 0.0 0.1 0.83
0.11 0.22 0.15 0.47 0.24 0.22 0.15 0.12 1.0 0.06 0.03 0.06 0.13 0.07 0.1 0.25 0.28 0.09 0.04 0.05 0.07 0.04 0.03 0.13 0.08 0.08 0.18 0.09 0.1
0.7 0.74 0.65 0.25 0.7 0.74 0.65 0.41 0.49 0.26 0.08 0.19 0.43 1.0 0.48 0.09 0.87 0.43 0.91 0.37 0.54 0.31 0.47 0.52 0.72 0.57 0.66 0.23 0.18
0.21 0.0 0.12 0.0 0.21 0.0 0.12 0.12 0.99 0.42 0.1 0.34 0.3 0.21 0.35 0.36 0.02 0.27 0.2 0.41 0.51 0.01 0.17 0.46 0.54 1.0 0.42 0.11 0.38
0.28 0.39 0.47 0.78 0.48 0.39 0.47 0.85 0.08 0.29 0.24 0.25 0.09 0.18 0.19 0.15 0.64 0.1 0.1 0.41 0.2 0.14 0.32 0.27 0.48 0.69 1.0 0.38 0.34
0.09 0.04 0.02 0.32 0.1 0.04 0.02 0.11 0.02 0.13 0.11 0.02 0.09 0.53 0.51 0.11 0.02 0.16 1.0 0.04 0.29 0.09 0.08 0.01 0.38 0.05 0.06 0.06 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.17 0.15 0.13 0.02 0.13 0.17 0.28 0.0 0.08 0.64 0.05 0.01 0.0 0.03 0.05 0.37 0.2 1.0 0.03 0.21
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.08 0.34 0.67 1.0 0.4 0.46 0.36 0.11 0.17 0.04 0.52 0.56 0.11 0.33 0.29 0.85 0.41 0.2 0.85 0.22 0.45
0.25 0.45 0.43 0.11 0.3 0.45 0.43 0.57 0.48 0.27 0.29 0.52 0.14 0.14 0.05 0.11 0.57 0.12 0.06 0.27 0.06 0.25 0.65 0.23 0.08 1.0 0.0 0.19 0.1
0.58 0.33 0.39 0.0 0.49 0.33 0.39 0.43 0.89 0.58 0.58 0.74 0.44 0.58 0.48 0.66 0.63 0.75 0.56 0.46 0.54 0.32 0.82 0.41 0.66 0.55 1.0 0.43 0.38
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.3 0.02 0.18 0.17 0.22 0.02 0.12 0.08 0.42 0.13 0.09 0.28 0.04 0.03 0.1 0.2 0.05 0.0 0.28 0.08 0.03
0.66 0.46 0.48 0.38 0.88 0.46 0.48 1.0 0.55 0.35 0.84 0.39 0.41 0.24 0.45 0.12 0.21 0.29 0.49 0.15 0.55 0.14 0.3 0.31 0.3 0.59 0.12 0.52 0.29
0.45 0.18 0.11 0.0 0.47 0.18 0.11 0.25 0.09 0.35 0.5 0.25 0.32 0.77 0.64 0.6 0.6 0.58 0.32 0.69 0.34 0.45 0.58 0.14 0.61 0.37 1.0 0.53 0.42
0.56 0.75 0.52 0.06 0.51 0.75 0.52 0.13 0.56 0.62 0.67 0.5 0.61 0.92 0.7 0.7 0.46 0.71 0.61 0.61 0.68 0.85 0.47 0.73 0.73 0.59 0.74 1.0 0.62
0.17 0.27 0.34 1.0 0.12 0.27 0.34 0.23 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.95 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0
0.68 0.24 0.23 0.01 0.73 0.24 0.23 0.08 0.32 0.48 0.87 0.33 0.83 0.83 0.68 0.92 0.38 0.64 0.39 0.45 0.76 1.0 0.6 0.97 0.95 0.79 0.89 0.8 0.52
0.76 0.54 0.72 0.0 0.83 0.54 0.72 0.24 0.0 0.04 0.18 0.16 0.03 0.01 0.45 0.26 0.27 0.05 0.12 0.02 0.28 0.74 0.25 1.0 0.34 0.0 0.37 0.07 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.02 0.35 0.07 0.58 0.51 0.44 0.33 1.0 0.49 0.37 0.18 0.04 0.38 0.13 0.09 0.43 0.25 0.83 0.16 0.53
0.4 0.15 0.28 0.0 0.41 0.15 0.28 0.47 0.92 0.44 0.38 0.69 0.48 0.48 0.44 0.34 0.07 0.83 0.16 0.27 0.69 0.46 0.38 0.53 0.31 0.32 1.0 0.47 0.49
0.44 0.34 0.31 0.05 0.48 0.34 0.31 0.53 1.0 0.19 0.27 0.31 0.14 0.39 0.23 0.28 0.64 0.5 0.17 0.2 0.3 0.2 0.27 0.28 0.34 0.3 0.28 0.34 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.03 0.0 0.36 0.14 0.02 0.3 0.0 0.0 0.04 1.0 0.51 0.0 0.19 0.09 0.75 0.34 0.36 0.32 0.0 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.35 0.22 0.39 0.0 0.34 0.5 0.53 0.34 0.59 0.28 0.3 0.21 1.0 0.16 0.43 0.41 0.42 0.16 0.55 0.16 0.28
0.4 0.07 0.08 0.45 0.27 0.07 0.08 0.61 1.0 0.11 0.48 0.84 0.13 0.14 0.12 0.05 0.34 0.76 0.55 0.43 0.06 0.41 0.08 0.37 0.02 0.26 0.09 0.14 0.25
0.2 0.15 0.29 0.04 0.13 0.15 0.29 0.02 0.0 0.03 0.15 0.27 0.11 0.05 0.0 0.42 0.15 0.03 1.0 0.07 0.29 0.0 0.0 0.04 0.13 0.37 0.16 0.2 0.24
0.48 0.1 0.13 0.25 0.38 0.1 0.13 0.52 0.47 0.47 0.0 0.34 0.37 0.16 0.34 0.31 0.01 0.04 0.96 0.29 0.76 0.38 0.27 0.45 1.0 0.16 0.08 0.13 0.28
0.06 0.16 0.04 0.41 0.16 0.16 0.04 0.05 1.0 0.2 0.17 0.71 0.04 0.22 0.2 0.02 0.0 0.12 0.21 0.29 0.19 0.07 0.0 0.43 0.04 0.36 0.0 0.08 0.1
0.19 0.15 0.16 0.69 0.23 0.15 0.16 0.24 0.68 0.17 0.02 0.14 0.1 0.42 0.19 0.18 0.02 0.04 1.0 0.28 0.09 0.13 0.18 0.37 0.29 0.55 0.56 0.17 0.24
0.42 0.16 0.15 1.0 0.38 0.16 0.15 0.45 0.82 0.29 0.13 0.59 0.14 0.16 0.22 0.3 0.38 0.09 0.1 0.17 0.41 0.23 0.07 0.14 0.11 0.28 0.12 0.15 0.24
0.05 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 1.0 0.0 0.03 0.03 0.08 0.0 0.09 0.16 0.0 0.13 0.04 0.08 0.13 0.32 0.0 0.38 0.09 0.09 0.24 0.08 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 1.0 0.87 0.0 0.69 1.0 0.87 0.95 0.27 0.36 0.85 0.83 0.53 0.67 0.51 0.65 0.47 0.32 0.39 0.37 0.55 0.6 0.58 0.58 0.45 0.58 0.42 0.71 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)