Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	ATCC 44394, early decay stage, 0-5 mm	ATCC 44394, middle late decay stage, 15-20 mm	ATCC 44394, late decay stage, 30-35 mm	SB12	MAD698-R, early decay stage, 0-5 mm	MAD698-R, middle late decay stage, 15-20 mm	MAD698-R, late decay stage, 30-35 mm	MAD698-R	Pure culture	week 6, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, untreated wood	week 4, untreated wood	week 3, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 1, untreated wood	week 2, untreated wood	week 5, untreated wood
EED77260	0.21	0.25	0.22	0.0	0.19	0.25	0.22	1.0	0.13	0.69	0.65	0.5	0.55	0.4	0.66	0.46	0.56	0.63	0.7	0.51	0.73	0.74	0.56	0.79	0.75	0.82	0.87	0.54	0.79
EED77471	0.78	0.89	0.9	0.34	0.84	0.89	0.9	0.65	0.43	0.53	0.4	0.38	0.5	0.7	0.61	0.69	0.35	0.5	0.62	0.43	0.54	0.42	0.46	0.44	0.71	0.45	0.55	0.49	1.0
EED77478	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED77555	0.14	0.19	0.17	0.0	0.11	0.19	0.17	1.0	0.32	0.52	0.47	0.42	0.47	0.32	0.51	0.37	0.49	0.46	0.51	0.4	0.51	0.58	0.41	0.58	0.56	0.43	0.76	0.39	0.61
EED77589	0.73	0.37	0.43	0.08	0.74	0.37	0.43	1.0	0.97	0.57	0.64	0.59	0.72	0.59	0.67	0.61	0.42	0.72	0.58	0.58	0.66	0.52	0.84	0.69	0.76	0.8	0.86	0.71	0.66
EED77783	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED78109	0.17	0.17	0.15	0.27	0.15	0.17	0.15	0.27	0.03	0.13	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	1.0	0.03	0.07	0.05	0.06	0.08	0.15	0.03	0.02	0.01	0.43
EED78112	0.21	0.41	0.85	0.17	0.19	0.41	0.85	0.12	0.08	0.16	0.06	0.08	0.11	0.14	0.13	0.13	0.09	0.1	0.24	0.14	0.14	0.09	0.08	0.11	0.32	0.12	1.0	0.04	0.74
EED78345	0.68	0.22	0.24	0.16	0.67	0.22	0.24	0.56	1.0	0.7	0.4	0.56	0.48	0.58	0.72	0.58	0.3	0.58	0.65	0.47	0.63	0.59	0.69	0.74	0.97	0.67	0.74	0.61	0.44
EED78431	0.09	0.16	0.73	0.03	0.07	0.16	0.73	0.01	0.02	0.42	0.13	0.14	0.13	0.29	0.47	0.35	0.16	0.08	1.0	0.26	0.23	0.08	0.12	0.15	0.15	0.18	0.06	0.02	0.98
EED78541	0.03	0.04	0.03	0.1	0.04	0.04	0.03	0.01	1.0	0.23	0.09	0.11	0.11	0.04	0.09	0.09	0.02	0.14	0.15	0.11	0.29	0.4	0.32	0.43	0.21	0.24	0.13	0.03	0.03
EED78683	0.07	0.1	0.13	0.08	0.06	0.1	0.13	0.61	0.24	0.58	0.46	0.34	0.49	0.36	0.48	0.32	0.28	0.49	0.41	0.39	0.5	0.48	0.39	0.4	0.57	0.34	1.0	0.21	0.68
EED78920	0.52	0.6	0.6	0.8	0.54	0.6	0.6	0.62	0.51	0.84	0.85	0.34	0.59	0.55	0.53	0.8	0.23	0.41	0.73	0.41	1.0	0.59	0.76	0.79	0.91	0.57	0.95	0.59	0.48
EED78939	0.3	0.24	0.28	1.0	0.3	0.24	0.28	0.6	0.27	0.36	0.15	0.16	0.16	0.19	0.17	0.17	0.19	0.08	0.34	0.16	0.38	0.29	0.44	0.52	0.47	0.73	0.51	0.16	0.35
EED79152	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.17	1.0	0.36	0.26	0.25	0.3	0.12	0.26	0.2	0.13	0.21	0.32	0.22	0.42	0.37	0.42	0.43	0.37	0.45	0.15	0.12	0.25
EED79166	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79357	0.1	0.19	0.52	0.13	0.11	0.19	0.52	0.1	0.07	0.21	0.07	0.06	0.15	0.27	0.22	0.21	0.24	0.09	0.5	0.11	0.17	0.05	0.08	0.08	0.29	0.18	0.19	0.09	1.0
EED79383	0.54	0.45	0.37	0.95	0.57	0.45	0.37	1.0	0.54	0.29	0.19	0.31	0.31	0.27	0.3	0.45	0.35	0.37	0.25	0.25	0.29	0.27	0.57	0.31	0.45	0.34	0.51	0.31	0.37
EED79614	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79802	1.0	0.36	0.33	0.4	0.84	0.36	0.33	0.37	0.47	0.29	0.25	0.35	0.29	0.29	0.28	0.31	0.26	0.39	0.26	0.38	0.29	0.32	0.37	0.37	0.53	0.4	0.31	0.23	0.23
EED79936	0.54	0.54	0.39	0.14	0.48	0.54	0.39	0.18	1.0	0.58	0.35	0.31	0.52	0.39	0.44	0.59	0.33	0.45	0.74	0.33	0.51	0.52	0.26	0.45	0.55	0.4	0.5	0.55	0.5
EED79958	0.04	0.02	0.04	0.18	0.06	0.02	0.04	0.06	0.22	0.21	0.14	0.08	0.2	0.09	0.11	0.07	0.01	0.07	1.0	0.08	0.75	0.21	0.64	0.43	0.65	0.15	0.05	0.09	0.11
EED80083	0.06	0.61	0.41	1.0	0.21	0.61	0.41	0.41	0.68	0.37	0.44	0.29	0.32	0.39	0.45	0.49	0.37	0.06	0.64	0.13	0.28	0.53	0.0	0.24	0.45	0.76	0.38	0.73	0.31
EED80144	0.08	0.43	0.88	0.02	0.09	0.43	0.88	0.02	0.02	0.3	0.07	0.03	0.18	0.45	0.33	0.19	0.17	0.04	0.34	0.06	0.23	0.03	0.12	0.04	0.55	0.18	0.07	0.08	1.0
EED80199	0.48	0.29	0.34	0.44	0.55	0.29	0.34	1.0	0.66	0.62	0.36	0.35	0.48	0.27	0.39	0.35	0.34	0.36	0.76	0.36	0.76	0.38	0.4	0.53	0.63	0.39	0.87	0.31	0.46
EED80523	0.5	0.47	0.54	0.51	0.51	0.47	0.54	1.0	0.87	0.28	0.29	0.26	0.28	0.27	0.25	0.32	0.16	0.33	0.26	0.17	0.38	0.21	0.47	0.29	0.4	0.2	0.2	0.3	0.27
EED80558	0.51	0.2	0.18	0.01	0.51	0.2	0.18	0.23	0.38	0.33	0.46	0.22	0.33	0.48	1.0	0.47	0.42	0.39	0.7	0.25	0.56	0.32	0.41	0.5	0.83	0.5	0.36	0.49	0.49
EED80571	0.69	0.55	0.5	0.73	0.74	0.55	0.5	0.95	1.0	0.51	0.7	0.48	0.58	0.53	0.69	0.64	0.62	0.69	0.62	0.49	0.58	0.62	0.72	0.58	0.81	0.6	0.68	0.74	0.6
EED80823	0.6	0.45	0.46	0.42	0.56	0.45	0.46	1.0	0.9	0.37	0.28	0.25	0.36	0.29	0.36	0.39	0.24	0.36	0.32	0.25	0.46	0.29	0.51	0.32	0.51	0.35	0.33	0.29	0.47
EED80899	0.22	0.25	0.16	0.62	0.2	0.25	0.16	0.55	1.0	0.31	0.11	0.27	0.28	0.33	0.25	0.21	0.06	0.43	0.37	0.43	0.52	0.39	0.47	0.51	0.47	0.53	0.66	0.23	0.22
EED80919	1.0	0.45	0.43	0.14	0.8	0.45	0.43	0.12	0.07	0.06	0.11	0.07	0.12	0.12	0.04	0.17	0.01	0.05	0.1	0.14	0.1	0.12	0.14	0.16	0.75	0.25	0.11	0.12	0.21
EED80921	0.71	0.57	0.7	0.49	0.63	0.57	0.7	0.91	1.0	0.61	0.4	0.41	0.45	0.58	0.56	0.58	0.39	0.54	0.65	0.41	0.61	0.37	0.6	0.48	0.72	0.53	0.49	0.52	0.58
EED80939	0.8	0.16	0.26	0.62	0.76	0.16	0.26	1.0	0.36	0.18	0.2	0.19	0.1	0.18	0.14	0.33	0.01	0.2	0.2	0.11	0.13	0.08	0.34	0.29	0.21	0.31	0.35	0.13	0.13
EED80940	0.18	0.02	0.31	0.0	0.12	0.02	0.31	0.15	0.31	0.17	0.37	0.95	0.0	0.04	0.17	0.03	0.31	0.04	1.0	0.02	0.15	0.45	0.53	0.57	0.08	0.25	0.23	0.3	0.19
EED80988	0.97	0.75	0.56	0.88	0.84	0.75	0.56	1.0	0.28	0.33	0.21	0.25	0.44	0.18	0.3	0.45	0.1	0.52	0.57	0.31	0.98	0.22	0.51	0.54	0.45	0.55	0.96	0.37	0.33
EED81215	0.11	0.12	0.15	0.16	0.14	0.12	0.15	0.08	0.34	0.2	0.17	0.21	0.15	0.19	0.23	0.16	0.21	0.27	1.0	0.18	0.31	0.15	0.61	0.21	0.36	0.19	0.17	0.24	0.16
EED81302	0.24	0.19	0.18	0.43	0.28	0.19	0.18	0.28	1.0	0.45	0.33	0.33	0.34	0.47	0.42	0.37	0.21	0.3	0.5	0.32	0.69	0.32	0.79	0.47	0.69	0.41	0.41	0.43	0.37
EED81320	0.77	0.61	0.58	0.78	0.78	0.61	0.58	0.72	0.92	0.71	0.61	0.6	0.73	0.68	0.67	0.82	0.29	0.58	0.75	0.56	0.84	0.58	0.93	0.76	0.69	0.63	1.0	0.75	0.69
EED81810	0.37	0.41	0.4	0.01	0.42	0.41	0.4	0.98	1.0	0.72	0.27	0.42	0.61	0.48	0.62	0.54	0.12	0.41	0.86	0.46	0.66	0.62	0.87	0.77	0.89	0.43	0.81	0.31	0.77
EED81811	0.72	0.67	0.67	0.91	0.71	0.67	0.67	0.74	0.74	0.78	0.66	0.63	0.72	0.66	0.72	0.79	0.24	0.63	0.62	0.7	0.75	0.6	1.0	0.7	0.95	0.87	0.85	0.74	0.65
EED81829	0.5	0.44	0.44	0.02	0.49	0.44	0.44	0.82	1.0	0.62	0.61	0.49	0.64	0.67	0.65	0.64	0.51	0.58	0.73	0.52	0.71	0.57	0.77	0.66	0.83	0.48	0.77	0.75	0.74
EED81853	0.37	0.37	0.42	0.51	0.38	0.37	0.42	0.36	0.29	0.58	0.59	0.37	0.58	0.38	0.48	0.69	0.19	0.43	0.69	0.48	0.6	0.62	0.65	0.52	1.0	0.58	0.22	0.59	0.53
EED82129	0.41	0.4	0.4	0.38	0.41	0.4	0.4	0.54	1.0	0.6	0.36	0.34	0.42	0.48	0.64	0.52	0.37	0.36	0.56	0.33	0.51	0.39	0.46	0.4	0.67	0.54	0.41	0.49	0.67
EED82321	0.96	0.35	0.28	0.37	1.0	0.35	0.28	0.59	0.47	0.2	0.14	0.08	0.26	0.09	0.24	0.3	0.11	0.33	0.44	0.38	0.49	0.26	0.22	0.33	0.45	0.26	0.46	0.12	0.47
EED82346	0.32	0.23	0.69	0.18	0.35	0.23	0.69	0.55	0.05	0.22	0.13	0.13	0.25	0.36	0.24	0.27	0.18	0.36	0.47	0.51	0.31	0.13	0.2	0.28	0.48	0.44	0.76	0.14	1.0
EED82682	0.42	0.42	0.43	0.86	0.49	0.42	0.43	0.27	1.0	0.1	0.05	0.2	0.11	0.12	0.21	0.2	0.02	0.24	0.22	0.08	0.06	0.23	0.13	0.19	0.13	0.33	0.2	0.18	0.15
EED82842	0.19	0.35	0.57	0.39	0.19	0.35	0.57	0.17	0.24	0.31	0.22	0.18	0.25	0.26	0.27	0.26	0.18	0.2	0.85	0.23	0.24	0.16	0.18	0.26	0.56	0.29	0.95	0.19	1.0
EED82936	1.0	0.08	0.07	0.88	0.87	0.08	0.07	0.69	0.6	0.95	0.24	0.17	0.28	0.09	0.39	0.19	0.09	0.3	0.96	0.21	0.69	0.52	0.44	0.47	0.5	0.56	0.53	0.08	0.45
EED83009	0.17	0.09	0.11	1.0	0.16	0.09	0.11	0.21	0.93	0.4	0.21	0.25	0.4	0.1	0.29	0.16	0.11	0.22	0.21	0.19	0.53	0.43	0.48	0.37	0.37	0.35	0.17	0.09	0.34
EED83016	0.24	0.14	0.12	0.55	0.23	0.14	0.12	0.51	1.0	0.27	0.19	0.23	0.22	0.14	0.33	0.2	0.03	0.19	0.3	0.2	0.32	0.2	0.34	0.33	0.34	0.49	0.16	0.1	0.29
EED83034	0.54	0.32	0.39	0.33	0.56	0.32	0.39	0.99	1.0	0.41	0.46	0.46	0.35	0.48	0.45	0.44	0.11	0.53	0.44	0.49	0.6	0.33	0.84	0.56	0.57	0.61	0.8	0.67	0.42
EED83249	0.36	0.42	0.39	0.21	0.3	0.42	0.39	0.35	1.0	0.34	0.27	0.31	0.27	0.27	0.37	0.36	0.38	0.28	0.44	0.3	0.31	0.31	0.36	0.43	0.35	0.32	0.17	0.26	0.35
EED83468	0.37	0.27	0.24	0.19	0.37	0.27	0.24	0.47	1.0	0.21	0.16	0.2	0.11	0.15	0.22	0.17	0.1	0.13	0.41	0.19	0.08	0.18	0.19	0.29	0.26	0.35	0.14	0.14	0.32
EED83716	0.41	0.35	0.31	0.0	0.44	0.35	0.31	0.54	0.64	0.61	0.46	0.6	0.46	0.47	0.49	0.56	0.3	0.58	0.55	0.54	0.7	0.5	0.69	0.63	0.63	0.49	1.0	0.5	0.46
EED83868	0.24	0.17	0.1	0.06	0.21	0.17	0.1	0.49	1.0	0.46	0.26	0.26	0.31	0.09	0.23	0.2	0.06	0.24	0.38	0.22	0.64	0.26	0.44	0.38	0.66	0.4	0.27	0.12	0.29
EED83957	0.76	1.0	0.72	0.43	0.88	1.0	0.72	0.87	0.66	0.42	0.49	0.39	0.52	0.48	0.67	0.47	0.7	0.63	0.45	0.53	0.51	0.51	0.55	0.57	0.92	0.73	0.64	0.53	0.55
EED83962	0.62	0.56	0.63	0.63	0.61	0.56	0.63	0.92	1.0	0.71	0.82	0.6	0.59	0.7	0.75	0.67	0.75	0.64	0.68	0.6	0.67	0.69	0.8	0.76	0.77	0.68	0.76	0.73	0.6
EED84023	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	1.0	0.28	0.09	0.16	0.07	0.03	0.08	0.1	0.09	0.16	0.09	0.11	0.27	0.39	0.2	0.32	0.11	0.12	0.12	0.04	0.03
EED84087	0.03	0.05	0.06	0.14	0.05	0.05	0.06	0.36	1.0	0.54	0.29	0.18	0.27	0.17	0.28	0.25	0.08	0.29	0.4	0.17	0.44	0.24	0.54	0.32	0.5	0.25	0.5	0.16	0.35
EED84111	0.81	0.62	0.74	0.19	0.83	0.62	0.74	1.0	0.98	0.63	0.51	0.55	0.57	0.65	0.6	0.68	0.3	0.58	0.74	0.49	0.61	0.49	0.73	0.63	0.97	0.54	0.57	0.6	0.89
EED84324	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED84437	1.0	0.26	0.25	0.1	0.74	0.26	0.25	0.95	0.85	0.49	0.26	0.24	0.42	0.33	0.35	0.33	0.17	0.29	0.49	0.26	0.52	0.31	0.51	0.44	0.94	0.37	0.23	0.26	0.3
EED84503	0.22	0.19	0.2	0.18	0.23	0.19	0.2	0.25	1.0	0.25	0.17	0.27	0.21	0.13	0.14	0.19	0.06	0.14	0.17	0.19	0.29	0.12	0.26	0.24	0.2	0.3	0.14	0.15	0.16
EED84685	0.8	0.64	0.56	0.59	0.78	0.64	0.56	1.0	0.89	0.52	0.48	0.48	0.56	0.53	0.68	0.66	0.51	0.63	0.53	0.34	0.54	0.58	0.76	0.46	0.57	0.49	0.69	0.69	0.52
EED85148	0.29	0.16	0.14	0.04	0.33	0.16	0.14	1.0	0.19	0.19	0.43	0.19	0.66	0.13	0.23	0.28	0.16	0.54	0.89	0.22	0.41	0.31	0.21	0.21	0.48	0.19	0.55	0.09	0.54
EED85247	1.0	1.0	0.74	0.15	0.77	1.0	0.74	0.22	0.41	0.41	0.1	0.13	0.14	0.53	0.52	0.31	0.22	0.13	0.64	0.16	0.21	0.11	0.14	0.23	0.42	0.17	0.2	0.37	0.7
EED85548	0.42	0.37	0.44	0.52	0.42	0.37	0.44	0.66	1.0	0.64	0.5	0.57	0.48	0.46	0.58	0.59	0.4	0.54	0.86	0.56	0.71	0.51	0.71	0.64	0.83	0.62	0.78	0.62	0.55
EED85823	0.13	0.14	0.12	0.02	0.11	0.14	0.12	1.0	0.14	0.47	0.35	0.34	0.43	0.29	0.46	0.28	0.17	0.43	0.38	0.32	0.39	0.47	0.4	0.48	0.54	0.45	0.76	0.27	0.55
EED85836	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED85909	0.67	0.33	0.39	0.94	0.71	0.33	0.39	1.0	0.44	0.24	0.28	0.24	0.21	0.25	0.27	0.33	0.3	0.33	0.24	0.24	0.3	0.28	0.48	0.29	0.37	0.24	0.29	0.27	0.24
EED85944	0.33	0.33	0.37	0.78	0.34	0.33	0.37	0.72	0.99	0.73	0.57	0.75	0.56	0.4	0.51	0.49	0.47	0.55	0.77	0.7	0.7	0.49	0.71	0.61	0.64	0.69	1.0	0.38	0.59
EED86026	0.53	0.51	0.62	0.21	0.45	0.51	0.62	0.52	1.0	0.77	0.42	0.51	0.45	0.56	0.63	0.64	0.43	0.56	0.63	0.49	0.75	0.47	0.77	0.66	0.76	0.62	0.43	0.37	0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)